MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Solibacter usitatus Ellin6076 chromosome

Total Repeats: 6733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008536	CAAAG	2	10	122	131	60 %	0 %	20 %	20 %	116619146
2	NC_008536	CGCCT	2	10	2156	2165	0 %	20 %	20 %	60 %	116619147
3	NC_008536	GACGC	2	10	3998	4007	20 %	0 %	40 %	40 %	116619148
4	NC_008536	CTTTT	2	10	5314	5323	0 %	80 %	0 %	20 %	116619149
5	NC_008536	GCGCC	2	10	5435	5444	0 %	0 %	40 %	60 %	116619149
6	NC_008536	AGCGC	2	10	6620	6629	20 %	0 %	40 %	40 %	116619149
7	NC_008536	CTCAC	2	10	6831	6840	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_008536	CTTGG	2	10	7376	7385	0 %	40 %	40 %	20 %	116619150
9	NC_008536	GCCGC	2	10	10865	10874	0 %	0 %	40 %	60 %	116619152
10	NC_008536	CAATT	2	10	12216	12225	40 %	40 %	0 %	20 %	116619154
11	NC_008536	AACTG	2	10	12398	12407	40 %	20 %	20 %	20 %	116619154
12	NC_008536	CATCG	2	10	13006	13015	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_008536	CGGCT	2	10	15136	15145	0 %	20 %	40 %	40 %	116619157
14	NC_008536	CCCCG	2	10	19470	19479	0 %	0 %	20 %	80 %	116619158
15	NC_008536	TTCCA	2	10	20077	20086	20 %	40 %	0 %	40 %	116619159
16	NC_008536	CCTGG	2	10	21978	21987	0 %	20 %	40 %	40 %	116619160
17	NC_008536	GCAAC	2	10	24957	24966	40 %	0 %	20 %	40 %	116619163
18	NC_008536	ATCGC	2	10	25729	25738	20 %	20 %	20 %	40 %	116619164
19	NC_008536	GCACC	2	10	26519	26528	20 %	0 %	20 %	60 %	116619164
20	NC_008536	CCGCG	2	10	27465	27474	0 %	0 %	40 %	60 %	116619165
21	NC_008536	CGGGG	2	10	29611	29620	0 %	0 %	80 %	20 %	116619166
22	NC_008536	ACGCC	2	10	31179	31188	20 %	0 %	20 %	60 %	116619166
23	NC_008536	GCGCG	2	10	36365	36374	0 %	0 %	60 %	40 %	116619169
24	NC_008536	TGGCA	2	10	37017	37026	20 %	20 %	40 %	20 %	116619169
25	NC_008536	CATCA	2	10	38236	38245	40 %	20 %	0 %	40 %	116619170
26	NC_008536	GGGGA	2	10	38761	38770	20 %	0 %	80 %	0 %	116619171
27	NC_008536	GGCGG	2	10	41058	41067	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008536	GGACG	2	10	41782	41791	20 %	0 %	60 %	20 %	116619174
29	NC_008536	TGAGC	2	10	43507	43516	20 %	20 %	40 %	20 %	116619174
30	NC_008536	GCAGG	2	10	44167	44176	20 %	0 %	60 %	20 %	116619175
31	NC_008536	GGCGG	2	10	44849	44858	0 %	0 %	80 %	20 %	116619175
32	NC_008536	GCGGA	2	10	45381	45390	20 %	0 %	60 %	20 %	116619175
33	NC_008536	CTGAC	2	10	46351	46360	20 %	20 %	20 %	40 %	116619175
34	NC_008536	GGACG	2	10	47291	47300	20 %	0 %	60 %	20 %	116619175
35	NC_008536	CGTCG	2	10	47831	47840	0 %	20 %	40 %	40 %	116619176
36	NC_008536	GAGCG	2	10	49844	49853	20 %	0 %	60 %	20 %	116619179
37	NC_008536	GCGCG	2	10	50678	50687	0 %	0 %	60 %	40 %	116619179
38	NC_008536	GGCGT	2	10	54167	54176	0 %	20 %	60 %	20 %	116619180
39	NC_008536	CCGCC	2	10	57557	57566	0 %	0 %	20 %	80 %	116619182
40	NC_008536	CCCCG	2	10	58302	58311	0 %	0 %	20 %	80 %	116619182
41	NC_008536	GGCAG	2	10	60065	60074	20 %	0 %	60 %	20 %	116619183
42	NC_008536	GGCGA	2	10	60637	60646	20 %	0 %	60 %	20 %	116619183
43	NC_008536	CGGGC	2	10	62350	62359	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_008536	CCGTG	2	10	62380	62389	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_008536	CGGCG	2	10	63177	63186	0 %	0 %	60 %	40 %	116619185
46	NC_008536	CCGTC	2	10	63586	63595	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_008536	TAATA	2	10	65666	65675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008536	CCGAC	2	10	66772	66781	20 %	0 %	20 %	60 %	116619187
49	NC_008536	ACCGG	2	10	69072	69081	20 %	0 %	40 %	40 %	116619187
50	NC_008536	CGGGC	2	10	69113	69122	0 %	0 %	60 %	40 %	116619187
51	NC_008536	GACTC	2	10	69637	69646	20 %	20 %	20 %	40 %	116619188
52	NC_008536	CAGGT	2	10	76815	76824	20 %	20 %	40 %	20 %	116619195
53	NC_008536	CAGGT	2	10	76830	76839	20 %	20 %	40 %	20 %	116619195
54	NC_008536	CAGGT	2	10	76845	76854	20 %	20 %	40 %	20 %	116619195
55	NC_008536	CAGGT	2	10	76860	76869	20 %	20 %	40 %	20 %	116619195
56	NC_008536	ACGGT	2	10	81582	81591	20 %	20 %	40 %	20 %	116619198
57	NC_008536	GCAAC	2	10	81679	81688	40 %	0 %	20 %	40 %	116619198
58	NC_008536	CTGAT	2	10	82340	82349	20 %	40 %	20 %	20 %	116619199
59	NC_008536	GATGC	2	10	84010	84019	20 %	20 %	40 %	20 %	116619202
60	NC_008536	GCGCA	2	10	84880	84889	20 %	0 %	40 %	40 %	116619202
61	NC_008536	GCAGA	2	10	85331	85340	40 %	0 %	40 %	20 %	116619203
62	NC_008536	ACGGT	2	10	85619	85628	20 %	20 %	40 %	20 %	116619203
63	NC_008536	GCGCC	2	10	88849	88858	0 %	0 %	40 %	60 %	116619205
64	NC_008536	GCCGA	2	10	89188	89197	20 %	0 %	40 %	40 %	116619205
65	NC_008536	GCGAT	2	10	89582	89591	20 %	20 %	40 %	20 %	116619206
66	NC_008536	CTGCG	2	10	90471	90480	0 %	20 %	40 %	40 %	116619207
67	NC_008536	GCGCT	2	10	91637	91646	0 %	20 %	40 %	40 %	116619208
68	NC_008536	CGGGT	2	10	92964	92973	0 %	20 %	60 %	20 %	116619209
69	NC_008536	GCGGG	2	10	93697	93706	0 %	0 %	80 %	20 %	116619210
70	NC_008536	CGCGT	2	10	95150	95159	0 %	20 %	40 %	40 %	116619211
71	NC_008536	TGCGG	2	10	95290	95299	0 %	20 %	60 %	20 %	116619211
72	NC_008536	GCCCG	2	10	97741	97750	0 %	0 %	40 %	60 %	116619213
73	NC_008536	CGATG	2	10	97961	97970	20 %	20 %	40 %	20 %	116619214
74	NC_008536	CCGCG	2	10	102512	102521	0 %	0 %	40 %	60 %	116619216
75	NC_008536	AGCGC	2	10	105946	105955	20 %	0 %	40 %	40 %	116619219
76	NC_008536	CATTC	2	10	106459	106468	20 %	40 %	0 %	40 %	116619219
77	NC_008536	AAGAG	2	10	108207	108216	60 %	0 %	40 %	0 %	116619221
78	NC_008536	GCCGC	2	10	109227	109236	0 %	0 %	40 %	60 %	116619222
79	NC_008536	TGCTC	2	10	109380	109389	0 %	40 %	20 %	40 %	116619222
80	NC_008536	GTCTG	2	10	111523	111532	0 %	40 %	40 %	20 %	116619224
81	NC_008536	GCCAC	2	10	114543	114552	20 %	0 %	20 %	60 %	116619226
82	NC_008536	CGAAC	2	10	114891	114900	40 %	0 %	20 %	40 %	116619226
83	NC_008536	ATTCG	2	10	115522	115531	20 %	40 %	20 %	20 %	116619227
84	NC_008536	CGCGC	2	10	115854	115863	0 %	0 %	40 %	60 %	116619228
85	NC_008536	GCCAC	2	10	116459	116468	20 %	0 %	20 %	60 %	116619228
86	NC_008536	CCGCG	2	10	117608	117617	0 %	0 %	40 %	60 %	116619229
87	NC_008536	CCGTG	2	10	118264	118273	0 %	20 %	40 %	40 %	116619230
88	NC_008536	CGATG	2	10	119141	119150	20 %	20 %	40 %	20 %	116619230
89	NC_008536	CCGGC	2	10	120429	120438	0 %	0 %	40 %	60 %	116619231
90	NC_008536	CGCCT	2	10	120926	120935	0 %	20 %	20 %	60 %	116619232
91	NC_008536	GCCCA	2	10	121915	121924	20 %	0 %	20 %	60 %	116619233
92	NC_008536	CGGCC	2	10	122412	122421	0 %	0 %	40 %	60 %	116619233
93	NC_008536	GCTGC	2	10	122690	122699	0 %	20 %	40 %	40 %	116619234
94	NC_008536	CGAAT	2	10	124403	124412	40 %	20 %	20 %	20 %	116619235
95	NC_008536	TCGTG	2	10	124947	124956	0 %	40 %	40 %	20 %	116619235
96	NC_008536	GATCA	2	10	125596	125605	40 %	20 %	20 %	20 %	116619235
97	NC_008536	CCTGG	2	10	127570	127579	0 %	20 %	40 %	40 %	116619237
98	NC_008536	CGCGC	2	10	128356	128365	0 %	0 %	40 %	60 %	116619238
99	NC_008536	GAGAG	2	10	130295	130304	40 %	0 %	60 %	0 %	116619239
100	NC_008536	GCGCC	2	10	131554	131563	0 %	0 %	40 %	60 %	116619239
101	NC_008536	CCGGA	2	10	135962	135971	20 %	0 %	40 %	40 %	116619243
102	NC_008536	TTGGG	2	10	138004	138013	0 %	40 %	60 %	0 %	116619246
103	NC_008536	TGGCA	2	10	140745	140754	20 %	20 %	40 %	20 %	116619248
104	NC_008536	CACGG	2	10	141821	141830	20 %	0 %	40 %	40 %	116619248
105	NC_008536	GCCGG	2	10	142126	142135	0 %	0 %	60 %	40 %	116619248
106	NC_008536	GTGCG	2	10	145908	145917	0 %	20 %	60 %	20 %	116619249
107	NC_008536	AAGGA	2	10	146284	146293	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008536	CAGGC	2	10	150281	150290	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_008536	CGCGG	2	10	153857	153866	0 %	0 %	60 %	40 %	116619258
110	NC_008536	ACTCG	2	10	154483	154492	20 %	20 %	20 %	40 %	116619259
111	NC_008536	AACCG	2	10	156474	156483	40 %	0 %	20 %	40 %	116619261
112	NC_008536	CGCAC	2	10	162667	162676	20 %	0 %	20 %	60 %	116619265
113	NC_008536	TCCGC	2	10	164352	164361	0 %	20 %	20 %	60 %	116619266
114	NC_008536	CCTGC	2	10	165198	165207	0 %	20 %	20 %	60 %	116619266
115	NC_008536	TCCCC	2	10	165778	165787	0 %	20 %	0 %	80 %	116619266
116	NC_008536	TAAAC	2	10	165788	165797	60 %	20 %	0 %	20 %	116619266
117	NC_008536	ATCAC	2	10	166687	166696	40 %	20 %	0 %	40 %	116619267
118	NC_008536	AACCA	2	10	166720	166729	60 %	0 %	0 %	40 %	116619267
119	NC_008536	CTCAC	2	10	171769	171778	20 %	20 %	0 %	60 %	116619274
120	NC_008536	GCTCC	2	10	172018	172027	0 %	20 %	20 %	60 %	116619274
121	NC_008536	GACCA	2	10	174097	174106	40 %	0 %	20 %	40 %	116619276
122	NC_008536	GCCCG	2	10	176246	176255	0 %	0 %	40 %	60 %	116619280
123	NC_008536	TCGGC	2	10	177209	177218	0 %	20 %	40 %	40 %	116619281
124	NC_008536	GCGCC	2	10	177255	177264	0 %	0 %	40 %	60 %	116619281
125	NC_008536	TGCGC	2	10	178570	178579	0 %	20 %	40 %	40 %	116619282
126	NC_008536	CGGTG	2	10	179351	179360	0 %	20 %	60 %	20 %	116619283
127	NC_008536	GCCGG	2	10	179750	179759	0 %	0 %	60 %	40 %	116619283
128	NC_008536	ATGCG	2	10	180452	180461	20 %	20 %	40 %	20 %	116619283
129	NC_008536	GGAAT	2	10	181136	181145	40 %	20 %	40 %	0 %	116619283
130	NC_008536	TGGTT	2	10	182438	182447	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008536	CGGCA	2	10	182699	182708	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_008536	TGGAG	2	10	183149	183158	20 %	20 %	60 %	0 %	116619284
133	NC_008536	GGCGC	2	10	184217	184226	0 %	0 %	60 %	40 %	116619284
134	NC_008536	TCCGG	2	10	184734	184743	0 %	20 %	40 %	40 %	116619284
135	NC_008536	GCTCC	2	10	184929	184938	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_008536	CTGGG	2	10	187528	187537	0 %	20 %	60 %	20 %	116619289
137	NC_008536	AGCCG	2	10	187991	188000	20 %	0 %	40 %	40 %	116619291
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150	NC_008536	TCGAT	2	10	213683	213692	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_008536	CGTGA	2	10	213720	213729	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_008536	GGCGC	2	10	215844	215853	0 %	0 %	60 %	40 %	116619310
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156	NC_008536	CGTCG	2	10	224855	224864	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
157	NC_008536	TCGCC	2	10	229650	229659	0 %	20 %	20 %	60 %	116619323
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234	NC_008536	GCAGC	2	10	328950	328959	20 %	0 %	40 %	40 %	116619385
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243	NC_008536	GCACC	2	10	341524	341533	20 %	0 %	20 %	60 %	116619397
244	NC_008536	GCGAA	2	10	342894	342903	40 %	0 %	40 %	20 %	116619398
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248	NC_008536	GTTCC	2	10	348321	348330	0 %	40 %	20 %	40 %	116619403
249	NC_008536	CTGGC	2	10	354329	354338	0 %	20 %	40 %	40 %	116619408
250	NC_008536	GGCGC	2	10	356292	356301	0 %	0 %	60 %	40 %	116619409
251	NC_008536	ACCAG	2	10	357714	357723	40 %	0 %	20 %	40 %	116619410
252	NC_008536	CGGCG	2	10	358057	358066	0 %	0 %	60 %	40 %	116619411
253	NC_008536	AGGGC	2	10	358330	358339	20 %	0 %	60 %	20 %	116619411
254	NC_008536	GCGCA	2	10	358365	358374	20 %	0 %	40 %	40 %	116619411
255	NC_008536	CCATC	2	10	360038	360047	20 %	20 %	0 %	60 %	116619413
256	NC_008536	GCGAT	2	10	363590	363599	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
257	NC_008536	AATCA	2	10	363978	363987	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
258	NC_008536	CTGGG	2	10	364672	364681	0 %	20 %	60 %	20 %	116619415
259	NC_008536	TGGGA	2	10	365408	365417	20 %	20 %	60 %	0 %	116619415
260	NC_008536	TACAT	2	10	368093	368102	40 %	40 %	0 %	20 %	116619416
261	NC_008536	ACTGG	2	10	372525	372534	20 %	20 %	40 %	20 %	116619418
262	NC_008536	ACCGG	2	10	372647	372656	20 %	0 %	40 %	40 %	116619418
263	NC_008536	CTTGC	2	10	373186	373195	0 %	40 %	20 %	40 %	116619418
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