MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 chromosome

Total Repeats: 99689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008255	TCA	2	6	21735	21740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636447
502	NC_008255	TAA	2	6	21774	21779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636447
503	NC_008255	AGG	2	6	21874	21879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110636447
504	NC_008255	AGT	3	9	21883	21891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636447
505	NC_008255	AGA	2	6	21970	21975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636447
506	NC_008255	GTT	2	6	21992	21997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636447
507	NC_008255	TAT	2	6	22079	22084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636447
508	NC_008255	TTC	2	6	22206	22211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636447
509	NC_008255	AT	3	6	22285	22290	50 %	50 %	0 %	0 %	110636447
510	NC_008255	TAG	2	6	22305	22310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636447
511	NC_008255	TTA	2	6	22338	22343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636447
512	NC_008255	CTT	2	6	22350	22355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636447
513	NC_008255	A	6	6	22660	22665	100 %	0 %	0 %	0 %	110636448
514	NC_008255	A	7	7	22676	22682	100 %	0 %	0 %	0 %	110636448
515	NC_008255	ACT	2	6	22698	22703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636448
516	NC_008255	TTCT	2	8	22717	22724	0 %	75 %	0 %	25 %	110636448
517	NC_008255	TATT	2	8	22736	22743	25 %	75 %	0 %	0 %	110636448
518	NC_008255	TTA	2	6	22772	22777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636448
519	NC_008255	CAAA	2	8	22788	22795	75 %	0 %	0 %	25 %	110636448
520	NC_008255	T	6	6	22809	22814	0 %	100 %	0 %	0 %	110636448
521	NC_008255	TGG	2	6	22844	22849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110636448
522	NC_008255	TCAA	2	8	22985	22992	50 %	25 %	0 %	25 %	110636448
523	NC_008255	GAA	2	6	22998	23003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636448
524	NC_008255	A	6	6	23019	23024	100 %	0 %	0 %	0 %	110636448
525	NC_008255	TAC	3	9	23055	23063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636448
526	NC_008255	ATG	2	6	23098	23103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636448
527	NC_008255	CAGA	2	8	23162	23169	50 %	0 %	25 %	25 %	110636448
528	NC_008255	AAC	2	6	23170	23175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636448
529	NC_008255	AAG	2	6	23215	23220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636448
530	NC_008255	TAT	3	9	23283	23291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636448
531	NC_008255	ATT	2	6	23319	23324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636448
532	NC_008255	A	6	6	23465	23470	100 %	0 %	0 %	0 %	110636448
533	NC_008255	CAA	2	6	23500	23505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636448
534	NC_008255	TGC	2	6	23510	23515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636448
535	NC_008255	TAC	2	6	23537	23542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636448
536	NC_008255	ACA	2	6	23553	23558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636448
537	NC_008255	CAA	2	6	23609	23614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636448
538	NC_008255	A	6	6	23616	23621	100 %	0 %	0 %	0 %	110636448
539	NC_008255	GAA	2	6	23622	23627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636448
540	NC_008255	ATT	2	6	23638	23643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636448
541	NC_008255	AAT	2	6	23667	23672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636448
542	NC_008255	TTG	2	6	23731	23736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636448
543	NC_008255	CTT	2	6	23759	23764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636448
544	NC_008255	CTTT	2	8	23803	23810	0 %	75 %	0 %	25 %	110636448
545	NC_008255	AGA	2	6	23846	23851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636448
546	NC_008255	TTGC	2	8	23904	23911	0 %	50 %	25 %	25 %	110636448
547	NC_008255	GCT	2	6	23952	23957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636448
548	NC_008255	AAC	2	6	24003	24008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636448
549	NC_008255	CTA	2	6	24014	24019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636448
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553	NC_008255	ATTG	2	8	24302	24309	25 %	50 %	25 %	0 %	110636448
554	NC_008255	A	7	7	24312	24318	100 %	0 %	0 %	0 %	110636448
555	NC_008255	AATAA	2	10	24340	24349	80 %	20 %	0 %	0 %	110636448
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557	NC_008255	TTCT	2	8	24369	24376	0 %	75 %	0 %	25 %	110636449
558	NC_008255	ATTT	2	8	24378	24385	25 %	75 %	0 %	0 %	110636449
559	NC_008255	A	7	7	24391	24397	100 %	0 %	0 %	0 %	110636449
560	NC_008255	TGT	2	6	24402	24407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636449
561	NC_008255	GTT	2	6	24442	24447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636449
562	NC_008255	TA	3	6	24474	24479	50 %	50 %	0 %	0 %	110636449
563	NC_008255	CAA	2	6	24485	24490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636449
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569	NC_008255	A	6	6	24814	24819	100 %	0 %	0 %	0 %	110636449
570	NC_008255	GATA	2	8	24849	24856	50 %	25 %	25 %	0 %	110636449
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574	NC_008255	A	7	7	25080	25086	100 %	0 %	0 %	0 %	110636449
575	NC_008255	AT	3	6	25108	25113	50 %	50 %	0 %	0 %	110636450
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580	NC_008255	AGC	2	6	25248	25253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636450
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589	NC_008255	ATGCAC	2	12	25542	25553	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110636450
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593	NC_008255	A	6	6	25672	25677	100 %	0 %	0 %	0 %	110636450
594	NC_008255	A	6	6	25690	25695	100 %	0 %	0 %	0 %	110636450
595	NC_008255	TCA	2	6	25724	25729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636450
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599	NC_008255	CGAA	2	8	25816	25823	50 %	0 %	25 %	25 %	110636450
600	NC_008255	A	7	7	25822	25828	100 %	0 %	0 %	0 %	110636450
601	NC_008255	TAA	2	6	25864	25869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636450
602	NC_008255	A	7	7	25881	25887	100 %	0 %	0 %	0 %	110636450
603	NC_008255	GCA	2	6	26122	26127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636450
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608	NC_008255	A	7	7	26494	26500	100 %	0 %	0 %	0 %	110636451
609	NC_008255	AAG	2	6	26558	26563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636451
610	NC_008255	GAC	2	6	26593	26598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636451
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612	NC_008255	TAC	2	6	26695	26700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636452
613	NC_008255	A	6	6	26703	26708	100 %	0 %	0 %	0 %	110636452
614	NC_008255	AT	3	6	26888	26893	50 %	50 %	0 %	0 %	110636452
615	NC_008255	TAT	3	9	26955	26963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636452
616	NC_008255	GCC	2	6	26966	26971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110636452
617	NC_008255	TGA	2	6	26979	26984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636452
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625	NC_008255	CAGGA	2	10	27299	27308	40 %	0 %	40 %	20 %	110636452
626	NC_008255	TTC	2	6	27327	27332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636452
627	NC_008255	AAG	2	6	27398	27403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636452
628	NC_008255	CA	3	6	27444	27449	50 %	0 %	0 %	50 %	110636452
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630	NC_008255	TTA	2	6	27508	27513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636452
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669	NC_008255	A	6	6	29297	29302	100 %	0 %	0 %	0 %	110636453
670	NC_008255	TAT	2	6	29390	29395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636453
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759	NC_008255	A	6	6	34266	34271	100 %	0 %	0 %	0 %	110636456
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761	NC_008255	GCAA	2	8	34411	34418	50 %	0 %	25 %	25 %	110636456
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