MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome

Total Repeats: 53982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_007514	CAC	2	6	190511	190516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188152
4003	NC_007514	CCA	2	6	190522	190527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188152
4004	NC_007514	CCT	2	6	190545	190550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78188152
4005	NC_007514	AAC	2	6	190571	190576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188152
4006	NC_007514	TCC	2	6	190738	190743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78188153
4007	NC_007514	TAG	2	6	190859	190864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188153
4008	NC_007514	TGA	2	6	190921	190926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188153
4009	NC_007514	TTG	2	6	190971	190976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188153
4010	NC_007514	CATA	2	8	190985	190992	50 %	25 %	0 %	25 %	78188153
4011	NC_007514	GCA	2	6	191104	191109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188153
4012	NC_007514	T	6	6	191131	191136	0 %	100 %	0 %	0 %	78188153
4013	NC_007514	GCAA	2	8	191137	191144	50 %	0 %	25 %	25 %	78188153
4014	NC_007514	CCAA	2	8	191145	191152	50 %	0 %	0 %	50 %	78188153
4015	NC_007514	CAT	2	6	191154	191159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188153
4016	NC_007514	GCA	2	6	191264	191269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188153
4017	NC_007514	GTT	2	6	191304	191309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_007514	TCG	2	6	191355	191360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_007514	GAG	2	6	191377	191382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_007514	GTA	2	6	191411	191416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_007514	CAC	2	6	191432	191437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_007514	AGT	2	6	191445	191450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_007514	T	6	6	191467	191472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_007514	T	7	7	191486	191492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_007514	TATC	2	8	191513	191520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4026	NC_007514	TC	3	6	191567	191572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_007514	GTG	2	6	191609	191614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188154
4028	NC_007514	TGG	2	6	191688	191693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188154
4029	NC_007514	GCA	2	6	191769	191774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188154
4030	NC_007514	GGT	2	6	191793	191798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188154
4031	NC_007514	TTG	2	6	191828	191833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188154
4032	NC_007514	TTG	2	6	191861	191866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188154
4033	NC_007514	AGC	2	6	191896	191901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188154
4034	NC_007514	CAG	2	6	191995	192000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188154
4035	NC_007514	TTA	2	6	192023	192028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188154
4036	NC_007514	AAGC	2	8	192029	192036	50 %	0 %	25 %	25 %	78188154
4037	NC_007514	TTG	2	6	192062	192067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188154
4038	NC_007514	GCG	2	6	192091	192096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188154
4039	NC_007514	GGA	2	6	192111	192116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78188154
4040	NC_007514	TGC	2	6	192132	192137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188154
4041	NC_007514	GGT	2	6	192144	192149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188154
4042	NC_007514	T	6	6	192159	192164	0 %	100 %	0 %	0 %	78188154
4043	NC_007514	GT	3	6	192182	192187	0 %	50 %	50 %	0 %	78188154
4044	NC_007514	T	7	7	192218	192224	0 %	100 %	0 %	0 %	78188154
4045	NC_007514	ATT	2	6	192346	192351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188154
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4048	NC_007514	GGT	2	6	192441	192446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188154
4049	NC_007514	GC	3	6	192457	192462	0 %	0 %	50 %	50 %	78188154
4050	NC_007514	GTG	2	6	192484	192489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188154
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4052	NC_007514	T	6	6	192511	192516	0 %	100 %	0 %	0 %	78188154
4053	NC_007514	TGCGT	2	10	192519	192528	0 %	40 %	40 %	20 %	78188154
4054	NC_007514	TGGA	2	8	192536	192543	25 %	25 %	50 %	0 %	78188154
4055	NC_007514	AGT	3	9	192591	192599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188154
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4058	NC_007514	T	6	6	192743	192748	0 %	100 %	0 %	0 %	78188154
4059	NC_007514	GCA	2	6	192807	192812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188154
4060	NC_007514	ACG	2	6	192881	192886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188155
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4062	NC_007514	AGCA	2	8	192907	192914	50 %	0 %	25 %	25 %	78188155
4063	NC_007514	TGC	2	6	192936	192941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188155
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4065	NC_007514	ATC	2	6	192970	192975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188155
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4099	NC_007514	TCCC	2	8	194918	194925	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4100	NC_007514	A	7	7	194991	194997	100 %	0 %	0 %	0 %	78188157
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4104	NC_007514	A	6	6	195112	195117	100 %	0 %	0 %	0 %	78188157
4105	NC_007514	CG	3	6	195128	195133	0 %	0 %	50 %	50 %	78188157
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4112	NC_007514	AG	3	6	195591	195596	50 %	0 %	50 %	0 %	78188157
4113	NC_007514	TCGC	2	8	195690	195697	0 %	25 %	25 %	50 %	78188157
4114	NC_007514	A	6	6	195752	195757	100 %	0 %	0 %	0 %	78188158
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4120	NC_007514	GATCGG	2	12	196135	196146	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	78188158
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4123	NC_007514	CCAT	2	8	196239	196246	25 %	25 %	0 %	50 %	78188158
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4125	NC_007514	TTG	2	6	196345	196350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188158
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4235	NC_007514	A	6	6	201649	201654	100 %	0 %	0 %	0 %	78188162
4236	NC_007514	CAGCT	2	10	201691	201700	20 %	20 %	20 %	40 %	78188162
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4241	NC_007514	C	7	7	201927	201933	0 %	0 %	0 %	100 %	78188162
4242	NC_007514	AGC	2	6	201979	201984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188162
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4245	NC_007514	GCG	2	6	202074	202079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188162
4246	NC_007514	GCA	2	6	202084	202089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188162
4247	NC_007514	GCA	2	6	202104	202109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188162
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4249	NC_007514	GCG	2	6	202220	202225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188162
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