MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid

Total Repeats: 59922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007974	GCG	2	6	145473	145478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314859
3502	NC_007974	CCA	2	6	145496	145501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94314859
3503	NC_007974	CAGC	2	8	145511	145518	25 %	0 %	25 %	50 %	94314859
3504	NC_007974	TCA	2	6	145523	145528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314859
3505	NC_007974	GCT	2	6	145542	145547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314859
3506	NC_007974	TTG	2	6	145555	145560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94314859
3507	NC_007974	TGA	2	6	145562	145567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314859
3508	NC_007974	TTG	2	6	145588	145593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94314859
3509	NC_007974	ACG	2	6	145669	145674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314859
3510	NC_007974	CG	3	6	145682	145687	0 %	0 %	50 %	50 %	94314859
3511	NC_007974	GTT	3	9	145701	145709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94314859
3512	NC_007974	GGA	2	6	145751	145756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94314859
3513	NC_007974	TGC	2	6	145815	145820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314859
3514	NC_007974	CGG	2	6	145862	145867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314859
3515	NC_007974	CAG	2	6	145929	145934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314859
3516	NC_007974	TGC	2	6	145951	145956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314859
3517	NC_007974	GC	3	6	145970	145975	0 %	0 %	50 %	50 %	94314859
3518	NC_007974	CAG	2	6	146013	146018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314859
3519	NC_007974	GTC	2	6	146061	146066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314859
3520	NC_007974	TGC	2	6	146092	146097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314859
3521	NC_007974	TGG	2	6	146100	146105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314859
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3523	NC_007974	A	7	7	146260	146266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_007974	GCC	2	6	146293	146298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_007974	GAG	2	6	146311	146316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_007974	GGC	2	6	146484	146489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314860
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3528	NC_007974	TGC	2	6	146573	146578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314860
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3536	NC_007974	CGT	2	6	146805	146810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314860
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3538	NC_007974	ATCGA	2	10	146839	146848	40 %	20 %	20 %	20 %	94314860
3539	NC_007974	CTGG	2	8	146879	146886	0 %	25 %	50 %	25 %	94314860
3540	NC_007974	CCGC	2	8	146946	146953	0 %	0 %	25 %	75 %	94314860
3541	NC_007974	GCA	2	6	147011	147016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314860
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3544	NC_007974	TGT	2	6	147092	147097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_007974	TGT	2	6	147134	147139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_007974	GAC	2	6	147150	147155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_007974	CG	3	6	147175	147180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3548	NC_007974	GC	4	8	147195	147202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3549	NC_007974	TGC	2	6	147261	147266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_007974	T	6	6	147275	147280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_007974	AGCG	2	8	147373	147380	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3552	NC_007974	ACG	2	6	147391	147396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_007974	GAC	2	6	147411	147416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_007974	TAG	2	6	147453	147458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_007974	TGA	2	6	147466	147471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3557	NC_007974	ATGA	2	8	147566	147573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_007974	TCAT	2	8	147583	147590	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3559	NC_007974	GTG	2	6	147627	147632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94312548
3560	NC_007974	TCGA	2	8	147633	147640	25 %	25 %	25 %	25 %	94312548
3561	NC_007974	GAG	2	6	147648	147653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94312548
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3567	NC_007974	AGGGTG	2	12	147834	147845	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	94312548
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3571	NC_007974	CA	3	6	147955	147960	50 %	0 %	0 %	50 %	94312548
3572	NC_007974	GCCA	2	8	147978	147985	25 %	0 %	25 %	50 %	94312548
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3588	NC_007974	CGA	2	6	148861	148866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3592	NC_007974	GAAA	2	8	149030	149037	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_007974	GAA	2	6	149075	149080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_007974	CAG	2	6	149103	149108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3596	NC_007974	GGA	2	6	149294	149299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_007974	TGAC	2	8	149331	149338	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3598	NC_007974	GTT	2	6	149413	149418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_007974	GAT	2	6	149528	149533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3601	NC_007974	TGC	2	6	149635	149640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_007974	GTC	2	6	149647	149652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_007974	TCGTG	2	10	149656	149665	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3604	NC_007974	AG	3	6	149731	149736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_007974	GGA	2	6	149754	149759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_007974	AC	3	6	149974	149979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_007974	AGT	2	6	150014	150019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_007974	AGG	2	6	150033	150038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_007974	CCT	2	6	150115	150120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_007974	GTTT	2	8	150164	150171	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_007974	GGT	2	6	150200	150205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_007974	CCA	2	6	150257	150262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_007974	CG	3	6	150269	150274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_007974	GTC	2	6	150319	150324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_007974	TCC	2	6	150340	150345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3616	NC_007974	AGGCG	2	10	150383	150392	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3617	NC_007974	GTA	2	6	150460	150465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_007974	TGA	2	6	150482	150487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_007974	GTA	2	6	150494	150499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_007974	GA	3	6	150612	150617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_007974	TGG	2	6	150653	150658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_007974	CTGA	2	8	150780	150787	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3623	NC_007974	AGT	2	6	150868	150873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_007974	CGAA	2	8	150876	150883	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_007974	AGC	2	6	150907	150912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3627	NC_007974	TCC	2	6	151046	151051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3629	NC_007974	GCAT	2	8	151147	151154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3832	NC_007974	CGG	2	6	161934	161939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94312557
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3854	NC_007974	CAG	2	6	162600	162605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94312557
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3867	NC_007974	CCGCCT	2	12	163127	163138	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	94312558
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3878	NC_007974	GCCA	2	8	163605	163612	25 %	0 %	25 %	50 %	94312558
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