MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 93799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007973	AAAT	2	8	160238	160245	75 %	25 %	0 %	0 %	94309100
4002	NC_007973	GC	3	6	160276	160281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_007973	GCC	3	9	160314	160322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_007973	CGC	2	6	160455	160460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_007973	GGC	2	6	160632	160637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309101
4006	NC_007973	CAC	2	6	160683	160688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309101
4007	NC_007973	CG	4	8	160716	160723	0 %	0 %	50 %	50 %	94309101
4008	NC_007973	ACA	2	6	160748	160753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94309101
4009	NC_007973	TGG	2	6	160790	160795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309101
4010	NC_007973	CG	3	6	160837	160842	0 %	0 %	50 %	50 %	94309101
4011	NC_007973	GAC	2	6	160846	160851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309101
4012	NC_007973	CGA	2	6	160902	160907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309101
4013	NC_007973	CTA	2	6	160935	160940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309101
4014	NC_007973	TGG	2	6	160952	160957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309101
4015	NC_007973	GCT	2	6	160968	160973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309101
4016	NC_007973	GCC	2	6	160985	160990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309101
4017	NC_007973	ATC	2	6	161137	161142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309101
4018	NC_007973	TGC	2	6	161150	161155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309101
4019	NC_007973	ATC	2	6	161254	161259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309101
4020	NC_007973	TGG	2	6	161271	161276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309101
4021	NC_007973	CGC	2	6	161282	161287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309101
4022	NC_007973	GCC	2	6	161338	161343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309101
4023	NC_007973	CGC	2	6	161346	161351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309101
4024	NC_007973	CGT	2	6	161370	161375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309101
4025	NC_007973	GCC	2	6	161377	161382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309101
4026	NC_007973	GC	3	6	161389	161394	0 %	0 %	50 %	50 %	94309101
4027	NC_007973	GCCC	2	8	161431	161438	0 %	0 %	25 %	75 %	94309101
4028	NC_007973	CGA	2	6	161481	161486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309101
4029	NC_007973	CGC	2	6	161493	161498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309101
4030	NC_007973	CTG	2	6	161554	161559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309101
4031	NC_007973	CCG	2	6	161579	161584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309101
4032	NC_007973	GAG	2	6	161605	161610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94309101
4033	NC_007973	GC	3	6	161652	161657	0 %	0 %	50 %	50 %	94309101
4034	NC_007973	GCC	2	6	161659	161664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309101
4035	NC_007973	CTG	3	9	161678	161686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_007973	CCG	2	6	161715	161720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_007973	GC	3	6	161732	161737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_007973	T	6	6	161742	161747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_007973	TGC	2	6	161756	161761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_007973	AATGG	2	10	161810	161819	40 %	20 %	40 %	0 %	94309102
4041	NC_007973	GAA	2	6	162007	162012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94309102
4042	NC_007973	GCGCG	2	10	162043	162052	0 %	0 %	60 %	40 %	94309102
4043	NC_007973	CAG	2	6	162062	162067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309102
4044	NC_007973	CCG	2	6	162094	162099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309102
4045	NC_007973	CG	4	8	162162	162169	0 %	0 %	50 %	50 %	94309102
4046	NC_007973	CGAG	2	8	162186	162193	25 %	0 %	50 %	25 %	94309102
4047	NC_007973	GAC	2	6	162224	162229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309102
4048	NC_007973	GCT	2	6	162265	162270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309102
4049	NC_007973	CTG	2	6	162281	162286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309102
4050	NC_007973	GT	3	6	162288	162293	0 %	50 %	50 %	0 %	94309102
4051	NC_007973	TGA	2	6	162408	162413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309102
4052	NC_007973	GC	3	6	162433	162438	0 %	0 %	50 %	50 %	94309102
4053	NC_007973	TGC	2	6	162462	162467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309102
4054	NC_007973	ATG	2	6	162602	162607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309102
4055	NC_007973	CGC	2	6	162631	162636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309102
4056	NC_007973	CGCA	2	8	162647	162654	25 %	0 %	25 %	50 %	94309102
4057	NC_007973	TGT	2	6	162669	162674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94309102
4058	NC_007973	GGC	2	6	162700	162705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309102
4059	NC_007973	GCA	3	9	162760	162768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309103
4060	NC_007973	GGC	2	6	162801	162806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309103
4061	NC_007973	AGC	2	6	162810	162815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309103
4062	NC_007973	GGCC	2	8	162829	162836	0 %	0 %	50 %	50 %	94309103
4063	NC_007973	CGC	2	6	162916	162921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309103
4064	NC_007973	GTC	2	6	162932	162937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309103
4065	NC_007973	CGC	2	6	162973	162978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309103
4066	NC_007973	CCA	2	6	163006	163011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309103
4067	NC_007973	GCGGGC	2	12	163045	163056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309103
4068	NC_007973	GC	3	6	163055	163060	0 %	0 %	50 %	50 %	94309103
4069	NC_007973	TGC	2	6	163087	163092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309103
4070	NC_007973	CAC	2	6	163100	163105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309103
4071	NC_007973	TCC	2	6	163128	163133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94309103
4072	NC_007973	CAG	2	6	163166	163171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309103
4073	NC_007973	GC	3	6	163187	163192	0 %	0 %	50 %	50 %	94309103
4074	NC_007973	GGC	2	6	163193	163198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309103
4075	NC_007973	GGCGT	2	10	163203	163212	0 %	20 %	60 %	20 %	94309103
4076	NC_007973	CGC	2	6	163238	163243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309103
4077	NC_007973	GGC	3	9	163247	163255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309103
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4079	NC_007973	TGA	2	6	163291	163296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309103
4080	NC_007973	GC	3	6	163316	163321	0 %	0 %	50 %	50 %	94309103
4081	NC_007973	GCG	2	6	163349	163354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309103
4082	NC_007973	GCC	2	6	163356	163361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309103
4083	NC_007973	CAG	2	6	163433	163438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309103
4084	NC_007973	CCA	2	6	163444	163449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309103
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4089	NC_007973	CAG	2	6	163592	163597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309103
4090	NC_007973	GGC	3	9	163622	163630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309103
4091	NC_007973	TCG	2	6	163662	163667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309103
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4093	NC_007973	AAC	2	6	163698	163703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94309103
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4095	NC_007973	GCCG	2	8	163751	163758	0 %	0 %	50 %	50 %	94309103
4096	NC_007973	GC	3	6	163762	163767	0 %	0 %	50 %	50 %	94309103
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4099	NC_007973	TGCCG	2	10	163912	163921	0 %	20 %	40 %	40 %	94309103
4100	NC_007973	CAG	2	6	163961	163966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309103
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4102	NC_007973	GCG	2	6	164054	164059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309103
4103	NC_007973	TGG	2	6	164084	164089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309103
4104	NC_007973	GC	3	6	164112	164117	0 %	0 %	50 %	50 %	94309103
4105	NC_007973	GAC	2	6	164133	164138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309103
4106	NC_007973	TC	3	6	164151	164156	0 %	50 %	0 %	50 %	94309103
4107	NC_007973	CGGGG	2	10	164191	164200	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4108	NC_007973	CCA	2	6	164222	164227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_007973	AGCC	2	8	164230	164237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_007973	CG	3	6	164274	164279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_007973	CGC	2	6	164305	164310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_007973	C	6	6	164320	164325	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4113	NC_007973	GAG	2	6	164396	164401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_007973	TCG	2	6	164428	164433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309104
4115	NC_007973	GC	3	6	164455	164460	0 %	0 %	50 %	50 %	94309104
4116	NC_007973	GGC	2	6	164467	164472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309104
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4119	NC_007973	CGC	2	6	164549	164554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309104
4120	NC_007973	CAGC	2	8	164639	164646	25 %	0 %	25 %	50 %	94309104
4121	NC_007973	CGG	2	6	164663	164668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309104
4122	NC_007973	CG	3	6	164698	164703	0 %	0 %	50 %	50 %	94309104
4123	NC_007973	GCC	2	6	164704	164709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309104
4124	NC_007973	ACG	2	6	164719	164724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309104
4125	NC_007973	GAC	2	6	164760	164765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309104
4126	NC_007973	TGC	2	6	164767	164772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309104
4127	NC_007973	CCG	2	6	164780	164785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309104
4128	NC_007973	GAC	2	6	164817	164822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309104
4129	NC_007973	GCA	2	6	164904	164909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309104
4130	NC_007973	GC	3	6	164912	164917	0 %	0 %	50 %	50 %	94309104
4131	NC_007973	CGA	2	6	164948	164953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309104
4132	NC_007973	GCGA	2	8	164995	165002	25 %	0 %	50 %	25 %	94309104
4133	NC_007973	CG	4	8	165011	165018	0 %	0 %	50 %	50 %	94309104
4134	NC_007973	CGG	2	6	165029	165034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309104
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4139	NC_007973	GAT	2	6	165251	165256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309104
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4142	NC_007973	GCC	2	6	165484	165489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309104
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4147	NC_007973	TGC	2	6	165595	165600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309104
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4150	NC_007973	CG	3	6	165722	165727	0 %	0 %	50 %	50 %	94309104
4151	NC_007973	CGG	2	6	165761	165766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309104
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4153	NC_007973	CG	3	6	165818	165823	0 %	0 %	50 %	50 %	94309104
4154	NC_007973	CG	3	6	165834	165839	0 %	0 %	50 %	50 %	94309104
4155	NC_007973	GCATGG	2	12	165877	165888	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	94309104
4156	NC_007973	GGT	2	6	165899	165904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309104
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4158	NC_007973	GTG	2	6	165945	165950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309104
4159	NC_007973	GGT	2	6	165978	165983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309104
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4163	NC_007973	GGC	2	6	166105	166110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4164	NC_007973	CCA	2	6	166163	166168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309105
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4202	NC_007973	ACGC	2	8	167693	167700	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4203	NC_007973	GCAAG	2	10	167702	167711	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4204	NC_007973	CGT	2	6	167712	167717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4230	NC_007973	GCA	2	6	168580	168585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309106
4231	NC_007973	AGTCG	2	10	168607	168616	20 %	20 %	40 %	20 %	94309106
4232	NC_007973	TGG	2	6	168622	168627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309106
4233	NC_007973	GAT	2	6	168635	168640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309106
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4235	NC_007973	GCT	2	6	168704	168709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309106
4236	NC_007973	TGC	2	6	168766	168771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309106
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4242	NC_007973	GC	3	6	168948	168953	0 %	0 %	50 %	50 %	94309106
4243	NC_007973	GCC	2	6	168962	168967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309106
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4245	NC_007973	ATC	2	6	168993	168998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309106
4246	NC_007973	CGG	2	6	169000	169005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309106
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4496	NC_007973	GCCG	2	8	179109	179116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4497	NC_007973	TCA	2	6	179129	179134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4498	NC_007973	CCAA	2	8	179158	179165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4499	NC_007973	ATC	2	6	179203	179208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309116
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