MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 81352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008262	CAG	2	6	199653	199658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110803242
5502	NC_008262	ATG	2	6	199659	199664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803242
5503	NC_008262	ATT	2	6	199707	199712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803242
5504	NC_008262	A	6	6	199759	199764	100 %	0 %	0 %	0 %	110803242
5505	NC_008262	ATA	2	6	199797	199802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803242
5506	NC_008262	GTT	2	6	199838	199843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110803242
5507	NC_008262	CAG	2	6	199875	199880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110803242
5508	NC_008262	TTA	2	6	199890	199895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803242
5509	NC_008262	AT	3	6	199904	199909	50 %	50 %	0 %	0 %	110803242
5510	NC_008262	ATA	2	6	199929	199934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803242
5511	NC_008262	ATT	2	6	199998	200003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803242
5512	NC_008262	ATG	2	6	200037	200042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803242
5513	NC_008262	AATAG	2	10	200063	200072	60 %	20 %	20 %	0 %	110803242
5514	NC_008262	AT	3	6	200077	200082	50 %	50 %	0 %	0 %	110803242
5515	NC_008262	ATAATG	2	12	200124	200135	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	110803242
5516	NC_008262	AAT	2	6	200147	200152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803242
5517	NC_008262	AGA	2	6	200188	200193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803242
5518	NC_008262	TTAT	2	8	200242	200249	25 %	75 %	0 %	0 %	110803242
5519	NC_008262	AT	3	6	200257	200262	50 %	50 %	0 %	0 %	110803242
5520	NC_008262	GATTTA	2	12	200276	200287	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	110803242
5521	NC_008262	TGG	2	6	200293	200298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110803242
5522	NC_008262	TCA	2	6	200306	200311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110803242
5523	NC_008262	TAA	2	6	200329	200334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803242
5524	NC_008262	TGA	2	6	200383	200388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803242
5525	NC_008262	GTA	2	6	200399	200404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803242
5526	NC_008262	AGA	2	6	200425	200430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803242
5527	NC_008262	AGT	2	6	200485	200490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803242
5528	NC_008262	AGA	2	6	200509	200514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803242
5529	NC_008262	GAT	2	6	200525	200530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803242
5530	NC_008262	TGT	2	6	200539	200544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110803242
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5533	NC_008262	TGG	2	6	200608	200613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110803242
5534	NC_008262	TA	4	8	200614	200621	50 %	50 %	0 %	0 %	110803242
5535	NC_008262	CTTT	2	8	200637	200644	0 %	75 %	0 %	25 %	110803242
5536	NC_008262	TA	4	8	200671	200678	50 %	50 %	0 %	0 %	110803242
5537	NC_008262	AGA	2	6	200683	200688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803242
5538	NC_008262	ATT	2	6	200689	200694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803242
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5540	NC_008262	CAG	2	6	200802	200807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110803242
5541	NC_008262	ATA	2	6	200886	200891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803242
5542	NC_008262	ATG	2	6	200904	200909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803242
5543	NC_008262	ACA	2	6	200976	200981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110803242
5544	NC_008262	TAA	2	6	200998	201003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803242
5545	NC_008262	AAT	2	6	201023	201028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803242
5546	NC_008262	AGT	2	6	201065	201070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803242
5547	NC_008262	TA	3	6	201101	201106	50 %	50 %	0 %	0 %	110803242
5548	NC_008262	ATA	2	6	201120	201125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803242
5549	NC_008262	AAG	2	6	201213	201218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803242
5550	NC_008262	TAC	2	6	201268	201273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110803242
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5552	NC_008262	GAA	2	6	201317	201322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803242
5553	NC_008262	AT	3	6	201357	201362	50 %	50 %	0 %	0 %	110803242
5554	NC_008262	ATG	2	6	201456	201461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803242
5555	NC_008262	GAAT	2	8	201474	201481	50 %	25 %	25 %	0 %	110803242
5556	NC_008262	TAAA	2	8	201507	201514	75 %	25 %	0 %	0 %	110803242
5557	NC_008262	TTC	2	6	201541	201546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110803242
5558	NC_008262	GAA	3	9	201557	201565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803242
5559	NC_008262	AAGATG	2	12	201591	201602	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	110803242
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5562	NC_008262	ATA	2	6	201675	201680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803242
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5565	NC_008262	AATA	2	8	201730	201737	75 %	25 %	0 %	0 %	110803242
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5574	NC_008262	AATC	2	8	202091	202098	50 %	25 %	0 %	25 %	110803242
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5592	NC_008262	TTAA	2	8	202851	202858	50 %	50 %	0 %	0 %	110803206
5593	NC_008262	TAG	2	6	202885	202890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803206
5594	NC_008262	CAG	2	6	202897	202902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110803206
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5601	NC_008262	TAAAAA	2	12	203196	203207	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_008262	ATA	2	6	203219	203224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_008262	TAA	2	6	203264	203269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_008262	TAA	3	9	203332	203340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_008262	A	6	6	203339	203344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_008262	ATTTT	2	10	203359	203368	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_008262	AG	3	6	203370	203375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5610	NC_008262	AAAGT	2	10	203493	203502	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_008262	AG	3	6	203521	203526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_008262	ATG	2	6	203531	203536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5614	NC_008262	TAG	2	6	203598	203603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_008262	T	7	7	203737	203743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_008262	TA	3	6	203759	203764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_008262	GTT	2	6	203765	203770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_008262	AT	3	6	203780	203785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5620	NC_008262	ATT	2	6	203794	203799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_008262	A	6	6	203817	203822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_008262	TTTA	2	8	203828	203835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_008262	TAA	2	6	203853	203858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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