MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome

Total Repeats: 53982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_007514	TTGC	2	8	237129	237136	0 %	50 %	25 %	25 %	78188191
5003	NC_007514	A	6	6	237331	237336	100 %	0 %	0 %	0 %	78188191
5004	NC_007514	CT	3	6	237372	237377	0 %	50 %	0 %	50 %	78188191
5005	NC_007514	TAC	2	6	237477	237482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188191
5006	NC_007514	CACG	2	8	237493	237500	25 %	0 %	25 %	50 %	78188191
5007	NC_007514	CGA	2	6	237521	237526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188191
5008	NC_007514	A	6	6	237543	237548	100 %	0 %	0 %	0 %	78188191
5009	NC_007514	ATT	2	6	237564	237569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188191
5010	NC_007514	CGGT	2	8	237610	237617	0 %	25 %	50 %	25 %	78188191
5011	NC_007514	GTC	2	6	237649	237654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188191
5012	NC_007514	GGCA	2	8	237683	237690	25 %	0 %	50 %	25 %	78188191
5013	NC_007514	GGT	2	6	237698	237703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188191
5014	NC_007514	GCT	2	6	237773	237778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188191
5015	NC_007514	TTA	2	6	237829	237834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_007514	CCA	2	6	237861	237866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5017	NC_007514	T	6	6	237870	237875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_007514	CTC	2	6	237936	237941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_007514	CTT	2	6	237952	237957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_007514	ACC	2	6	238001	238006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_007514	ACT	2	6	238080	238085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188192
5022	NC_007514	TATG	2	8	238197	238204	25 %	50 %	25 %	0 %	78188192
5023	NC_007514	GAAC	2	8	238269	238276	50 %	0 %	25 %	25 %	78188192
5024	NC_007514	ATT	2	6	238333	238338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188192
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5027	NC_007514	TTGT	2	8	238432	238439	0 %	75 %	25 %	0 %	78188192
5028	NC_007514	A	8	8	238474	238481	100 %	0 %	0 %	0 %	78188192
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5030	NC_007514	CTTT	2	8	238530	238537	0 %	75 %	0 %	25 %	78188192
5031	NC_007514	T	7	7	238596	238602	0 %	100 %	0 %	0 %	78188192
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5033	NC_007514	T	6	6	238717	238722	0 %	100 %	0 %	0 %	78188192
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5039	NC_007514	TGGT	2	8	239003	239010	0 %	50 %	50 %	0 %	78188192
5040	NC_007514	AT	3	6	239016	239021	50 %	50 %	0 %	0 %	78188192
5041	NC_007514	T	6	6	239032	239037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_007514	CT	3	6	239094	239099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_007514	T	8	8	239099	239106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_007514	ATTGC	2	10	239107	239116	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5045	NC_007514	T	6	6	239144	239149	0 %	100 %	0 %	0 %	78188193
5046	NC_007514	CCTTG	2	10	239164	239173	0 %	40 %	20 %	40 %	78188193
5047	NC_007514	CAAG	2	8	239174	239181	50 %	0 %	25 %	25 %	78188193
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5053	NC_007514	TAG	2	6	239650	239655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188193
5054	NC_007514	TTTG	2	8	239720	239727	0 %	75 %	25 %	0 %	78188193
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5056	NC_007514	T	7	7	239845	239851	0 %	100 %	0 %	0 %	78188193
5057	NC_007514	T	6	6	239881	239886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_007514	ATTT	2	8	239967	239974	25 %	75 %	0 %	0 %	78188194
5059	NC_007514	TGA	4	12	240028	240039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188194
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5061	NC_007514	CCGATG	2	12	240138	240149	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	78188194
5062	NC_007514	TG	3	6	240212	240217	0 %	50 %	50 %	0 %	78188194
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5077	NC_007514	T	7	7	240878	240884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5079	NC_007514	T	7	7	240896	240902	0 %	100 %	0 %	0 %	78188195
5080	NC_007514	TGC	2	6	240990	240995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188195
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5084	NC_007514	TGGCA	2	10	241222	241231	20 %	20 %	40 %	20 %	78188195
5085	NC_007514	GGCGTG	2	12	241233	241244	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78188195
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5092	NC_007514	A	7	7	241605	241611	100 %	0 %	0 %	0 %	78188195
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5098	NC_007514	GGT	2	6	241806	241811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188195
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5100	NC_007514	GGT	2	6	241857	241862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188195
5101	NC_007514	TTG	2	6	241886	241891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188195
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5103	NC_007514	T	7	7	241950	241956	0 %	100 %	0 %	0 %	78188195
5104	NC_007514	GCTG	2	8	242002	242009	0 %	25 %	50 %	25 %	78188195
5105	NC_007514	TGAG	2	8	242034	242041	25 %	25 %	50 %	0 %	78188195
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5107	NC_007514	TTA	2	6	242134	242139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_007514	A	6	6	242214	242219	100 %	0 %	0 %	0 %	78188196
5109	NC_007514	TAA	2	6	242263	242268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188196
5110	NC_007514	TG	3	6	242301	242306	0 %	50 %	50 %	0 %	78188196
5111	NC_007514	A	6	6	242325	242330	100 %	0 %	0 %	0 %	78188196
5112	NC_007514	TGA	2	6	242348	242353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188196
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5115	NC_007514	ACC	2	6	242604	242609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78188196
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5117	NC_007514	TGA	2	6	242902	242907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188196
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5120	NC_007514	TGA	2	6	243101	243106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188196
5121	NC_007514	A	6	6	243151	243156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_007514	T	6	6	243169	243174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_007514	AGC	2	6	243271	243276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5257	NC_007514	A	6	6	249486	249491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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