MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 chromosome

Total Repeats: 99689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008255	CAG	2	6	179585	179590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636574
4002	NC_008255	TAT	2	6	179644	179649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636574
4003	NC_008255	AAT	2	6	179656	179661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636574
4004	NC_008255	ATGA	2	8	179735	179742	50 %	25 %	25 %	0 %	110636575
4005	NC_008255	AGCA	2	8	179749	179756	50 %	0 %	25 %	25 %	110636575
4006	NC_008255	ATGC	2	8	179872	179879	25 %	25 %	25 %	25 %	110636575
4007	NC_008255	AC	3	6	179896	179901	50 %	0 %	0 %	50 %	110636575
4008	NC_008255	CAT	2	6	179908	179913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636575
4009	NC_008255	GCA	2	6	179963	179968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636575
4010	NC_008255	CAG	2	6	179994	179999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636575
4011	NC_008255	T	6	6	180010	180015	0 %	100 %	0 %	0 %	110636575
4012	NC_008255	GCA	2	6	180020	180025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636575
4013	NC_008255	ATGT	2	8	180059	180066	25 %	50 %	25 %	0 %	110636575
4014	NC_008255	GAA	2	6	180103	180108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636575
4015	NC_008255	A	6	6	180113	180118	100 %	0 %	0 %	0 %	110636575
4016	NC_008255	ACAG	2	8	180166	180173	50 %	0 %	25 %	25 %	110636575
4017	NC_008255	AAAAG	2	10	180232	180241	80 %	0 %	20 %	0 %	110636575
4018	NC_008255	AGT	2	6	180303	180308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_008255	T	6	6	180409	180414	0 %	100 %	0 %	0 %	110636576
4020	NC_008255	AAC	2	6	180492	180497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636576
4021	NC_008255	A	7	7	180506	180512	100 %	0 %	0 %	0 %	110636576
4022	NC_008255	CGA	2	6	180526	180531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636576
4023	NC_008255	T	7	7	180534	180540	0 %	100 %	0 %	0 %	110636576
4024	NC_008255	ATA	2	6	180678	180683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636576
4025	NC_008255	A	6	6	180688	180693	100 %	0 %	0 %	0 %	110636576
4026	NC_008255	TTTG	2	8	180697	180704	0 %	75 %	25 %	0 %	110636576
4027	NC_008255	TGA	2	6	180810	180815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636576
4028	NC_008255	T	6	6	180883	180888	0 %	100 %	0 %	0 %	110636576
4029	NC_008255	TA	4	8	180936	180943	50 %	50 %	0 %	0 %	110636576
4030	NC_008255	A	6	6	180943	180948	100 %	0 %	0 %	0 %	110636576
4031	NC_008255	TGC	2	6	180951	180956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636576
4032	NC_008255	GAT	2	6	181004	181009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636576
4033	NC_008255	AAAATC	2	12	181014	181025	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	110636576
4034	NC_008255	AAG	2	6	181048	181053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636576
4035	NC_008255	TTGGTG	2	12	181089	181100	0 %	50 %	50 %	0 %	110636576
4036	NC_008255	CAT	2	6	181157	181162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636576
4037	NC_008255	TGA	2	6	181294	181299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636576
4038	NC_008255	A	6	6	181409	181414	100 %	0 %	0 %	0 %	110636576
4039	NC_008255	CAG	2	6	181440	181445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636576
4040	NC_008255	GATA	2	8	181486	181493	50 %	25 %	25 %	0 %	110636576
4041	NC_008255	AC	3	6	181508	181513	50 %	0 %	0 %	50 %	110636576
4042	NC_008255	AGCG	2	8	181552	181559	25 %	0 %	50 %	25 %	110636576
4043	NC_008255	CAT	2	6	181609	181614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636576
4044	NC_008255	CAAA	2	8	181662	181669	75 %	0 %	0 %	25 %	110636576
4045	NC_008255	T	6	6	181795	181800	0 %	100 %	0 %	0 %	110636576
4046	NC_008255	GAA	4	12	181832	181843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636576
4047	NC_008255	AAG	2	6	181872	181877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636576
4048	NC_008255	CA	3	6	181912	181917	50 %	0 %	0 %	50 %	110636576
4049	NC_008255	CCT	2	6	181956	181961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110636576
4050	NC_008255	TAT	2	6	181965	181970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636576
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4052	NC_008255	TAA	2	6	182020	182025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636576
4053	NC_008255	GAT	2	6	182150	182155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636576
4054	NC_008255	A	7	7	182167	182173	100 %	0 %	0 %	0 %	110636576
4055	NC_008255	TA	3	6	182183	182188	50 %	50 %	0 %	0 %	110636576
4056	NC_008255	T	6	6	182218	182223	0 %	100 %	0 %	0 %	110636576
4057	NC_008255	TCA	2	6	182247	182252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636576
4058	NC_008255	AGA	2	6	182326	182331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636576
4059	NC_008255	TAA	2	6	182377	182382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636576
4060	NC_008255	AAT	2	6	182476	182481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636576
4061	NC_008255	A	6	6	182560	182565	100 %	0 %	0 %	0 %	110636576
4062	NC_008255	T	6	6	182618	182623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_008255	GTA	2	6	182630	182635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_008255	CCT	2	6	182669	182674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_008255	GA	3	6	182675	182680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_008255	T	6	6	182705	182710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_008255	AGC	2	6	182764	182769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_008255	AAT	2	6	182828	182833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_008255	A	8	8	182940	182947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_008255	GAG	2	6	182948	182953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_008255	GGAAA	2	10	182998	183007	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_008255	AATAG	2	10	183028	183037	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_008255	TAAAT	2	10	183045	183054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_008255	GACA	2	8	183068	183075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4075	NC_008255	ACCT	2	8	183269	183276	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4076	NC_008255	CATGA	2	10	183335	183344	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4077	NC_008255	CGAT	2	8	183421	183428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4078	NC_008255	GAT	2	6	183443	183448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_008255	GCA	2	6	183492	183497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_008255	GAA	2	6	183551	183556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_008255	ACT	2	6	183574	183579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_008255	CAG	2	6	183654	183659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_008255	GGC	2	6	183719	183724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_008255	TAA	2	6	183726	183731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_008255	GTG	2	6	183736	183741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_008255	GAT	2	6	183953	183958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_008255	TG	3	6	183966	183971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_008255	AAGCGA	2	12	183991	184002	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4089	NC_008255	GAT	2	6	184095	184100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_008255	TGC	2	6	184179	184184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_008255	GTC	2	6	184191	184196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_008255	AG	3	6	184282	184287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_008255	AG	3	6	184303	184308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_008255	AGG	2	6	184311	184316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_008255	GAC	2	6	184318	184323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_008255	TCA	2	6	184330	184335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_008255	AC	3	6	184356	184361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_008255	AC	3	6	184526	184531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_008255	TGG	2	6	184554	184559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_008255	CCT	2	6	184658	184663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_008255	ATT	2	6	184715	184720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_008255	CTA	2	6	184726	184731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_008255	TTTA	2	8	184733	184740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_008255	TAA	2	6	184767	184772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_008255	GGT	2	6	184791	184796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_008255	GTT	2	6	184883	184888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_008255	AAT	2	6	184901	184906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_008255	AGT	2	6	185094	185099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_008255	TAA	2	6	185134	185139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_008255	ATAA	2	8	185145	185152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_008255	GAA	2	6	185186	185191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_008255	CTG	2	6	185224	185229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_008255	GGA	2	6	185334	185339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_008255	AGT	2	6	185365	185370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_008255	GCGA	2	8	185372	185379	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_008255	TGT	2	6	185401	185406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_008255	GA	3	6	185599	185604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_008255	CTC	2	6	185751	185756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_008255	TGA	2	6	186072	186077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4121	NC_008255	AGC	2	6	186237	186242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_008255	ATA	2	6	186294	186299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_008255	GTA	2	6	186314	186319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_008255	ATA	2	6	186440	186445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_008255	TCG	2	6	186494	186499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_008255	AGT	2	6	186545	186550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_008255	GA	3	6	186597	186602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_008255	AGT	2	6	186606	186611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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