MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL30

Total Repeats: 4624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007971	CTC	2	6	26691	26696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152440
502	NC_007971	GCG	2	6	26702	26707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152440
503	NC_007971	CCAC	2	8	26731	26738	25 %	0 %	0 %	75 %	94152440
504	NC_007971	CAT	2	6	26866	26871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291464758
505	NC_007971	GCC	2	6	26926	26931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291464758
506	NC_007971	GAC	2	6	26977	26982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291464758
507	NC_007971	GGC	2	6	27035	27040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291464758
508	NC_007971	TGA	2	6	27072	27077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291464758
509	NC_007971	ACCA	2	8	27091	27098	50 %	0 %	0 %	50 %	291464758
510	NC_007971	TGG	2	6	27112	27117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291464758
511	NC_007971	GTG	2	6	27125	27130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291464758
512	NC_007971	TCC	2	6	27173	27178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291464758
513	NC_007971	GGC	2	6	27214	27219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291464758
514	NC_007971	CAG	2	6	27226	27231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291464758
515	NC_007971	GT	3	6	27282	27287	0 %	50 %	50 %	0 %	94152439
516	NC_007971	GGAT	2	8	27292	27299	25 %	25 %	50 %	0 %	94152439
517	NC_007971	GAA	2	6	27384	27389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152439
518	NC_007971	ATG	2	6	27400	27405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152439
519	NC_007971	AAGGC	2	10	27472	27481	40 %	0 %	40 %	20 %	94152439
520	NC_007971	GAG	2	6	27604	27609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152439
521	NC_007971	CGA	2	6	27700	27705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_007971	GCC	2	6	27746	27751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_007971	CCG	2	6	27880	27885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_007971	TGC	2	6	27901	27906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_007971	TGG	2	6	27927	27932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_007971	GC	3	6	27979	27984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_007971	GA	3	6	27995	28000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_007971	GAGC	2	8	28005	28012	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
529	NC_007971	GCA	2	6	28040	28045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_007971	TGT	2	6	28079	28084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_007971	TCG	2	6	28111	28116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_007971	TCA	2	6	28142	28147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_007971	GAG	2	6	28173	28178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152437
534	NC_007971	ATG	2	6	28249	28254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152437
535	NC_007971	ACGG	2	8	28269	28276	25 %	0 %	50 %	25 %	94152437
536	NC_007971	TGAGG	2	10	28289	28298	20 %	20 %	60 %	0 %	94152437
537	NC_007971	CTC	2	6	28470	28475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152437
538	NC_007971	TTC	2	6	28480	28485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152437
539	NC_007971	CGA	2	6	28550	28555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152437
540	NC_007971	TC	3	6	28606	28611	0 %	50 %	0 %	50 %	94152437
541	NC_007971	TGC	2	6	28615	28620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152437
542	NC_007971	GCTT	2	8	28640	28647	0 %	50 %	25 %	25 %	94152437
543	NC_007971	TTG	2	6	28690	28695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152437
544	NC_007971	CGT	2	6	28814	28819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152437
545	NC_007971	ACG	2	6	28960	28965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152437
546	NC_007971	GGA	2	6	28997	29002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152437
547	NC_007971	C	6	6	29020	29025	0 %	0 %	0 %	100 %	94152437
548	NC_007971	GCG	2	6	29057	29062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152437
549	NC_007971	GGA	2	6	29275	29280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152436
550	NC_007971	GAT	2	6	29309	29314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152436
551	NC_007971	CG	3	6	29372	29377	0 %	0 %	50 %	50 %	94152436
552	NC_007971	GTC	2	6	29466	29471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152436
553	NC_007971	TC	3	6	29545	29550	0 %	50 %	0 %	50 %	94152436
554	NC_007971	TGT	2	6	29560	29565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152436
555	NC_007971	C	6	6	29597	29602	0 %	0 %	0 %	100 %	94152436
556	NC_007971	GGTT	2	8	29654	29661	0 %	50 %	50 %	0 %	94152436
557	NC_007971	GTT	2	6	29695	29700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152436
558	NC_007971	TCA	2	6	29950	29955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_007971	GCC	2	6	30113	30118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152435
560	NC_007971	ACC	2	6	30221	30226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152434
561	NC_007971	CAT	2	6	30449	30454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152434
562	NC_007971	CG	3	6	30465	30470	0 %	0 %	50 %	50 %	94152434
563	NC_007971	GAA	2	6	30513	30518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152434
564	NC_007971	TGA	2	6	30525	30530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152434
565	NC_007971	CGGC	2	8	30580	30587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
566	NC_007971	GGCC	2	8	30605	30612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_007971	TGG	2	6	30616	30621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152433
568	NC_007971	AGA	2	6	30633	30638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152433
569	NC_007971	ACC	2	6	30658	30663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152433
570	NC_007971	GGAT	2	8	30674	30681	25 %	25 %	50 %	0 %	94152433
571	NC_007971	ATC	2	6	30693	30698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152433
572	NC_007971	GA	4	8	30759	30766	50 %	0 %	50 %	0 %	94152433
573	NC_007971	ATG	2	6	30786	30791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152433
574	NC_007971	GTT	2	6	30801	30806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152433
575	NC_007971	GA	3	6	30822	30827	50 %	0 %	50 %	0 %	94152433
576	NC_007971	CG	3	6	30846	30851	0 %	0 %	50 %	50 %	94152433
577	NC_007971	AGA	2	6	30887	30892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152433
578	NC_007971	GGT	2	6	30899	30904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152433
579	NC_007971	CGA	2	6	30913	30918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152433
580	NC_007971	CCA	2	6	30941	30946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152433
581	NC_007971	GTCG	2	8	31061	31068	0 %	25 %	50 %	25 %	94152433
582	NC_007971	TGA	2	6	31181	31186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152433
583	NC_007971	GAT	2	6	31205	31210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152433
584	NC_007971	CGG	2	6	31258	31263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152433
585	NC_007971	GC	3	6	31274	31279	0 %	0 %	50 %	50 %	94152433
586	NC_007971	CCTT	2	8	31294	31301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_007971	CG	3	6	31340	31345	0 %	0 %	50 %	50 %	94152432
588	NC_007971	AC	3	6	31506	31511	50 %	0 %	0 %	50 %	94152432
589	NC_007971	GCT	2	6	31608	31613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152432
590	NC_007971	CGC	2	6	31638	31643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152432
591	NC_007971	GCGCG	2	10	31858	31867	0 %	0 %	60 %	40 %	94152432
592	NC_007971	CGCACG	2	12	31918	31929	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	94152432
593	NC_007971	CG	3	6	31928	31933	0 %	0 %	50 %	50 %	94152432
594	NC_007971	CGG	2	6	31959	31964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152432
595	NC_007971	TCG	2	6	32087	32092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152432
596	NC_007971	AGC	2	6	32131	32136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152432
597	NC_007971	GCG	2	6	32265	32270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152432
598	NC_007971	CTG	2	6	32296	32301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152432
599	NC_007971	CGAA	2	8	32396	32403	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
600	NC_007971	ATC	2	6	32480	32485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_007971	GGA	2	6	32550	32555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152430
602	NC_007971	GCG	2	6	32583	32588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152430
603	NC_007971	ACGATC	2	12	32607	32618	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94152430
604	NC_007971	CAC	2	6	32775	32780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152430
605	NC_007971	ATTCG	2	10	32824	32833	20 %	40 %	20 %	20 %	94152430
606	NC_007971	ATCC	2	8	32845	32852	25 %	25 %	0 %	50 %	94152430
607	NC_007971	GA	3	6	33005	33010	50 %	0 %	50 %	0 %	94152429
608	NC_007971	CG	3	6	33014	33019	0 %	0 %	50 %	50 %	94152429
609	NC_007971	CGC	2	6	33124	33129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152429
610	NC_007971	ACG	2	6	33155	33160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152429
611	NC_007971	GCA	2	6	33225	33230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_007971	CGT	2	6	33295	33300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_007971	CTT	2	6	33344	33349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_007971	TG	3	6	33406	33411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_007971	GGT	2	6	33432	33437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_007971	CGT	2	6	33477	33482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_007971	CCTC	2	8	33499	33506	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
618	NC_007971	GAGCG	2	10	33550	33559	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
619	NC_007971	CTCGA	2	10	33564	33573	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
620	NC_007971	CGGG	2	8	33632	33639	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
621	NC_007971	CGG	2	6	33720	33725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_007971	CCG	2	6	33741	33746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_007971	GCC	2	6	33754	33759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_007971	CGC	2	6	33838	33843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_007971	TCA	2	6	33871	33876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_007971	CGGC	2	8	33884	33891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_007971	CTCG	2	8	33900	33907	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
628	NC_007971	CGT	2	6	33912	33917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_007971	CCA	2	6	33932	33937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_007971	AGCCA	2	10	33953	33962	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
631	NC_007971	TGAT	2	8	34062	34069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_007971	AACTCT	2	12	34192	34203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_007971	CG	3	6	34318	34323	0 %	0 %	50 %	50 %	94152427
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