MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Carsonella ruddii PV

Total Repeats: 209

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008512	ATTTTA	2	12	506	517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334903
2	NC_008512	AGAATT	2	12	1487	1498	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116334904
3	NC_008512	TTAAAT	2	12	2662	2673	50 %	50 %	0 %	0 %	116334904
4	NC_008512	ATTTAA	2	12	2840	2851	50 %	50 %	0 %	0 %	116334905
5	NC_008512	AAATTG	2	12	3080	3091	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116334905
6	NC_008512	AAATAT	2	12	3102	3113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334905
7	NC_008512	ATCTTT	2	12	3282	3293	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116334905
8	NC_008512	TTTTAT	2	12	3423	3434	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116334905
9	NC_008512	ATTAAT	2	12	5591	5602	50 %	50 %	0 %	0 %	116334909
10	NC_008512	AAATTG	2	12	5710	5721	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116334909
11	NC_008512	TTTAAT	2	12	6079	6090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334910
12	NC_008512	TATAAT	2	12	6353	6364	50 %	50 %	0 %	0 %	116334910
13	NC_008512	CCAATT	4	24	11043	11066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334915
14	NC_008512	ACAAAA	2	12	13313	13324	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	116334917
15	NC_008512	ATAACT	2	12	14948	14959	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116334919
16	NC_008512	AATTCC	2	12	15334	15345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334920
17	NC_008512	TATTTG	2	12	15579	15590	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116334920
18	NC_008512	TTTAAT	2	12	15812	15823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334920
19	NC_008512	AAATAA	2	12	17542	17553	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116334923
20	NC_008512	GAATAT	2	12	18375	18386	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116334924
21	NC_008512	AAAAAT	2	12	19365	19376	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116334925
22	NC_008512	AGATTT	2	12	19710	19721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116334925
23	NC_008512	AATTAA	2	12	21771	21782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334925
24	NC_008512	AAAAAT	2	12	22103	22114	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116334926
25	NC_008512	ATTTTT	2	12	22395	22406	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008512	AATTAA	2	12	23395	23406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334927
27	NC_008512	AAATAT	2	12	24734	24745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334928
28	NC_008512	TAAAAA	2	12	25127	25138	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116334929
29	NC_008512	AATTAT	2	12	27536	27547	50 %	50 %	0 %	0 %	116334931
30	NC_008512	TAAAAA	2	12	28449	28460	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116334932
31	NC_008512	GATAAA	2	12	28660	28671	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116334932
32	NC_008512	ATTTTA	2	12	29477	29488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334933
33	NC_008512	TAAAAT	2	12	30148	30159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334933
34	NC_008512	ATTAAA	2	12	31666	31677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334934
35	NC_008512	AAATTT	2	12	31716	31727	50 %	50 %	0 %	0 %	116334935
36	NC_008512	ATTTTT	2	12	32103	32114	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116334935
37	NC_008512	AATTTT	2	12	32130	32141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334935
38	NC_008512	ATTTAA	2	12	33564	33575	50 %	50 %	0 %	0 %	116334937
39	NC_008512	TTAAAA	2	12	33894	33905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334937
40	NC_008512	TTTACT	2	12	35291	35302	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116334939
41	NC_008512	ATTAAA	2	12	36092	36103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334941
42	NC_008512	ATTGAA	2	12	36710	36721	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116334941
43	NC_008512	ATAATT	2	12	37010	37021	50 %	50 %	0 %	0 %	116334941
44	NC_008512	TAAAGT	2	12	37778	37789	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116334942
45	NC_008512	TAAATT	2	12	38162	38173	50 %	50 %	0 %	0 %	116334942
46	NC_008512	TTAAAA	2	12	38646	38657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334943
47	NC_008512	TATCAA	2	12	39350	39361	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116334944
48	NC_008512	ATTTTT	2	12	40409	40420	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116334945
49	NC_008512	TCATAA	2	12	40700	40711	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116334945
50	NC_008512	TGTTTT	2	12	41502	41513	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	116334946
51	NC_008512	TTTAAT	2	12	42312	42323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334948
52	NC_008512	TAAAAA	2	12	42763	42774	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116334949
53	NC_008512	TAAAAA	2	12	43048	43059	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116334949
54	NC_008512	TAAAAT	2	12	43845	43856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334950
55	NC_008512	ATTTTA	2	12	44574	44585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334951
56	NC_008512	ATTTTA	2	12	45191	45202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334952
57	NC_008512	TAAAAA	2	12	45458	45469	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116334952
58	NC_008512	ATTTCT	2	12	46621	46632	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116334953
59	NC_008512	AATTAA	2	12	47121	47132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334953
60	NC_008512	TTTTAA	2	12	48142	48153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008512	TGTTAT	2	12	48812	48823	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116334955
62	NC_008512	ATTTTA	2	12	50107	50118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334957
63	NC_008512	TTAAAA	2	12	50813	50824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334958
64	NC_008512	ATAGGT	2	12	51562	51573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334960
65	NC_008512	TTTAAT	2	12	51619	51630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334960
66	NC_008512	TAAAAA	2	12	52004	52015	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116334961
67	NC_008512	TTAATT	2	12	52558	52569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334961
68	NC_008512	AAAATT	2	12	53538	53549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334962
69	NC_008512	TAGAAA	2	12	55936	55947	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116334964
70	NC_008512	TTTTAA	2	12	56843	56854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334966
71	NC_008512	TTTAAT	2	12	56976	56987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334966
72	NC_008512	TTTAAA	2	12	58641	58652	50 %	50 %	0 %	0 %	116334969
73	NC_008512	GAATTA	2	12	58864	58875	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116334969
74	NC_008512	TATAAA	2	12	60177	60188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334969
75	NC_008512	TTAGAT	2	12	60364	60375	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116334969
76	NC_008512	AATTTT	2	12	61918	61929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334970
77	NC_008512	ATGATA	2	12	62370	62381	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116334970
78	NC_008512	AATTAA	2	12	62704	62715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334970
79	NC_008512	TATAAT	2	12	63163	63174	50 %	50 %	0 %	0 %	116334972
80	NC_008512	AAAATT	2	12	64619	64630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334973
81	NC_008512	ATTTTT	2	12	64879	64890	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116334973
82	NC_008512	ATTAGA	2	12	66039	66050	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116334975
83	NC_008512	TTAATT	2	12	66976	66987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334975
84	NC_008512	ATAATT	2	12	67309	67320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008512	AAAATT	2	12	68262	68273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334977
86	NC_008512	ATAAAA	2	12	68503	68514	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116334977
87	NC_008512	GTTTAA	2	12	68974	68985	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116334977
88	NC_008512	TAAAAA	2	12	69059	69070	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116334977
89	NC_008512	TTCCTT	2	12	71128	71139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334979
90	NC_008512	GAATAG	2	12	72172	72183	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116334979
91	NC_008512	ACTTTA	2	12	73320	73331	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116334980
92	NC_008512	TTTTAA	2	12	74140	74151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334980
93	NC_008512	TAATTA	2	12	74212	74223	50 %	50 %	0 %	0 %	116334980
94	NC_008512	TAAAAA	2	12	75206	75217	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116334981
95	NC_008512	TGATTT	2	12	76857	76868	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116334982
96	NC_008512	ATTAAA	2	12	78871	78882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334985
97	NC_008512	TAATTA	2	12	79628	79639	50 %	50 %	0 %	0 %	116334986
98	NC_008512	ATTTAT	2	12	82110	82121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334990
99	NC_008512	TTTAAA	2	12	82729	82740	50 %	50 %	0 %	0 %	116334990
100	NC_008512	TTTTTA	2	12	83290	83301	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116334990
101	NC_008512	ATACCT	2	12	83372	83383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334991
102	NC_008512	TTCCTA	2	12	83439	83450	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116334991
103	NC_008512	TTTTTA	2	12	85923	85934	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116334995
104	NC_008512	AAATTA	2	12	85983	85994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334995
105	NC_008512	AAATTT	2	12	86159	86170	50 %	50 %	0 %	0 %	116334996
106	NC_008512	ATAAAA	2	12	86818	86829	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116334996
107	NC_008512	TAAAAT	2	12	87161	87172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334998
108	NC_008512	TATTAA	2	12	87199	87210	50 %	50 %	0 %	0 %	116334998
109	NC_008512	TTTTAA	2	12	88064	88075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334998
110	NC_008512	AAAAAT	2	12	88375	88386	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116334999
111	NC_008512	TTATAA	2	12	88403	88414	50 %	50 %	0 %	0 %	116334999
112	NC_008512	TCAAAA	2	12	89951	89962	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116335000
113	NC_008512	TAAAAT	2	12	91438	91449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116335002
114	NC_008512	TTAAAT	2	12	92451	92462	50 %	50 %	0 %	0 %	116335003
115	NC_008512	AAATTT	2	12	92702	92713	50 %	50 %	0 %	0 %	116335003
116	NC_008512	TATATT	2	12	92749	92760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116335003
117	NC_008512	TTTTTA	2	12	93197	93208	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116335003
118	NC_008512	TAAAAA	2	12	93957	93968	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116335004
119	NC_008512	TCAAAA	2	12	94310	94321	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116335004
120	NC_008512	TAAAAA	2	12	94377	94388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116335004
121	NC_008512	TTTAAT	2	12	94901	94912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116335005
122	NC_008512	AGTATA	2	12	97118	97129	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008512	ATTGTT	2	12	97593	97604	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116335009
124	NC_008512	TAAAAA	2	12	98110	98121	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116335009
125	NC_008512	TTAAAT	2	12	98232	98243	50 %	50 %	0 %	0 %	116335009
126	NC_008512	ATAAAC	2	12	98704	98715	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116335009
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.