MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium perfringens ATCC 13124 chromosome

Total Repeats: 91288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008261	AAT	2	6	20065	20070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800557
502	NC_008261	GAT	2	6	20109	20114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800557
503	NC_008261	TAG	2	6	20124	20129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800557
504	NC_008261	T	6	6	20147	20152	0 %	100 %	0 %	0 %	110800557
505	NC_008261	ATAATC	2	12	20156	20167	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	110800557
506	NC_008261	GAT	2	6	20185	20190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800557
507	NC_008261	A	6	6	20196	20201	100 %	0 %	0 %	0 %	110800557
508	NC_008261	AT	3	6	20208	20213	50 %	50 %	0 %	0 %	110800557
509	NC_008261	ATA	2	6	20269	20274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800557
510	NC_008261	TGA	2	6	20277	20282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800557
511	NC_008261	ATA	2	6	20284	20289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800557
512	NC_008261	TAAAT	2	10	20292	20301	60 %	40 %	0 %	0 %	110800557
513	NC_008261	TAAA	2	8	20309	20316	75 %	25 %	0 %	0 %	110800557
514	NC_008261	AAG	2	6	20331	20336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800557
515	NC_008261	GAG	2	6	20368	20373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110800557
516	NC_008261	AGA	2	6	20503	20508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800557
517	NC_008261	ATA	2	6	20557	20562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800557
518	NC_008261	AT	3	6	20564	20569	50 %	50 %	0 %	0 %	110800557
519	NC_008261	AG	3	6	20575	20580	50 %	0 %	50 %	0 %	110800557
520	NC_008261	A	7	7	20585	20591	100 %	0 %	0 %	0 %	110800557
521	NC_008261	GGT	2	6	20671	20676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008261	AT	3	6	20690	20695	50 %	50 %	0 %	0 %	110799910
523	NC_008261	A	6	6	20725	20730	100 %	0 %	0 %	0 %	110799910
524	NC_008261	TAA	2	6	20754	20759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799910
525	NC_008261	GATT	2	8	20781	20788	25 %	50 %	25 %	0 %	110799910
526	NC_008261	A	6	6	20889	20894	100 %	0 %	0 %	0 %	110799910
527	NC_008261	T	6	6	20944	20949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_008261	AT	3	6	20950	20955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008261	TAA	3	9	20967	20975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008261	TA	3	6	20999	21004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_008261	AG	3	6	21013	21018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_008261	TGA	2	6	21077	21082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008261	T	7	7	21126	21132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008261	T	6	6	21198	21203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008261	AT	3	6	21204	21209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008261	T	7	7	21209	21215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008261	TAA	2	6	21219	21224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008261	TAAATA	2	12	21230	21241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008261	A	6	6	21276	21281	100 %	0 %	0 %	0 %	110798993
540	NC_008261	AAG	2	6	21285	21290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798993
541	NC_008261	GAA	2	6	21298	21303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798993
542	NC_008261	A	6	6	21307	21312	100 %	0 %	0 %	0 %	110798993
543	NC_008261	GAA	2	6	21376	21381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798993
544	NC_008261	AGA	2	6	21382	21387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798993
545	NC_008261	A	7	7	21456	21462	100 %	0 %	0 %	0 %	110798993
546	NC_008261	GA	3	6	21498	21503	50 %	0 %	50 %	0 %	110798993
547	NC_008261	TGA	2	6	21525	21530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110798993
548	NC_008261	CAT	2	6	21567	21572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110798993
549	NC_008261	TGA	2	6	21621	21626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110798993
550	NC_008261	CTA	2	6	21659	21664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110798993
551	NC_008261	AG	3	6	21789	21794	50 %	0 %	50 %	0 %	110798993
552	NC_008261	TAA	2	6	21800	21805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110798993
553	NC_008261	ACT	2	6	21806	21811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110798993
554	NC_008261	AC	3	6	21822	21827	50 %	0 %	0 %	50 %	110798993
555	NC_008261	ACC	2	6	21855	21860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110798993
556	NC_008261	ACTGGT	2	12	21886	21897	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	110798993
557	NC_008261	GAA	2	6	21913	21918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798993
558	NC_008261	TGC	2	6	22032	22037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110798993
559	NC_008261	CAG	2	6	22070	22075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110798993
560	NC_008261	ACA	2	6	22101	22106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110798993
561	NC_008261	TAA	2	6	22113	22118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110798993
562	NC_008261	AGTT	2	8	22124	22131	25 %	50 %	25 %	0 %	110798993
563	NC_008261	GAA	2	6	22159	22164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798993
564	NC_008261	CTG	2	6	22259	22264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110798993
565	NC_008261	GTT	2	6	22325	22330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110798993
566	NC_008261	AGA	2	6	22354	22359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798993
567	NC_008261	GAA	2	6	22439	22444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798993
568	NC_008261	GCT	2	6	22450	22455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110798993
569	NC_008261	CAA	2	6	22471	22476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110798993
570	NC_008261	AGT	2	6	22488	22493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110798993
571	NC_008261	AT	3	6	22515	22520	50 %	50 %	0 %	0 %	110798993
572	NC_008261	AAT	2	6	22538	22543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110798993
573	NC_008261	AGA	2	6	22557	22562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_008261	AT	3	6	22564	22569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008261	TA	3	6	22585	22590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_008261	ATAA	2	8	22596	22603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_008261	T	8	8	22641	22648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_008261	A	6	6	22660	22665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_008261	ATT	2	6	22713	22718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_008261	CTG	2	6	22837	22842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110801223
582	NC_008261	GAA	2	6	22860	22865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801223
583	NC_008261	AT	3	6	22883	22888	50 %	50 %	0 %	0 %	110801223
584	NC_008261	TGA	2	6	22901	22906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801223
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586	NC_008261	A	7	7	22934	22940	100 %	0 %	0 %	0 %	110801223
587	NC_008261	A	6	6	23040	23045	100 %	0 %	0 %	0 %	110801223
588	NC_008261	AAT	2	6	23052	23057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801223
589	NC_008261	GATA	2	8	23130	23137	50 %	25 %	25 %	0 %	110801223
590	NC_008261	TA	3	6	23169	23174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008261	TTTTAT	2	12	23207	23218	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008261	T	7	7	23218	23224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008261	A	7	7	23227	23233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_008261	ATA	2	6	23261	23266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_008261	GA	3	6	23281	23286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_008261	GCGT	2	8	23324	23331	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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598	NC_008261	T	8	8	23371	23378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008261	A	6	6	23381	23386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_008261	TTTA	2	8	23519	23526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008261	TAAAA	2	10	23536	23545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_008261	AAT	2	6	23546	23551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_008261	CTT	2	6	23590	23595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_008261	TAAT	2	8	23600	23607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_008261	A	7	7	23615	23621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_008261	TTA	2	6	23649	23654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_008261	ATA	2	6	23686	23691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_008261	TTGT	2	8	23697	23704	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
609	NC_008261	TAATT	2	10	23718	23727	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_008261	GAG	2	6	23744	23749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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613	NC_008261	AGT	2	6	23836	23841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799632
614	NC_008261	GCA	2	6	23848	23853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110799632
615	NC_008261	T	6	6	23860	23865	0 %	100 %	0 %	0 %	110799632
616	NC_008261	TAT	2	6	23895	23900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799632
617	NC_008261	ATA	2	6	23959	23964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799632
618	NC_008261	TAT	2	6	23993	23998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799632
619	NC_008261	ATT	2	6	24021	24026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799632
620	NC_008261	A	6	6	24030	24035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_008261	A	6	6	24052	24057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008261	T	7	7	24065	24071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008261	A	7	7	24074	24080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008261	AAAATG	2	12	24093	24104	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008261	ATA	3	9	24107	24115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008261	GA	3	6	24131	24136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_008261	GCGT	2	8	24174	24181	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
628	NC_008261	TC	3	6	24210	24215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
629	NC_008261	T	8	8	24341	24348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_008261	TAA	2	6	24398	24403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800136
631	NC_008261	A	6	6	24468	24473	100 %	0 %	0 %	0 %	110800136
632	NC_008261	AGTA	2	8	24477	24484	50 %	25 %	25 %	0 %	110800136
633	NC_008261	AT	3	6	24485	24490	50 %	50 %	0 %	0 %	110800136
634	NC_008261	ATA	2	6	24493	24498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800136
635	NC_008261	A	6	6	24504	24509	100 %	0 %	0 %	0 %	110800136
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