MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 chromosome

Total Repeats: 14466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008255	TTTC	2	8	80	87	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008255	GAAA	2	8	316	323	75 %	0 %	25 %	0 %	110636428
3	NC_008255	GATG	2	8	628	635	25 %	25 %	50 %	0 %	110636428
4	NC_008255	GTTT	2	8	1394	1401	0 %	75 %	25 %	0 %	110636429
5	NC_008255	GCCG	2	8	1506	1513	0 %	0 %	50 %	50 %	110636429
6	NC_008255	AATT	2	8	1891	1898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008255	TCAA	2	8	2411	2418	50 %	25 %	0 %	25 %	110636430
8	NC_008255	CAAG	2	8	2593	2600	50 %	0 %	25 %	25 %	110636430
9	NC_008255	CATT	2	8	2923	2930	25 %	50 %	0 %	25 %	110636430
10	NC_008255	AAAT	2	8	3346	3353	75 %	25 %	0 %	0 %	110636430
11	NC_008255	TTGG	2	8	3508	3515	0 %	50 %	50 %	0 %	110636431
12	NC_008255	GTTC	2	8	3912	3919	0 %	50 %	25 %	25 %	110636431
13	NC_008255	AGAA	2	8	3982	3989	75 %	0 %	25 %	0 %	110636431
14	NC_008255	TACA	2	8	4619	4626	50 %	25 %	0 %	25 %	110636432
15	NC_008255	GCAA	2	8	4858	4865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008255	AGGA	2	8	4946	4953	50 %	0 %	50 %	0 %	110636433
17	NC_008255	GAAG	2	8	5214	5221	50 %	0 %	50 %	0 %	110636433
18	NC_008255	GCAG	2	8	5571	5578	25 %	0 %	50 %	25 %	110636433
19	NC_008255	TGTC	2	8	5957	5964	0 %	50 %	25 %	25 %	110636434
20	NC_008255	TTAA	2	8	6485	6492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008255	GAAA	2	8	6552	6559	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008255	TATT	2	8	6623	6630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008255	AAAC	2	8	7750	7757	75 %	0 %	0 %	25 %	110636435
24	NC_008255	TACA	2	8	8100	8107	50 %	25 %	0 %	25 %	110636435
25	NC_008255	TTGG	2	8	8175	8182	0 %	50 %	50 %	0 %	110636435
26	NC_008255	AAAT	2	8	8492	8499	75 %	25 %	0 %	0 %	110636435
27	NC_008255	AAGA	2	8	8604	8611	75 %	0 %	25 %	0 %	110636435
28	NC_008255	GAAT	2	8	8827	8834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008255	ATTA	2	8	9035	9042	50 %	50 %	0 %	0 %	110636436
30	NC_008255	GATT	2	8	9537	9544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008255	GAAA	2	8	9605	9612	75 %	0 %	25 %	0 %	110636437
32	NC_008255	GCAA	2	8	10189	10196	50 %	0 %	25 %	25 %	110636438
33	NC_008255	AAAT	2	8	10311	10318	75 %	25 %	0 %	0 %	110636438
34	NC_008255	ATTA	2	8	10572	10579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008255	TTTA	2	8	10630	10637	25 %	75 %	0 %	0 %	110636439
36	NC_008255	CTTT	2	8	10923	10930	0 %	75 %	0 %	25 %	110636439
37	NC_008255	ATGT	2	8	11158	11165	25 %	50 %	25 %	0 %	110636439
38	NC_008255	TCTT	2	8	11211	11218	0 %	75 %	0 %	25 %	110636439
39	NC_008255	CTTG	2	8	11546	11553	0 %	50 %	25 %	25 %	110636439
40	NC_008255	AACA	2	8	11749	11756	75 %	0 %	0 %	25 %	110636439
41	NC_008255	GCCT	2	8	12783	12790	0 %	25 %	25 %	50 %	110636440
42	NC_008255	CCGT	2	8	13224	13231	0 %	25 %	25 %	50 %	110636440
43	NC_008255	GTTT	2	8	14069	14076	0 %	75 %	25 %	0 %	110636440
44	NC_008255	TTTG	2	8	14489	14496	0 %	75 %	25 %	0 %	110636440
45	NC_008255	TTAC	2	8	14569	14576	25 %	50 %	0 %	25 %	110636440
46	NC_008255	GCCT	2	8	14602	14609	0 %	25 %	25 %	50 %	110636440
47	NC_008255	ATCA	2	8	14890	14897	50 %	25 %	0 %	25 %	110636440
48	NC_008255	TTAT	2	8	14955	14962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008255	TCAT	2	8	14977	14984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008255	CGGC	2	8	15237	15244	0 %	0 %	50 %	50 %	110636441
51	NC_008255	TGAT	2	8	15340	15347	25 %	50 %	25 %	0 %	110636441
52	NC_008255	AATT	2	8	15826	15833	50 %	50 %	0 %	0 %	110636441
53	NC_008255	ATGC	2	8	15972	15979	25 %	25 %	25 %	25 %	110636441
54	NC_008255	TATT	2	8	16024	16031	25 %	75 %	0 %	0 %	110636441
55	NC_008255	ATCA	2	8	16300	16307	50 %	25 %	0 %	25 %	110636441
56	NC_008255	CAAA	2	8	16781	16788	75 %	0 %	0 %	25 %	110636441
57	NC_008255	TGCA	2	8	16913	16920	25 %	25 %	25 %	25 %	110636441
58	NC_008255	CATG	2	8	17182	17189	25 %	25 %	25 %	25 %	110636442
59	NC_008255	TTGG	2	8	18168	18175	0 %	50 %	50 %	0 %	110636443
60	NC_008255	AAGC	2	8	18685	18692	50 %	0 %	25 %	25 %	110636443
61	NC_008255	TCGT	2	8	18726	18733	0 %	50 %	25 %	25 %	110636444
62	NC_008255	AAAT	2	8	19481	19488	75 %	25 %	0 %	0 %	110636444
63	NC_008255	CTGC	2	8	19597	19604	0 %	25 %	25 %	50 %	110636445
64	NC_008255	AAAT	2	8	20808	20815	75 %	25 %	0 %	0 %	110636445
65	NC_008255	TAAA	2	8	21072	21079	75 %	25 %	0 %	0 %	110636446
66	NC_008255	AGTT	2	8	21180	21187	25 %	50 %	25 %	0 %	110636446
67	NC_008255	TTCT	2	8	22717	22724	0 %	75 %	0 %	25 %	110636448
68	NC_008255	TATT	2	8	22736	22743	25 %	75 %	0 %	0 %	110636448
69	NC_008255	CAAA	2	8	22788	22795	75 %	0 %	0 %	25 %	110636448
70	NC_008255	TCAA	2	8	22985	22992	50 %	25 %	0 %	25 %	110636448
71	NC_008255	CAGA	2	8	23162	23169	50 %	0 %	25 %	25 %	110636448
72	NC_008255	CTTT	2	8	23803	23810	0 %	75 %	0 %	25 %	110636448
73	NC_008255	TTGC	2	8	23904	23911	0 %	50 %	25 %	25 %	110636448
74	NC_008255	GAAA	2	8	24032	24039	75 %	0 %	25 %	0 %	110636448
75	NC_008255	ATTG	2	8	24302	24309	25 %	50 %	25 %	0 %	110636448
76	NC_008255	TTCT	2	8	24369	24376	0 %	75 %	0 %	25 %	110636449
77	NC_008255	ATTT	2	8	24378	24385	25 %	75 %	0 %	0 %	110636449
78	NC_008255	CTAT	2	8	24574	24581	25 %	50 %	0 %	25 %	110636449
79	NC_008255	TAAA	2	8	24779	24786	75 %	25 %	0 %	0 %	110636449
80	NC_008255	GATA	2	8	24849	24856	50 %	25 %	25 %	0 %	110636449
81	NC_008255	CCAA	2	8	25045	25052	50 %	0 %	0 %	50 %	110636449
82	NC_008255	TCAT	2	8	25476	25483	25 %	50 %	0 %	25 %	110636450
83	NC_008255	CGAA	2	8	25816	25823	50 %	0 %	25 %	25 %	110636450
84	NC_008255	TCTT	2	8	26477	26484	0 %	75 %	0 %	25 %	110636451
85	NC_008255	TGCA	2	8	27893	27900	25 %	25 %	25 %	25 %	110636452
86	NC_008255	ACAT	2	8	28796	28803	50 %	25 %	0 %	25 %	110636453
87	NC_008255	TTTA	2	8	29028	29035	25 %	75 %	0 %	0 %	110636453
88	NC_008255	GATT	2	8	29283	29290	25 %	50 %	25 %	0 %	110636453
89	NC_008255	TAAG	2	8	29583	29590	50 %	25 %	25 %	0 %	110636454
90	NC_008255	TATT	2	8	30342	30349	25 %	75 %	0 %	0 %	110636454
91	NC_008255	AAAG	2	8	31110	31117	75 %	0 %	25 %	0 %	110636454
92	NC_008255	ACCA	2	8	31489	31496	50 %	0 %	0 %	50 %	110636454
93	NC_008255	AATT	2	8	31837	31844	50 %	50 %	0 %	0 %	110636454
94	NC_008255	CAAG	2	8	32421	32428	50 %	0 %	25 %	25 %	110636455
95	NC_008255	AAAT	2	8	32661	32668	75 %	25 %	0 %	0 %	110636456
96	NC_008255	AACA	2	8	32818	32825	75 %	0 %	0 %	25 %	110636456
97	NC_008255	TCCG	2	8	32972	32979	0 %	25 %	25 %	50 %	110636456
98	NC_008255	GTTT	2	8	33062	33069	0 %	75 %	25 %	0 %	110636456
99	NC_008255	CGAT	2	8	34256	34263	25 %	25 %	25 %	25 %	110636456
100	NC_008255	GTAT	2	8	34359	34366	25 %	50 %	25 %	0 %	110636456
101	NC_008255	GCAA	2	8	34411	34418	50 %	0 %	25 %	25 %	110636456
102	NC_008255	AAGG	2	8	34436	34443	50 %	0 %	50 %	0 %	110636456
103	NC_008255	GATG	2	8	35499	35506	25 %	25 %	50 %	0 %	110636456
104	NC_008255	AGTA	2	8	36048	36055	50 %	25 %	25 %	0 %	110636456
105	NC_008255	CAAT	2	8	36297	36304	50 %	25 %	0 %	25 %	110636456
106	NC_008255	TCTG	2	8	36378	36385	0 %	50 %	25 %	25 %	110636456
107	NC_008255	TGCA	2	8	36608	36615	25 %	25 %	25 %	25 %	110636456
108	NC_008255	TATG	2	8	37230	37237	25 %	50 %	25 %	0 %	110636456
109	NC_008255	ATTG	2	8	37830	37837	25 %	50 %	25 %	0 %	110636456
110	NC_008255	GGAT	2	8	38422	38429	25 %	25 %	50 %	0 %	110636456
111	NC_008255	TGGA	2	8	38756	38763	25 %	25 %	50 %	0 %	110636456
112	NC_008255	TGAA	2	8	39125	39132	50 %	25 %	25 %	0 %	110636456
113	NC_008255	ATTT	2	8	39857	39864	25 %	75 %	0 %	0 %	110636457
114	NC_008255	TGGT	2	8	40025	40032	0 %	50 %	50 %	0 %	110636457
115	NC_008255	CTTC	2	8	40130	40137	0 %	50 %	0 %	50 %	110636458
116	NC_008255	AATA	2	8	40659	40666	75 %	25 %	0 %	0 %	110636459
117	NC_008255	CATT	2	8	41361	41368	25 %	50 %	0 %	25 %	110636459
118	NC_008255	AATA	2	8	41828	41835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008255	GATA	2	8	42128	42135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008255	AAAT	2	8	42663	42670	75 %	25 %	0 %	0 %	110636460
121	NC_008255	CAAA	2	8	43365	43372	75 %	0 %	0 %	25 %	110636460
122	NC_008255	AAAT	2	8	43718	43725	75 %	25 %	0 %	0 %	110636460
123	NC_008255	AATT	2	8	43754	43761	50 %	50 %	0 %	0 %	110636460
124	NC_008255	AGAA	2	8	44042	44049	75 %	0 %	25 %	0 %	110636460
125	NC_008255	AGAA	2	8	44271	44278	75 %	0 %	25 %	0 %	110636460
126	NC_008255	TTAT	2	8	44399	44406	25 %	75 %	0 %	0 %	110636460
127	NC_008255	ATAG	2	8	44853	44860	50 %	25 %	25 %	0 %	110636461
128	NC_008255	AAAT	2	8	44873	44880	75 %	25 %	0 %	0 %	110636461
129	NC_008255	GTTT	2	8	45382	45389	0 %	75 %	25 %	0 %	110636461
130	NC_008255	ACAG	2	8	45445	45452	50 %	0 %	25 %	25 %	110636461
131	NC_008255	TTGG	2	8	46400	46407	0 %	50 %	50 %	0 %	110636462
132	NC_008255	AATA	2	8	46537	46544	75 %	25 %	0 %	0 %	110636462
133	NC_008255	ATTG	2	8	46729	46736	25 %	50 %	25 %	0 %	110636463
134	NC_008255	TAAA	2	8	46793	46800	75 %	25 %	0 %	0 %	110636463
135	NC_008255	ATTG	2	8	46843	46850	25 %	50 %	25 %	0 %	110636463
136	NC_008255	TAAA	2	8	47189	47196	75 %	25 %	0 %	0 %	110636463
137	NC_008255	ATCC	2	8	47203	47210	25 %	25 %	0 %	50 %	110636463
138	NC_008255	TGAA	2	8	47336	47343	50 %	25 %	25 %	0 %	110636463
139	NC_008255	ATTA	2	8	47377	47384	50 %	50 %	0 %	0 %	110636463
140	NC_008255	ATTA	2	8	48489	48496	50 %	50 %	0 %	0 %	110636464
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142	NC_008255	TAAA	2	8	48703	48710	75 %	25 %	0 %	0 %	110636464
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