MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 chromosome

Total Repeats: 50308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_007503	GGT	2	6	120822	120827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043882
2502	NC_007503	GGT	2	6	120840	120845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043882
2503	NC_007503	CCA	2	6	120868	120873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78043882
2504	NC_007503	TGC	2	6	120896	120901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78043882
2505	NC_007503	TGG	2	6	121000	121005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043882
2506	NC_007503	AAT	2	6	121085	121090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78043882
2507	NC_007503	CGG	2	6	121107	121112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043882
2508	NC_007503	CTG	2	6	121129	121134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78043882
2509	NC_007503	T	6	6	121263	121268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_007503	G	6	6	121292	121297	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_007503	CTGG	2	8	121321	121328	0 %	25 %	50 %	25 %	78043220
2512	NC_007503	T	6	6	121330	121335	0 %	100 %	0 %	0 %	78043220
2513	NC_007503	TGG	2	6	121409	121414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043220
2514	NC_007503	T	6	6	121458	121463	0 %	100 %	0 %	0 %	78043220
2515	NC_007503	TTC	2	6	121524	121529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043220
2516	NC_007503	GGA	2	6	121557	121562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78043220
2517	NC_007503	TAT	2	6	121581	121586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043220
2518	NC_007503	T	7	7	121588	121594	0 %	100 %	0 %	0 %	78043220
2519	NC_007503	AT	3	6	121598	121603	50 %	50 %	0 %	0 %	78042726
2520	NC_007503	A	6	6	121617	121622	100 %	0 %	0 %	0 %	78042726
2521	NC_007503	ATT	2	6	121654	121659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78042726
2522	NC_007503	GCA	2	6	121726	121731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78042726
2523	NC_007503	GCC	2	6	121736	121741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78042726
2524	NC_007503	T	7	7	121748	121754	0 %	100 %	0 %	0 %	78042726
2525	NC_007503	CTT	2	6	121758	121763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78042726
2526	NC_007503	TTTTA	2	10	121772	121781	20 %	80 %	0 %	0 %	78042726
2527	NC_007503	T	6	6	121831	121836	0 %	100 %	0 %	0 %	78042726
2528	NC_007503	CTA	2	6	121851	121856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78042726
2529	NC_007503	GTA	2	6	121875	121880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78042726
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2531	NC_007503	A	6	6	121927	121932	100 %	0 %	0 %	0 %	78042726
2532	NC_007503	T	7	7	121946	121952	0 %	100 %	0 %	0 %	78042726
2533	NC_007503	A	6	6	121961	121966	100 %	0 %	0 %	0 %	78042726
2534	NC_007503	TACC	2	8	122004	122011	25 %	25 %	0 %	50 %	78042726
2535	NC_007503	GGA	2	6	122013	122018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78042726
2536	NC_007503	T	6	6	122022	122027	0 %	100 %	0 %	0 %	78042726
2537	NC_007503	CTTT	2	8	122089	122096	0 %	75 %	0 %	25 %	78042726
2538	NC_007503	AGA	2	6	122120	122125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78042726
2539	NC_007503	T	6	6	122128	122133	0 %	100 %	0 %	0 %	78042726
2540	NC_007503	TTAC	2	8	122229	122236	25 %	50 %	0 %	25 %	78042726
2541	NC_007503	GAT	2	6	122346	122351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78042726
2542	NC_007503	A	6	6	122378	122383	100 %	0 %	0 %	0 %	78042726
2543	NC_007503	AT	3	6	122438	122443	50 %	50 %	0 %	0 %	78042726
2544	NC_007503	ATA	2	6	122494	122499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78042726
2545	NC_007503	CTG	2	6	122530	122535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78042726
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2547	NC_007503	GGT	2	6	122570	122575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78042726
2548	NC_007503	TA	3	6	122761	122766	50 %	50 %	0 %	0 %	78042726
2549	NC_007503	CTT	2	6	122777	122782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78042726
2550	NC_007503	GAG	2	6	122796	122801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78042726
2551	NC_007503	TAAAT	2	10	122822	122831	60 %	40 %	0 %	0 %	78042726
2552	NC_007503	ATT	2	6	122857	122862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78042726
2553	NC_007503	CGG	2	6	122946	122951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78042726
2554	NC_007503	GAG	2	6	122979	122984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78042726
2555	NC_007503	TGT	2	6	122987	122992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78042726
2556	NC_007503	GCT	2	6	123117	123122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78042726
2557	NC_007503	GGA	2	6	123128	123133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78042726
2558	NC_007503	TGGTAA	2	12	123211	123222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78042726
2559	NC_007503	ATT	2	6	123246	123251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_007503	TAC	2	6	123269	123274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_007503	TAAAA	2	10	123277	123286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_007503	A	7	7	123283	123289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_007503	GTA	2	6	123295	123300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_007503	A	6	6	123319	123324	100 %	0 %	0 %	0 %	78044784
2565	NC_007503	TAT	2	6	123453	123458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044784
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2569	NC_007503	CTTA	2	8	123588	123595	25 %	50 %	0 %	25 %	78044784
2570	NC_007503	GGT	2	6	123618	123623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78044784
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2580	NC_007503	GGT	2	6	124065	124070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_007503	GGTC	2	8	124075	124082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2582	NC_007503	A	7	7	124089	124095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_007503	A	6	6	124173	124178	100 %	0 %	0 %	0 %	78044668
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2592	NC_007503	T	6	6	124522	124527	0 %	100 %	0 %	0 %	78042626
2593	NC_007503	GCGG	2	8	124573	124580	0 %	0 %	75 %	25 %	78042626
2594	NC_007503	GCA	2	6	124633	124638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78042626
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2596	NC_007503	TCC	2	6	124669	124674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78042626
2597	NC_007503	CCGG	2	8	124769	124776	0 %	0 %	50 %	50 %	78042626
2598	NC_007503	TAA	2	6	124804	124809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78042626
2599	NC_007503	A	7	7	124813	124819	100 %	0 %	0 %	0 %	78042626
2600	NC_007503	TAC	2	6	124820	124825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78042626
2601	NC_007503	AAAT	2	8	124841	124848	75 %	25 %	0 %	0 %	78042626
2602	NC_007503	T	7	7	124858	124864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_007503	GGA	2	6	124894	124899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_007503	CAA	2	6	124920	124925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78043023
2605	NC_007503	CAA	2	6	125025	125030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78043023
2606	NC_007503	CGGTGG	2	12	125045	125056	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	78043023
2607	NC_007503	G	6	6	125133	125138	0 %	0 %	100 %	0 %	78043023
2608	NC_007503	GAT	2	6	125160	125165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78043858
2609	NC_007503	CAG	2	6	125176	125181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78043858
2610	NC_007503	AGGA	2	8	125216	125223	50 %	0 %	50 %	0 %	78043858
2611	NC_007503	TGA	2	6	125249	125254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78043858
2612	NC_007503	TGG	2	6	125289	125294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043858
2613	NC_007503	TGG	2	6	125300	125305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043858
2614	NC_007503	T	6	6	125380	125385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_007503	T	7	7	125408	125414	0 %	100 %	0 %	0 %	78044399
2616	NC_007503	T	6	6	125456	125461	0 %	100 %	0 %	0 %	78044399
2617	NC_007503	TAA	2	6	125495	125500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044399
2618	NC_007503	TGC	2	6	125634	125639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78042713
2619	NC_007503	CGG	2	6	125714	125719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78042713
2620	NC_007503	AAAGA	2	10	125722	125731	80 %	0 %	20 %	0 %	78042713
2621	NC_007503	ACA	2	6	125768	125773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78042713
2622	NC_007503	CTT	2	6	125777	125782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78042713
2623	NC_007503	GGC	2	6	125810	125815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78042713
2624	NC_007503	CGT	2	6	125975	125980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78042713
2625	NC_007503	ACGATG	2	12	126010	126021	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	78042713
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