MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome

Total Repeats: 53982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_007514	GTTT	2	8	49139	49146	0 %	75 %	25 %	0 %	78188027
1003	NC_007514	T	8	8	49184	49191	0 %	100 %	0 %	0 %	78188027
1004	NC_007514	T	6	6	49217	49222	0 %	100 %	0 %	0 %	78188027
1005	NC_007514	CAT	2	6	49229	49234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188027
1006	NC_007514	ATG	2	6	49261	49266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188027
1007	NC_007514	TAAA	2	8	49267	49274	75 %	25 %	0 %	0 %	78188027
1008	NC_007514	CCA	2	6	49288	49293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188027
1009	NC_007514	TGC	2	6	49316	49321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188027
1010	NC_007514	CAAG	2	8	49361	49368	50 %	0 %	25 %	25 %	78188027
1011	NC_007514	AAG	2	6	49408	49413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78188027
1012	NC_007514	CAT	2	6	49440	49445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188027
1013	NC_007514	AAG	2	6	49455	49460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78188027
1014	NC_007514	TGG	2	6	49490	49495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188027
1015	NC_007514	TAA	2	6	49526	49531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188027
1016	NC_007514	AGT	2	6	49556	49561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188027
1017	NC_007514	AAT	2	6	49586	49591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188027
1018	NC_007514	A	6	6	49632	49637	100 %	0 %	0 %	0 %	78188027
1019	NC_007514	AG	3	6	49731	49736	50 %	0 %	50 %	0 %	78188027
1020	NC_007514	CAC	2	6	49742	49747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188027
1021	NC_007514	AAT	2	6	49791	49796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188027
1022	NC_007514	TC	3	6	49864	49869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_007514	AATT	2	8	49883	49890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_007514	GTT	2	6	49895	49900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188028
1025	NC_007514	GCT	2	6	49905	49910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188028
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1028	NC_007514	TGG	2	6	50035	50040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188028
1029	NC_007514	AAT	2	6	50156	50161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188028
1030	NC_007514	GGC	3	9	50174	50182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188028
1031	NC_007514	AATTA	2	10	50207	50216	60 %	40 %	0 %	0 %	78188028
1032	NC_007514	ACA	2	6	50277	50282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188028
1033	NC_007514	CT	3	6	50358	50363	0 %	50 %	0 %	50 %	78188028
1034	NC_007514	AAG	2	6	50403	50408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78188028
1035	NC_007514	GCC	2	6	50423	50428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78188028
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1038	NC_007514	CTT	2	6	50713	50718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78188028
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1040	NC_007514	TGC	2	6	50778	50783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188028
1041	NC_007514	TGCCA	2	10	50810	50819	20 %	20 %	20 %	40 %	78188028
1042	NC_007514	AGC	2	6	50849	50854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188028
1043	NC_007514	ACCG	2	8	50923	50930	25 %	0 %	25 %	50 %	78188028
1044	NC_007514	GGAGG	2	10	50954	50963	20 %	0 %	80 %	0 %	78188028
1045	NC_007514	CAA	2	6	50968	50973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188028
1046	NC_007514	GTC	2	6	50981	50986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188028
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1049	NC_007514	TGGT	2	8	51095	51102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_007514	TG	4	8	51128	51135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_007514	TC	3	6	51143	51148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_007514	TA	3	6	51185	51190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_007514	AAT	2	6	51206	51211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_007514	ATT	2	6	51248	51253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188029
1055	NC_007514	TAC	3	9	51257	51265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188029
1056	NC_007514	ATG	2	6	51294	51299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188029
1057	NC_007514	GTA	2	6	51480	51485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188029
1058	NC_007514	GCG	2	6	51489	51494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188029
1059	NC_007514	GTAA	2	8	51563	51570	50 %	25 %	25 %	0 %	78188029
1060	NC_007514	GCG	2	6	51602	51607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188029
1061	NC_007514	AGG	2	6	51637	51642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78188029
1062	NC_007514	GCG	2	6	51667	51672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188029
1063	NC_007514	TGC	2	6	51676	51681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188029
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1065	NC_007514	T	6	6	51699	51704	0 %	100 %	0 %	0 %	78188029
1066	NC_007514	TCA	2	6	51733	51738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188029
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1068	NC_007514	GTGC	2	8	51948	51955	0 %	25 %	50 %	25 %	78188029
1069	NC_007514	G	6	6	51990	51995	0 %	0 %	100 %	0 %	78188029
1070	NC_007514	CTTG	2	8	52084	52091	0 %	50 %	25 %	25 %	78188029
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1074	NC_007514	GAG	2	6	52247	52252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78188029
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1093	NC_007514	CAA	2	6	52877	52882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_007514	ATT	3	9	52901	52909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1100	NC_007514	ATCA	2	8	53382	53389	50 %	25 %	0 %	25 %	78188031
1101	NC_007514	T	6	6	53416	53421	0 %	100 %	0 %	0 %	78188031
1102	NC_007514	GCA	2	6	53471	53476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188031
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1110	NC_007514	T	6	6	53724	53729	0 %	100 %	0 %	0 %	78188031
1111	NC_007514	CAT	2	6	53733	53738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188031
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1113	NC_007514	CT	3	6	53946	53951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_007514	T	8	8	53972	53979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_007514	A	7	7	54048	54054	100 %	0 %	0 %	0 %	78188032
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1123	NC_007514	ATT	2	6	54395	54400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188033
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1129	NC_007514	AGC	2	6	54636	54641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188033
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1131	NC_007514	AAG	2	6	54725	54730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78188033
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