MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL28

Total Repeats: 3445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007972	CTT	2	6	148992	148997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152700
3002	NC_007972	CGG	2	6	149000	149005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152700
3003	NC_007972	CGG	2	6	149039	149044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152700
3004	NC_007972	GCT	2	6	149054	149059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152700
3005	NC_007972	ACG	2	6	149203	149208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152700
3006	NC_007972	GAA	2	6	149295	149300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152700
3007	NC_007972	GCC	2	6	149341	149346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152700
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3009	NC_007972	GGCGCG	2	12	149473	149484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152700
3010	NC_007972	ATC	2	6	149545	149550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152700
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3012	NC_007972	AGC	3	9	149657	149665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152701
3013	NC_007972	ACC	2	6	149698	149703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152701
3014	NC_007972	CGA	2	6	149735	149740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152701
3015	NC_007972	GTC	2	6	149752	149757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152701
3016	NC_007972	GAT	2	6	149800	149805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152701
3017	NC_007972	CGA	2	6	149829	149834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152701
3018	NC_007972	ACTG	2	8	149849	149856	25 %	25 %	25 %	25 %	94152701
3019	NC_007972	GTT	2	6	149860	149865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152701
3020	NC_007972	CGT	2	6	149937	149942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152701
3021	NC_007972	CG	3	6	149943	149948	0 %	0 %	50 %	50 %	94152701
3022	NC_007972	GCC	2	6	149966	149971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152701
3023	NC_007972	ACCG	2	8	149980	149987	25 %	0 %	25 %	50 %	94152701
3024	NC_007972	TGA	2	6	150000	150005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152701
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3026	NC_007972	CGT	3	9	150034	150042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152701
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3029	NC_007972	CGA	2	6	150232	150237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152701
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3102	NC_007972	CGT	2	6	154258	154263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152705
3103	NC_007972	GC	3	6	154282	154287	0 %	0 %	50 %	50 %	94152705
3104	NC_007972	CG	3	6	154296	154301	0 %	0 %	50 %	50 %	94152705
3105	NC_007972	TGCC	2	8	154367	154374	0 %	25 %	25 %	50 %	94152705
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3122	NC_007972	GCA	2	6	155158	155163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152706
3123	NC_007972	CGG	2	6	155168	155173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152706
3124	NC_007972	CTG	2	6	155193	155198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152706
3125	NC_007972	GCT	2	6	155246	155251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152706
3126	NC_007972	TTC	3	9	155323	155331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152706
3127	NC_007972	CGC	2	6	155358	155363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152706
3128	NC_007972	CGG	2	6	155378	155383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152706
3129	NC_007972	GCC	2	6	155611	155616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152706
3130	NC_007972	CAC	2	6	155618	155623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152706
3131	NC_007972	GAC	2	6	155634	155639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152706
3132	NC_007972	CGTC	2	8	155678	155685	0 %	25 %	25 %	50 %	94152706
3133	NC_007972	TTTG	2	8	155708	155715	0 %	75 %	25 %	0 %	94152706
3134	NC_007972	GCG	3	9	155741	155749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152707
3135	NC_007972	CTTCA	2	10	155762	155771	20 %	40 %	0 %	40 %	94152707
3136	NC_007972	TCG	2	6	155772	155777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152707
3137	NC_007972	GCA	2	6	155785	155790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152707
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3140	NC_007972	ACC	2	6	155847	155852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152707
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3143	NC_007972	CGT	2	6	156085	156090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152707
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3146	NC_007972	GCC	2	6	156155	156160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152707
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3149	NC_007972	CCGT	2	8	156267	156274	0 %	25 %	25 %	50 %	94152707
3150	NC_007972	TCG	2	6	156327	156332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152707
3151	NC_007972	GATCT	2	10	156383	156392	20 %	40 %	20 %	20 %	94152707
3152	NC_007972	CGC	2	6	156448	156453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152707
3153	NC_007972	AGC	2	6	156570	156575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152707
3154	NC_007972	CGA	2	6	156646	156651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3155	NC_007972	GCC	2	6	156656	156661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152708
3156	NC_007972	A	6	6	156676	156681	100 %	0 %	0 %	0 %	94152708
3157	NC_007972	CCT	2	6	156720	156725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152708
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3159	NC_007972	CGA	3	9	156816	156824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152708
3160	NC_007972	TGA	2	6	156852	156857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152708
3161	NC_007972	CGA	2	6	156883	156888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152708
3162	NC_007972	GGC	2	6	156943	156948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152708
3163	NC_007972	CGAAC	2	10	156965	156974	40 %	0 %	20 %	40 %	94152708
3164	NC_007972	CGA	2	6	156994	156999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152708
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3176	NC_007972	GCC	2	6	157484	157489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3177	NC_007972	C	6	6	157488	157493	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3178	NC_007972	GAC	2	6	157530	157535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3181	NC_007972	CGC	2	6	157717	157722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3182	NC_007972	CAA	2	6	157744	157749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3183	NC_007972	AAC	2	6	157773	157778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152709
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3200	NC_007972	CGCT	2	8	158594	158601	0 %	25 %	25 %	50 %	94152709
3201	NC_007972	CTT	2	6	158631	158636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152709
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3203	NC_007972	CGA	2	6	158666	158671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152709
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3217	NC_007972	GTC	2	6	159063	159068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152710
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3229	NC_007972	TTC	2	6	159880	159885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152712
3230	NC_007972	CGC	2	6	159930	159935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152712
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3232	NC_007972	CGC	2	6	160098	160103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152712
3233	NC_007972	CCA	2	6	160107	160112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152712
3234	NC_007972	TGAG	2	8	160178	160185	25 %	25 %	50 %	0 %	94152712
3235	NC_007972	GCG	2	6	160288	160293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152712
3236	NC_007972	CTG	2	6	160303	160308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152712
3237	NC_007972	CAT	2	6	160335	160340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152712
3238	NC_007972	GGC	2	6	160407	160412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152712
3239	NC_007972	AT	3	6	160440	160445	50 %	50 %	0 %	0 %	94152712
3240	NC_007972	AGG	2	6	160451	160456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152712
3241	NC_007972	GGA	2	6	160479	160484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152712
3242	NC_007972	GTC	2	6	160564	160569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152712
3243	NC_007972	GGT	2	6	160611	160616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152712
3244	NC_007972	GGC	2	6	160671	160676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152712
3245	NC_007972	CGGT	2	8	160765	160772	0 %	25 %	50 %	25 %	94152712
3246	NC_007972	GCC	2	6	160827	160832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152712
3247	NC_007972	CCTG	2	8	160838	160845	0 %	25 %	25 %	50 %	94152712
3248	NC_007972	GGC	2	6	160891	160896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152712
3249	NC_007972	GCT	2	6	161031	161036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152712
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3251	NC_007972	GAC	2	6	161164	161169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152712
3252	NC_007972	GCT	2	6	161220	161225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152712
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3254	NC_007972	GGGC	2	8	161316	161323	0 %	0 %	75 %	25 %	94152712
3255	NC_007972	CTT	2	6	161334	161339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152712
3256	NC_007972	GCG	2	6	161390	161395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152712
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3262	NC_007972	CG	3	6	161619	161624	0 %	0 %	50 %	50 %	94152712
3263	NC_007972	ATCT	2	8	161668	161675	25 %	50 %	0 %	25 %	94152712
3264	NC_007972	CCAGAT	2	12	161739	161750	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94152712
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3281	NC_007972	AC	3	6	162435	162440	50 %	0 %	0 %	50 %	94152713
3282	NC_007972	GCC	2	6	162456	162461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152713
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3284	NC_007972	GTGC	2	8	162578	162585	0 %	25 %	50 %	25 %	94152713
3285	NC_007972	GCGAT	2	10	162644	162653	20 %	20 %	40 %	20 %	94152713
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3287	NC_007972	CA	3	6	162735	162740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3288	NC_007972	CGC	2	6	162795	162800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152714
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3292	NC_007972	CGCT	2	8	163239	163246	0 %	25 %	25 %	50 %	94152714
3293	NC_007972	GGC	2	6	163291	163296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152714
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3312	NC_007972	CGAC	2	8	164395	164402	25 %	0 %	25 %	50 %	94152715
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3320	NC_007972	CCG	2	6	164759	164764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152715
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3323	NC_007972	GCTC	2	8	164894	164901	0 %	25 %	25 %	50 %	94152715
3324	NC_007972	CGA	2	6	164994	164999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152715
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3332	NC_007972	AAG	2	6	165519	165524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152716
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3353	NC_007972	CGTT	2	8	166534	166541	0 %	50 %	25 %	25 %	94152716
3354	NC_007972	GCA	2	6	166595	166600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152716
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3357	NC_007972	CAG	2	6	166712	166717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152716
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3359	NC_007972	ATT	2	6	166887	166892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94152716
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3361	NC_007972	GCA	2	6	166912	166917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152717
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3366	NC_007972	CG	3	6	167102	167107	0 %	0 %	50 %	50 %	94152717
3367	NC_007972	CG	4	8	167152	167159	0 %	0 %	50 %	50 %	94152717
3368	NC_007972	ACA	2	6	167170	167175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152717
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