MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium perfringens SM101 plasmid pSM101A

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008263	ATTT	2	8	994	1001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008263	AATT	2	8	1106	1113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008263	TATT	2	8	1145	1152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008263	ATTA	2	8	1209	1216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008263	AGAA	2	8	1358	1365	75 %	0 %	25 %	0 %	110804002
6	NC_008263	AAAG	2	8	1368	1375	75 %	0 %	25 %	0 %	110804002
7	NC_008263	TAAT	2	8	1876	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008263	TAGA	2	8	2103	2110	50 %	25 %	25 %	0 %	110804008
9	NC_008263	TAGA	2	8	2295	2302	50 %	25 %	25 %	0 %	110804008
10	NC_008263	AAAC	2	8	2567	2574	75 %	0 %	0 %	25 %	110804008
11	NC_008263	ATTA	2	8	2897	2904	50 %	50 %	0 %	0 %	110804005
12	NC_008263	TTTA	2	8	3209	3216	25 %	75 %	0 %	0 %	110804005
13	NC_008263	AAAC	2	8	3306	3313	75 %	0 %	0 %	25 %	110804005
14	NC_008263	TTTA	2	8	3341	3348	25 %	75 %	0 %	0 %	110804005
15	NC_008263	AAAT	3	12	3523	3534	75 %	25 %	0 %	0 %	110804005
16	NC_008263	TTTA	2	8	3772	3779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008263	ATGA	2	8	4118	4125	50 %	25 %	25 %	0 %	110804004
18	NC_008263	TAAA	2	8	4254	4261	75 %	25 %	0 %	0 %	110804004
19	NC_008263	AGAA	2	8	4408	4415	75 %	0 %	25 %	0 %	110804004
20	NC_008263	TTAG	2	8	4550	4557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008263	GTAA	2	8	5536	5543	50 %	25 %	25 %	0 %	110804003
22	NC_008263	AACT	2	8	5646	5653	50 %	25 %	0 %	25 %	110804003
23	NC_008263	ATGG	2	8	6008	6015	25 %	25 %	50 %	0 %	110804003
24	NC_008263	ATGG	2	8	6110	6117	25 %	25 %	50 %	0 %	110804003
25	NC_008263	TAAA	2	8	6551	6558	75 %	25 %	0 %	0 %	110804003
26	NC_008263	ATTA	2	8	6889	6896	50 %	50 %	0 %	0 %	110804003
27	NC_008263	GATG	2	8	7278	7285	25 %	25 %	50 %	0 %	110804003
28	NC_008263	AGGT	2	8	7707	7714	25 %	25 %	50 %	0 %	110804003
29	NC_008263	TTTA	2	8	8271	8278	25 %	75 %	0 %	0 %	110804001
30	NC_008263	TAAA	2	8	8375	8382	75 %	25 %	0 %	0 %	110804001
31	NC_008263	AGTT	2	8	8457	8464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008263	AATT	2	8	8541	8548	50 %	50 %	0 %	0 %	110804007
33	NC_008263	GAAA	2	8	8834	8841	75 %	0 %	25 %	0 %	110804007
34	NC_008263	AATT	2	8	9364	9371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008263	ATTG	2	8	9383	9390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008263	AAGA	2	8	9866	9873	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008263	TTGA	2	8	10060	10067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008263	TATT	2	8	10139	10146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008263	GGAA	2	8	10243	10250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008263	TTAA	2	8	10835	10842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008263	TAAT	2	8	11165	11172	50 %	50 %	0 %	0 %	110803999
42	NC_008263	AAAT	2	8	11929	11936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008263	TATT	2	8	12210	12217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008263	TTTA	2	8	12267	12274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.