MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 9027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008262	TA	3	6	48	53	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008262	TA	4	8	1167	1174	50 %	50 %	0 %	0 %	110803386
3	NC_008262	CT	3	6	1240	1245	0 %	50 %	0 %	50 %	110803386
4	NC_008262	AT	3	6	1832	1837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008262	GA	3	6	2126	2131	50 %	0 %	50 %	0 %	110803106
6	NC_008262	TG	3	6	3116	3121	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008262	TA	3	6	3394	3399	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
8	NC_008262	TA	3	6	3516	3521	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
9	NC_008262	CA	3	6	3542	3547	50 %	0 %	0 %	50 %	110802319
10	NC_008262	TC	3	6	3740	3745	0 %	50 %	0 %	50 %	110802319
11	NC_008262	AT	3	6	3919	3924	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
12	NC_008262	GA	3	6	3947	3952	50 %	0 %	50 %	0 %	110802319
13	NC_008262	AT	3	6	3975	3980	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
14	NC_008262	AT	3	6	4053	4058	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
15	NC_008262	AT	4	8	4178	4185	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
16	NC_008262	GA	3	6	4506	4511	50 %	0 %	50 %	0 %	110802474
17	NC_008262	TA	3	6	4970	4975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008262	AT	3	6	6540	6545	50 %	50 %	0 %	0 %	110803693
19	NC_008262	GA	3	6	6546	6551	50 %	0 %	50 %	0 %	110803693
20	NC_008262	TA	3	6	6574	6579	50 %	50 %	0 %	0 %	110803693
21	NC_008262	TA	3	6	6593	6598	50 %	50 %	0 %	0 %	110803693
22	NC_008262	AG	3	6	6618	6623	50 %	0 %	50 %	0 %	110803693
23	NC_008262	AT	3	6	6896	6901	50 %	50 %	0 %	0 %	110803693
24	NC_008262	AT	3	6	7221	7226	50 %	50 %	0 %	0 %	110801534
25	NC_008262	AT	3	6	7743	7748	50 %	50 %	0 %	0 %	110801534
26	NC_008262	AG	3	6	7841	7846	50 %	0 %	50 %	0 %	110801534
27	NC_008262	TA	3	6	7877	7882	50 %	50 %	0 %	0 %	110801534
28	NC_008262	TA	3	6	7978	7983	50 %	50 %	0 %	0 %	110801534
29	NC_008262	AG	4	8	8040	8047	50 %	0 %	50 %	0 %	110801534
30	NC_008262	AC	3	6	8141	8146	50 %	0 %	0 %	50 %	110801534
31	NC_008262	AT	3	6	8457	8462	50 %	50 %	0 %	0 %	110801534
32	NC_008262	AG	3	6	8498	8503	50 %	0 %	50 %	0 %	110801534
33	NC_008262	AC	3	6	8572	8577	50 %	0 %	0 %	50 %	110801534
34	NC_008262	AT	3	6	8678	8683	50 %	50 %	0 %	0 %	110801534
35	NC_008262	CT	3	6	10700	10705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008262	AC	3	6	11188	11193	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008262	AG	3	6	11213	11218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008262	AC	3	6	11356	11361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008262	GA	3	6	11571	11576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008262	TC	3	6	11580	11585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008262	TC	3	6	12540	12545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008262	GA	3	6	12837	12842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008262	GT	3	6	13168	13173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008262	AG	4	8	13307	13314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008262	TG	3	6	14782	14787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008262	CA	3	6	15100	15105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008262	AT	3	6	15125	15130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008262	TA	3	6	15169	15174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008262	AG	3	6	15440	15445	50 %	0 %	50 %	0 %	110801545
50	NC_008262	AT	4	8	15591	15598	50 %	50 %	0 %	0 %	110801545
51	NC_008262	TA	3	6	15928	15933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008262	TA	3	6	15991	15996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008262	AT	3	6	16026	16031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008262	TA	4	8	16125	16132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008262	TA	3	6	16357	16362	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
56	NC_008262	AT	3	6	16560	16565	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
57	NC_008262	TA	3	6	16654	16659	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
58	NC_008262	AG	3	6	17760	17765	50 %	0 %	50 %	0 %	110802161
59	NC_008262	AT	3	6	17806	17811	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
60	NC_008262	TA	3	6	17903	17908	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
61	NC_008262	AT	3	6	18005	18010	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
62	NC_008262	GA	3	6	18192	18197	50 %	0 %	50 %	0 %	110802161
63	NC_008262	TA	4	8	18448	18455	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
64	NC_008262	TA	3	6	18541	18546	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
65	NC_008262	TA	3	6	18979	18984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008262	AT	3	6	19098	19103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008262	AG	3	6	19439	19444	50 %	0 %	50 %	0 %	110803344
68	NC_008262	AT	3	6	20061	20066	50 %	50 %	0 %	0 %	110803344
69	NC_008262	AT	3	6	20417	20422	50 %	50 %	0 %	0 %	110803344
70	NC_008262	AG	3	6	20428	20433	50 %	0 %	50 %	0 %	110803344
71	NC_008262	AT	3	6	20543	20548	50 %	50 %	0 %	0 %	110803928
72	NC_008262	AT	3	6	20803	20808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008262	TA	3	6	20852	20857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008262	AG	3	6	20866	20871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008262	AT	3	6	21057	21062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008262	GA	3	6	21351	21356	50 %	0 %	50 %	0 %	110801909
77	NC_008262	AG	3	6	21642	21647	50 %	0 %	50 %	0 %	110801909
78	NC_008262	AC	3	6	21675	21680	50 %	0 %	0 %	50 %	110801909
79	NC_008262	AT	3	6	22368	22373	50 %	50 %	0 %	0 %	110801909
80	NC_008262	TA	3	6	22438	22443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008262	AT	3	6	22739	22744	50 %	50 %	0 %	0 %	110802696
82	NC_008262	GA	3	6	23344	23349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008262	TC	3	6	23423	23428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008262	GA	3	6	24190	24195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008262	TC	3	6	24269	24274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008262	AT	3	6	24547	24552	50 %	50 %	0 %	0 %	110802429
87	NC_008262	AT	3	6	24786	24791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008262	AT	4	8	24811	24818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008262	TA	3	6	25027	25032	50 %	50 %	0 %	0 %	110803720
90	NC_008262	AT	3	6	25081	25086	50 %	50 %	0 %	0 %	110803720
91	NC_008262	AT	3	6	25150	25155	50 %	50 %	0 %	0 %	110803720
92	NC_008262	AT	4	8	25256	25263	50 %	50 %	0 %	0 %	110803720
93	NC_008262	CT	4	8	25877	25884	0 %	50 %	0 %	50 %	110801704
94	NC_008262	TA	3	6	26080	26085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008262	AT	3	6	26160	26165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008262	TA	3	6	26202	26207	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
97	NC_008262	AT	3	6	26985	26990	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
98	NC_008262	AT	3	6	27158	27163	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
99	NC_008262	AG	3	6	27175	27180	50 %	0 %	50 %	0 %	110802216
100	NC_008262	AG	3	6	27217	27222	50 %	0 %	50 %	0 %	110802216
101	NC_008262	TA	3	6	27280	27285	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
102	NC_008262	AG	3	6	27586	27591	50 %	0 %	50 %	0 %	110802216
103	NC_008262	AG	3	6	28542	28547	50 %	0 %	50 %	0 %	110802216
104	NC_008262	TA	3	6	28573	28578	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
105	NC_008262	AT	3	6	28609	28614	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
106	NC_008262	AC	3	6	29332	29337	50 %	0 %	0 %	50 %	110802216
107	NC_008262	GT	3	6	29518	29523	0 %	50 %	50 %	0 %	110802216
108	NC_008262	AT	3	6	29543	29548	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
109	NC_008262	GA	5	10	29854	29863	50 %	0 %	50 %	0 %	110802763
110	NC_008262	AT	4	8	30402	30409	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
111	NC_008262	TA	4	8	30967	30974	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
112	NC_008262	AT	3	6	31012	31017	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
113	NC_008262	AG	3	6	31025	31030	50 %	0 %	50 %	0 %	110802763
114	NC_008262	TA	3	6	31223	31228	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
115	NC_008262	TA	3	6	31640	31645	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
116	NC_008262	GA	3	6	31831	31836	50 %	0 %	50 %	0 %	110802763
117	NC_008262	TA	3	6	32744	32749	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
118	NC_008262	AG	3	6	32793	32798	50 %	0 %	50 %	0 %	110802763
119	NC_008262	TA	3	6	32990	32995	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
120	NC_008262	TA	3	6	33147	33152	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
121	NC_008262	TA	3	6	33366	33371	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
122	NC_008262	AT	3	6	33702	33707	50 %	50 %	0 %	0 %	110802983
123	NC_008262	AT	3	6	33726	33731	50 %	50 %	0 %	0 %	110802983
124	NC_008262	AT	3	6	34745	34750	50 %	50 %	0 %	0 %	110802983
125	NC_008262	AT	3	6	35055	35060	50 %	50 %	0 %	0 %	110803547
126	NC_008262	AT	3	6	35447	35452	50 %	50 %	0 %	0 %	110803547
127	NC_008262	AT	4	8	36523	36530	50 %	50 %	0 %	0 %	110803943
128	NC_008262	AT	3	6	36805	36810	50 %	50 %	0 %	0 %	110803943
129	NC_008262	AC	3	6	37841	37846	50 %	0 %	0 %	50 %	110803414
130	NC_008262	AT	3	6	38369	38374	50 %	50 %	0 %	0 %	110803414
131	NC_008262	AT	4	8	38409	38416	50 %	50 %	0 %	0 %	110803414
132	NC_008262	AT	3	6	38508	38513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008262	AT	3	6	38531	38536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008262	TA	3	6	38665	38670	50 %	50 %	0 %	0 %	110803370
135	NC_008262	CT	3	6	39148	39153	0 %	50 %	0 %	50 %	110803370
136	NC_008262	AT	3	6	39350	39355	50 %	50 %	0 %	0 %	110803370
137	NC_008262	TA	3	6	39539	39544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008262	AT	3	6	39627	39632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008262	TA	3	6	39774	39779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008262	TA	3	6	40407	40412	50 %	50 %	0 %	0 %	110803517
141	NC_008262	AC	3	6	40923	40928	50 %	0 %	0 %	50 %	110803517
142	NC_008262	CT	3	6	41394	41399	0 %	50 %	0 %	50 %	110802920
143	NC_008262	TA	3	6	42049	42054	50 %	50 %	0 %	0 %	110802920
144	NC_008262	AT	3	6	42153	42158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008262	AT	4	8	42168	42175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008262	AG	3	6	42657	42662	50 %	0 %	50 %	0 %	110802708
147	NC_008262	AG	3	6	42697	42702	50 %	0 %	50 %	0 %	110802708
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