MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome

Total Repeats: 53982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_007514	T	6	6	72453	72458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_007514	A	6	6	72462	72467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_007514	TTTG	2	8	72493	72500	0 %	75 %	25 %	0 %	78188047
1505	NC_007514	G	6	6	72540	72545	0 %	0 %	100 %	0 %	78188047
1506	NC_007514	ATT	2	6	72579	72584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188047
1507	NC_007514	ATG	2	6	72608	72613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188047
1508	NC_007514	TAA	2	6	72679	72684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188047
1509	NC_007514	GGC	2	6	72695	72700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188047
1510	NC_007514	TTA	2	6	72713	72718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188047
1511	NC_007514	TGG	2	6	72732	72737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188047
1512	NC_007514	TTG	2	6	72747	72752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188047
1513	NC_007514	TGT	3	9	72811	72819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188047
1514	NC_007514	A	8	8	72854	72861	100 %	0 %	0 %	0 %	78188047
1515	NC_007514	ATT	3	9	72931	72939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188048
1516	NC_007514	GCT	2	6	73013	73018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188048
1517	NC_007514	TTA	2	6	73092	73097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188048
1518	NC_007514	CAC	2	6	73100	73105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188048
1519	NC_007514	TTG	2	6	73164	73169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188048
1520	NC_007514	TGT	2	6	73201	73206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188048
1521	NC_007514	GTT	2	6	73217	73222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188048
1522	NC_007514	TGC	2	6	73246	73251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188048
1523	NC_007514	TTG	2	6	73323	73328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188048
1524	NC_007514	CTG	2	6	73394	73399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188048
1525	NC_007514	TCT	2	6	73407	73412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78188048
1526	NC_007514	TG	3	6	73420	73425	0 %	50 %	50 %	0 %	78188048
1527	NC_007514	CTTG	2	8	73429	73436	0 %	50 %	25 %	25 %	78188048
1528	NC_007514	GCTACA	2	12	73454	73465	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78188048
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1530	NC_007514	ATT	2	6	73595	73600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188048
1531	NC_007514	GTTT	2	8	73656	73663	0 %	75 %	25 %	0 %	78188048
1532	NC_007514	CTTG	2	8	73777	73784	0 %	50 %	25 %	25 %	78188048
1533	NC_007514	CT	3	6	73833	73838	0 %	50 %	0 %	50 %	78188048
1534	NC_007514	TCA	2	6	73897	73902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188048
1535	NC_007514	T	6	6	73954	73959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_007514	ACA	2	6	73990	73995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_007514	GCT	2	6	74114	74119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188049
1538	NC_007514	ACC	2	6	74162	74167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188049
1539	NC_007514	ATT	2	6	74171	74176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188049
1540	NC_007514	TGCT	2	8	74229	74236	0 %	50 %	25 %	25 %	78188049
1541	NC_007514	TAAG	2	8	74239	74246	50 %	25 %	25 %	0 %	78188049
1542	NC_007514	CTT	2	6	74371	74376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78188050
1543	NC_007514	TGC	2	6	74441	74446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188050
1544	NC_007514	A	7	7	74455	74461	100 %	0 %	0 %	0 %	78188050
1545	NC_007514	CAT	2	6	74475	74480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188050
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1548	NC_007514	GCT	2	6	74580	74585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188050
1549	NC_007514	CT	3	6	74584	74589	0 %	50 %	0 %	50 %	78188050
1550	NC_007514	A	6	6	74609	74614	100 %	0 %	0 %	0 %	78188050
1551	NC_007514	AGA	2	6	74709	74714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78188050
1552	NC_007514	CGT	2	6	74731	74736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188050
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1554	NC_007514	TTA	2	6	74795	74800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188050
1555	NC_007514	GTT	2	6	74833	74838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188050
1556	NC_007514	AGT	2	6	74899	74904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188051
1557	NC_007514	AGA	2	6	74947	74952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78188051
1558	NC_007514	TGA	2	6	74977	74982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188051
1559	NC_007514	TGC	2	6	75003	75008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188051
1560	NC_007514	A	7	7	75062	75068	100 %	0 %	0 %	0 %	78188051
1561	NC_007514	TTG	2	6	75075	75080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188051
1562	NC_007514	GTGA	2	8	75101	75108	25 %	25 %	50 %	0 %	78188051
1563	NC_007514	T	6	6	75119	75124	0 %	100 %	0 %	0 %	78188051
1564	NC_007514	TTG	2	6	75132	75137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188051
1565	NC_007514	GAAA	2	8	75138	75145	75 %	0 %	25 %	0 %	78188051
1566	NC_007514	TTG	2	6	75171	75176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188051
1567	NC_007514	CTTG	2	8	75190	75197	0 %	50 %	25 %	25 %	78188051
1568	NC_007514	TAT	2	6	75211	75216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188051
1569	NC_007514	TGA	2	6	75250	75255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188051
1570	NC_007514	GCAA	2	8	75256	75263	50 %	0 %	25 %	25 %	78188051
1571	NC_007514	AGTT	2	8	75267	75274	25 %	50 %	25 %	0 %	78188051
1572	NC_007514	CAA	2	6	75276	75281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188051
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1576	NC_007514	TGC	2	6	75424	75429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188051
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1578	NC_007514	T	8	8	75494	75501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_007514	TAGCAT	2	12	75536	75547	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1580	NC_007514	CA	3	6	75655	75660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_007514	T	6	6	75662	75667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_007514	CTT	2	6	75687	75692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_007514	CAT	2	6	75715	75720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_007514	ATG	2	6	75750	75755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188052
1585	NC_007514	CAA	2	6	75886	75891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188052
1586	NC_007514	TCA	2	6	75937	75942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188052
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1591	NC_007514	A	6	6	76159	76164	100 %	0 %	0 %	0 %	78188052
1592	NC_007514	CGG	2	6	76264	76269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188052
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1595	NC_007514	A	8	8	76326	76333	100 %	0 %	0 %	0 %	78188052
1596	NC_007514	ACA	2	6	76398	76403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188052
1597	NC_007514	TTA	2	6	76523	76528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188052
1598	NC_007514	TTG	2	6	76557	76562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188052
1599	NC_007514	GGC	2	6	76710	76715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188053
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1603	NC_007514	AGCA	2	8	76927	76934	50 %	0 %	25 %	25 %	78188053
1604	NC_007514	TTACC	2	10	76964	76973	20 %	40 %	0 %	40 %	78188053
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1609	NC_007514	GCCT	2	8	77234	77241	0 %	25 %	25 %	50 %	78188053
1610	NC_007514	TTC	2	6	77245	77250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78188053
1611	NC_007514	AGG	2	6	77263	77268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78188053
1612	NC_007514	TTTG	2	8	77291	77298	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_007514	CTTT	2	8	77339	77346	0 %	75 %	0 %	25 %	78188054
1614	NC_007514	AGC	2	6	77419	77424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188054
1615	NC_007514	T	6	6	77522	77527	0 %	100 %	0 %	0 %	78188054
1616	NC_007514	CAAG	2	8	77534	77541	50 %	0 %	25 %	25 %	78188054
1617	NC_007514	CTT	2	6	77663	77668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78188054
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1619	NC_007514	TGC	2	6	77786	77791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188054
1620	NC_007514	TAA	2	6	77795	77800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188054
1621	NC_007514	A	6	6	77799	77804	100 %	0 %	0 %	0 %	78188054
1622	NC_007514	ATC	2	6	77841	77846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188054
1623	NC_007514	TGT	2	6	77940	77945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188054
1624	NC_007514	TCA	2	6	77989	77994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188054
1625	NC_007514	CT	3	6	78035	78040	0 %	50 %	0 %	50 %	78188054
1626	NC_007514	GTC	2	6	78165	78170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188054
1627	NC_007514	AGA	2	6	78180	78185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78188054
1628	NC_007514	TAT	3	9	78224	78232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188054
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