MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium chlorochromatii CaD3 chromosome

Total Repeats: 53982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_007514	CA	3	6	214566	214571	50 %	0 %	0 %	50 %	78188170
4502	NC_007514	TTC	2	6	214580	214585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78188170
4503	NC_007514	GCCA	2	8	214834	214841	25 %	0 %	25 %	50 %	78188170
4504	NC_007514	AAAG	2	8	215021	215028	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_007514	T	7	7	215040	215046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_007514	TTGCT	2	10	215064	215073	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4507	NC_007514	TC	3	6	215091	215096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4508	NC_007514	CAT	2	6	215163	215168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_007514	T	6	6	215173	215178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_007514	T	6	6	215218	215223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_007514	AAT	2	6	215260	215265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_007514	AT	3	6	215264	215269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_007514	GCA	2	6	215407	215412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188171
4514	NC_007514	ATT	3	9	215427	215435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188171
4515	NC_007514	GGT	2	6	215436	215441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188171
4516	NC_007514	CAG	2	6	215461	215466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188171
4517	NC_007514	GGC	2	6	215480	215485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188171
4518	NC_007514	TGG	2	6	215492	215497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188171
4519	NC_007514	TGT	2	6	215519	215524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188171
4520	NC_007514	A	8	8	215653	215660	100 %	0 %	0 %	0 %	78188171
4521	NC_007514	A	7	7	215684	215690	100 %	0 %	0 %	0 %	78188171
4522	NC_007514	CTG	2	6	215743	215748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188171
4523	NC_007514	CGG	2	6	215770	215775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188171
4524	NC_007514	ATT	3	9	215880	215888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188171
4525	NC_007514	TCC	2	6	215889	215894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78188171
4526	NC_007514	CT	3	6	215904	215909	0 %	50 %	0 %	50 %	78188171
4527	NC_007514	ATT	2	6	215955	215960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188171
4528	NC_007514	GCGG	2	8	215976	215983	0 %	0 %	75 %	25 %	78188171
4529	NC_007514	AGG	2	6	216064	216069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78188171
4530	NC_007514	CTG	2	6	216091	216096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188171
4531	NC_007514	AAG	2	6	216184	216189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78188171
4532	NC_007514	AGC	2	6	216211	216216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188171
4533	NC_007514	ACT	2	6	216217	216222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188171
4534	NC_007514	GAA	2	6	216234	216239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78188171
4535	NC_007514	TTA	2	6	216386	216391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188171
4536	NC_007514	TAAAAA	2	12	216433	216444	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	78188171
4537	NC_007514	TTG	2	6	216476	216481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188171
4538	NC_007514	CTAC	2	8	216496	216503	25 %	25 %	0 %	50 %	78188171
4539	NC_007514	CTTC	2	8	216549	216556	0 %	50 %	0 %	50 %	78188171
4540	NC_007514	TAG	2	6	216587	216592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188171
4541	NC_007514	TAG	2	6	216627	216632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188171
4542	NC_007514	GTAA	2	8	216634	216641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_007514	G	7	7	216644	216650	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_007514	GTT	2	6	216708	216713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_007514	CTCTT	2	10	216772	216781	0 %	60 %	0 %	40 %	78188172
4546	NC_007514	T	7	7	216780	216786	0 %	100 %	0 %	0 %	78188172
4547	NC_007514	TGG	2	6	216823	216828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188172
4548	NC_007514	TTTC	2	8	216840	216847	0 %	75 %	0 %	25 %	78188172
4549	NC_007514	TTTC	2	8	216858	216865	0 %	75 %	0 %	25 %	78188172
4550	NC_007514	CAT	2	6	216911	216916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188172
4551	NC_007514	GCTCT	2	10	216939	216948	0 %	40 %	20 %	40 %	78188172
4552	NC_007514	T	6	6	216948	216953	0 %	100 %	0 %	0 %	78188172
4553	NC_007514	GCA	2	6	217063	217068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188172
4554	NC_007514	GGT	2	6	217087	217092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188172
4555	NC_007514	CAA	2	6	217150	217155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188172
4556	NC_007514	A	6	6	217154	217159	100 %	0 %	0 %	0 %	78188172
4557	NC_007514	T	7	7	217160	217166	0 %	100 %	0 %	0 %	78188172
4558	NC_007514	CAA	2	6	217217	217222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78188172
4559	NC_007514	TGT	2	6	217231	217236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188172
4560	NC_007514	TTG	2	6	217282	217287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188172
4561	NC_007514	ATT	2	6	217365	217370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188172
4562	NC_007514	GCTT	2	8	217391	217398	0 %	50 %	25 %	25 %	78188172
4563	NC_007514	GGT	2	6	217410	217415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188172
4564	NC_007514	T	6	6	217431	217436	0 %	100 %	0 %	0 %	78188172
4565	NC_007514	TGC	2	6	217493	217498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188172
4566	NC_007514	GCA	2	6	217547	217552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188172
4567	NC_007514	CCT	2	6	217567	217572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78188172
4568	NC_007514	GGT	2	6	217586	217591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78188172
4569	NC_007514	A	7	7	217637	217643	100 %	0 %	0 %	0 %	78188172
4570	NC_007514	GCA	2	6	217670	217675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188172
4571	NC_007514	AGT	2	6	217686	217691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188172
4572	NC_007514	GAT	2	6	217749	217754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188172
4573	NC_007514	ATA	2	6	217757	217762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78188172
4574	NC_007514	A	6	6	217795	217800	100 %	0 %	0 %	0 %	78188173
4575	NC_007514	CA	3	6	217971	217976	50 %	0 %	0 %	50 %	78188173
4576	NC_007514	TTG	2	6	218024	218029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188173
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4579	NC_007514	GGC	2	6	218200	218205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78188173
4580	NC_007514	ATCA	2	8	218224	218231	50 %	25 %	0 %	25 %	78188173
4581	NC_007514	TTG	2	6	218264	218269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_007514	A	6	6	218274	218279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_007514	T	6	6	218313	218318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_007514	GTT	2	6	218322	218327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_007514	TGA	2	6	218355	218360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_007514	T	6	6	218377	218382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_007514	CTTTT	2	10	218483	218492	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4588	NC_007514	TC	3	6	218538	218543	0 %	50 %	0 %	50 %	78188174
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4592	NC_007514	TCA	2	6	218716	218721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188174
4593	NC_007514	T	8	8	218803	218810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_007514	T	6	6	218820	218825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_007514	AGC	2	6	218832	218837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_007514	CAG	2	6	218918	218923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78188175
4597	NC_007514	ATT	2	6	218927	218932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188175
4598	NC_007514	CTC	2	6	218961	218966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78188175
4599	NC_007514	CCG	2	6	219001	219006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78188175
4600	NC_007514	GAGTA	2	10	219015	219024	40 %	20 %	40 %	0 %	78188175
4601	NC_007514	TTG	2	6	219063	219068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188175
4602	NC_007514	GCT	2	6	219109	219114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188175
4603	NC_007514	TG	3	6	219146	219151	0 %	50 %	50 %	0 %	78188175
4604	NC_007514	TGC	2	6	219157	219162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188175
4605	NC_007514	TTG	2	6	219173	219178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188175
4606	NC_007514	TGT	2	6	219198	219203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188175
4607	NC_007514	CA	3	6	219230	219235	50 %	0 %	0 %	50 %	78188175
4608	NC_007514	ATG	2	6	219243	219248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78188175
4609	NC_007514	CGT	2	6	219271	219276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188175
4610	NC_007514	ATGAGC	2	12	219312	219323	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78188175
4611	NC_007514	GCT	2	6	219355	219360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188175
4612	NC_007514	T	9	9	219373	219381	0 %	100 %	0 %	0 %	78188175
4613	NC_007514	TGCGT	2	10	219388	219397	0 %	40 %	40 %	20 %	78188175
4614	NC_007514	TGC	2	6	219421	219426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78188175
4615	NC_007514	CT	3	6	219435	219440	0 %	50 %	0 %	50 %	78188175
4616	NC_007514	ATC	2	6	219501	219506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188175
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4619	NC_007514	GTTG	2	8	219643	219650	0 %	50 %	50 %	0 %	78188175
4620	NC_007514	TTG	2	6	219680	219685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188175
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4622	NC_007514	TAT	2	6	219710	219715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78188175
4623	NC_007514	CTA	2	6	219724	219729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78188175
4624	NC_007514	TTTGA	2	10	219731	219740	20 %	60 %	20 %	0 %	78188175
4625	NC_007514	GTT	2	6	219791	219796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78188175
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4627	NC_007514	GGCG	2	8	219886	219893	0 %	0 %	75 %	25 %	78188175
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