MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome

Total Repeats: 3090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007514	CA	3	6	286	291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007514	AG	3	6	453	458	50 %	0 %	50 %	0 %	78187985
3	NC_007514	CT	3	6	1207	1212	0 %	50 %	0 %	50 %	78187985
4	NC_007514	CT	3	6	1671	1676	0 %	50 %	0 %	50 %	78187985
5	NC_007514	TC	3	6	1812	1817	0 %	50 %	0 %	50 %	78187985
6	NC_007514	CA	3	6	1916	1921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007514	AC	3	6	1960	1965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007514	TG	4	8	2765	2772	0 %	50 %	50 %	0 %	78187986
9	NC_007514	AG	3	6	4756	4761	50 %	0 %	50 %	0 %	78187988
10	NC_007514	AG	3	6	6527	6532	50 %	0 %	50 %	0 %	78187989
11	NC_007514	AG	3	6	6837	6842	50 %	0 %	50 %	0 %	78187989
12	NC_007514	AT	3	6	7131	7136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007514	CA	3	6	7147	7152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007514	CT	3	6	7611	7616	0 %	50 %	0 %	50 %	78187990
15	NC_007514	AG	3	6	7849	7854	50 %	0 %	50 %	0 %	78187990
16	NC_007514	CT	3	6	8430	8435	0 %	50 %	0 %	50 %	78187991
17	NC_007514	AC	3	6	8820	8825	50 %	0 %	0 %	50 %	78187991
18	NC_007514	GC	3	6	9994	9999	0 %	0 %	50 %	50 %	78187991
19	NC_007514	CT	4	8	10770	10777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007514	TG	3	6	11620	11625	0 %	50 %	50 %	0 %	78187992
21	NC_007514	AG	3	6	12106	12111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007514	CT	3	6	13341	13346	0 %	50 %	0 %	50 %	78187993
23	NC_007514	CG	3	6	14503	14508	0 %	0 %	50 %	50 %	78187994
24	NC_007514	CT	3	6	14669	14674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007514	TA	3	6	14695	14700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007514	AG	3	6	16000	16005	50 %	0 %	50 %	0 %	78187997
27	NC_007514	CA	3	6	18315	18320	50 %	0 %	0 %	50 %	78188002
28	NC_007514	CA	3	6	19497	19502	50 %	0 %	0 %	50 %	78188003
29	NC_007514	CA	3	6	21851	21856	50 %	0 %	0 %	50 %	78188005
30	NC_007514	CT	3	6	23054	23059	0 %	50 %	0 %	50 %	78188006
31	NC_007514	GA	3	6	24533	24538	50 %	0 %	50 %	0 %	78188007
32	NC_007514	TC	4	8	24690	24697	0 %	50 %	0 %	50 %	78188007
33	NC_007514	TA	3	6	26008	26013	50 %	50 %	0 %	0 %	78188009
34	NC_007514	AT	3	6	26392	26397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007514	GT	3	6	27229	27234	0 %	50 %	50 %	0 %	78188010
36	NC_007514	TG	3	6	28067	28072	0 %	50 %	50 %	0 %	78188010
37	NC_007514	CT	3	6	31323	31328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007514	CG	3	6	32131	32136	0 %	0 %	50 %	50 %	78188013
39	NC_007514	AG	3	6	33360	33365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007514	TC	3	6	35374	35379	0 %	50 %	0 %	50 %	78188017
41	NC_007514	TA	3	6	35711	35716	50 %	50 %	0 %	0 %	78188017
42	NC_007514	CA	3	6	36989	36994	50 %	0 %	0 %	50 %	78188018
43	NC_007514	CG	3	6	38331	38336	0 %	0 %	50 %	50 %	78188020
44	NC_007514	CT	3	6	40094	40099	0 %	50 %	0 %	50 %	78188021
45	NC_007514	TC	3	6	40102	40107	0 %	50 %	0 %	50 %	78188021
46	NC_007514	TC	3	6	40980	40985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007514	AG	3	6	41424	41429	50 %	0 %	50 %	0 %	78188022
48	NC_007514	AG	3	6	41998	42003	50 %	0 %	50 %	0 %	78188022
49	NC_007514	TC	3	6	42454	42459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007514	GA	3	6	43868	43873	50 %	0 %	50 %	0 %	78188023
51	NC_007514	CT	3	6	45661	45666	0 %	50 %	0 %	50 %	78188025
52	NC_007514	GC	3	6	46065	46070	0 %	0 %	50 %	50 %	78188025
53	NC_007514	CG	3	6	46483	46488	0 %	0 %	50 %	50 %	78188025
54	NC_007514	GA	3	6	47210	47215	50 %	0 %	50 %	0 %	78188026
55	NC_007514	AT	3	6	47542	47547	50 %	50 %	0 %	0 %	78188026
56	NC_007514	AT	3	6	48769	48774	50 %	50 %	0 %	0 %	78188026
57	NC_007514	AG	3	6	49731	49736	50 %	0 %	50 %	0 %	78188027
58	NC_007514	TC	3	6	49864	49869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007514	CT	3	6	50358	50363	0 %	50 %	0 %	50 %	78188028
60	NC_007514	TG	4	8	51128	51135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007514	TC	3	6	51143	51148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007514	TA	3	6	51185	51190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007514	AG	3	6	52264	52269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007514	TG	3	6	52857	52862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007514	CT	3	6	53946	53951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007514	CG	3	6	56471	56476	0 %	0 %	50 %	50 %	78188034
67	NC_007514	CG	3	6	57647	57652	0 %	0 %	50 %	50 %	78188034
68	NC_007514	AG	3	6	58058	58063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007514	TC	3	6	58909	58914	0 %	50 %	0 %	50 %	78188035
70	NC_007514	CT	3	6	59290	59295	0 %	50 %	0 %	50 %	78188035
71	NC_007514	CG	3	6	59448	59453	0 %	0 %	50 %	50 %	78188035
72	NC_007514	CT	3	6	59607	59612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007514	TG	3	6	59953	59958	0 %	50 %	50 %	0 %	78188036
74	NC_007514	CA	3	6	60917	60922	50 %	0 %	0 %	50 %	78188037
75	NC_007514	CG	3	6	61958	61963	0 %	0 %	50 %	50 %	78188037
76	NC_007514	GA	3	6	62060	62065	50 %	0 %	50 %	0 %	78188037
77	NC_007514	GT	3	6	62142	62147	0 %	50 %	50 %	0 %	78188037
78	NC_007514	GC	3	6	62859	62864	0 %	0 %	50 %	50 %	78188038
79	NC_007514	CT	3	6	62997	63002	0 %	50 %	0 %	50 %	78188038
80	NC_007514	AG	3	6	63356	63361	50 %	0 %	50 %	0 %	78188038
81	NC_007514	GC	3	6	63824	63829	0 %	0 %	50 %	50 %	78188039
82	NC_007514	GC	3	6	63974	63979	0 %	0 %	50 %	50 %	78188039
83	NC_007514	GT	3	6	64160	64165	0 %	50 %	50 %	0 %	78188039
84	NC_007514	GT	3	6	64422	64427	0 %	50 %	50 %	0 %	78188039
85	NC_007514	AT	3	6	65150	65155	50 %	50 %	0 %	0 %	78188040
86	NC_007514	CG	3	6	65849	65854	0 %	0 %	50 %	50 %	78188040
87	NC_007514	GT	4	8	67189	67196	0 %	50 %	50 %	0 %	78188042
88	NC_007514	CG	3	6	67882	67887	0 %	0 %	50 %	50 %	78188042
89	NC_007514	GC	3	6	68878	68883	0 %	0 %	50 %	50 %	78188043
90	NC_007514	AG	3	6	69468	69473	50 %	0 %	50 %	0 %	78188043
91	NC_007514	GA	3	6	69821	69826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007514	AG	3	6	70612	70617	50 %	0 %	50 %	0 %	78188044
93	NC_007514	TG	3	6	73420	73425	0 %	50 %	50 %	0 %	78188048
94	NC_007514	CT	3	6	73833	73838	0 %	50 %	0 %	50 %	78188048
95	NC_007514	CT	3	6	74584	74589	0 %	50 %	0 %	50 %	78188050
96	NC_007514	CT	3	6	75415	75420	0 %	50 %	0 %	50 %	78188051
97	NC_007514	CA	3	6	75655	75660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007514	GT	3	6	76908	76913	0 %	50 %	50 %	0 %	78188053
99	NC_007514	CT	3	6	78035	78040	0 %	50 %	0 %	50 %	78188054
100	NC_007514	TC	3	6	79020	79025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007514	GC	3	6	79858	79863	0 %	0 %	50 %	50 %	78188056
102	NC_007514	TA	5	10	80917	80926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007514	AG	3	6	81072	81077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007514	CT	3	6	81168	81173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007514	GC	3	6	81300	81305	0 %	0 %	50 %	50 %	78188057
106	NC_007514	CG	3	6	81744	81749	0 %	0 %	50 %	50 %	78188057
107	NC_007514	GA	3	6	82321	82326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007514	AG	3	6	85552	85557	50 %	0 %	50 %	0 %	78188059
109	NC_007514	GC	3	6	86669	86674	0 %	0 %	50 %	50 %	78188060
110	NC_007514	GC	3	6	87048	87053	0 %	0 %	50 %	50 %	78188060
111	NC_007514	CT	3	6	88301	88306	0 %	50 %	0 %	50 %	78188061
112	NC_007514	TC	3	6	88386	88391	0 %	50 %	0 %	50 %	78188061
113	NC_007514	TG	4	8	89035	89042	0 %	50 %	50 %	0 %	78188062
114	NC_007514	CT	3	6	89728	89733	0 %	50 %	0 %	50 %	78188063
115	NC_007514	AG	3	6	91817	91822	50 %	0 %	50 %	0 %	78188065
116	NC_007514	CT	3	6	92015	92020	0 %	50 %	0 %	50 %	78188065
117	NC_007514	AT	3	6	92550	92555	50 %	50 %	0 %	0 %	78188066
118	NC_007514	CT	4	8	92800	92807	0 %	50 %	0 %	50 %	78188066
119	NC_007514	AG	3	6	94364	94369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007514	CT	3	6	94776	94781	0 %	50 %	0 %	50 %	78188069
121	NC_007514	AT	3	6	95160	95165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007514	AG	3	6	95764	95769	50 %	0 %	50 %	0 %	78188070
123	NC_007514	AT	3	6	96478	96483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007514	AG	3	6	96780	96785	50 %	0 %	50 %	0 %	78188071
125	NC_007514	GC	3	6	97163	97168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007514	GC	3	6	97175	97180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007514	CA	3	6	97593	97598	50 %	0 %	0 %	50 %	78188072
128	NC_007514	CT	3	6	101070	101075	0 %	50 %	0 %	50 %	78188073
129	NC_007514	AG	4	8	101855	101862	50 %	0 %	50 %	0 %	78188073
130	NC_007514	CG	3	6	101968	101973	0 %	0 %	50 %	50 %	78188073
131	NC_007514	GC	3	6	102027	102032	0 %	0 %	50 %	50 %	78188073
132	NC_007514	GA	3	6	102097	102102	50 %	0 %	50 %	0 %	78188073
133	NC_007514	GC	3	6	102302	102307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007514	AC	3	6	103201	103206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007514	CA	3	6	103798	103803	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007514	AC	3	6	103965	103970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_007514	GA	3	6	104435	104440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007514	TG	3	6	104969	104974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007514	CT	3	6	105007	105012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007514	GT	3	6	105176	105181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007514	CT	3	6	106168	106173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007514	CT	3	6	106356	106361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007514	GC	3	6	106569	106574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007514	CG	3	6	108505	108510	0 %	0 %	50 %	50 %	78188075
145	NC_007514	GA	3	6	108587	108592	50 %	0 %	50 %	0 %	78188075
146	NC_007514	AG	3	6	110602	110607	50 %	0 %	50 %	0 %	78188078
147	NC_007514	GT	3	6	110884	110889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007514	TC	3	6	113757	113762	0 %	50 %	0 %	50 %	78188082
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