MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 chromosome

Total Repeats: 99689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008255	AAC	3	9	226022	226030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636607
5002	NC_008255	AGA	2	6	226043	226048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636607
5003	NC_008255	AGAT	2	8	226111	226118	50 %	25 %	25 %	0 %	110636607
5004	NC_008255	A	6	6	226120	226125	100 %	0 %	0 %	0 %	110636607
5005	NC_008255	AGG	2	6	226130	226135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110636607
5006	NC_008255	AATAA	2	10	226191	226200	80 %	20 %	0 %	0 %	110636607
5007	NC_008255	A	6	6	226199	226204	100 %	0 %	0 %	0 %	110636607
5008	NC_008255	TAT	2	6	226237	226242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_008255	AT	3	6	226244	226249	50 %	50 %	0 %	0 %	110636608
5010	NC_008255	TGA	2	6	226265	226270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636608
5011	NC_008255	CAG	2	6	226290	226295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636608
5012	NC_008255	AGA	2	6	226325	226330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636608
5013	NC_008255	TTC	2	6	226342	226347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636608
5014	NC_008255	ATT	2	6	226403	226408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636608
5015	NC_008255	GAA	2	6	226449	226454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636608
5016	NC_008255	AAG	2	6	226498	226503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636608
5017	NC_008255	GTT	2	6	226569	226574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636608
5018	NC_008255	TA	3	6	226624	226629	50 %	50 %	0 %	0 %	110636608
5019	NC_008255	ATC	2	6	226752	226757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636608
5020	NC_008255	AAC	2	6	226778	226783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636608
5021	NC_008255	ATCA	2	8	226803	226810	50 %	25 %	0 %	25 %	110636608
5022	NC_008255	CTA	2	6	226876	226881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636608
5023	NC_008255	AGT	3	9	226931	226939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636608
5024	NC_008255	GCT	2	6	226941	226946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636608
5025	NC_008255	GTT	2	6	227040	227045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636608
5026	NC_008255	ATG	2	6	227047	227052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636608
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5028	NC_008255	TTA	2	6	227157	227162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636608
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5030	NC_008255	TGA	2	6	227189	227194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636608
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5032	NC_008255	TCT	2	6	227347	227352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636608
5033	NC_008255	TGG	2	6	227420	227425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110636608
5034	NC_008255	ATCAA	2	10	227436	227445	60 %	20 %	0 %	20 %	110636608
5035	NC_008255	A	6	6	227448	227453	100 %	0 %	0 %	0 %	110636608
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5039	NC_008255	CAA	2	6	227626	227631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636608
5040	NC_008255	CAA	2	6	227641	227646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636608
5041	NC_008255	GTA	2	6	227667	227672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636608
5042	NC_008255	AAATC	2	10	227743	227752	60 %	20 %	0 %	20 %	110636608
5043	NC_008255	TGA	2	6	227762	227767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636608
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5045	NC_008255	AAG	2	6	227800	227805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636608
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5054	NC_008255	TTG	2	6	228067	228072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636609
5055	NC_008255	CAGA	2	8	228082	228089	50 %	0 %	25 %	25 %	110636609
5056	NC_008255	ATTG	2	8	228137	228144	25 %	50 %	25 %	0 %	110636609
5057	NC_008255	A	6	6	228201	228206	100 %	0 %	0 %	0 %	110636609
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5061	NC_008255	GGCA	2	8	228421	228428	25 %	0 %	50 %	25 %	110636609
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5069	NC_008255	AT	3	6	228789	228794	50 %	50 %	0 %	0 %	110636610
5070	NC_008255	T	7	7	228854	228860	0 %	100 %	0 %	0 %	110636610
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5091	NC_008255	TGGGA	2	10	229570	229579	20 %	20 %	60 %	0 %	110636610
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5104	NC_008255	GAG	2	6	229923	229928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110636611
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5107	NC_008255	AG	3	6	230040	230045	50 %	0 %	50 %	0 %	110636611
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5110	NC_008255	TGCGGG	2	12	230315	230326	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	110636611
5111	NC_008255	TTAAA	2	10	230398	230407	60 %	40 %	0 %	0 %	110636611
5112	NC_008255	TAT	2	6	230444	230449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636611
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5117	NC_008255	A	6	6	230811	230816	100 %	0 %	0 %	0 %	110636611
5118	NC_008255	T	7	7	230874	230880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_008255	A	7	7	230931	230937	100 %	0 %	0 %	0 %	110636612
5120	NC_008255	T	8	8	230950	230957	0 %	100 %	0 %	0 %	110636612
5121	NC_008255	CTTA	2	8	230979	230986	25 %	50 %	0 %	25 %	110636612
5122	NC_008255	AGA	2	6	231017	231022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636612
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5124	NC_008255	AAG	2	6	231118	231123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636612
5125	NC_008255	TGA	2	6	231499	231504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636612
5126	NC_008255	ACAGAA	2	12	231604	231615	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	110636612
5127	NC_008255	AT	3	6	231654	231659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_008255	CT	3	6	231728	231733	0 %	50 %	0 %	50 %	110636613
5129	NC_008255	GTT	2	6	231757	231762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636613
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5133	NC_008255	GCT	2	6	231962	231967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636613
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5139	NC_008255	ATATC	2	10	232365	232374	40 %	40 %	0 %	20 %	110636614
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5143	NC_008255	TGT	2	6	232462	232467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_008255	ATG	2	6	232473	232478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5145	NC_008255	TTTTTA	2	12	232481	232492	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_008255	CAAT	2	8	232560	232567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5153	NC_008255	TAT	2	6	232739	232744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636615
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5164	NC_008255	T	6	6	233465	233470	0 %	100 %	0 %	0 %	110636615
5165	NC_008255	A	6	6	233479	233484	100 %	0 %	0 %	0 %	110636615
5166	NC_008255	GTT	2	6	233485	233490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636615
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5176	NC_008255	TGTT	2	8	233902	233909	0 %	75 %	25 %	0 %	110636616
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5203	NC_008255	CATT	2	8	234972	234979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5234	NC_008255	ATTG	2	8	236072	236079	25 %	50 %	25 %	0 %	110636617
5235	NC_008255	T	7	7	236097	236103	0 %	100 %	0 %	0 %	110636617
5236	NC_008255	CTTT	2	8	236106	236113	0 %	75 %	0 %	25 %	110636617
5237	NC_008255	CTA	2	6	236139	236144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636617
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5242	NC_008255	GTT	2	6	236376	236381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636617
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5245	NC_008255	ATTC	2	8	236491	236498	25 %	50 %	0 %	25 %	110636617
5246	NC_008255	CCTG	2	8	236508	236515	0 %	25 %	25 %	50 %	110636617
5247	NC_008255	ATTTT	2	10	236538	236547	20 %	80 %	0 %	0 %	110636617
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5499	NC_008255	GCA	2	6	247464	247469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636626
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