MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 93799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_007973	ACGC	2	8	40870	40877	25 %	0 %	25 %	50 %	94308983
1003	NC_007973	AAG	2	6	40892	40897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308983
1004	NC_007973	CCG	2	6	40923	40928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308983
1005	NC_007973	CGC	2	6	40944	40949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308983
1006	NC_007973	GCAC	2	8	41019	41026	25 %	0 %	25 %	50 %	94308983
1007	NC_007973	GTC	2	6	41053	41058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308983
1008	NC_007973	AAC	3	9	41066	41074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94308983
1009	NC_007973	AC	3	6	41103	41108	50 %	0 %	0 %	50 %	94308983
1010	NC_007973	ACA	2	6	41115	41120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94308983
1011	NC_007973	ATC	2	6	41159	41164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308983
1012	NC_007973	GCC	2	6	41195	41200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308983
1013	NC_007973	CGGC	2	8	41220	41227	0 %	0 %	50 %	50 %	94308983
1014	NC_007973	TGC	2	6	41277	41282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308983
1015	NC_007973	GC	3	6	41289	41294	0 %	0 %	50 %	50 %	94308983
1016	NC_007973	CGG	2	6	41349	41354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308983
1017	NC_007973	CAA	3	9	41396	41404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94308984
1018	NC_007973	TGA	2	6	41469	41474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94308984
1019	NC_007973	GGC	3	9	41477	41485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308984
1020	NC_007973	CG	3	6	41508	41513	0 %	0 %	50 %	50 %	94308984
1021	NC_007973	ATG	2	6	41516	41521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94308984
1022	NC_007973	CAT	2	6	41545	41550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308984
1023	NC_007973	GCA	2	6	41619	41624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308984
1024	NC_007973	TGCG	2	8	41642	41649	0 %	25 %	50 %	25 %	94308984
1025	NC_007973	GCA	2	6	41766	41771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308984
1026	NC_007973	AGC	2	6	41772	41777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308984
1027	NC_007973	CGCTG	2	10	41782	41791	0 %	20 %	40 %	40 %	94308984
1028	NC_007973	ACC	3	9	41804	41812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94308984
1029	NC_007973	GTG	2	6	41822	41827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308984
1030	NC_007973	GC	5	10	41846	41855	0 %	0 %	50 %	50 %	94308984
1031	NC_007973	AGC	2	6	41868	41873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308984
1032	NC_007973	TCG	2	6	41910	41915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308984
1033	NC_007973	TGGCGA	2	12	41935	41946	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	94308984
1034	NC_007973	GGCGT	2	10	41957	41966	0 %	20 %	60 %	20 %	94308984
1035	NC_007973	TGG	2	6	42043	42048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308984
1036	NC_007973	ATC	2	6	42071	42076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308984
1037	NC_007973	AGA	2	6	42150	42155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94308984
1038	NC_007973	CGAA	2	8	42159	42166	50 %	0 %	25 %	25 %	94308984
1039	NC_007973	CTG	2	6	42182	42187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308984
1040	NC_007973	GCT	2	6	42301	42306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308984
1041	NC_007973	CTG	2	6	42338	42343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308984
1042	NC_007973	ATG	2	6	42374	42379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94308984
1043	NC_007973	CG	3	6	42407	42412	0 %	0 %	50 %	50 %	94308984
1044	NC_007973	GCG	2	6	42419	42424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308984
1045	NC_007973	TGC	3	9	42438	42446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308984
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1047	NC_007973	GTC	2	6	42547	42552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308984
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1050	NC_007973	GC	3	6	42618	42623	0 %	0 %	50 %	50 %	94308984
1051	NC_007973	GC	3	6	42772	42777	0 %	0 %	50 %	50 %	94308984
1052	NC_007973	GAT	2	6	42812	42817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94308984
1053	NC_007973	GC	4	8	42821	42828	0 %	0 %	50 %	50 %	94308984
1054	NC_007973	GCA	2	6	42831	42836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308984
1055	NC_007973	CGC	2	6	42837	42842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308984
1056	NC_007973	TGG	3	9	42843	42851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308984
1057	NC_007973	TGA	2	6	42978	42983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94308984
1058	NC_007973	CGA	2	6	43036	43041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308984
1059	NC_007973	CG	4	8	43198	43205	0 %	0 %	50 %	50 %	94308984
1060	NC_007973	CCAA	2	8	43238	43245	50 %	0 %	0 %	50 %	94308984
1061	NC_007973	TGA	2	6	43281	43286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94308984
1062	NC_007973	CG	3	6	43287	43292	0 %	0 %	50 %	50 %	94308984
1063	NC_007973	ACG	2	6	43320	43325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308984
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1066	NC_007973	CAT	2	6	43423	43428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94308984
1067	NC_007973	CCG	2	6	43431	43436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308984
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1072	NC_007973	GCG	2	6	43511	43516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308984
1073	NC_007973	TGC	3	9	43518	43526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308984
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1092	NC_007973	GT	3	6	44382	44387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_007973	CTG	2	6	44499	44504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308986
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1099	NC_007973	CGGC	2	8	44569	44576	0 %	0 %	50 %	50 %	94308986
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1101	NC_007973	GTG	2	6	44637	44642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308986
1102	NC_007973	GC	3	6	44764	44769	0 %	0 %	50 %	50 %	94308986
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1109	NC_007973	TGG	2	6	45010	45015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94308986
1110	NC_007973	CCG	2	6	45022	45027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308986
1111	NC_007973	CTG	2	6	45033	45038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308986
1112	NC_007973	GC	3	6	45078	45083	0 %	0 %	50 %	50 %	94308986
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1114	NC_007973	TTC	2	6	45099	45104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94308986
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1117	NC_007973	CGA	3	9	45164	45172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94308986
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1119	NC_007973	ATCG	2	8	45197	45204	25 %	25 %	25 %	25 %	94308986
1120	NC_007973	TCTGG	2	10	45206	45215	0 %	40 %	40 %	20 %	94308986
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1125	NC_007973	GCC	2	6	45350	45355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94308986
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1128	NC_007973	TGC	2	6	45493	45498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94308986
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1247	NC_007973	CGG	2	6	50062	50067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308989
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1249	NC_007973	GCG	2	6	50083	50088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94308989
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1252	NC_007973	GC	5	10	50213	50222	0 %	0 %	50 %	50 %	94308989
1253	NC_007973	GCCGCT	2	12	50258	50269	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	94308989
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