MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Clostridium perfringens SM101 plasmid pSM101A

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008263	A	7	7	507	513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008263	A	7	7	705	711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008263	A	6	6	1181	1186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008263	T	7	7	1200	1206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008263	A	6	6	1490	1495	100 %	0 %	0 %	0 %	110804002
6	NC_008263	A	7	7	1666	1672	100 %	0 %	0 %	0 %	110804002
7	NC_008263	T	8	8	1778	1785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008263	A	6	6	1826	1831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008263	A	7	7	2052	2058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008263	A	6	6	2645	2650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008263	A	6	6	2657	2662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008263	T	6	6	2674	2679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008263	T	6	6	2829	2834	0 %	100 %	0 %	0 %	110804005
14	NC_008263	T	6	6	3384	3389	0 %	100 %	0 %	0 %	110804005
15	NC_008263	T	6	6	3423	3428	0 %	100 %	0 %	0 %	110804005
16	NC_008263	A	6	6	3711	3716	100 %	0 %	0 %	0 %	110804005
17	NC_008263	T	7	7	3900	3906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008263	A	6	6	3952	3957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008263	A	6	6	4094	4099	100 %	0 %	0 %	0 %	110804004
20	NC_008263	A	6	6	4180	4185	100 %	0 %	0 %	0 %	110804004
21	NC_008263	A	7	7	4228	4234	100 %	0 %	0 %	0 %	110804004
22	NC_008263	T	6	6	4331	4336	0 %	100 %	0 %	0 %	110804004
23	NC_008263	A	6	6	4519	4524	100 %	0 %	0 %	0 %	110804004
24	NC_008263	A	6	6	4752	4757	100 %	0 %	0 %	0 %	110804000
25	NC_008263	A	6	6	4773	4778	100 %	0 %	0 %	0 %	110804000
26	NC_008263	A	6	6	4801	4806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008263	A	7	7	4813	4819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008263	T	7	7	4825	4831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008263	A	6	6	4853	4858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008263	T	6	6	6930	6935	0 %	100 %	0 %	0 %	110804003
31	NC_008263	A	7	7	7112	7118	100 %	0 %	0 %	0 %	110804003
32	NC_008263	A	6	6	7687	7692	100 %	0 %	0 %	0 %	110804003
33	NC_008263	A	6	6	7908	7913	100 %	0 %	0 %	0 %	110804003
34	NC_008263	T	6	6	8581	8586	0 %	100 %	0 %	0 %	110804007
35	NC_008263	T	7	7	8588	8594	0 %	100 %	0 %	0 %	110804007
36	NC_008263	A	6	6	8615	8620	100 %	0 %	0 %	0 %	110804007
37	NC_008263	A	6	6	8897	8902	100 %	0 %	0 %	0 %	110804007
38	NC_008263	A	6	6	8917	8922	100 %	0 %	0 %	0 %	110804007
39	NC_008263	A	6	6	9019	9024	100 %	0 %	0 %	0 %	110804007
40	NC_008263	T	7	7	9112	9118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008263	A	6	6	9171	9176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008263	A	7	7	9234	9240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008263	A	9	9	9316	9324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008263	T	7	7	9608	9614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008263	A	6	6	9639	9644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008263	A	6	6	9683	9688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008263	G	8	8	10011	10018	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008263	A	7	7	10076	10082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008263	A	7	7	10110	10116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008263	A	7	7	10363	10369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008263	A	7	7	10713	10719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008263	T	7	7	10772	10778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008263	T	7	7	10867	10873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008263	A	6	6	11011	11016	100 %	0 %	0 %	0 %	110803999
55	NC_008263	A	7	7	11031	11037	100 %	0 %	0 %	0 %	110803999
56	NC_008263	A	7	7	11042	11048	100 %	0 %	0 %	0 %	110803999
57	NC_008263	A	6	6	11106	11111	100 %	0 %	0 %	0 %	110803999
58	NC_008263	A	6	6	11119	11124	100 %	0 %	0 %	0 %	110803999
59	NC_008263	A	8	8	11126	11133	100 %	0 %	0 %	0 %	110803999
60	NC_008263	A	7	7	11176	11182	100 %	0 %	0 %	0 %	110804006
61	NC_008263	A	6	6	11289	11294	100 %	0 %	0 %	0 %	110804006
62	NC_008263	A	6	6	11370	11375	100 %	0 %	0 %	0 %	110804006
63	NC_008263	T	6	6	11570	11575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008263	T	6	6	11613	11618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008263	A	6	6	11726	11731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008263	T	6	6	11733	11738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008263	T	6	6	11752	11757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008263	T	7	7	11784	11790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008263	A	7	7	11851	11857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008263	T	8	8	12033	12040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008263	T	7	7	12046	12052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008263	T	6	6	12065	12070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008263	A	6	6	12095	12100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008263	T	6	6	12117	12122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008263	A	6	6	12138	12143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008263	T	6	6	12183	12188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008263	T	7	7	12324	12330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.