MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL30

Total Repeats: 4624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007971	ATCA	2	8	52638	52645	50 %	25 %	0 %	25 %	94152407
1002	NC_007971	TGA	2	6	52721	52726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152407
1003	NC_007971	CGG	2	6	52733	52738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152407
1004	NC_007971	TTG	2	6	52864	52869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152407
1005	NC_007971	AGT	2	6	52988	52993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152407
1006	NC_007971	CTGGC	2	10	53126	53135	0 %	20 %	40 %	40 %	94152407
1007	NC_007971	CCG	2	6	53178	53183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152407
1008	NC_007971	GCT	2	6	53195	53200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152407
1009	NC_007971	CTC	2	6	53269	53274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152407
1010	NC_007971	CGG	2	6	53318	53323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152407
1011	NC_007971	CTT	2	6	53448	53453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152407
1012	NC_007971	ATG	2	6	53461	53466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152407
1013	NC_007971	GCC	2	6	53487	53492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152407
1014	NC_007971	GCC	2	6	53505	53510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152407
1015	NC_007971	GAT	2	6	53573	53578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152407
1016	NC_007971	AGC	2	6	53657	53662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152407
1017	NC_007971	CCG	2	6	53668	53673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152407
1018	NC_007971	CGT	2	6	53688	53693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152407
1019	NC_007971	GTC	2	6	53736	53741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152407
1020	NC_007971	AGCC	2	8	53749	53756	25 %	0 %	25 %	50 %	94152407
1021	NC_007971	CAC	2	6	53771	53776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152407
1022	NC_007971	TGG	2	6	53841	53846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152407
1023	NC_007971	G	6	6	53845	53850	0 %	0 %	100 %	0 %	94152407
1024	NC_007971	TCG	2	6	53917	53922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152407
1025	NC_007971	GCC	2	6	53934	53939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152407
1026	NC_007971	GC	3	6	53949	53954	0 %	0 %	50 %	50 %	94152407
1027	NC_007971	GC	3	6	53970	53975	0 %	0 %	50 %	50 %	94152407
1028	NC_007971	GT	3	6	54177	54182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_007971	GC	3	6	54213	54218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_007971	CGG	2	6	54266	54271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_007971	A	6	6	54290	54295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_007971	CAT	2	6	54327	54332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_007971	CGG	2	6	54333	54338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_007971	CAG	3	9	54380	54388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_007971	AGG	2	6	54417	54422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_007971	CATT	2	8	54424	54431	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_007971	CGCA	2	8	54452	54459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_007971	AGG	2	6	54477	54482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_007971	TGAC	2	8	54544	54551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_007971	GGTG	2	8	54605	54612	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_007971	ATGA	2	8	54664	54671	50 %	25 %	25 %	0 %	94152405
1042	NC_007971	CCA	2	6	54680	54685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152405
1043	NC_007971	CG	3	6	54742	54747	0 %	0 %	50 %	50 %	94152405
1044	NC_007971	GAGC	2	8	54766	54773	25 %	0 %	50 %	25 %	94152405
1045	NC_007971	CGG	2	6	54799	54804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152405
1046	NC_007971	GCG	2	6	54935	54940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152405
1047	NC_007971	GGCA	2	8	55148	55155	25 %	0 %	50 %	25 %	94152405
1048	NC_007971	GTTTT	2	10	55232	55241	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_007971	AGG	2	6	55297	55302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_007971	C	6	6	55335	55340	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1051	NC_007971	CA	3	6	55388	55393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_007971	GCT	2	6	55457	55462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_007971	CAC	2	6	55496	55501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_007971	TCCA	2	8	55541	55548	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_007971	GCC	2	6	55571	55576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_007971	ACCCG	2	10	55635	55644	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1057	NC_007971	TGG	2	6	55693	55698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_007971	TCA	2	6	55699	55704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_007971	AGCA	2	8	55759	55766	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_007971	GCG	3	9	55928	55936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_007971	AAG	2	6	55951	55956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_007971	CAA	2	6	55992	55997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_007971	CCT	2	6	56008	56013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_007971	CGCGC	2	10	56026	56035	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1065	NC_007971	CGC	2	6	56080	56085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_007971	CGG	2	6	56110	56115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_007971	GCC	2	6	56325	56330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_007971	GC	3	6	56360	56365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_007971	AGC	3	9	56427	56435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_007971	CGT	2	6	56473	56478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_007971	TGA	2	6	56542	56547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_007971	CGC	2	6	56568	56573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_007971	GCA	2	6	56616	56621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_007971	TGG	2	6	56721	56726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_007971	GCC	2	6	56735	56740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_007971	GAA	2	6	56750	56755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_007971	GC	3	6	56760	56765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_007971	CG	4	8	56776	56783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_007971	GGC	2	6	56791	56796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_007971	CCG	2	6	56826	56831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_007971	GGGC	2	8	56854	56861	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_007971	GCGCA	2	10	56864	56873	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1083	NC_007971	GCA	2	6	56887	56892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_007971	GCA	2	6	56929	56934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_007971	CG	3	6	56944	56949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_007971	AGC	2	6	56961	56966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_007971	CG	4	8	57040	57047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_007971	GACCAG	2	12	57089	57100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_007971	AGC	2	6	57111	57116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_007971	GCA	2	6	57151	57156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_007971	CAT	2	6	57160	57165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1093	NC_007971	GC	4	8	57204	57211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1095	NC_007971	AGC	2	6	57309	57314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_007971	GCG	2	6	57329	57334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_007971	AGC	2	6	57375	57380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_007971	AGC	2	6	57404	57409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_007971	GCA	2	6	57472	57477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_007971	TCG	2	6	57507	57512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_007971	AGCG	2	8	57515	57522	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_007971	GC	3	6	57539	57544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_007971	ATC	2	6	57589	57594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_007971	GAT	2	6	57673	57678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_007971	CGT	2	6	57704	57709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_007971	GAT	2	6	57775	57780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_007971	CAT	2	6	57789	57794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_007971	GA	3	6	57906	57911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_007971	CGT	2	6	57984	57989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152401
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1113	NC_007971	GCC	2	6	58277	58282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152401
1114	NC_007971	CCG	2	6	58352	58357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152401
1115	NC_007971	CCG	2	6	58490	58495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152401
1116	NC_007971	GCCA	2	8	58535	58542	25 %	0 %	25 %	50 %	94152401
1117	NC_007971	CGT	2	6	58545	58550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152401
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1119	NC_007971	GAT	2	6	58597	58602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152401
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1123	NC_007971	TTGGC	2	10	58841	58850	0 %	40 %	40 %	20 %	94152401
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1125	NC_007971	GAT	2	6	58916	58921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152401
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1128	NC_007971	GGAC	2	8	59057	59064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_007971	CCG	2	6	59096	59101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_007971	CAAT	2	8	59177	59184	50 %	25 %	0 %	25 %	94152400
1131	NC_007971	GC	3	6	59206	59211	0 %	0 %	50 %	50 %	94152400
1132	NC_007971	GCC	2	6	59275	59280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152400
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1134	NC_007971	TG	3	6	59310	59315	0 %	50 %	50 %	0 %	94152400
1135	NC_007971	GGT	2	6	59327	59332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152400
1136	NC_007971	CCT	3	9	59342	59350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152400
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1139	NC_007971	CAT	2	6	59486	59491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152400
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1161	NC_007971	CACT	2	8	60547	60554	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1162	NC_007971	CAA	2	6	60576	60581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1244	NC_007971	TCG	2	6	65372	65377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1245	NC_007971	GCCTTG	2	12	65398	65409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1247	NC_007971	T	7	7	65490	65496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1249	NC_007971	AGCG	2	8	65563	65570	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1250	NC_007971	AGC	2	6	65584	65589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1251	NC_007971	CAA	2	6	65602	65607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1252	NC_007971	ATG	2	6	65615	65620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_007971	GTG	2	6	65637	65642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152393
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1255	NC_007971	CAG	2	6	65659	65664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152393
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