MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium novyi NT chromosome

Total Repeats: 2757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008593	AGTAG	2	10	650	659	40 %	20 %	40 %	0 %	118443844
2	NC_008593	ACAAA	2	10	1347	1356	80 %	0 %	0 %	20 %	118442981
3	NC_008593	AAGAT	2	10	4827	4836	60 %	20 %	20 %	0 %	118443722
4	NC_008593	AGAGC	2	10	5573	5582	40 %	0 %	40 %	20 %	118443722
5	NC_008593	AGATA	2	10	5752	5761	60 %	20 %	20 %	0 %	118443722
6	NC_008593	TGGAA	2	10	6002	6011	40 %	20 %	40 %	0 %	118444066
7	NC_008593	AAAGA	2	10	6205	6214	80 %	0 %	20 %	0 %	118444066
8	NC_008593	AAATA	2	10	7116	7125	80 %	20 %	0 %	0 %	118443812
9	NC_008593	TAAAA	2	10	7638	7647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008593	GGTTT	2	10	7671	7680	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008593	CAATT	2	10	8184	8193	40 %	40 %	0 %	20 %	118443230
12	NC_008593	ATATA	2	10	11210	11219	60 %	40 %	0 %	0 %	118444555
13	NC_008593	TGTTA	2	10	11573	11582	20 %	60 %	20 %	0 %	118444134
14	NC_008593	ATACT	2	10	11960	11969	40 %	40 %	0 %	20 %	118444568
15	NC_008593	TAAGG	2	10	15276	15285	40 %	20 %	40 %	0 %	118444184
16	NC_008593	TTTTA	2	10	15826	15835	20 %	80 %	0 %	0 %	118444184
17	NC_008593	ATACT	2	10	17683	17692	40 %	40 %	0 %	20 %	118443553
18	NC_008593	AGAGT	2	10	17727	17736	40 %	20 %	40 %	0 %	118443553
19	NC_008593	TGATA	2	10	19325	19334	40 %	40 %	20 %	0 %	118443592
20	NC_008593	ACAGT	2	10	20012	20021	40 %	20 %	20 %	20 %	118443592
21	NC_008593	TAGAT	2	10	20030	20039	40 %	40 %	20 %	0 %	118443592
22	NC_008593	TAATA	2	10	20724	20733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008593	TGAAA	2	10	22458	22467	60 %	20 %	20 %	0 %	118444706
24	NC_008593	GCATT	2	10	23094	23103	20 %	40 %	20 %	20 %	118443218
25	NC_008593	TTATG	2	10	23456	23465	20 %	60 %	20 %	0 %	118443218
26	NC_008593	AAATA	2	10	25880	25889	80 %	20 %	0 %	0 %	118443625
27	NC_008593	TATTT	2	10	30062	30071	20 %	80 %	0 %	0 %	118442930
28	NC_008593	GGAAC	2	10	31901	31910	40 %	0 %	40 %	20 %	118444065
29	NC_008593	ATGTA	2	10	32932	32941	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008593	ATAAA	2	10	33150	33159	80 %	20 %	0 %	0 %	118444000
31	NC_008593	TAAGG	2	10	35082	35091	40 %	20 %	40 %	0 %	118442902
32	NC_008593	TTCTT	2	10	35706	35715	0 %	80 %	0 %	20 %	118443206
33	NC_008593	CTTTA	2	10	36305	36314	20 %	60 %	0 %	20 %	118443206
34	NC_008593	TTATG	2	10	36713	36722	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008593	GAAAC	2	10	37066	37075	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008593	TTTAT	2	10	40344	40353	20 %	80 %	0 %	0 %	118443542
37	NC_008593	AAAAT	2	10	41500	41509	80 %	20 %	0 %	0 %	118443542
38	NC_008593	TTATA	2	10	41827	41836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008593	ATGAA	2	10	43377	43386	60 %	20 %	20 %	0 %	118443447
40	NC_008593	AAAAT	2	10	43506	43515	80 %	20 %	0 %	0 %	118442905
41	NC_008593	GAAAT	2	10	46989	46998	60 %	20 %	20 %	0 %	118443407
42	NC_008593	ATTAT	2	10	50704	50713	40 %	60 %	0 %	0 %	118443895
43	NC_008593	TTTGT	2	10	51268	51277	0 %	80 %	20 %	0 %	118444723
44	NC_008593	TATAA	2	10	51576	51585	60 %	40 %	0 %	0 %	118444723
45	NC_008593	ACTTC	2	10	52445	52454	20 %	40 %	0 %	40 %	118444146
46	NC_008593	AAACA	2	10	52696	52705	80 %	0 %	0 %	20 %	118444146
47	NC_008593	ATAAC	2	10	53795	53804	60 %	20 %	0 %	20 %	118443320
48	NC_008593	CCATA	2	10	54899	54908	40 %	20 %	0 %	40 %	118443506
49	NC_008593	TTAAA	2	10	56161	56170	60 %	40 %	0 %	0 %	118443798
50	NC_008593	TTTTA	2	10	56793	56802	20 %	80 %	0 %	0 %	118443798
51	NC_008593	GAATG	2	10	57633	57642	40 %	20 %	40 %	0 %	118443798
52	NC_008593	TAAAT	2	10	58278	58287	60 %	40 %	0 %	0 %	118443604
53	NC_008593	TCATA	2	10	58546	58555	40 %	40 %	0 %	20 %	118443604
54	NC_008593	TCTTT	2	10	59600	59609	0 %	80 %	0 %	20 %	118443931
55	NC_008593	ATAAA	2	10	61002	61011	80 %	20 %	0 %	0 %	118444655
56	NC_008593	GTTTT	2	10	61166	61175	0 %	80 %	20 %	0 %	118444655
57	NC_008593	AAAGA	2	10	61447	61456	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008593	TGAAA	2	10	61877	61886	60 %	20 %	20 %	0 %	118443193
59	NC_008593	CAAAA	2	10	62681	62690	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_008593	ATTTT	2	10	63510	63519	20 %	80 %	0 %	0 %	118443302
61	NC_008593	AGTAG	2	10	64618	64627	40 %	20 %	40 %	0 %	118443747
62	NC_008593	AAATA	2	10	67272	67281	80 %	20 %	0 %	0 %	118444018
63	NC_008593	ATGGA	2	10	67712	67721	40 %	20 %	40 %	0 %	118444018
64	NC_008593	TCTAT	2	10	69003	69012	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008593	TAAAA	2	10	70034	70043	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008593	AAAAT	2	10	72708	72717	80 %	20 %	0 %	0 %	118443765
67	NC_008593	AAATT	2	10	73013	73022	60 %	40 %	0 %	0 %	118443016
68	NC_008593	AGAAA	2	10	73123	73132	80 %	0 %	20 %	0 %	118443016
69	NC_008593	TATAA	2	10	73454	73463	60 %	40 %	0 %	0 %	118444357
70	NC_008593	AAATA	2	10	74083	74092	80 %	20 %	0 %	0 %	118444357
71	NC_008593	AAGAT	2	10	74214	74223	60 %	20 %	20 %	0 %	118444357
72	NC_008593	TATAA	2	10	74760	74769	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008593	AAAAG	2	10	75029	75038	80 %	0 %	20 %	0 %	118443992
74	NC_008593	ATTAC	2	10	77211	77220	40 %	40 %	0 %	20 %	118443720
75	NC_008593	GAAAA	2	10	78406	78415	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008593	TAAAA	2	10	78655	78664	80 %	20 %	0 %	0 %	118444677
77	NC_008593	GTAGA	2	10	79161	79170	40 %	20 %	40 %	0 %	118444677
78	NC_008593	TAAAT	2	10	79312	79321	60 %	40 %	0 %	0 %	118444677
79	NC_008593	TAAAA	2	10	79460	79469	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008593	ATGTT	2	10	79547	79556	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008593	TAATA	2	10	79558	79567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008593	AAATA	2	10	80338	80347	80 %	20 %	0 %	0 %	118444270
83	NC_008593	CTTTA	2	10	81164	81173	20 %	60 %	0 %	20 %	118443339
84	NC_008593	CAAAT	2	10	81373	81382	60 %	20 %	0 %	20 %	118443339
85	NC_008593	TGCCA	2	10	81673	81682	20 %	20 %	20 %	40 %	118443004
86	NC_008593	TTTTA	2	10	82024	82033	20 %	80 %	0 %	0 %	118443004
87	NC_008593	TCATA	2	10	82239	82248	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_008593	TAAAA	2	10	83280	83289	80 %	20 %	0 %	0 %	118443149
89	NC_008593	AAACT	2	10	84677	84686	60 %	20 %	0 %	20 %	118443686
90	NC_008593	ATTAA	2	10	85509	85518	60 %	40 %	0 %	0 %	118443270
91	NC_008593	GGTTT	2	10	85568	85577	0 %	60 %	40 %	0 %	118443270
92	NC_008593	GATAA	2	10	85752	85761	60 %	20 %	20 %	0 %	118443270
93	NC_008593	GCTAG	2	10	86199	86208	20 %	20 %	40 %	20 %	118444556
94	NC_008593	AAGGA	2	10	86932	86941	60 %	0 %	40 %	0 %	118444556
95	NC_008593	TGGAA	2	10	87368	87377	40 %	20 %	40 %	0 %	118444102
96	NC_008593	CAATA	2	10	87643	87652	60 %	20 %	0 %	20 %	118444102
97	NC_008593	AAATT	2	10	88516	88525	60 %	40 %	0 %	0 %	118443400
98	NC_008593	AAAAT	2	10	89552	89561	80 %	20 %	0 %	0 %	118443002
99	NC_008593	AAATT	2	10	91058	91067	60 %	40 %	0 %	0 %	118443002
100	NC_008593	AGGAG	2	10	91126	91135	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008593	AAAAT	2	10	91454	91463	80 %	20 %	0 %	0 %	118444261
102	NC_008593	TTAAA	2	10	94248	94257	60 %	40 %	0 %	0 %	118443848
103	NC_008593	ATAAA	2	10	95001	95010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008593	TTTAT	2	10	95034	95043	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008593	TCTTT	2	10	95318	95327	0 %	80 %	0 %	20 %	118443187
106	NC_008593	TTTAT	2	10	96690	96699	20 %	80 %	0 %	0 %	118444097
107	NC_008593	CTTTT	2	10	97292	97301	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008593	ATATA	2	10	97545	97554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008593	TATAT	2	10	98528	98537	40 %	60 %	0 %	0 %	118443234
110	NC_008593	ATTTA	2	10	98624	98633	40 %	60 %	0 %	0 %	118443234
111	NC_008593	ATAAA	2	10	101433	101442	80 %	20 %	0 %	0 %	118444220
112	NC_008593	TGTAT	2	10	101699	101708	20 %	60 %	20 %	0 %	118444220
113	NC_008593	TTATT	2	10	103731	103740	20 %	80 %	0 %	0 %	118443394
114	NC_008593	GTAAT	2	10	103915	103924	40 %	40 %	20 %	0 %	118443394
115	NC_008593	TTAAT	2	10	104772	104781	40 %	60 %	0 %	0 %	118443806
116	NC_008593	CAAGT	2	10	106785	106794	40 %	20 %	20 %	20 %	118443155
117	NC_008593	AAAAT	2	10	108736	108745	80 %	20 %	0 %	0 %	118443995
118	NC_008593	ATATT	2	10	108842	108851	40 %	60 %	0 %	0 %	118443995
119	NC_008593	ATTAG	2	10	108978	108987	40 %	40 %	20 %	0 %	118443995
120	NC_008593	AAAAT	2	10	109654	109663	80 %	20 %	0 %	0 %	118443995
121	NC_008593	ATACA	2	10	110110	110119	60 %	20 %	0 %	20 %	118443995
122	NC_008593	TTCTG	2	10	110433	110442	0 %	60 %	20 %	20 %	118443852
123	NC_008593	TCTTT	2	10	110793	110802	0 %	80 %	0 %	20 %	118443852
124	NC_008593	TAAAG	2	10	112279	112288	60 %	20 %	20 %	0 %	118444265
125	NC_008593	CAATA	2	10	112989	112998	60 %	20 %	0 %	20 %	118444265
126	NC_008593	AATTA	2	10	113633	113642	60 %	40 %	0 %	0 %	118443721
127	NC_008593	TTTGC	2	10	115413	115422	0 %	60 %	20 %	20 %	118444006
128	NC_008593	TAGAA	2	10	116064	116073	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008593	ATTTT	2	10	116518	116527	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008593	TATGG	2	10	116814	116823	20 %	40 %	40 %	0 %	118443984
131	NC_008593	TATTT	2	10	116941	116950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008593	TAAAA	2	10	117084	117093	80 %	20 %	0 %	0 %	118444072
133	NC_008593	GGTTA	2	10	117560	117569	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008593	ACTAT	2	10	118145	118154	40 %	40 %	0 %	20 %	118444591
135	NC_008593	AAAGA	2	10	118360	118369	80 %	0 %	20 %	0 %	118444591
136	NC_008593	TTTAT	2	10	119232	119241	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008593	ATTAT	2	10	120007	120016	40 %	60 %	0 %	0 %	118443707
138	NC_008593	AATGG	2	10	121811	121820	40 %	20 %	40 %	0 %	118443264
139	NC_008593	AACAG	2	10	122359	122368	60 %	0 %	20 %	20 %	118443264
140	NC_008593	ATTTT	2	10	124496	124505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008593	AGAAA	2	10	124989	124998	80 %	0 %	20 %	0 %	118443393
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253	NC_008593	AATTA	2	10	235216	235225	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_008593	TTTTG	2	10	258879	258888	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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