MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL28

Total Repeats: 3445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007972	ACC	2	6	50365	50370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152609
1002	NC_007972	CCCGA	2	10	50396	50405	20 %	0 %	20 %	60 %	94152609
1003	NC_007972	AAG	2	6	50449	50454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152609
1004	NC_007972	TCA	2	6	50472	50477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152609
1005	NC_007972	GCC	2	6	50486	50491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152609
1006	NC_007972	CGG	2	6	50542	50547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152609
1007	NC_007972	GC	3	6	50549	50554	0 %	0 %	50 %	50 %	94152609
1008	NC_007972	ACCAG	2	10	50559	50568	40 %	0 %	20 %	40 %	94152609
1009	NC_007972	GCCAC	2	10	50589	50598	20 %	0 %	20 %	60 %	94152609
1010	NC_007972	AGAT	2	8	50636	50643	50 %	25 %	25 %	0 %	94152609
1011	NC_007972	GAT	2	6	50704	50709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152609
1012	NC_007972	CTG	2	6	50718	50723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152609
1013	NC_007972	GCC	2	6	50761	50766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152609
1014	NC_007972	ACG	2	6	50808	50813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152609
1015	NC_007972	CGA	2	6	50832	50837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152609
1016	NC_007972	CCTT	2	8	50930	50937	0 %	50 %	0 %	50 %	94152609
1017	NC_007972	CGA	2	6	50970	50975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152609
1018	NC_007972	GCGTA	2	10	51058	51067	20 %	20 %	40 %	20 %	94152609
1019	NC_007972	GGT	2	6	51110	51115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152609
1020	NC_007972	CTT	2	6	51150	51155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_007972	CAG	2	6	51235	51240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152610
1022	NC_007972	CGT	3	9	51243	51251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152610
1023	NC_007972	GCC	2	6	51316	51321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152610
1024	NC_007972	ATC	2	6	51338	51343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152610
1025	NC_007972	GGCG	2	8	51351	51358	0 %	0 %	75 %	25 %	94152610
1026	NC_007972	AGC	2	6	51392	51397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152610
1027	NC_007972	AAACG	2	10	51403	51412	60 %	0 %	20 %	20 %	94152610
1028	NC_007972	TG	4	8	51423	51430	0 %	50 %	50 %	0 %	94152610
1029	NC_007972	CGT	2	6	51462	51467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152610
1030	NC_007972	GGGTC	2	10	51600	51609	0 %	20 %	60 %	20 %	94152610
1031	NC_007972	A	6	6	51725	51730	100 %	0 %	0 %	0 %	94152610
1032	NC_007972	GCA	2	6	51780	51785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152610
1033	NC_007972	CCAT	2	8	51837	51844	25 %	25 %	0 %	50 %	94152610
1034	NC_007972	AAC	2	6	51869	51874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152610
1035	NC_007972	CCT	2	6	51888	51893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152610
1036	NC_007972	GTC	2	6	51898	51903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152610
1037	NC_007972	GC	3	6	52066	52071	0 %	0 %	50 %	50 %	94152610
1038	NC_007972	ACG	2	6	52097	52102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152610
1039	NC_007972	TGT	2	6	52182	52187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_007972	GCTC	2	8	52266	52273	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_007972	TTG	2	6	52392	52397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152611
1042	NC_007972	AGG	2	6	52415	52420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152611
1043	NC_007972	ATTG	2	8	52447	52454	25 %	50 %	25 %	0 %	94152611
1044	NC_007972	CTG	2	6	52479	52484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152611
1045	NC_007972	GCC	3	9	52487	52495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152611
1046	NC_007972	CGCA	2	8	52497	52504	25 %	0 %	25 %	50 %	94152611
1047	NC_007972	CGA	2	6	52522	52527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152611
1048	NC_007972	AGC	2	6	52562	52567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152611
1049	NC_007972	CGC	2	6	52621	52626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152611
1050	NC_007972	CGA	2	6	52630	52635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152611
1051	NC_007972	GGT	2	6	52673	52678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152611
1052	NC_007972	AAG	2	6	52730	52735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152611
1053	NC_007972	CGGG	2	8	52818	52825	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_007972	GGC	2	6	52859	52864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_007972	GGC	2	6	52874	52879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_007972	GCTTT	2	10	52896	52905	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1057	NC_007972	CCG	2	6	52962	52967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_007972	CGG	2	6	53005	53010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_007972	ATG	2	6	53016	53021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_007972	AGTC	2	8	53036	53043	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_007972	ATC	2	6	53091	53096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_007972	CGG	2	6	53172	53177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_007972	TGGA	2	8	53294	53301	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_007972	ACGC	2	8	53334	53341	25 %	0 %	25 %	50 %	94152612
1065	NC_007972	TCG	2	6	53428	53433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152612
1066	NC_007972	CG	3	6	53432	53437	0 %	0 %	50 %	50 %	94152612
1067	NC_007972	CTG	2	6	53459	53464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152612
1068	NC_007972	CGC	2	6	53465	53470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152612
1069	NC_007972	CAAT	2	8	53497	53504	50 %	25 %	0 %	25 %	94152612
1070	NC_007972	CAT	2	6	53516	53521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152612
1071	NC_007972	GTGG	2	8	53543	53550	0 %	25 %	75 %	0 %	94152612
1072	NC_007972	CCG	2	6	53560	53565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152612
1073	NC_007972	CTC	2	6	53580	53585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152612
1074	NC_007972	ATG	2	6	53594	53599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152612
1075	NC_007972	ACT	2	6	53644	53649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152613
1076	NC_007972	CGG	2	6	53664	53669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152613
1077	NC_007972	AGA	2	6	53779	53784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152613
1078	NC_007972	AGC	2	6	53890	53895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152613
1079	NC_007972	GCC	2	6	53915	53920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152613
1080	NC_007972	AGCG	2	8	53931	53938	25 %	0 %	50 %	25 %	94152613
1081	NC_007972	TGCG	2	8	53961	53968	0 %	25 %	50 %	25 %	94152613
1082	NC_007972	CGC	2	6	54023	54028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152613
1083	NC_007972	TGGCG	2	10	54123	54132	0 %	20 %	60 %	20 %	94152614
1084	NC_007972	CG	3	6	54144	54149	0 %	0 %	50 %	50 %	94152614
1085	NC_007972	GAC	2	6	54178	54183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152614
1086	NC_007972	GTC	2	6	54184	54189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152614
1087	NC_007972	GCC	2	6	54205	54210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152614
1088	NC_007972	GCGG	2	8	54358	54365	0 %	0 %	75 %	25 %	94152614
1089	NC_007972	ACG	2	6	54374	54379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152614
1090	NC_007972	GCC	2	6	54403	54408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152614
1091	NC_007972	CGGG	2	8	54558	54565	0 %	0 %	75 %	25 %	94152614
1092	NC_007972	CTG	2	6	54586	54591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152614
1093	NC_007972	AG	3	6	54653	54658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_007972	TGA	2	6	54683	54688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152615
1095	NC_007972	TCG	2	6	54725	54730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152615
1096	NC_007972	GCT	2	6	54744	54749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152615
1097	NC_007972	CGTTG	2	10	54753	54762	0 %	40 %	40 %	20 %	94152615
1098	NC_007972	CCT	2	6	54781	54786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152615
1099	NC_007972	GCA	2	6	54801	54806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152615
1100	NC_007972	GCC	2	6	54841	54846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152615
1101	NC_007972	TGC	2	6	54870	54875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152615
1102	NC_007972	AGT	2	6	54937	54942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152615
1103	NC_007972	AGG	2	6	54996	55001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152615
1104	NC_007972	GCG	2	6	55007	55012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152615
1105	NC_007972	GCG	2	6	55045	55050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152615
1106	NC_007972	CGC	2	6	55083	55088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152615
1107	NC_007972	GCG	2	6	55120	55125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152615
1108	NC_007972	GGC	2	6	55179	55184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152615
1109	NC_007972	CG	3	6	55185	55190	0 %	0 %	50 %	50 %	94152615
1110	NC_007972	AAG	2	6	55211	55216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152615
1111	NC_007972	GC	3	6	55229	55234	0 %	0 %	50 %	50 %	94152615
1112	NC_007972	AGGCCA	2	12	55235	55246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152615
1113	NC_007972	GGC	3	9	55251	55259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152615
1114	NC_007972	GGC	2	6	55272	55277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152615
1115	NC_007972	CCA	2	6	55280	55285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152615
1116	NC_007972	GAC	2	6	55368	55373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152615
1117	NC_007972	CGT	2	6	55380	55385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152615
1118	NC_007972	GCA	2	6	55399	55404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152615
1119	NC_007972	GCC	2	6	55429	55434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152615
1120	NC_007972	CCG	2	6	55518	55523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152615
1121	NC_007972	TCCAT	2	10	55570	55579	20 %	40 %	0 %	40 %	94152615
1122	NC_007972	GCC	2	6	55630	55635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152615
1123	NC_007972	GC	3	6	55675	55680	0 %	0 %	50 %	50 %	94152615
1124	NC_007972	CCG	2	6	55706	55711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152615
1125	NC_007972	AGC	2	6	55715	55720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152615
1126	NC_007972	GCT	2	6	55723	55728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152615
1127	NC_007972	GGC	3	9	55746	55754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152615
1128	NC_007972	GCG	2	6	55824	55829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152615
1129	NC_007972	TCG	2	6	55835	55840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152615
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1248	NC_007972	AAC	2	6	60911	60916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152618
1249	NC_007972	GCT	2	6	60946	60951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152618
1250	NC_007972	GCCT	2	8	60956	60963	0 %	25 %	25 %	50 %	94152618
1251	NC_007972	ACC	2	6	60992	60997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152618
1252	NC_007972	GCG	2	6	61040	61045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152618
1253	NC_007972	ATC	2	6	61055	61060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152618
1254	NC_007972	TTGT	2	8	61091	61098	0 %	75 %	25 %	0 %	94152618
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1256	NC_007972	GGCTTT	2	12	61219	61230	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	94152618
1257	NC_007972	GT	3	6	61242	61247	0 %	50 %	50 %	0 %	94152618
1258	NC_007972	GA	3	6	61260	61265	50 %	0 %	50 %	0 %	94152618
1259	NC_007972	GAGCAT	2	12	61271	61282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94152618
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1368	NC_007972	TCGTA	2	10	66572	66581	20 %	40 %	20 %	20 %	94152623
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1374	NC_007972	GCA	2	6	66774	66779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152623
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1383	NC_007972	CGC	3	9	67246	67254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152623
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