MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlorobium luteolum DSM 273 chromosome

Total Repeats: 49044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007512	CAA	2	6	101	106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007512	GCT	2	6	161	166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007512	GAA	2	6	167	172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007512	AAG	3	9	208	216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007512	CAA	2	6	246	251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007512	A	6	6	265	270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007512	CCT	2	6	306	311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185893
8	NC_007512	CAGT	2	8	333	340	25 %	25 %	25 %	25 %	78185893
9	NC_007512	ATCG	2	8	367	374	25 %	25 %	25 %	25 %	78185893
10	NC_007512	CGGA	2	8	435	442	25 %	0 %	50 %	25 %	78185893
11	NC_007512	TCGA	2	8	560	567	25 %	25 %	25 %	25 %	78185893
12	NC_007512	CGAC	2	8	606	613	25 %	0 %	25 %	50 %	78185893
13	NC_007512	ACC	2	6	728	733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185893
14	NC_007512	ATG	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185893
15	NC_007512	GAAG	2	8	791	798	50 %	0 %	50 %	0 %	78185893
16	NC_007512	CAT	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185893
17	NC_007512	GGT	2	6	883	888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185893
18	NC_007512	TCC	2	6	912	917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185893
19	NC_007512	GCC	2	6	1007	1012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185893
20	NC_007512	TCA	3	9	1074	1082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185893
21	NC_007512	GAT	2	6	1165	1170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185893
22	NC_007512	AGG	2	6	1212	1217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185893
23	NC_007512	GTG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185893
24	NC_007512	ATTCA	2	10	1258	1267	40 %	40 %	0 %	20 %	78185893
25	NC_007512	GCT	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185893
26	NC_007512	TGA	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185893
27	NC_007512	GAA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185893
28	NC_007512	AAC	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185893
29	NC_007512	T	6	6	1458	1463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007512	CTG	2	6	1475	1480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007512	ATG	2	6	1493	1498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007512	CGA	2	6	1526	1531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007512	TCAC	2	8	1596	1603	25 %	25 %	0 %	50 %	78185894
34	NC_007512	CCAT	2	8	1679	1686	25 %	25 %	0 %	50 %	78185894
35	NC_007512	GC	3	6	1715	1720	0 %	0 %	50 %	50 %	78185894
36	NC_007512	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185894
37	NC_007512	GCT	2	6	2007	2012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185894
38	NC_007512	TGC	2	6	2027	2032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185894
39	NC_007512	AGC	2	6	2033	2038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185894
40	NC_007512	CTT	2	6	2047	2052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185894
41	NC_007512	CTT	2	6	2063	2068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185894
42	NC_007512	GA	3	6	2084	2089	50 %	0 %	50 %	0 %	78185894
43	NC_007512	TGC	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185894
44	NC_007512	TTC	2	6	2235	2240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185894
45	NC_007512	TGA	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185894
46	NC_007512	TGA	2	6	2361	2366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185894
47	NC_007512	CTG	2	6	2368	2373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185894
48	NC_007512	TTTC	2	8	2374	2381	0 %	75 %	0 %	25 %	78185894
49	NC_007512	A	6	6	2398	2403	100 %	0 %	0 %	0 %	78185894
50	NC_007512	CAG	2	6	2419	2424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185894
51	NC_007512	CGA	2	6	2505	2510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185894
52	NC_007512	ACG	2	6	2590	2595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185894
53	NC_007512	GTT	2	6	2837	2842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185895
54	NC_007512	CTC	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185895
55	NC_007512	GCT	2	6	3001	3006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007512	CCT	2	6	3032	3037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_007512	AGC	2	6	3046	3051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007512	AAGC	2	8	3071	3078	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007512	CAT	2	6	3203	3208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185896
60	NC_007512	GATT	2	8	3328	3335	25 %	50 %	25 %	0 %	78185896
61	NC_007512	GAA	2	6	3341	3346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185896
62	NC_007512	TGAT	2	8	3372	3379	25 %	50 %	25 %	0 %	78185896
63	NC_007512	GAT	2	6	3395	3400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185896
64	NC_007512	TCT	2	6	3418	3423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185896
65	NC_007512	TTCG	2	8	3566	3573	0 %	50 %	25 %	25 %	78185896
66	NC_007512	CGT	2	6	3757	3762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185896
67	NC_007512	TCA	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185896
68	NC_007512	T	6	6	3790	3795	0 %	100 %	0 %	0 %	78185896
69	NC_007512	CTC	3	9	3842	3850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185896
70	NC_007512	ATGAA	2	10	3897	3906	60 %	20 %	20 %	0 %	78185896
71	NC_007512	GAA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185896
72	NC_007512	ACA	2	6	4011	4016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78185896
73	NC_007512	CTA	2	6	4081	4086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185896
74	NC_007512	CTT	2	6	4178	4183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185896
75	NC_007512	TGA	2	6	4192	4197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185896
76	NC_007512	GGA	2	6	4300	4305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185896
77	NC_007512	TGTC	2	8	4312	4319	0 %	50 %	25 %	25 %	78185896
78	NC_007512	TTC	2	6	4349	4354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007512	TAC	2	6	4364	4369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007512	CCT	2	6	4393	4398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_007512	AAAG	2	8	4510	4517	75 %	0 %	25 %	0 %	78185897
82	NC_007512	AGG	2	6	4560	4565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185897
83	NC_007512	TCGC	2	8	4616	4623	0 %	25 %	25 %	50 %	78185897
84	NC_007512	GTA	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
85	NC_007512	ATG	2	6	4682	4687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
86	NC_007512	GCGGA	2	10	4688	4697	20 %	0 %	60 %	20 %	78185897
87	NC_007512	CTT	2	6	4895	4900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185897
88	NC_007512	CAC	2	6	4923	4928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185897
89	NC_007512	GAA	2	6	4943	4948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185897
90	NC_007512	TTTCAT	2	12	4951	4962	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	78185897
91	NC_007512	T	8	8	4991	4998	0 %	100 %	0 %	0 %	78185897
92	NC_007512	ACCG	2	8	5022	5029	25 %	0 %	25 %	50 %	78185897
93	NC_007512	TTC	2	6	5089	5094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185897
94	NC_007512	GGA	2	6	5117	5122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185897
95	NC_007512	GAT	2	6	5152	5157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
96	NC_007512	TCA	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185897
97	NC_007512	GCC	2	6	5254	5259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185897
98	NC_007512	TGA	2	6	5289	5294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
99	NC_007512	CAGC	2	8	5331	5338	25 %	0 %	25 %	50 %	78185897
100	NC_007512	TTC	2	6	5359	5364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185897
101	NC_007512	TGC	2	6	5555	5560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185897
102	NC_007512	TGA	2	6	5610	5615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
103	NC_007512	GCC	2	6	5633	5638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185897
104	NC_007512	GCT	2	6	5695	5700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185897
105	NC_007512	AAG	2	6	5707	5712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185897
106	NC_007512	GTC	2	6	5767	5772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185897
107	NC_007512	TGC	2	6	5964	5969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185897
108	NC_007512	TTCC	2	8	6017	6024	0 %	50 %	0 %	50 %	78185897
109	NC_007512	TA	3	6	6064	6069	50 %	50 %	0 %	0 %	78185897
110	NC_007512	TGT	2	6	6090	6095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185897
111	NC_007512	TGA	2	6	6126	6131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
112	NC_007512	GAA	2	6	6147	6152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185897
113	NC_007512	ATG	3	9	6218	6226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
114	NC_007512	CTT	2	6	6253	6258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185897
115	NC_007512	TCG	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185897
116	NC_007512	GAA	2	6	6334	6339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185897
117	NC_007512	CAT	2	6	6355	6360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185897
118	NC_007512	TCC	2	6	6412	6417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185897
119	NC_007512	TAT	2	6	6438	6443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78185897
120	NC_007512	CTT	2	6	6457	6462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185897
121	NC_007512	GAT	2	6	6471	6476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185897
122	NC_007512	AAG	2	6	6592	6597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185897
123	NC_007512	A	8	8	6614	6621	100 %	0 %	0 %	0 %	78185897
124	NC_007512	CTC	2	6	6718	6723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185897
125	NC_007512	TCT	3	9	6793	6801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_007512	TGC	2	6	6847	6852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007512	AG	3	6	7004	7009	50 %	0 %	50 %	0 %	78185898
128	NC_007512	GC	3	6	7061	7066	0 %	0 %	50 %	50 %	78185898
129	NC_007512	AGTA	2	8	7079	7086	50 %	25 %	25 %	0 %	78185898
130	NC_007512	CCT	2	6	7141	7146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185898
131	NC_007512	TCA	2	6	7195	7200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185898
132	NC_007512	TCT	2	6	7243	7248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185898
133	NC_007512	TGGC	2	8	7265	7272	0 %	25 %	50 %	25 %	78185898
134	NC_007512	T	6	6	7318	7323	0 %	100 %	0 %	0 %	78185898
135	NC_007512	TCA	2	6	7518	7523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185898
136	NC_007512	TATG	2	8	7535	7542	25 %	50 %	25 %	0 %	78185898
137	NC_007512	GCG	2	6	7587	7592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185898
138	NC_007512	GGA	2	6	7716	7721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185898
139	NC_007512	CCT	2	6	7765	7770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185898
140	NC_007512	GCCCT	2	10	8052	8061	0 %	20 %	20 %	60 %	78185898
141	NC_007512	CTC	2	6	8114	8119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78185898
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153	NC_007512	AAT	2	6	8790	8795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_007512	TTC	2	6	8801	8806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_007512	ATT	2	6	8842	8847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_007512	GCG	2	6	8913	8918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_007512	GTTA	2	8	8924	8931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
160	NC_007512	AT	3	6	8948	8953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_007512	TCA	2	6	8989	8994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185899
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199	NC_007512	T	6	6	10774	10779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_007512	CATCAG	2	12	13682	13693	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	78185902
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261	NC_007512	GCG	2	6	14001	14006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185902
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268	NC_007512	TCA	2	6	14242	14247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185902
269	NC_007512	TTC	2	6	14269	14274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185902
270	NC_007512	TGT	2	6	14366	14371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78185902
271	NC_007512	TCG	2	6	14491	14496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185902
272	NC_007512	GCC	2	6	14520	14525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185902
273	NC_007512	CAC	2	6	14565	14570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185902
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277	NC_007512	CCG	2	6	15016	15021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185902
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284	NC_007512	GCTT	2	8	15261	15268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
285	NC_007512	G	6	6	15278	15283	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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393	NC_007512	CCG	2	6	19621	19626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185906
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397	NC_007512	GCC	2	6	19867	19872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185906
398	NC_007512	A	7	7	19925	19931	100 %	0 %	0 %	0 %	78185906
399	NC_007512	GCAA	2	8	19965	19972	50 %	0 %	25 %	25 %	78185906
400	NC_007512	GGT	2	6	19986	19991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185906
401	NC_007512	CAT	2	6	20009	20014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78185906
402	NC_007512	CTG	2	6	20067	20072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185906
403	NC_007512	TGCA	2	8	20077	20084	25 %	25 %	25 %	25 %	78185906
404	NC_007512	GCATC	2	10	20097	20106	20 %	20 %	20 %	40 %	78185906
405	NC_007512	GCC	2	6	20111	20116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185906
406	NC_007512	GCG	2	6	20133	20138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185906
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408	NC_007512	GGA	2	6	20210	20215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78185906
409	NC_007512	GAA	2	6	20219	20224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185906
410	NC_007512	CTT	2	6	20226	20231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185906
411	NC_007512	A	6	6	20239	20244	100 %	0 %	0 %	0 %	78185906
412	NC_007512	TGC	2	6	20297	20302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185906
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435	NC_007512	GTA	2	6	21337	21342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78185908
436	NC_007512	GAA	2	6	21367	21372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78185908
437	NC_007512	CGA	2	6	21531	21536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185908
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442	NC_007512	CGA	2	6	21762	21767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78185908
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450	NC_007512	CTT	2	6	22126	22131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78185908
451	NC_007512	CGG	2	6	22144	22149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78185908
452	NC_007512	CCG	2	6	22187	22192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185908
453	NC_007512	CTG	2	6	22257	22262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78185908
454	NC_007512	TGG	3	9	22314	22322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78185908
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482	NC_007512	AT	3	6	23846	23851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_007512	GC	3	6	23956	23961	0 %	0 %	50 %	50 %	78185910
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491	NC_007512	CAC	2	6	24375	24380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78185911
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499	NC_007512	GCC	2	6	24642	24647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78185911
500	NC_007512	GGGGT	2	10	24769	24778	0 %	20 %	80 %	0 %	78185911

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