MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Koribacter versatilis Ellin345 chromosome

Total Repeats: 3844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008009	AAAGC	2	10	1677	1686	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008009	CATCT	2	10	2689	2698	20 %	40 %	0 %	40 %	94967033
3	NC_008009	CGAAG	2	10	3088	3097	40 %	0 %	40 %	20 %	94967034
4	NC_008009	CTCGC	2	10	3845	3854	0 %	20 %	20 %	60 %	94967034
5	NC_008009	GCGCT	2	10	4433	4442	0 %	20 %	40 %	40 %	94967035
6	NC_008009	GCCAA	2	10	6181	6190	40 %	0 %	20 %	40 %	94967036
7	NC_008009	CAGAG	2	10	7347	7356	40 %	0 %	40 %	20 %	94967038
8	NC_008009	TGGCG	2	10	9128	9137	0 %	20 %	60 %	20 %	94967039
9	NC_008009	GAACG	2	10	13055	13064	40 %	0 %	40 %	20 %	94967040
10	NC_008009	CCAGT	2	10	14049	14058	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_008009	GTTGT	2	10	16180	16189	0 %	60 %	40 %	0 %	94967043
12	NC_008009	GCACG	2	10	17281	17290	20 %	0 %	40 %	40 %	94967044
13	NC_008009	GCGAC	2	10	19692	19701	20 %	0 %	40 %	40 %	94967047
14	NC_008009	CGATC	2	10	22451	22460	20 %	20 %	20 %	40 %	94967052
15	NC_008009	CGACG	2	10	24601	24610	20 %	0 %	40 %	40 %	94967054
16	NC_008009	CGAGG	2	10	25811	25820	20 %	0 %	60 %	20 %	94967057
17	NC_008009	CGAAT	2	10	26893	26902	40 %	20 %	20 %	20 %	94967058
18	NC_008009	CGAAG	2	10	28644	28653	40 %	0 %	40 %	20 %	94967061
19	NC_008009	TTTCT	2	10	30432	30441	0 %	80 %	0 %	20 %	94967065
20	NC_008009	CGTTT	2	10	31152	31161	0 %	60 %	20 %	20 %	94967066
21	NC_008009	GTCAG	2	10	31887	31896	20 %	20 %	40 %	20 %	94967067
22	NC_008009	CCGCG	2	10	39569	39578	0 %	0 %	40 %	60 %	94967074
23	NC_008009	CGCCA	2	10	41453	41462	20 %	0 %	20 %	60 %	94967076
24	NC_008009	TCCCC	2	10	44066	44075	0 %	20 %	0 %	80 %	94967078
25	NC_008009	GCGTC	2	10	49957	49966	0 %	20 %	40 %	40 %	94967082
26	NC_008009	ATCGC	2	10	50043	50052	20 %	20 %	20 %	40 %	94967082
27	NC_008009	GCCCA	2	10	50765	50774	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_008009	CTTCG	2	10	51703	51712	0 %	40 %	20 %	40 %	94967085
29	NC_008009	CGTGC	2	10	53041	53050	0 %	20 %	40 %	40 %	94967087
30	NC_008009	TTCGC	2	10	54522	54531	0 %	40 %	20 %	40 %	94967087
31	NC_008009	ACTCC	2	10	54928	54937	20 %	20 %	0 %	60 %	94967087
32	NC_008009	CGATG	2	10	55681	55690	20 %	20 %	40 %	20 %	94967088
33	NC_008009	GTTCC	2	10	56253	56262	0 %	40 %	20 %	40 %	94967088
34	NC_008009	GGATT	2	10	56420	56429	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008009	TCCCC	2	10	56439	56448	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
36	NC_008009	CAAAA	2	10	56539	56548	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_008009	GCGCT	2	10	57192	57201	0 %	20 %	40 %	40 %	94967089
38	NC_008009	CGCTT	2	10	61179	61188	0 %	40 %	20 %	40 %	94967094
39	NC_008009	CGAAG	2	10	64254	64263	40 %	0 %	40 %	20 %	94967096
40	NC_008009	CGGGA	2	10	65562	65571	20 %	0 %	60 %	20 %	94967097
41	NC_008009	TCGCA	2	10	65626	65635	20 %	20 %	20 %	40 %	94967097
42	NC_008009	CTTCT	2	10	66654	66663	0 %	60 %	0 %	40 %	94967098
43	NC_008009	CCAGC	2	10	67948	67957	20 %	0 %	20 %	60 %	94967098
44	NC_008009	CTTCG	2	10	67994	68003	0 %	40 %	20 %	40 %	94967098
45	NC_008009	TTCTG	2	10	68705	68714	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_008009	TGCGC	2	10	71238	71247	0 %	20 %	40 %	40 %	94967101
47	NC_008009	GCTCG	2	10	71889	71898	0 %	20 %	40 %	40 %	94967102
48	NC_008009	GGGCT	2	10	74926	74935	0 %	20 %	60 %	20 %	94967103
49	NC_008009	CCGGC	2	10	77560	77569	0 %	0 %	40 %	60 %	94967105
50	NC_008009	GCCGA	2	10	81953	81962	20 %	0 %	40 %	40 %	94967111
51	NC_008009	CGATT	2	10	82321	82330	20 %	40 %	20 %	20 %	94967111
52	NC_008009	GCATG	2	10	85992	86001	20 %	20 %	40 %	20 %	94967116
53	NC_008009	GCATC	2	10	86187	86196	20 %	20 %	20 %	40 %	94967116
54	NC_008009	TTCCT	2	10	93653	93662	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_008009	GACCG	2	10	100457	100466	20 %	0 %	40 %	40 %	94967129
56	NC_008009	CCGAG	2	10	100690	100699	20 %	0 %	40 %	40 %	94967129
57	NC_008009	GCTGG	2	10	102455	102464	0 %	20 %	60 %	20 %	94967129
58	NC_008009	CAGAG	2	10	102861	102870	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008009	CGATT	2	10	104237	104246	20 %	40 %	20 %	20 %	94967131
60	NC_008009	TGCGT	2	10	106865	106874	0 %	40 %	40 %	20 %	94967132
61	NC_008009	TAGAT	2	10	108083	108092	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008009	GCCAA	2	10	108654	108663	40 %	0 %	20 %	40 %	94967134
63	NC_008009	GCGCC	2	10	108664	108673	0 %	0 %	40 %	60 %	94967134
64	NC_008009	CGCGC	2	10	108973	108982	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65	NC_008009	TGAGG	2	10	109539	109548	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008009	CGGAA	2	10	112448	112457	40 %	0 %	40 %	20 %	94967136
67	NC_008009	GGGCA	2	10	113114	113123	20 %	0 %	60 %	20 %	94967136
68	NC_008009	TTCAT	2	10	116703	116712	20 %	60 %	0 %	20 %	94967139
69	NC_008009	GCGAA	2	10	117757	117766	40 %	0 %	40 %	20 %	94967142
70	NC_008009	TTCAG	2	10	117959	117968	20 %	40 %	20 %	20 %	94967142
71	NC_008009	GTCGG	2	10	118757	118766	0 %	20 %	60 %	20 %	94967143
72	NC_008009	GCCAT	2	10	120025	120034	20 %	20 %	20 %	40 %	94967143
73	NC_008009	CGGCG	2	10	122938	122947	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_008009	GCGCG	2	10	123506	123515	0 %	0 %	60 %	40 %	94967146
75	NC_008009	GCGCA	2	10	125019	125028	20 %	0 %	40 %	40 %	94967147
76	NC_008009	CCGTT	2	10	125777	125786	0 %	40 %	20 %	40 %	94967147
77	NC_008009	CAAGC	2	10	126415	126424	40 %	0 %	20 %	40 %	94967148
78	NC_008009	GATCG	2	10	126876	126885	20 %	20 %	40 %	20 %	94967149
79	NC_008009	CTCCG	2	10	128375	128384	0 %	20 %	20 %	60 %	94967150
80	NC_008009	CAGCC	2	10	129766	129775	20 %	0 %	20 %	60 %	94967152
81	NC_008009	AGCCG	2	10	130054	130063	20 %	0 %	40 %	40 %	94967152
82	NC_008009	CCTTC	2	10	131163	131172	0 %	40 %	0 %	60 %	94967154
83	NC_008009	GCTCG	2	10	133513	133522	0 %	20 %	40 %	40 %	94967156
84	NC_008009	TTGGG	2	10	136005	136014	0 %	40 %	60 %	0 %	94967158
85	NC_008009	GAAGA	2	10	136023	136032	60 %	0 %	40 %	0 %	94967158
86	NC_008009	CGATC	2	10	136805	136814	20 %	20 %	20 %	40 %	94967160
87	NC_008009	TGGGC	2	10	137282	137291	0 %	20 %	60 %	20 %	94967160
88	NC_008009	GCTTC	2	10	137508	137517	0 %	40 %	20 %	40 %	94967161
89	NC_008009	TCGCC	2	10	138018	138027	0 %	20 %	20 %	60 %	94967161
90	NC_008009	GGCTG	2	10	138237	138246	0 %	20 %	60 %	20 %	94967161
91	NC_008009	CCATG	2	10	138391	138400	20 %	20 %	20 %	40 %	94967161
92	NC_008009	CGCAA	2	10	139894	139903	40 %	0 %	20 %	40 %	94967163
93	NC_008009	GAAGT	2	10	142112	142121	40 %	20 %	40 %	0 %	94967163
94	NC_008009	GCACG	2	10	142161	142170	20 %	0 %	40 %	40 %	94967163
95	NC_008009	GCGGT	2	10	142412	142421	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_008009	CTTCG	2	10	142443	142452	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_008009	GTGCG	2	10	143011	143020	0 %	20 %	60 %	20 %	94967164
98	NC_008009	TTCGC	2	10	143938	143947	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_008009	GCGCG	2	10	144852	144861	0 %	0 %	60 %	40 %	94967166
100	NC_008009	TGACG	2	10	145944	145953	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_008009	CGCTG	2	10	146493	146502	0 %	20 %	40 %	40 %	94967168
102	NC_008009	CGCTG	2	10	148470	148479	0 %	20 %	40 %	40 %	94967171
103	NC_008009	CGGTT	2	10	150488	150497	0 %	40 %	40 %	20 %	94967171
104	NC_008009	TTCGC	2	10	150984	150993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_008009	ACGGC	2	10	151081	151090	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_008009	CGCTG	2	10	153571	153580	0 %	20 %	40 %	40 %	94967175
107	NC_008009	GAAGT	2	10	154830	154839	40 %	20 %	40 %	0 %	94967177
108	NC_008009	GATTC	2	10	155847	155856	20 %	40 %	20 %	20 %	94967177
109	NC_008009	TTCGA	2	10	156303	156312	20 %	40 %	20 %	20 %	94967177
110	NC_008009	CACGA	2	10	157183	157192	40 %	0 %	20 %	40 %	94967178
111	NC_008009	AGCAA	2	10	157703	157712	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008009	CGTTC	2	10	159239	159248	0 %	40 %	20 %	40 %	94967180
113	NC_008009	ACGGT	2	10	159707	159716	20 %	20 %	40 %	20 %	94967181
114	NC_008009	GGCCG	2	10	161321	161330	0 %	0 %	60 %	40 %	94967183
115	NC_008009	CTTTG	2	10	161407	161416	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008009	TCCGG	2	10	162598	162607	0 %	20 %	40 %	40 %	94967184
117	NC_008009	GCTAA	2	10	162673	162682	40 %	20 %	20 %	20 %	94967184
118	NC_008009	TAAAT	2	10	163584	163593	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008009	GCCGG	2	10	170919	170928	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_008009	CACAT	2	10	171068	171077	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_008009	TCTCG	2	10	171181	171190	0 %	40 %	20 %	40 %	94967192
122	NC_008009	CGAGT	2	10	172718	172727	20 %	20 %	40 %	20 %	94967193
123	NC_008009	GCTTT	2	10	173214	173223	0 %	60 %	20 %	20 %	94967193
124	NC_008009	CACGG	2	10	174381	174390	20 %	0 %	40 %	40 %	94967193
125	NC_008009	ACGGT	2	10	176603	176612	20 %	20 %	40 %	20 %	94967195
126	NC_008009	GCTAC	2	10	176906	176915	20 %	20 %	20 %	40 %	94967195
127	NC_008009	AGCGG	2	10	177495	177504	20 %	0 %	60 %	20 %	94967195
128	NC_008009	CCGTC	2	10	177974	177983	0 %	20 %	20 %	60 %	94967196
129	NC_008009	CCGGG	2	10	180079	180088	0 %	0 %	60 %	40 %	94967198
130	NC_008009	GTAGG	2	10	184747	184756	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008009	CCACT	2	10	185036	185045	20 %	20 %	0 %	60 %	94967206
132	NC_008009	CCACT	2	10	185855	185864	20 %	20 %	0 %	60 %	94967206
133	NC_008009	GATCG	2	10	186365	186374	20 %	20 %	40 %	20 %	94967206
134	NC_008009	CTGTG	2	10	189165	189174	0 %	40 %	40 %	20 %	94967209
135	NC_008009	CCGCG	2	10	194307	194316	0 %	0 %	40 %	60 %	94967215
136	NC_008009	GGTCA	2	10	196367	196376	20 %	20 %	40 %	20 %	94967216
137	NC_008009	CCGAT	2	10	197646	197655	20 %	20 %	20 %	40 %	94967216
138	NC_008009	GGTTG	2	10	198641	198650	0 %	40 %	60 %	0 %	94967217
139	NC_008009	CGTTC	2	10	199992	200001	0 %	40 %	20 %	40 %	94967219
140	NC_008009	ACGCC	2	10	200513	200522	20 %	0 %	20 %	60 %	94967220
141	NC_008009	CCGTG	2	10	202417	202426	0 %	20 %	40 %	40 %	94967221
142	NC_008009	GTGCC	2	10	205269	205278	0 %	20 %	40 %	40 %	94967222
143	NC_008009	TGCCG	2	10	205660	205669	0 %	20 %	40 %	40 %	94967222
144	NC_008009	CATCG	2	10	210059	210068	20 %	20 %	20 %	40 %	94967227
145	NC_008009	TTACC	2	10	214422	214431	20 %	40 %	0 %	40 %	94967232
146	NC_008009	AGCGA	2	10	214777	214786	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_008009	AGGCC	2	10	215691	215700	20 %	0 %	40 %	40 %	94967234
148	NC_008009	CGCGG	2	10	218852	218861	0 %	0 %	60 %	40 %	94967237
149	NC_008009	GTAGG	2	10	226373	226382	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008009	GAGCG	2	10	227862	227871	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
151	NC_008009	GTCAT	2	10	229105	229114	20 %	40 %	20 %	20 %	94967246
152	NC_008009	TGGTC	2	10	230487	230496	0 %	40 %	40 %	20 %	94967248
153	NC_008009	CGGCG	2	10	230948	230957	0 %	0 %	60 %	40 %	94967248
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156	NC_008009	CGACG	2	10	236946	236955	20 %	0 %	40 %	40 %	94967255
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159	NC_008009	ACGGC	2	10	238525	238534	20 %	0 %	40 %	40 %	94967255
160	NC_008009	GCGAA	2	10	238774	238783	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
161	NC_008009	TCAAT	2	10	241642	241651	40 %	40 %	0 %	20 %	94967259
162	NC_008009	AGCGA	2	10	241760	241769	40 %	0 %	40 %	20 %	94967259
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165	NC_008009	CGCGC	2	10	246253	246262	0 %	0 %	40 %	60 %	94967263
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173	NC_008009	GTCGA	2	10	262929	262938	20 %	20 %	40 %	20 %	94967279
174	NC_008009	CGGGT	2	10	263208	263217	0 %	20 %	60 %	20 %	94967279
175	NC_008009	TACGG	2	10	263699	263708	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
176	NC_008009	CTTGC	2	10	264491	264500	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_008009	GAGCG	2	10	290618	290627	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
192	NC_008009	CACGA	2	10	291235	291244	40 %	0 %	20 %	40 %	94967311
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194	NC_008009	AGCGA	2	10	293770	293779	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
195	NC_008009	CAATC	2	10	295721	295730	40 %	20 %	0 %	40 %	94967313
196	NC_008009	CCGCA	2	10	295781	295790	20 %	0 %	20 %	60 %	94967313
197	NC_008009	ACAAG	2	10	296937	296946	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
198	NC_008009	GGAAG	2	10	299124	299133	40 %	0 %	60 %	0 %	94967316
199	NC_008009	TTTCA	2	10	299974	299983	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
200	NC_008009	TCGCC	2	10	302420	302429	0 %	20 %	20 %	60 %	94967318
201	NC_008009	GCTTG	2	10	304446	304455	0 %	40 %	40 %	20 %	94967320
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250	NC_008009	GATTC	2	10	376287	376296	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
251	NC_008009	GCCGA	2	10	377579	377588	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
252	NC_008009	CCTCA	2	10	377680	377689	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
253	NC_008009	AACGC	2	10	379160	379169	40 %	0 %	20 %	40 %	94967377
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256	NC_008009	ATCGC	2	10	382811	382820	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
257	NC_008009	CCGAT	2	10	383384	383393	20 %	20 %	20 %	40 %	94967380
258	NC_008009	TGGCG	2	10	383699	383708	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
259	NC_008009	ACGCA	2	10	383734	383743	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
260	NC_008009	TGCAG	2	10	384912	384921	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
261	NC_008009	CCTCA	2	10	385719	385728	20 %	20 %	0 %	60 %	94967383
262	NC_008009	AACGG	2	10	385758	385767	40 %	0 %	40 %	20 %	94967383
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267	NC_008009	ATCGG	2	10	391615	391624	20 %	20 %	40 %	20 %	94967385
268	NC_008009	ATCGG	2	10	391765	391774	20 %	20 %	40 %	20 %	94967385
269	NC_008009	AGCTG	2	10	392922	392931	20 %	20 %	40 %	20 %	94967386
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