MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chromohalobacter salexigens DSM 3043 chromosome

Total Repeats: 85586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007963	CAC	2	6	217452	217457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112331
5002	NC_007963	CGC	2	6	217458	217463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112331
5003	NC_007963	CAG	2	6	217540	217545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112331
5004	NC_007963	CAG	3	9	217611	217619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112331
5005	NC_007963	CCAC	2	8	217646	217653	25 %	0 %	0 %	75 %	92112331
5006	NC_007963	CCAG	2	8	217661	217668	25 %	0 %	25 %	50 %	92112331
5007	NC_007963	GAG	2	6	217675	217680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112331
5008	NC_007963	CAG	2	6	217761	217766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112331
5009	NC_007963	GCG	2	6	217815	217820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112331
5010	NC_007963	CAG	2	6	217854	217859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112331
5011	NC_007963	CGC	2	6	217866	217871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112331
5012	NC_007963	GTC	2	6	217891	217896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112331
5013	NC_007963	TGGA	2	8	217948	217955	25 %	25 %	50 %	0 %	92112331
5014	NC_007963	CACG	2	8	218006	218013	25 %	0 %	25 %	50 %	92112331
5015	NC_007963	TGACA	2	10	218019	218028	40 %	20 %	20 %	20 %	92112331
5016	NC_007963	CCT	2	6	218029	218034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92112331
5017	NC_007963	TGC	2	6	218048	218053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112331
5018	NC_007963	TGGC	2	8	218071	218078	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_007963	AGCG	2	8	218138	218145	25 %	0 %	50 %	25 %	92112332
5020	NC_007963	GCC	2	6	218168	218173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112332
5021	NC_007963	CAG	2	6	218210	218215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112332
5022	NC_007963	ACGTCA	2	12	218274	218285	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	92112332
5023	NC_007963	GCC	2	6	218347	218352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112332
5024	NC_007963	GC	3	6	218369	218374	0 %	0 %	50 %	50 %	92112332
5025	NC_007963	CGA	2	6	218377	218382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112332
5026	NC_007963	TGGG	2	8	218390	218397	0 %	25 %	75 %	0 %	92112332
5027	NC_007963	GCT	2	6	218422	218427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112332
5028	NC_007963	AGG	2	6	218448	218453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112332
5029	NC_007963	GA	3	6	218484	218489	50 %	0 %	50 %	0 %	92112332
5030	NC_007963	TGG	2	6	218532	218537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112332
5031	NC_007963	GTG	2	6	218675	218680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112332
5032	NC_007963	GC	3	6	218761	218766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_007963	CAC	2	6	218799	218804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112333
5034	NC_007963	GCCG	2	8	218822	218829	0 %	0 %	50 %	50 %	92112333
5035	NC_007963	CGC	2	6	218835	218840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112333
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5037	NC_007963	GTA	2	6	218898	218903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112333
5038	NC_007963	GGT	2	6	218937	218942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112333
5039	NC_007963	GGTA	2	8	218980	218987	25 %	25 %	50 %	0 %	92112333
5040	NC_007963	GC	3	6	219025	219030	0 %	0 %	50 %	50 %	92112333
5041	NC_007963	CTG	2	6	219116	219121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112333
5042	NC_007963	CGG	2	6	219186	219191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112334
5043	NC_007963	GTG	2	6	219209	219214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112334
5044	NC_007963	GTC	2	6	219406	219411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112334
5045	NC_007963	CGCT	2	8	219437	219444	0 %	25 %	25 %	50 %	92112334
5046	NC_007963	CAG	2	6	219490	219495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112334
5047	NC_007963	GCA	2	6	219552	219557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112334
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5049	NC_007963	CG	3	6	219653	219658	0 %	0 %	50 %	50 %	92112334
5050	NC_007963	GCG	3	9	219656	219664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112334
5051	NC_007963	CGTC	2	8	219692	219699	0 %	25 %	25 %	50 %	92112334
5052	NC_007963	GCC	2	6	219763	219768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112334
5053	NC_007963	TAG	2	6	219803	219808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112334
5054	NC_007963	CCG	2	6	219833	219838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112334
5055	NC_007963	ATG	2	6	219857	219862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112334
5056	NC_007963	TGAA	2	8	219881	219888	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_007963	CGG	2	6	219917	219922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_007963	TTCG	2	8	219928	219935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5059	NC_007963	GAT	2	6	219979	219984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_007963	GC	3	6	219986	219991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5061	NC_007963	CGA	2	6	220032	220037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_007963	CGT	2	6	220151	220156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112335
5063	NC_007963	TGC	2	6	220185	220190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112335
5064	NC_007963	TGG	2	6	220191	220196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112335
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5066	NC_007963	CGATG	2	10	220240	220249	20 %	20 %	40 %	20 %	92112335
5067	NC_007963	GAT	2	6	220261	220266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112335
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5069	NC_007963	CGC	2	6	220408	220413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112335
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5071	NC_007963	GAC	2	6	220459	220464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112335
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5074	NC_007963	GTC	2	6	220570	220575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_007963	GGAT	2	8	220583	220590	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5110	NC_007963	GCCC	2	8	222015	222022	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5111	NC_007963	CG	3	6	222029	222034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_007963	GGCG	2	8	222035	222042	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_007963	CGT	2	6	222047	222052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5124	NC_007963	CGG	2	6	222523	222528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112337
5125	NC_007963	GCCC	2	8	222586	222593	0 %	0 %	25 %	75 %	92112337
5126	NC_007963	TTC	2	6	222627	222632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112337
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5129	NC_007963	CCG	2	6	222874	222879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_007963	TAT	2	6	222900	222905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_007963	GC	3	6	222910	222915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5132	NC_007963	ACCG	2	8	222929	222936	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5133	NC_007963	CG	3	6	222942	222947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5134	NC_007963	GCC	2	6	222954	222959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112338
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5242	NC_007963	GCGA	2	8	227139	227146	25 %	0 %	50 %	25 %	92112340
5243	NC_007963	CTG	2	6	227183	227188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112340
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5245	NC_007963	GTT	2	6	227284	227289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92112340
5246	NC_007963	CTG	2	6	227354	227359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112340
5247	NC_007963	TGC	2	6	227442	227447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112340
5248	NC_007963	TGG	2	6	227534	227539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112340
5249	NC_007963	CAC	2	6	227582	227587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112340
5250	NC_007963	CAT	2	6	227596	227601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112340
5251	NC_007963	CGA	2	6	227608	227613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112340
5252	NC_007963	GCT	2	6	227635	227640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112340
5253	NC_007963	CCA	2	6	227668	227673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112340
5254	NC_007963	AGC	2	6	227786	227791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112340
5255	NC_007963	CG	3	6	227863	227868	0 %	0 %	50 %	50 %	92112340
5256	NC_007963	CT	3	6	227899	227904	0 %	50 %	0 %	50 %	92112340
5257	NC_007963	CAT	2	6	227951	227956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112340
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5260	NC_007963	TTC	2	6	228070	228075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112341
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5262	NC_007963	GCC	2	6	228117	228122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112341
5263	NC_007963	TACC	2	8	228242	228249	25 %	25 %	0 %	50 %	92112341
5264	NC_007963	CTA	2	6	228263	228268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112341
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5267	NC_007963	GGA	2	6	228359	228364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112341
5268	NC_007963	GA	3	6	228499	228504	50 %	0 %	50 %	0 %	92112341
5269	NC_007963	TCG	2	6	228547	228552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112341
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5272	NC_007963	CGA	2	6	228620	228625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112341
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5274	NC_007963	TGGA	2	8	228789	228796	25 %	25 %	50 %	0 %	92112341
5275	NC_007963	AGGATG	2	12	228802	228813	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	92112341
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5279	NC_007963	GAG	2	6	229035	229040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112341
5280	NC_007963	CGG	2	6	229081	229086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112341
5281	NC_007963	GAG	2	6	229095	229100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92112341
5282	NC_007963	GCT	2	6	229133	229138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112341
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5285	NC_007963	CGT	2	6	229249	229254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112341
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5287	NC_007963	GAA	2	6	229353	229358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112341
5288	NC_007963	GCGCT	2	10	229360	229369	0 %	20 %	40 %	40 %	92112341
5289	NC_007963	GTG	2	6	229379	229384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112341
5290	NC_007963	ACATGA	2	12	229390	229401	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	92112341
5291	NC_007963	CCG	2	6	229454	229459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112341
5292	NC_007963	GCA	2	6	229466	229471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112341
5293	NC_007963	CGA	3	9	229517	229525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112341
5294	NC_007963	CAC	2	6	229577	229582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112341
5295	NC_007963	GGAG	2	8	229610	229617	25 %	0 %	75 %	0 %	92112341
5296	NC_007963	TTC	2	6	229689	229694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112341
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5298	NC_007963	TGC	2	6	229775	229780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112341
5299	NC_007963	CCG	2	6	229796	229801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112341
5300	NC_007963	GTC	2	6	229817	229822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112341
5301	NC_007963	ATC	2	6	229929	229934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112341
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5303	NC_007963	GC	3	6	229980	229985	0 %	0 %	50 %	50 %	92112341
5304	NC_007963	GGCG	2	8	230000	230007	0 %	0 %	75 %	25 %	92112341
5305	NC_007963	CATGGT	2	12	230060	230071	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	92112341
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5308	NC_007963	TGA	2	6	230183	230188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112341
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5310	NC_007963	TTG	2	6	230257	230262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92112341
5311	NC_007963	TCG	2	6	230307	230312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112341
5312	NC_007963	CAG	2	6	230337	230342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112341
5313	NC_007963	GAT	2	6	230496	230501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112341
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5315	NC_007963	ACC	2	6	230535	230540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112341
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5317	NC_007963	CCA	2	6	230591	230596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112341
5318	NC_007963	AAG	2	6	230663	230668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5319	NC_007963	ATGA	2	8	230798	230805	50 %	25 %	25 %	0 %	92112342
5320	NC_007963	TTC	2	6	230828	230833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112342
5321	NC_007963	G	9	9	230844	230852	0 %	0 %	100 %	0 %	92112342
5322	NC_007963	T	6	6	230899	230904	0 %	100 %	0 %	0 %	92112342
5323	NC_007963	CTT	2	6	230905	230910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112342
5324	NC_007963	T	8	8	230928	230935	0 %	100 %	0 %	0 %	92112342
5325	NC_007963	T	8	8	230981	230988	0 %	100 %	0 %	0 %	92112342
5326	NC_007963	AAG	2	6	231107	231112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112342
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5328	NC_007963	GGT	2	6	231205	231210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112342
5329	NC_007963	AAG	2	6	231215	231220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92112342
5330	NC_007963	TTC	3	9	231245	231253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112342
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5332	NC_007963	ACG	2	6	231279	231284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112342
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5335	NC_007963	GCT	2	6	231424	231429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112342
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5338	NC_007963	TGC	2	6	231519	231524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112342
5339	NC_007963	CTG	3	9	231551	231559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112342
5340	NC_007963	GAT	2	6	231636	231641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5341	NC_007963	AG	3	6	231708	231713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5342	NC_007963	TTG	2	6	231752	231757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5343	NC_007963	TGAA	2	8	231835	231842	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5344	NC_007963	T	7	7	231893	231899	0 %	100 %	0 %	0 %	92112343
5345	NC_007963	GGCT	2	8	231903	231910	0 %	25 %	50 %	25 %	92112343
5346	NC_007963	CGA	2	6	231945	231950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112343
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5348	NC_007963	GCG	2	6	231987	231992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112343
5349	NC_007963	CGACG	2	10	232021	232030	20 %	0 %	40 %	40 %	92112343
5350	NC_007963	TGG	2	6	232044	232049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112343
5351	NC_007963	ATC	2	6	232086	232091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112343
5352	NC_007963	TTG	2	6	232106	232111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92112343
5353	NC_007963	GCGT	2	8	232119	232126	0 %	25 %	50 %	25 %	92112343
5354	NC_007963	GTG	2	6	232130	232135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112343
5355	NC_007963	CAC	2	6	232138	232143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92112343
5356	NC_007963	TGT	2	6	232197	232202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92112343
5357	NC_007963	CGG	2	6	232255	232260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112343
5358	NC_007963	GCG	2	6	232320	232325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112343
5359	NC_007963	TG	3	6	232345	232350	0 %	50 %	50 %	0 %	92112343
5360	NC_007963	TGG	2	6	232383	232388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92112343
5361	NC_007963	GCT	2	6	232478	232483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112343
5362	NC_007963	CAA	2	6	232495	232500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92112343
5363	NC_007963	TCC	2	6	232514	232519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92112343
5364	NC_007963	GCC	2	6	232544	232549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112343
5365	NC_007963	TGT	2	6	232641	232646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92112343
5366	NC_007963	ATC	2	6	232665	232670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92112343
5367	NC_007963	GC	3	6	232688	232693	0 %	0 %	50 %	50 %	92112343
5368	NC_007963	GC	3	6	232710	232715	0 %	0 %	50 %	50 %	92112343
5369	NC_007963	GTT	2	6	232728	232733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	92112343
5370	NC_007963	GGTA	2	8	232783	232790	25 %	25 %	50 %	0 %	92112343
5371	NC_007963	CGA	2	6	232792	232797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112343
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5477	NC_007963	CGCGT	2	10	237522	237531	0 %	20 %	40 %	40 %	92112348
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5487	NC_007963	GAC	2	6	238004	238009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112349
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5489	NC_007963	TCGA	2	8	238056	238063	25 %	25 %	25 %	25 %	92112349
5490	NC_007963	CGA	2	6	238097	238102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112349
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5492	NC_007963	CTG	2	6	238194	238199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92112349
5493	NC_007963	GCG	2	6	238222	238227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92112349
5494	NC_007963	TCT	2	6	238250	238255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92112349
5495	NC_007963	GC	3	6	238268	238273	0 %	0 %	50 %	50 %	92112349
5496	NC_007963	GAT	2	6	238304	238309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112349
5497	NC_007963	TGA	2	6	238342	238347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92112349
5498	NC_007963	GCA	2	6	238355	238360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92112349
5499	NC_007963	CGC	2	6	238377	238382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112349
5500	NC_007963	CGC	2	6	238413	238418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92112349

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