MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 81352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008262	TAA	2	6	37724	37729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803414
1002	NC_008262	ATC	2	6	37730	37735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110803414
1003	NC_008262	GAA	2	6	37780	37785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803414
1004	NC_008262	AC	3	6	37841	37846	50 %	0 %	0 %	50 %	110803414
1005	NC_008262	TGG	2	6	37851	37856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110803414
1006	NC_008262	TGC	2	6	37890	37895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110803414
1007	NC_008262	ATA	2	6	37912	37917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803414
1008	NC_008262	A	6	6	38018	38023	100 %	0 %	0 %	0 %	110803414
1009	NC_008262	TTA	2	6	38050	38055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803414
1010	NC_008262	A	6	6	38075	38080	100 %	0 %	0 %	0 %	110803414
1011	NC_008262	TAA	2	6	38096	38101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803414
1012	NC_008262	AAG	2	6	38114	38119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803414
1013	NC_008262	AGAAA	2	10	38131	38140	80 %	0 %	20 %	0 %	110803414
1014	NC_008262	TAAA	2	8	38165	38172	75 %	25 %	0 %	0 %	110803414
1015	NC_008262	A	6	6	38170	38175	100 %	0 %	0 %	0 %	110803414
1016	NC_008262	ACATGA	2	12	38216	38227	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	110803414
1017	NC_008262	CTG	2	6	38264	38269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110803414
1018	NC_008262	AGG	2	6	38319	38324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110803414
1019	NC_008262	AT	3	6	38369	38374	50 %	50 %	0 %	0 %	110803414
1020	NC_008262	TGG	2	6	38379	38384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110803414
1021	NC_008262	AT	4	8	38409	38416	50 %	50 %	0 %	0 %	110803414
1022	NC_008262	ATA	2	6	38458	38463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803414
1023	NC_008262	TAAA	2	8	38488	38495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008262	AT	3	6	38508	38513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008262	TAAT	2	8	38519	38526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008262	AT	3	6	38531	38536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008262	T	6	6	38550	38555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008262	ATTT	2	8	38556	38563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008262	TAA	2	6	38564	38569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_008262	TAA	2	6	38574	38579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008262	ACTT	2	8	38580	38587	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_008262	AAG	3	9	38612	38620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803370
1033	NC_008262	TA	3	6	38665	38670	50 %	50 %	0 %	0 %	110803370
1034	NC_008262	T	7	7	38824	38830	0 %	100 %	0 %	0 %	110803370
1035	NC_008262	CAT	2	6	38868	38873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110803370
1036	NC_008262	TAA	2	6	38899	38904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803370
1037	NC_008262	GCT	3	9	38915	38923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110803370
1038	NC_008262	TTC	2	6	38934	38939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110803370
1039	NC_008262	TCT	2	6	39002	39007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110803370
1040	NC_008262	ATA	2	6	39061	39066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803370
1041	NC_008262	CTA	2	6	39105	39110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110803370
1042	NC_008262	TAA	2	6	39139	39144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803370
1043	NC_008262	CT	3	6	39148	39153	0 %	50 %	0 %	50 %	110803370
1044	NC_008262	TAT	2	6	39168	39173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803370
1045	NC_008262	TGA	2	6	39190	39195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803370
1046	NC_008262	TTC	2	6	39235	39240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110803370
1047	NC_008262	CAA	2	6	39249	39254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110803370
1048	NC_008262	TTG	2	6	39276	39281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110803370
1049	NC_008262	TAT	2	6	39306	39311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803370
1050	NC_008262	AT	3	6	39350	39355	50 %	50 %	0 %	0 %	110803370
1051	NC_008262	TAT	2	6	39360	39365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803370
1052	NC_008262	TAAT	2	8	39389	39396	50 %	50 %	0 %	0 %	110803370
1053	NC_008262	TAAA	2	8	39444	39451	75 %	25 %	0 %	0 %	110803370
1054	NC_008262	T	6	6	39457	39462	0 %	100 %	0 %	0 %	110803370
1055	NC_008262	TCC	2	6	39475	39480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_008262	TA	3	6	39539	39544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008262	TAA	3	9	39574	39582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008262	GAA	2	6	39595	39600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_008262	TTA	2	6	39617	39622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008262	AT	3	6	39627	39632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008262	GGT	2	6	39657	39662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_008262	AGT	2	6	39678	39683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008262	CGC	2	6	39722	39727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_008262	T	7	7	39758	39764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008262	TA	3	6	39774	39779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008262	A	8	8	39795	39802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008262	AAT	2	6	39816	39821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008262	TCA	2	6	39839	39844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_008262	ATA	2	6	39881	39886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_008262	ATA	2	6	39898	39903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803517
1071	NC_008262	TTA	2	6	39957	39962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803517
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1075	NC_008262	TGA	2	6	40079	40084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803517
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1081	NC_008262	CAT	2	6	40325	40330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110803517
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1083	NC_008262	ACTA	2	8	40401	40408	50 %	25 %	0 %	25 %	110803517
1084	NC_008262	TA	3	6	40407	40412	50 %	50 %	0 %	0 %	110803517
1085	NC_008262	ATG	2	6	40477	40482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803517
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1099	NC_008262	TAA	2	6	40903	40908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803517
1100	NC_008262	TAG	2	6	40915	40920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803517
1101	NC_008262	AC	3	6	40923	40928	50 %	0 %	0 %	50 %	110803517
1102	NC_008262	ATC	2	6	40940	40945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110803517
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1104	NC_008262	A	6	6	41001	41006	100 %	0 %	0 %	0 %	110803517
1105	NC_008262	AGA	2	6	41015	41020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803517
1106	NC_008262	A	6	6	41026	41031	100 %	0 %	0 %	0 %	110803517
1107	NC_008262	TAA	2	6	41032	41037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803517
1108	NC_008262	T	6	6	41045	41050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_008262	ATAA	2	8	41058	41065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008262	TAAATT	2	12	41083	41094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_008262	ATA	2	6	41136	41141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008262	CTAT	2	8	41306	41313	25 %	50 %	0 %	25 %	110802920
1113	NC_008262	TCTT	2	8	41324	41331	0 %	75 %	0 %	25 %	110802920
1114	NC_008262	TAG	2	6	41343	41348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110802920
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1116	NC_008262	T	7	7	41386	41392	0 %	100 %	0 %	0 %	110802920
1117	NC_008262	CT	3	6	41394	41399	0 %	50 %	0 %	50 %	110802920
1118	NC_008262	GAA	2	6	41457	41462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802920
1119	NC_008262	ATT	2	6	41530	41535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802920
1120	NC_008262	AAT	2	6	41556	41561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802920
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1124	NC_008262	TCA	2	6	41915	41920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110802920
1125	NC_008262	T	7	7	41934	41940	0 %	100 %	0 %	0 %	110802920
1126	NC_008262	CTTA	2	8	41941	41948	25 %	50 %	0 %	25 %	110802920
1127	NC_008262	TCT	2	6	41988	41993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110802920
1128	NC_008262	TAA	2	6	41997	42002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802920
1129	NC_008262	AAG	2	6	42011	42016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802920
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1131	NC_008262	CAT	2	6	42078	42083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110802920
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