MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid

Total Repeats: 7069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007974	GTAT	2	8	16	23	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007974	CGGC	2	8	1278	1285	0 %	0 %	50 %	50 %	94314736
3	NC_007974	ATCG	3	12	1608	1619	25 %	25 %	25 %	25 %	94314736
4	NC_007974	TGCG	2	8	1760	1767	0 %	25 %	50 %	25 %	94314736
5	NC_007974	GAGC	2	8	1899	1906	25 %	0 %	50 %	25 %	94314736
6	NC_007974	CAGT	2	8	2823	2830	25 %	25 %	25 %	25 %	94314738
7	NC_007974	GACC	2	8	3870	3877	25 %	0 %	25 %	50 %	94314739
8	NC_007974	TCCT	2	8	3904	3911	0 %	50 %	0 %	50 %	94314739
9	NC_007974	CGGC	2	8	4028	4035	0 %	0 %	50 %	50 %	94314739
10	NC_007974	ACCG	2	8	4372	4379	25 %	0 %	25 %	50 %	94314739
11	NC_007974	GTCC	2	8	4745	4752	0 %	25 %	25 %	50 %	94314740
12	NC_007974	CGAG	2	8	4920	4927	25 %	0 %	50 %	25 %	94314740
13	NC_007974	CCGG	2	8	5208	5215	0 %	0 %	50 %	50 %	94314740
14	NC_007974	GGTC	2	8	5677	5684	0 %	25 %	50 %	25 %	94314740
15	NC_007974	TCGA	2	8	5793	5800	25 %	25 %	25 %	25 %	94314740
16	NC_007974	CGCA	2	8	6639	6646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007974	GGCC	2	8	7486	7493	0 %	0 %	50 %	50 %	94314741
18	NC_007974	CCAT	2	8	8445	8452	25 %	25 %	0 %	50 %	94314741
19	NC_007974	TTGC	2	8	8618	8625	0 %	50 %	25 %	25 %	94314741
20	NC_007974	GACC	2	8	8701	8708	25 %	0 %	25 %	50 %	94314741
21	NC_007974	CGAG	2	8	8983	8990	25 %	0 %	50 %	25 %	94314741
22	NC_007974	CCTT	2	8	9027	9034	0 %	50 %	0 %	50 %	94314741
23	NC_007974	GCTG	2	8	9198	9205	0 %	25 %	50 %	25 %	94314741
24	NC_007974	CTGG	2	8	9271	9278	0 %	25 %	50 %	25 %	94314741
25	NC_007974	GCAG	2	8	9561	9568	25 %	0 %	50 %	25 %	94314741
26	NC_007974	CGCA	2	8	10099	10106	25 %	0 %	25 %	50 %	94314742
27	NC_007974	GGCG	2	8	10393	10400	0 %	0 %	75 %	25 %	94314742
28	NC_007974	TAGG	2	8	10832	10839	25 %	25 %	50 %	0 %	94314742
29	NC_007974	TGAG	2	8	10975	10982	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007974	GCCG	2	8	11385	11392	0 %	0 %	50 %	50 %	94314743
31	NC_007974	GCGA	2	8	11458	11465	25 %	0 %	50 %	25 %	94314743
32	NC_007974	GTGC	2	8	11564	11571	0 %	25 %	50 %	25 %	94314743
33	NC_007974	GGGA	2	8	11889	11896	25 %	0 %	75 %	0 %	94314743
34	NC_007974	CGCC	2	8	11943	11950	0 %	0 %	25 %	75 %	94314743
35	NC_007974	CCGG	2	8	12794	12801	0 %	0 %	50 %	50 %	94314744
36	NC_007974	CACG	2	8	12931	12938	25 %	0 %	25 %	50 %	94314745
37	NC_007974	GTTC	2	8	13191	13198	0 %	50 %	25 %	25 %	94314745
38	NC_007974	GCGT	2	8	13280	13287	0 %	25 %	50 %	25 %	94314745
39	NC_007974	CGGT	2	8	13340	13347	0 %	25 %	50 %	25 %	94314745
40	NC_007974	CGGC	2	8	13622	13629	0 %	0 %	50 %	50 %	94314745
41	NC_007974	TGCG	2	8	14301	14308	0 %	25 %	50 %	25 %	94314746
42	NC_007974	CAGC	2	8	14549	14556	25 %	0 %	25 %	50 %	94314746
43	NC_007974	TGCC	2	8	14567	14574	0 %	25 %	25 %	50 %	94314746
44	NC_007974	GTGC	2	8	15035	15042	0 %	25 %	50 %	25 %	94314746
45	NC_007974	GTTC	2	8	15847	15854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007974	GATC	2	8	16167	16174	25 %	25 %	25 %	25 %	94314747
47	NC_007974	CAGG	2	8	16615	16622	25 %	0 %	50 %	25 %	94314747
48	NC_007974	GATA	2	8	17627	17634	50 %	25 %	25 %	0 %	94314748
49	NC_007974	GCTT	2	8	18470	18477	0 %	50 %	25 %	25 %	94314749
50	NC_007974	TGCG	2	8	18480	18487	0 %	25 %	50 %	25 %	94314749
51	NC_007974	AGGG	2	8	19460	19467	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007974	CCGA	2	8	20150	20157	25 %	0 %	25 %	50 %	94314750
53	NC_007974	GGGC	3	12	21055	21066	0 %	0 %	75 %	25 %	94314751
54	NC_007974	AGGC	2	8	21207	21214	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007974	GGCC	2	8	21271	21278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007974	ACGG	2	8	21432	21439	25 %	0 %	50 %	25 %	94314752
57	NC_007974	GGCC	2	8	21496	21503	0 %	0 %	50 %	50 %	94314752
58	NC_007974	TTAC	2	8	21698	21705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007974	GGAT	2	8	21855	21862	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007974	GCCT	2	8	22072	22079	0 %	25 %	25 %	50 %	94314753
61	NC_007974	CTTT	2	8	22491	22498	0 %	75 %	0 %	25 %	94314753
62	NC_007974	GCCG	2	8	24707	24714	0 %	0 %	50 %	50 %	94314756
63	NC_007974	GCGT	2	8	25836	25843	0 %	25 %	50 %	25 %	94314757
64	NC_007974	CGCC	2	8	26124	26131	0 %	0 %	25 %	75 %	94314757
65	NC_007974	TGGA	2	8	26321	26328	25 %	25 %	50 %	0 %	94314757
66	NC_007974	TCGG	2	8	26343	26350	0 %	25 %	50 %	25 %	94314757
67	NC_007974	CAGC	2	8	26425	26432	25 %	0 %	25 %	50 %	94314757
68	NC_007974	CCAG	2	8	26639	26646	25 %	0 %	25 %	50 %	94314757
69	NC_007974	ATGG	2	8	26799	26806	25 %	25 %	50 %	0 %	94314758
70	NC_007974	GACG	2	8	27940	27947	25 %	0 %	50 %	25 %	94314759
71	NC_007974	TGCG	2	8	28166	28173	0 %	25 %	50 %	25 %	94314759
72	NC_007974	GCCC	2	8	28211	28218	0 %	0 %	25 %	75 %	94314759
73	NC_007974	GCTG	2	8	28712	28719	0 %	25 %	50 %	25 %	94314759
74	NC_007974	CGAG	2	8	29099	29106	25 %	0 %	50 %	25 %	94314759
75	NC_007974	GTCA	2	8	29137	29144	25 %	25 %	25 %	25 %	94314759
76	NC_007974	CTGC	2	8	29712	29719	0 %	25 %	25 %	50 %	94314759
77	NC_007974	TCAG	2	8	29933	29940	25 %	25 %	25 %	25 %	94314759
78	NC_007974	CCCG	2	8	30212	30219	0 %	0 %	25 %	75 %	94314759
79	NC_007974	TCGG	2	8	30647	30654	0 %	25 %	50 %	25 %	94314760
80	NC_007974	TCCG	2	8	32710	32717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007974	GCGG	2	8	32923	32930	0 %	0 %	75 %	25 %	94314762
82	NC_007974	CCGG	2	8	33061	33068	0 %	0 %	50 %	50 %	94314762
83	NC_007974	GCGT	2	8	33359	33366	0 %	25 %	50 %	25 %	94314762
84	NC_007974	CGGG	2	8	33422	33429	0 %	0 %	75 %	25 %	94314762
85	NC_007974	CCAG	2	8	33564	33571	25 %	0 %	25 %	50 %	94314762
86	NC_007974	TCGA	2	8	33682	33689	25 %	25 %	25 %	25 %	94314762
87	NC_007974	GATG	2	8	33747	33754	25 %	25 %	50 %	0 %	94314762
88	NC_007974	CGTG	2	8	33893	33900	0 %	25 %	50 %	25 %	94314762
89	NC_007974	AGCC	2	8	34402	34409	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007974	ATGG	2	8	34510	34517	25 %	25 %	50 %	0 %	94314763
91	NC_007974	GCTG	2	8	34523	34530	0 %	25 %	50 %	25 %	94314763
92	NC_007974	CGAT	2	8	35079	35086	25 %	25 %	25 %	25 %	94314763
93	NC_007974	CGAA	2	8	35463	35470	50 %	0 %	25 %	25 %	94314763
94	NC_007974	ACGA	2	8	35473	35480	50 %	0 %	25 %	25 %	94314763
95	NC_007974	GCCG	2	8	35800	35807	0 %	0 %	50 %	50 %	94314763
96	NC_007974	GGGC	2	8	36159	36166	0 %	0 %	75 %	25 %	94314763
97	NC_007974	GGCC	2	8	36307	36314	0 %	0 %	50 %	50 %	94314763
98	NC_007974	CCTG	2	8	36367	36374	0 %	25 %	25 %	50 %	94314763
99	NC_007974	TCGC	2	8	37198	37205	0 %	25 %	25 %	50 %	94314764
100	NC_007974	GCCC	2	8	37440	37447	0 %	0 %	25 %	75 %	94314764
101	NC_007974	GGCA	2	8	38737	38744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007974	GCGG	2	8	39906	39913	0 %	0 %	75 %	25 %	94314765
103	NC_007974	TGGC	2	8	40065	40072	0 %	25 %	50 %	25 %	94314765
104	NC_007974	GCCG	2	8	40272	40279	0 %	0 %	50 %	50 %	94314765
105	NC_007974	AGTC	2	8	40904	40911	25 %	25 %	25 %	25 %	94314766
106	NC_007974	GACT	2	8	41048	41055	25 %	25 %	25 %	25 %	94314766
107	NC_007974	CGAC	2	8	41324	41331	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007974	CGCT	2	8	41908	41915	0 %	25 %	25 %	50 %	94314767
109	NC_007974	GGCA	2	8	42033	42040	25 %	0 %	50 %	25 %	94314767
110	NC_007974	ACGC	2	8	43361	43368	25 %	0 %	25 %	50 %	94314768
111	NC_007974	GCGT	2	8	44295	44302	0 %	25 %	50 %	25 %	94314768
112	NC_007974	CTGA	2	8	44307	44314	25 %	25 %	25 %	25 %	94314768
113	NC_007974	TCGA	2	8	44317	44324	25 %	25 %	25 %	25 %	94314768
114	NC_007974	CGAT	2	8	44486	44493	25 %	25 %	25 %	25 %	94314768
115	NC_007974	CGAT	2	8	44561	44568	25 %	25 %	25 %	25 %	94314768
116	NC_007974	CGGG	2	8	44784	44791	0 %	0 %	75 %	25 %	94314768
117	NC_007974	GCTG	2	8	46045	46052	0 %	25 %	50 %	25 %	94314770
118	NC_007974	CCTG	2	8	46582	46589	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007974	CAGG	2	8	47600	47607	25 %	0 %	50 %	25 %	94314771
120	NC_007974	CGGC	2	8	47859	47866	0 %	0 %	50 %	50 %	94314772
121	NC_007974	GCAG	2	8	48281	48288	25 %	0 %	50 %	25 %	94314772
122	NC_007974	TGCC	2	8	48386	48393	0 %	25 %	25 %	50 %	94314772
123	NC_007974	GCCG	2	8	48651	48658	0 %	0 %	50 %	50 %	94314772
124	NC_007974	CCGG	2	8	48664	48671	0 %	0 %	50 %	50 %	94314772
125	NC_007974	CGGC	2	8	48955	48962	0 %	0 %	50 %	50 %	94314773
126	NC_007974	CCTT	2	8	49102	49109	0 %	50 %	0 %	50 %	94314773
127	NC_007974	CGGC	2	8	50191	50198	0 %	0 %	50 %	50 %	94314774
128	NC_007974	GGCA	2	8	50224	50231	25 %	0 %	50 %	25 %	94314774
129	NC_007974	CCAC	2	8	50313	50320	25 %	0 %	0 %	75 %	94314774
130	NC_007974	CAGC	2	8	50575	50582	25 %	0 %	25 %	50 %	94314774
131	NC_007974	CGTA	2	8	50806	50813	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007974	TGCG	2	8	51300	51307	0 %	25 %	50 %	25 %	94314775
133	NC_007974	GCCA	2	8	51822	51829	25 %	0 %	25 %	50 %	94314775
134	NC_007974	CGGA	2	8	51880	51887	25 %	0 %	50 %	25 %	94314775
135	NC_007974	CAGG	2	8	51981	51988	25 %	0 %	50 %	25 %	94314775
136	NC_007974	CAGT	2	8	52075	52082	25 %	25 %	25 %	25 %	94314775
137	NC_007974	CGCA	2	8	52258	52265	25 %	0 %	25 %	50 %	291481470
138	NC_007974	GCGA	2	8	52292	52299	25 %	0 %	50 %	25 %	291481470
139	NC_007974	CGTG	2	8	52352	52359	0 %	25 %	50 %	25 %	291481470
140	NC_007974	GTGG	2	8	52796	52803	0 %	25 %	75 %	0 %	94314776
141	NC_007974	CCGC	2	8	53060	53067	0 %	0 %	25 %	75 %	94314776
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143	NC_007974	GGCG	2	8	53414	53421	0 %	0 %	75 %	25 %	94314776
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