MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 chromosome

Total Repeats: 99689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008255	TTCT	2	8	136482	136489	0 %	75 %	0 %	25 %	110636538
3002	NC_008255	GCA	2	6	136528	136533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636538
3003	NC_008255	ATT	2	6	136564	136569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636538
3004	NC_008255	TAC	2	6	136581	136586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636538
3005	NC_008255	TGG	2	6	136675	136680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110636538
3006	NC_008255	A	6	6	136697	136702	100 %	0 %	0 %	0 %	110636538
3007	NC_008255	GAC	2	6	136711	136716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636538
3008	NC_008255	GAT	2	6	136794	136799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636538
3009	NC_008255	TC	3	6	136826	136831	0 %	50 %	0 %	50 %	110636538
3010	NC_008255	CAGG	2	8	136852	136859	25 %	0 %	50 %	25 %	110636538
3011	NC_008255	CAT	2	6	136860	136865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636538
3012	NC_008255	GTT	2	6	136944	136949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636538
3013	NC_008255	CA	3	6	137000	137005	50 %	0 %	0 %	50 %	110636538
3014	NC_008255	TAA	2	6	137039	137044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636538
3015	NC_008255	AAT	2	6	137074	137079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636538
3016	NC_008255	TA	3	6	137147	137152	50 %	50 %	0 %	0 %	110636538
3017	NC_008255	ATG	2	6	137158	137163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636538
3018	NC_008255	GTTGG	2	10	137300	137309	0 %	40 %	60 %	0 %	110636538
3019	NC_008255	TTA	2	6	137378	137383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636538
3020	NC_008255	GCT	2	6	137454	137459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636538
3021	NC_008255	T	6	6	137472	137477	0 %	100 %	0 %	0 %	110636538
3022	NC_008255	ACAA	2	8	137493	137500	75 %	0 %	0 %	25 %	110636538
3023	NC_008255	GGA	2	6	137508	137513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110636538
3024	NC_008255	TTG	2	6	137518	137523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636538
3025	NC_008255	TGC	2	6	137561	137566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636538
3026	NC_008255	AAC	2	6	137579	137584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636538
3027	NC_008255	AG	3	6	137631	137636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_008255	AAT	2	6	137660	137665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636539
3029	NC_008255	ATC	2	6	137686	137691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636539
3030	NC_008255	CTT	2	6	137694	137699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636539
3031	NC_008255	TAA	2	6	137722	137727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636539
3032	NC_008255	TAA	2	6	137779	137784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636539
3033	NC_008255	CAC	2	6	137811	137816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110636539
3034	NC_008255	CAATA	2	10	137845	137854	60 %	20 %	0 %	20 %	110636539
3035	NC_008255	AAT	2	6	137992	137997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636539
3036	NC_008255	CAA	2	6	138012	138017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636539
3037	NC_008255	AAC	2	6	138076	138081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636539
3038	NC_008255	CAA	2	6	138102	138107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636539
3039	NC_008255	CAC	2	6	138108	138113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110636539
3040	NC_008255	T	6	6	138130	138135	0 %	100 %	0 %	0 %	110636539
3041	NC_008255	ATC	2	6	138208	138213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636539
3042	NC_008255	AGA	2	6	138235	138240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636539
3043	NC_008255	AGC	2	6	138295	138300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636539
3044	NC_008255	T	6	6	138307	138312	0 %	100 %	0 %	0 %	110636539
3045	NC_008255	TCT	2	6	138332	138337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636539
3046	NC_008255	GTT	2	6	138350	138355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636539
3047	NC_008255	AAT	2	6	138411	138416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636539
3048	NC_008255	CAA	2	6	138444	138449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636539
3049	NC_008255	CAA	2	6	138465	138470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636539
3050	NC_008255	ACC	2	6	138481	138486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110636539
3051	NC_008255	GCC	2	6	138511	138516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110636539
3052	NC_008255	AGA	2	6	138556	138561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636539
3053	NC_008255	AAATTC	2	12	138599	138610	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	110636539
3054	NC_008255	T	6	6	138620	138625	0 %	100 %	0 %	0 %	110636539
3055	NC_008255	AATG	2	8	138628	138635	50 %	25 %	25 %	0 %	110636539
3056	NC_008255	GAAA	2	8	138640	138647	75 %	0 %	25 %	0 %	110636539
3057	NC_008255	T	6	6	138665	138670	0 %	100 %	0 %	0 %	110636539
3058	NC_008255	CCAT	2	8	138672	138679	25 %	25 %	0 %	50 %	110636539
3059	NC_008255	AT	3	6	138698	138703	50 %	50 %	0 %	0 %	110636539
3060	NC_008255	GTT	2	6	138743	138748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636539
3061	NC_008255	AATAA	2	10	138782	138791	80 %	20 %	0 %	0 %	110636539
3062	NC_008255	TTG	2	6	138804	138809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636539
3063	NC_008255	TTC	2	6	138892	138897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636539
3064	NC_008255	GAT	2	6	139018	139023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636539
3065	NC_008255	CAATG	2	10	139033	139042	40 %	20 %	20 %	20 %	110636539
3066	NC_008255	ACC	2	6	139054	139059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110636539
3067	NC_008255	GTA	2	6	139066	139071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636539
3068	NC_008255	CCAT	2	8	139124	139131	25 %	25 %	0 %	50 %	110636539
3069	NC_008255	CTT	2	6	139167	139172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636539
3070	NC_008255	TTTTG	2	10	139341	139350	0 %	80 %	20 %	0 %	110636539
3071	NC_008255	AGC	2	6	139360	139365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636539
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3074	NC_008255	AT	3	6	139526	139531	50 %	50 %	0 %	0 %	110636539
3075	NC_008255	CAA	2	6	139545	139550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636539
3076	NC_008255	TGA	2	6	139629	139634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636539
3077	NC_008255	TGT	2	6	139645	139650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636539
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3079	NC_008255	GCA	2	6	139721	139726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636539
3080	NC_008255	TGC	2	6	139747	139752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636539
3081	NC_008255	CAG	2	6	139761	139766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636539
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3088	NC_008255	CAA	2	6	139989	139994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636539
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3092	NC_008255	TGC	2	6	140208	140213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636539
3093	NC_008255	A	6	6	140224	140229	100 %	0 %	0 %	0 %	110636539
3094	NC_008255	TTG	2	6	140233	140238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636539
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3096	NC_008255	CTT	2	6	140415	140420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636539
3097	NC_008255	AAG	2	6	140441	140446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636539
3098	NC_008255	TA	3	6	140448	140453	50 %	50 %	0 %	0 %	110636539
3099	NC_008255	TA	4	8	140463	140470	50 %	50 %	0 %	0 %	110636539
3100	NC_008255	T	6	6	140488	140493	0 %	100 %	0 %	0 %	110636539
3101	NC_008255	TGT	2	6	140518	140523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636539
3102	NC_008255	TGC	2	6	140524	140529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636539
3103	NC_008255	TATAAA	2	12	140648	140659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_008255	ATT	2	6	140784	140789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636540
3105	NC_008255	CAAA	2	8	140844	140851	75 %	0 %	0 %	25 %	110636540
3106	NC_008255	CTTTT	2	10	140967	140976	0 %	80 %	0 %	20 %	110636540
3107	NC_008255	AAG	2	6	141066	141071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636540
3108	NC_008255	CTAA	2	8	141122	141129	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_008255	ATTT	2	8	141147	141154	25 %	75 %	0 %	0 %	110636541
3110	NC_008255	AAT	2	6	141155	141160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636541
3111	NC_008255	CCT	2	6	141230	141235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110636541
3112	NC_008255	TAA	2	6	141415	141420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636541
3113	NC_008255	A	6	6	141419	141424	100 %	0 %	0 %	0 %	110636541
3114	NC_008255	TA	4	8	141503	141510	50 %	50 %	0 %	0 %	110636541
3115	NC_008255	GTT	2	6	141512	141517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636541
3116	NC_008255	T	6	6	141560	141565	0 %	100 %	0 %	0 %	110636541
3117	NC_008255	TCC	2	6	141729	141734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110636541
3118	NC_008255	GCG	2	6	141752	141757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110636541
3119	NC_008255	T	7	7	141828	141834	0 %	100 %	0 %	0 %	110636542
3120	NC_008255	T	6	6	142014	142019	0 %	100 %	0 %	0 %	110636542
3121	NC_008255	GCA	2	6	142032	142037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636542
3122	NC_008255	TCG	2	6	142140	142145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636542
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3124	NC_008255	AGCAA	2	10	142325	142334	60 %	0 %	20 %	20 %	110636542
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3452	NC_008255	A	6	6	157064	157069	100 %	0 %	0 %	0 %	110636556
3453	NC_008255	TTGCG	2	10	157087	157096	0 %	40 %	40 %	20 %	110636556
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3456	NC_008255	ATGC	2	8	157167	157174	25 %	25 %	25 %	25 %	110636556
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3473	NC_008255	GATA	2	8	157745	157752	50 %	25 %	25 %	0 %	110636556
3474	NC_008255	AGC	2	6	157811	157816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636556
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3479	NC_008255	ACG	2	6	157933	157938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636556
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3482	NC_008255	TTA	2	6	158071	158076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3483	NC_008255	TA	3	6	158075	158080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3484	NC_008255	T	7	7	158092	158098	0 %	100 %	0 %	0 %	110636557
3485	NC_008255	T	7	7	158117	158123	0 %	100 %	0 %	0 %	110636557
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3487	NC_008255	TTA	2	6	158149	158154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636557
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3489	NC_008255	TAC	2	6	158183	158188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636557
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3491	NC_008255	TAA	3	9	158254	158262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636557
3492	NC_008255	GAT	2	6	158286	158291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636557
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3494	NC_008255	ATG	2	6	158334	158339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636557
3495	NC_008255	CAT	3	9	158386	158394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636557
3496	NC_008255	A	6	6	158396	158401	100 %	0 %	0 %	0 %	110636557
3497	NC_008255	TCATAA	2	12	158438	158449	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	110636557
3498	NC_008255	AGC	2	6	158453	158458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636557
3499	NC_008255	AAATAA	2	12	158470	158481	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	110636557
3500	NC_008255	AT	3	6	158517	158522	50 %	50 %	0 %	0 %	110636557

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