MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium perfringens ATCC 13124 chromosome

Total Repeats: 91288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_008261	ATTT	2	8	37415	37422	25 %	75 %	0 %	0 %	110800422
1003	NC_008261	A	6	6	37454	37459	100 %	0 %	0 %	0 %	110800422
1004	NC_008261	TTG	2	6	37474	37479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110800422
1005	NC_008261	ATG	2	6	37486	37491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800422
1006	NC_008261	TAA	2	6	37573	37578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800422
1007	NC_008261	ACT	2	6	37590	37595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800422
1008	NC_008261	TGA	2	6	37607	37612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800422
1009	NC_008261	TAA	2	6	37654	37659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800422
1010	NC_008261	GAA	2	6	37710	37715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800422
1011	NC_008261	TGG	2	6	37781	37786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110800422
1012	NC_008261	TGC	2	6	37820	37825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110800422
1013	NC_008261	ATA	2	6	37842	37847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800422
1014	NC_008261	A	6	6	37948	37953	100 %	0 %	0 %	0 %	110800422
1015	NC_008261	TTA	2	6	37980	37985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800422
1016	NC_008261	A	6	6	38005	38010	100 %	0 %	0 %	0 %	110800422
1017	NC_008261	TAA	2	6	38026	38031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800422
1018	NC_008261	AAG	2	6	38044	38049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800422
1019	NC_008261	AGAAA	2	10	38061	38070	80 %	0 %	20 %	0 %	110800422
1020	NC_008261	TAAA	2	8	38095	38102	75 %	25 %	0 %	0 %	110800422
1021	NC_008261	ACATGA	2	12	38146	38157	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	110800422
1022	NC_008261	CTG	2	6	38194	38199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110800422
1023	NC_008261	AGG	2	6	38249	38254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110800422
1024	NC_008261	AT	4	8	38339	38346	50 %	50 %	0 %	0 %	110800422
1025	NC_008261	ATA	2	6	38388	38393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800422
1026	NC_008261	TAAA	2	8	38418	38425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008261	AT	3	6	38438	38443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008261	TAAT	2	8	38449	38456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008261	AT	3	6	38461	38466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_008261	T	6	6	38480	38485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_008261	ATTT	2	8	38486	38493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_008261	TAA	2	6	38494	38499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008261	TAA	2	6	38504	38509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_008261	ACTT	2	8	38510	38517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_008261	AGA	2	6	38546	38551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801244
1036	NC_008261	TG	3	6	38571	38576	0 %	50 %	50 %	0 %	110801244
1037	NC_008261	TA	3	6	38595	38600	50 %	50 %	0 %	0 %	110801244
1038	NC_008261	TTGT	2	8	38693	38700	0 %	75 %	25 %	0 %	110801244
1039	NC_008261	T	7	7	38754	38760	0 %	100 %	0 %	0 %	110801244
1040	NC_008261	CTTAGC	2	12	38766	38777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	110801244
1041	NC_008261	CAT	2	6	38798	38803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110801244
1042	NC_008261	TAA	2	6	38829	38834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801244
1043	NC_008261	GCT	3	9	38845	38853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110801244
1044	NC_008261	TTC	2	6	38864	38869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110801244
1045	NC_008261	GAT	2	6	38882	38887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801244
1046	NC_008261	TCT	2	6	38932	38937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110801244
1047	NC_008261	AGC	2	6	38985	38990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110801244
1048	NC_008261	ATA	2	6	38991	38996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801244
1049	NC_008261	CTA	2	6	39035	39040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110801244
1050	NC_008261	TAA	2	6	39069	39074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801244
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1052	NC_008261	TAT	2	6	39098	39103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801244
1053	NC_008261	TGA	2	6	39120	39125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801244
1054	NC_008261	TTC	2	6	39165	39170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110801244
1055	NC_008261	CAA	2	6	39179	39184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110801244
1056	NC_008261	TTG	2	6	39206	39211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110801244
1057	NC_008261	TAT	2	6	39236	39241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801244
1058	NC_008261	AT	3	6	39280	39285	50 %	50 %	0 %	0 %	110801244
1059	NC_008261	TAT	2	6	39290	39295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801244
1060	NC_008261	TAAT	2	8	39319	39326	50 %	50 %	0 %	0 %	110801244
1061	NC_008261	T	6	6	39387	39392	0 %	100 %	0 %	0 %	110801244
1062	NC_008261	TCC	2	6	39405	39410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_008261	A	6	6	39454	39459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_008261	TA	3	6	39469	39474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008261	TAA	3	9	39504	39512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008261	GAA	2	6	39525	39530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008261	TTA	2	6	39547	39552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008261	AT	3	6	39557	39562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008261	GGT	2	6	39587	39592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_008261	AGT	2	6	39608	39613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008261	CGC	2	6	39652	39657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1073	NC_008261	TA	3	6	39703	39708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_008261	A	7	7	39724	39730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_008261	AAT	2	6	39745	39750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008261	TCA	2	6	39768	39773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_008261	ATA	2	6	39810	39815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_008261	ATA	2	6	39827	39832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110798802
1079	NC_008261	TTA	2	6	39886	39891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798802
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1100	NC_008261	TAT	2	6	40620	40625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798802
1101	NC_008261	GAA	2	6	40627	40632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798802
1102	NC_008261	TGA	2	6	40644	40649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110798802
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1119	NC_008261	A	6	6	41043	41048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008261	ATT	2	6	41057	41062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_008261	TATT	2	8	41087	41094	25 %	75 %	0 %	0 %	110798633
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