MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome

Total Repeats: 53982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_007514	ACGGG	2	10	119290	119299	20 %	0 %	60 %	20 %	78188087
2502	NC_007514	TCAAAA	2	12	119566	119577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	78188087
2503	NC_007514	ATC	2	6	119638	119643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188087
2504	NC_007514	TAA	2	6	119678	119683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188087
2505	NC_007514	GTT	2	6	119697	119702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188087
2506	NC_007514	TTTG	2	8	119733	119740	0 %	75 %	25 %	0 %	78188087
2507	NC_007514	T	7	7	119799	119805	0 %	100 %	0 %	0 %	78188087
2508	NC_007514	TGC	2	6	119858	119863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188088
2509	NC_007514	TTG	2	6	119871	119876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188088
2510	NC_007514	GAT	2	6	119896	119901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188088
2511	NC_007514	CAA	2	6	119922	119927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188088
2512	NC_007514	CGT	2	6	119939	119944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188088
2513	NC_007514	GCC	2	6	119952	119957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78188088
2514	NC_007514	GGCG	2	8	119958	119965	0 %	0 %	75 %	25 %	78188088
2515	NC_007514	GCA	2	6	119971	119976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188088
2516	NC_007514	GGC	2	6	120004	120009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188088
2517	NC_007514	TGC	2	6	120021	120026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188088
2518	NC_007514	CTTG	2	8	120092	120099	0 %	50 %	25 %	25 %	78188088
2519	NC_007514	TGG	2	6	120103	120108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188088
2520	NC_007514	T	6	6	120131	120136	0 %	100 %	0 %	0 %	78188088
2521	NC_007514	T	7	7	120152	120158	0 %	100 %	0 %	0 %	78188088
2522	NC_007514	GCA	2	6	120166	120171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188088
2523	NC_007514	CGGTT	2	10	120210	120219	0 %	40 %	40 %	20 %	78188088
2524	NC_007514	TG	3	6	120351	120356	0 %	50 %	50 %	0 %	78188088
2525	NC_007514	CCT	2	6	120437	120442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78188088
2526	NC_007514	A	8	8	120452	120459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_007514	CAG	2	6	120468	120473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_007514	GA	3	6	120474	120479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_007514	TTG	2	6	120534	120539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188089
2530	NC_007514	GGT	2	6	120572	120577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188089
2531	NC_007514	GCC	2	6	120603	120608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78188089
2532	NC_007514	TCG	2	6	120631	120636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188089
2533	NC_007514	TAG	2	6	120637	120642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188089
2534	NC_007514	TAAC	2	8	120920	120927	50 %	25 %	0 %	25 %	78188089
2535	NC_007514	GTC	2	6	120951	120956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188089
2536	NC_007514	T	7	7	120978	120984	0 %	100 %	0 %	0 %	78188089
2537	NC_007514	TGC	2	6	121004	121009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188089
2538	NC_007514	CAA	2	6	121052	121057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188089
2539	NC_007514	CAT	2	6	121074	121079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188089
2540	NC_007514	CCA	2	6	121166	121171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188089
2541	NC_007514	AGCA	2	8	121296	121303	50 %	0 %	25 %	25 %	78188089
2542	NC_007514	GTT	2	6	121304	121309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188089
2543	NC_007514	TTGC	2	8	121319	121326	0 %	50 %	25 %	25 %	78188089
2544	NC_007514	ATT	2	6	121350	121355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188089
2545	NC_007514	AGC	2	6	121452	121457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188089
2546	NC_007514	AGC	2	6	121478	121483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188089
2547	NC_007514	CAC	2	6	121488	121493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188089
2548	NC_007514	GTG	2	6	121504	121509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188089
2549	NC_007514	AAT	2	6	121578	121583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188089
2550	NC_007514	GCA	2	6	121598	121603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188089
2551	NC_007514	T	6	6	121647	121652	0 %	100 %	0 %	0 %	78188089
2552	NC_007514	TCA	2	6	121701	121706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188090
2553	NC_007514	GGT	2	6	121747	121752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188090
2554	NC_007514	TTC	2	6	121835	121840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78188090
2555	NC_007514	GGT	2	6	121921	121926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188090
2556	NC_007514	GTG	2	6	121934	121939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188090
2557	NC_007514	GCC	2	6	121964	121969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78188090
2558	NC_007514	CAAG	2	8	121971	121978	50 %	0 %	25 %	25 %	78188090
2559	NC_007514	TGG	2	6	122026	122031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188090
2560	NC_007514	CAA	2	6	122044	122049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188090
2561	NC_007514	GCG	2	6	122082	122087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188090
2562	NC_007514	AGCA	2	8	122132	122139	50 %	0 %	25 %	25 %	78188090
2563	NC_007514	TGG	2	6	122149	122154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188090
2564	NC_007514	GCA	2	6	122164	122169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188090
2565	NC_007514	T	6	6	122278	122283	0 %	100 %	0 %	0 %	78188090
2566	NC_007514	AGC	2	6	122327	122332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188090
2567	NC_007514	CAG	2	6	122368	122373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188090
2568	NC_007514	AAT	2	6	122378	122383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188090
2569	NC_007514	GGC	2	6	122422	122427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188090
2570	NC_007514	GCA	2	6	122475	122480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188090
2571	NC_007514	AG	3	6	122667	122672	50 %	0 %	50 %	0 %	78188090
2572	NC_007514	ACT	2	6	122682	122687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188090
2573	NC_007514	ATA	2	6	122775	122780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188090
2574	NC_007514	TGT	2	6	122866	122871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188091
2575	NC_007514	TTTTC	2	10	122893	122902	0 %	80 %	0 %	20 %	78188091
2576	NC_007514	GCCA	2	8	122912	122919	25 %	0 %	25 %	50 %	78188091
2577	NC_007514	CCA	2	6	122934	122939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188091
2578	NC_007514	GTT	2	6	122979	122984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188091
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2580	NC_007514	AAG	2	6	123024	123029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78188091
2581	NC_007514	ACA	2	6	123036	123041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188091
2582	NC_007514	TGGATT	2	12	123074	123085	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	78188091
2583	NC_007514	GCT	2	6	123174	123179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_007514	AGA	2	6	123205	123210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_007514	TTAT	2	8	123226	123233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_007514	GCA	2	6	123329	123334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188092
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2590	NC_007514	GCAATG	2	12	123461	123472	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78188092
2591	NC_007514	T	6	6	123507	123512	0 %	100 %	0 %	0 %	78188092
2592	NC_007514	CTA	2	6	123513	123518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188092
2593	NC_007514	GCT	2	6	123533	123538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188092
2594	NC_007514	GGC	2	6	123547	123552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188092
2595	NC_007514	CT	3	6	123578	123583	0 %	50 %	0 %	50 %	78188092
2596	NC_007514	TGC	3	9	123590	123598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188092
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2599	NC_007514	CAA	2	6	123825	123830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188092
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2603	NC_007514	TAA	2	6	124134	124139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188092
2604	NC_007514	CAC	2	6	124171	124176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188092
2605	NC_007514	GCC	2	6	124177	124182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78188092
2606	NC_007514	CAC	2	6	124225	124230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188092
2607	NC_007514	TAT	2	6	124285	124290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188092
2608	NC_007514	T	7	7	124298	124304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_007514	A	6	6	124310	124315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_007514	TAA	2	6	124329	124334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188093
2611	NC_007514	AGTA	2	8	124365	124372	50 %	25 %	25 %	0 %	78188093
2612	NC_007514	TAT	2	6	124410	124415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188093
2613	NC_007514	CTTT	2	8	124449	124456	0 %	75 %	0 %	25 %	78188093
2614	NC_007514	GCCT	2	8	124479	124486	0 %	25 %	25 %	50 %	78188093
2615	NC_007514	T	6	6	124510	124515	0 %	100 %	0 %	0 %	78188093
2616	NC_007514	T	7	7	124548	124554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_007514	AGG	2	6	124571	124576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_007514	TTG	2	6	124621	124626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188094
2619	NC_007514	T	6	6	124637	124642	0 %	100 %	0 %	0 %	78188094
2620	NC_007514	TTG	2	6	124675	124680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188094
2621	NC_007514	GCGTC	2	10	124697	124706	0 %	20 %	40 %	40 %	78188094
2622	NC_007514	TGC	2	6	124837	124842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188094
2623	NC_007514	T	7	7	124889	124895	0 %	100 %	0 %	0 %	78188094
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