MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium novyi NT chromosome

Total Repeats: 40270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008593	TAA	2	6	96	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008593	ATT	2	6	109	114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008593	TCA	2	6	121	126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008593	ATA	3	9	127	135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008593	AAT	2	6	182	187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008593	CAA	2	6	199	204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008593	GAT	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008593	GAA	2	6	414	419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444385
9	NC_008593	CAT	2	6	421	426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118444385
10	NC_008593	AGA	3	9	431	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444385
11	NC_008593	GAA	2	6	447	452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444385
12	NC_008593	TGG	2	6	480	485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008593	AAT	3	9	632	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443844
14	NC_008593	GTA	2	6	744	749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443844
15	NC_008593	TTG	2	6	777	782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118443844
16	NC_008593	TTA	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443844
17	NC_008593	ATA	2	6	877	882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443513
18	NC_008593	ATA	2	6	892	897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443513
19	NC_008593	TTG	2	6	936	941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118443513
20	NC_008593	TAA	2	6	984	989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443513
21	NC_008593	GTA	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443513
22	NC_008593	AGG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008593	AAT	2	6	1153	1158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442981
24	NC_008593	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442981
25	NC_008593	ATA	2	6	1255	1260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442981
26	NC_008593	ACA	3	9	1377	1385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118442981
27	NC_008593	ATG	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118442981
28	NC_008593	AGG	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118442981
29	NC_008593	ACT	2	6	1443	1448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118442981
30	NC_008593	TAT	2	6	1477	1482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118442981
31	NC_008593	TAA	2	6	1488	1493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442981
32	NC_008593	AAT	2	6	1635	1640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442981
33	NC_008593	ATG	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118442981
34	NC_008593	GAA	2	6	1825	1830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118442981
35	NC_008593	ACA	2	6	1845	1850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008593	AGA	2	6	1935	1940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
37	NC_008593	AGA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
38	NC_008593	AGA	3	9	2154	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
39	NC_008593	AAT	2	6	2275	2280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444639
40	NC_008593	AGA	2	6	2331	2336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
41	NC_008593	GAA	2	6	2485	2490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
42	NC_008593	AGA	2	6	2497	2502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444639
43	NC_008593	TAA	2	6	2555	2560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008593	GAA	2	6	2588	2593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008593	GCG	2	6	2615	2620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118444248
46	NC_008593	CAA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118444248
47	NC_008593	GAT	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444248
48	NC_008593	TAT	2	6	2764	2769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444248
49	NC_008593	CAG	2	6	2838	2843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118444248
50	NC_008593	TGT	2	6	2848	2853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118444248
51	NC_008593	TGG	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118444248
52	NC_008593	GTT	2	6	2876	2881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118444248
53	NC_008593	GAA	2	6	2970	2975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
54	NC_008593	TAA	2	6	3009	3014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444248
55	NC_008593	ATT	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444248
56	NC_008593	AGA	2	6	3145	3150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
57	NC_008593	AGA	2	6	3157	3162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
58	NC_008593	TGA	2	6	3205	3210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444248
59	NC_008593	TTA	2	6	3221	3226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444248
60	NC_008593	AAC	2	6	3361	3366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118444248
61	NC_008593	ATA	2	6	3416	3421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444248
62	NC_008593	TGA	2	6	3445	3450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444248
63	NC_008593	TGT	2	6	3451	3456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118444248
64	NC_008593	AAC	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118444248
65	NC_008593	GAT	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444248
66	NC_008593	TAT	2	6	3594	3599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444248
67	NC_008593	AAG	2	6	3633	3638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
68	NC_008593	AAG	2	6	3711	3716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
69	NC_008593	ATT	2	6	3727	3732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444248
70	NC_008593	AAG	2	6	3786	3791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
71	NC_008593	ACA	2	6	3840	3845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118444248
72	NC_008593	GAA	2	6	3923	3928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444248
73	NC_008593	ATA	2	6	3932	3937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444248
74	NC_008593	TGT	2	6	4084	4089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118443722
75	NC_008593	ATG	2	6	4118	4123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
76	NC_008593	AGG	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118443722
77	NC_008593	AGA	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
78	NC_008593	AAT	3	9	4474	4482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443722
79	NC_008593	GAA	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
80	NC_008593	GAT	2	6	4630	4635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
81	NC_008593	TGA	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
82	NC_008593	CAC	2	6	4770	4775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118443722
83	NC_008593	CTT	2	6	4818	4823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118443722
84	NC_008593	AGA	2	6	4897	4902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
85	NC_008593	GGA	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118443722
86	NC_008593	AAG	2	6	4960	4965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
87	NC_008593	ATG	2	6	4991	4996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
88	NC_008593	ATT	2	6	5077	5082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443722
89	NC_008593	GAA	2	6	5117	5122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
90	NC_008593	TGC	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118443722
91	NC_008593	TGA	2	6	5227	5232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
92	NC_008593	ATG	2	6	5267	5272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
93	NC_008593	ATT	3	9	5293	5301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443722
94	NC_008593	AGA	2	6	5362	5367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
95	NC_008593	AGA	2	6	5404	5409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
96	NC_008593	AAG	2	6	5451	5456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443722
97	NC_008593	CAG	2	6	5484	5489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118443722
98	NC_008593	GTA	2	6	5549	5554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443722
99	NC_008593	CTG	2	6	5808	5813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118443722
100	NC_008593	ACA	2	6	5847	5852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118443722
101	NC_008593	AGG	2	6	5868	5873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118443722
102	NC_008593	GCA	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118444066
103	NC_008593	AAG	2	6	5957	5962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444066
104	NC_008593	TTA	2	6	5990	5995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444066
105	NC_008593	ATA	2	6	6047	6052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444066
106	NC_008593	GGA	2	6	6137	6142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118444066
107	NC_008593	AAT	2	6	6163	6168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444066
108	NC_008593	GAT	2	6	6227	6232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444066
109	NC_008593	ATG	2	6	6255	6260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444066
110	NC_008593	AGA	2	6	6283	6288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444066
111	NC_008593	AGT	2	6	6328	6333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444066
112	NC_008593	TGA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444066
113	NC_008593	AGA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444066
114	NC_008593	AGA	2	6	6508	6513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444066
115	NC_008593	TTA	3	9	6537	6545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444066
116	NC_008593	ATT	2	6	6635	6640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008593	ATT	2	6	6745	6750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443812
118	NC_008593	TGA	2	6	6795	6800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443812
119	NC_008593	AGA	2	6	6858	6863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443812
120	NC_008593	AGA	2	6	6892	6897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443812
121	NC_008593	AGC	2	6	6903	6908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118443812
122	NC_008593	AAG	2	6	6926	6931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443812
123	NC_008593	AGA	2	6	7020	7025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443812
124	NC_008593	CTA	2	6	7106	7111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118443812
125	NC_008593	ACA	2	6	7155	7160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118443812
126	NC_008593	AAT	2	6	7171	7176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443812
127	NC_008593	AGA	2	6	7281	7286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443812
128	NC_008593	TAA	2	6	7466	7471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443812
129	NC_008593	TAA	2	6	7492	7497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008593	ACT	3	9	7739	7747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118443230
131	NC_008593	TAT	2	6	7791	7796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443230
132	NC_008593	ACA	2	6	7823	7828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118443230
133	NC_008593	ATG	2	6	7872	7877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443230
134	NC_008593	AGA	2	6	7900	7905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443230
135	NC_008593	TCC	2	6	8071	8076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118443230
136	NC_008593	TGC	2	6	8110	8115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118443230
137	NC_008593	AAG	2	6	8286	8291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443230
138	NC_008593	TAC	2	6	8323	8328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118443230
139	NC_008593	ATG	2	6	8388	8393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443230
140	NC_008593	TTA	2	6	8426	8431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443230
141	NC_008593	AGA	2	6	8519	8524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443024
142	NC_008593	TGA	2	6	8606	8611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443024
143	NC_008593	AAT	2	6	8618	8623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443024
144	NC_008593	AAT	2	6	8654	8659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443024
145	NC_008593	AGA	2	6	8715	8720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443024
146	NC_008593	GCT	2	6	8727	8732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118443024
147	NC_008593	CAG	2	6	8758	8763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118443024
148	NC_008593	TTA	2	6	8764	8769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443024
149	NC_008593	AGA	2	6	8825	8830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443024
150	NC_008593	AGA	2	6	8843	8848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443024
151	NC_008593	TGA	2	6	8873	8878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443024
152	NC_008593	AAG	2	6	8893	8898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443024
153	NC_008593	ATT	2	6	8951	8956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443024
154	NC_008593	TAA	2	6	8998	9003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443024
155	NC_008593	TAT	2	6	9025	9030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443024
156	NC_008593	AGA	2	6	9035	9040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443024
157	NC_008593	ATA	2	6	9072	9077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443024
158	NC_008593	TAT	2	6	9110	9115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443024
159	NC_008593	GAC	2	6	9153	9158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118443024
160	NC_008593	AGT	2	6	9221	9226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443024
161	NC_008593	ATT	2	6	9268	9273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443024
162	NC_008593	AAT	2	6	9293	9298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443024
163	NC_008593	GGA	2	6	9349	9354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_008593	AAT	2	6	9371	9376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443471
165	NC_008593	ATA	2	6	9405	9410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443471
166	NC_008593	GTT	2	6	9423	9428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118443471
167	NC_008593	TAC	2	6	9436	9441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118443471
168	NC_008593	ATG	2	6	9447	9452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443471
169	NC_008593	AAG	2	6	9494	9499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443471
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171	NC_008593	CTT	2	6	9544	9549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118443471
172	NC_008593	AGA	2	6	9575	9580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443471
173	NC_008593	CAA	3	9	9600	9608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118443471
174	NC_008593	TTA	2	6	9708	9713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443471
175	NC_008593	AAT	2	6	9720	9725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443471
176	NC_008593	GTT	2	6	9732	9737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118443471
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179	NC_008593	AAG	2	6	9829	9834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443471
180	NC_008593	TAA	2	6	9838	9843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443471
181	NC_008593	AGA	2	6	9860	9865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443471
182	NC_008593	ATT	2	6	9974	9979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444149
183	NC_008593	TGA	2	6	10005	10010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118444149
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188	NC_008593	ATT	2	6	10419	10424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444149
189	NC_008593	TAT	2	6	10519	10524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444149
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192	NC_008593	AAT	2	6	10582	10587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_008593	TTG	2	6	10711	10716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118444555
194	NC_008593	ATA	2	6	10794	10799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444555
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197	NC_008593	ATT	2	6	11307	11312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_008593	TAT	2	6	11318	11323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_008593	ATT	2	6	11324	11329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_008593	TAT	2	6	11338	11343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_008593	ATA	2	6	11361	11366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_008593	AAT	2	6	11391	11396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_008593	TAT	2	6	11416	11421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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223	NC_008593	TGG	2	6	12460	12465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118443896
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240	NC_008593	GGA	2	6	13280	13285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
241	NC_008593	TAT	2	6	13334	13339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443356
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249	NC_008593	ATA	2	6	13890	13895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443356
250	NC_008593	ATT	2	6	13974	13979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443356
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252	NC_008593	ATA	2	6	14076	14081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443356
253	NC_008593	AAG	2	6	14123	14128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443356
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256	NC_008593	CAA	2	6	14196	14201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118443356
257	NC_008593	AAT	2	6	14296	14301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444184
258	NC_008593	AGG	2	6	14385	14390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118444184
259	NC_008593	TTC	2	6	14393	14398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118444184
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