MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 chromosome

Total Repeats: 99689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008255	ACAATA	2	12	158569	158580	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	110636557
3502	NC_008255	ATT	2	6	158617	158622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636557
3503	NC_008255	A	6	6	158624	158629	100 %	0 %	0 %	0 %	110636557
3504	NC_008255	TCC	2	6	158678	158683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110636558
3505	NC_008255	T	7	7	158686	158692	0 %	100 %	0 %	0 %	110636558
3506	NC_008255	A	6	6	158714	158719	100 %	0 %	0 %	0 %	110636558
3507	NC_008255	ATTG	2	8	158758	158765	25 %	50 %	25 %	0 %	110636558
3508	NC_008255	TTC	2	6	158782	158787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636558
3509	NC_008255	CCAT	2	8	158788	158795	25 %	25 %	0 %	50 %	110636558
3510	NC_008255	CAAC	2	8	158802	158809	50 %	0 %	0 %	50 %	110636558
3511	NC_008255	GAG	2	6	158886	158891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_008255	TAA	2	6	158909	158914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_008255	CAAGAA	2	12	158935	158946	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3514	NC_008255	ATA	2	6	158951	158956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636559
3515	NC_008255	TTTA	2	8	158959	158966	25 %	75 %	0 %	0 %	110636559
3516	NC_008255	TAA	2	6	159126	159131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636559
3517	NC_008255	CTT	2	6	159132	159137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636559
3518	NC_008255	CATG	2	8	159143	159150	25 %	25 %	25 %	25 %	110636559
3519	NC_008255	ATA	2	6	159214	159219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636559
3520	NC_008255	TGA	2	6	159305	159310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636559
3521	NC_008255	TTCAA	2	10	159344	159353	40 %	40 %	0 %	20 %	110636559
3522	NC_008255	CTT	2	6	159366	159371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636559
3523	NC_008255	CCT	2	6	159380	159385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110636559
3524	NC_008255	GAA	2	6	159390	159395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636559
3525	NC_008255	TGCTT	2	10	159399	159408	0 %	60 %	20 %	20 %	110636559
3526	NC_008255	ATT	2	6	159461	159466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636559
3527	NC_008255	T	6	6	159479	159484	0 %	100 %	0 %	0 %	110636560
3528	NC_008255	A	6	6	159496	159501	100 %	0 %	0 %	0 %	110636560
3529	NC_008255	AAT	2	6	159534	159539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636560
3530	NC_008255	ATA	2	6	159563	159568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636560
3531	NC_008255	TG	3	6	159606	159611	0 %	50 %	50 %	0 %	110636560
3532	NC_008255	CACG	2	8	159623	159630	25 %	0 %	25 %	50 %	110636560
3533	NC_008255	ACC	2	6	159635	159640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110636560
3534	NC_008255	T	8	8	159647	159654	0 %	100 %	0 %	0 %	110636560
3535	NC_008255	TTC	2	6	159675	159680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636560
3536	NC_008255	GCA	2	6	159700	159705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636560
3537	NC_008255	ACC	2	6	159737	159742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110636560
3538	NC_008255	CTG	2	6	159765	159770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636560
3539	NC_008255	CAT	2	6	159824	159829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636560
3540	NC_008255	GTA	2	6	159850	159855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636560
3541	NC_008255	TAA	2	6	159903	159908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636560
3542	NC_008255	ATA	2	6	160056	160061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636560
3543	NC_008255	TAA	2	6	160115	160120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636560
3544	NC_008255	AAC	2	6	160137	160142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636560
3545	NC_008255	GTC	2	6	160200	160205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636560
3546	NC_008255	T	6	6	160233	160238	0 %	100 %	0 %	0 %	110636560
3547	NC_008255	ATA	2	6	160239	160244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636560
3548	NC_008255	T	6	6	160281	160286	0 %	100 %	0 %	0 %	110636560
3549	NC_008255	GACATC	2	12	160299	160310	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110636560
3550	NC_008255	TA	3	6	160371	160376	50 %	50 %	0 %	0 %	110636560
3551	NC_008255	TAG	2	6	160385	160390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636560
3552	NC_008255	T	6	6	160424	160429	0 %	100 %	0 %	0 %	110636560
3553	NC_008255	GCA	3	9	160435	160443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636560
3554	NC_008255	ATT	2	6	160455	160460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636560
3555	NC_008255	T	6	6	160478	160483	0 %	100 %	0 %	0 %	110636560
3556	NC_008255	A	7	7	160491	160497	100 %	0 %	0 %	0 %	110636560
3557	NC_008255	TAAAA	2	10	160599	160608	80 %	20 %	0 %	0 %	110636560
3558	NC_008255	CAA	2	6	160629	160634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636560
3559	NC_008255	CTT	2	6	160649	160654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636560
3560	NC_008255	GT	3	6	160659	160664	0 %	50 %	50 %	0 %	110636560
3561	NC_008255	AAAC	2	8	160679	160686	75 %	0 %	0 %	25 %	110636560
3562	NC_008255	ATA	2	6	160734	160739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636560
3563	NC_008255	CAAT	2	8	160847	160854	50 %	25 %	0 %	25 %	110636560
3564	NC_008255	A	6	6	160971	160976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_008255	TAT	2	6	161018	161023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636561
3566	NC_008255	CTG	3	9	161073	161081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636561
3567	NC_008255	T	6	6	161083	161088	0 %	100 %	0 %	0 %	110636561
3568	NC_008255	CTG	2	6	161104	161109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636561
3569	NC_008255	TCAGCA	2	12	161123	161134	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110636561
3570	NC_008255	CCG	3	9	161157	161165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110636561
3571	NC_008255	CTG	2	6	161190	161195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636561
3572	NC_008255	CCG	2	6	161196	161201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110636561
3573	NC_008255	TGC	2	6	161302	161307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636561
3574	NC_008255	TTTTG	2	10	161362	161371	0 %	80 %	20 %	0 %	110636561
3575	NC_008255	AGT	2	6	161488	161493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636561
3576	NC_008255	CAA	2	6	161604	161609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636561
3577	NC_008255	CAG	2	6	161623	161628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636561
3578	NC_008255	CAT	2	6	161761	161766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636561
3579	NC_008255	TCT	2	6	161841	161846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636561
3580	NC_008255	CTT	2	6	161871	161876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636561
3581	NC_008255	GCA	2	6	161879	161884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636561
3582	NC_008255	TG	3	6	161933	161938	0 %	50 %	50 %	0 %	110636561
3583	NC_008255	CGC	2	6	161946	161951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110636561
3584	NC_008255	CCT	2	6	161966	161971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110636561
3585	NC_008255	ACGA	2	8	162013	162020	50 %	0 %	25 %	25 %	110636561
3586	NC_008255	GCA	2	6	162077	162082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636561
3587	NC_008255	CAA	2	6	162114	162119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636561
3588	NC_008255	CTT	3	9	162132	162140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636561
3589	NC_008255	GTT	3	9	162155	162163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636561
3590	NC_008255	CATT	2	8	162179	162186	25 %	50 %	0 %	25 %	110636561
3591	NC_008255	GCT	2	6	162320	162325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636561
3592	NC_008255	T	6	6	162361	162366	0 %	100 %	0 %	0 %	110636561
3593	NC_008255	AT	3	6	162414	162419	50 %	50 %	0 %	0 %	110636561
3594	NC_008255	TTGT	2	8	162432	162439	0 %	75 %	25 %	0 %	110636561
3595	NC_008255	TAGTG	2	10	162514	162523	20 %	40 %	40 %	0 %	110636561
3596	NC_008255	ATA	2	6	162563	162568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636561
3597	NC_008255	ATC	2	6	162595	162600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636561
3598	NC_008255	TTTCA	2	10	162619	162628	20 %	60 %	0 %	20 %	110636561
3599	NC_008255	TAA	2	6	162664	162669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636561
3600	NC_008255	TGT	2	6	162865	162870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636561
3601	NC_008255	TCA	2	6	162957	162962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636561
3602	NC_008255	ATCG	2	8	162973	162980	25 %	25 %	25 %	25 %	110636561
3603	NC_008255	T	6	6	163006	163011	0 %	100 %	0 %	0 %	110636561
3604	NC_008255	CAA	2	6	163017	163022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636561
3605	NC_008255	GTC	2	6	163048	163053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636561
3606	NC_008255	GTT	2	6	163154	163159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636561
3607	NC_008255	TGT	2	6	163230	163235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636561
3608	NC_008255	ATA	2	6	163254	163259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636561
3609	NC_008255	ATC	2	6	163309	163314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636561
3610	NC_008255	AGC	2	6	163417	163422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636561
3611	NC_008255	CAA	2	6	163470	163475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636561
3612	NC_008255	GTTG	2	8	163480	163487	0 %	50 %	50 %	0 %	110636561
3613	NC_008255	CGC	2	6	163530	163535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110636561
3614	NC_008255	CATA	2	8	163566	163573	50 %	25 %	0 %	25 %	110636561
3615	NC_008255	ATC	2	6	163585	163590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636561
3616	NC_008255	TTC	2	6	163651	163656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636561
3617	NC_008255	GCA	2	6	163661	163666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636561
3618	NC_008255	TGT	2	6	163675	163680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636561
3619	NC_008255	GTAA	2	8	163687	163694	50 %	25 %	25 %	0 %	110636561
3620	NC_008255	TTGCT	2	10	163819	163828	0 %	60 %	20 %	20 %	110636561
3621	NC_008255	GA	3	6	163911	163916	50 %	0 %	50 %	0 %	110636561
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3623	NC_008255	TAT	2	6	163987	163992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636561
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4000	NC_008255	GAAA	2	8	179497	179504	75 %	0 %	25 %	0 %	110636574

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