MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 chromosome

Total Repeats: 50308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_007503	GA	3	6	24382	24387	50 %	0 %	50 %	0 %	78044617
503	NC_007503	ATT	2	6	24520	24525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044617
504	NC_007503	CCGC	2	8	24584	24591	0 %	0 %	25 %	75 %	78044617
505	NC_007503	CGGG	2	8	24658	24665	0 %	0 %	75 %	25 %	78044617
506	NC_007503	ACC	2	6	24835	24840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	78044617
507	NC_007503	TAC	2	6	24852	24857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78044617
508	NC_007503	TAAA	2	8	24968	24975	75 %	25 %	0 %	0 %	78044617
509	NC_007503	TCC	2	6	25025	25030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_007503	TAAT	2	8	25037	25044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_007503	T	6	6	25046	25051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_007503	AGT	2	6	25098	25103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78043835
513	NC_007503	TAA	2	6	25127	25132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78043835
514	NC_007503	T	6	6	25133	25138	0 %	100 %	0 %	0 %	78043835
515	NC_007503	ATA	2	6	25153	25158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78043835
516	NC_007503	T	6	6	25240	25245	0 %	100 %	0 %	0 %	78043835
517	NC_007503	TCC	2	6	25304	25309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78045203
518	NC_007503	CTT	2	6	25365	25370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045203
519	NC_007503	TCT	2	6	25565	25570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045203
520	NC_007503	TTG	2	6	25619	25624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045203
521	NC_007503	GAT	2	6	25651	25656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045203
522	NC_007503	TTC	2	6	25705	25710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78045203
523	NC_007503	TAAAA	2	10	25771	25780	80 %	20 %	0 %	0 %	78045203
524	NC_007503	A	7	7	25777	25783	100 %	0 %	0 %	0 %	78045203
525	NC_007503	AAT	2	6	25897	25902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78045203
526	NC_007503	TAAA	2	8	25922	25929	75 %	25 %	0 %	0 %	78045203
527	NC_007503	AGT	2	6	26045	26050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045203
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529	NC_007503	AAT	2	6	26068	26073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78045203
530	NC_007503	AGTTTA	2	12	26109	26120	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	78045203
531	NC_007503	TCA	2	6	26133	26138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045203
532	NC_007503	ATATT	2	10	26167	26176	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_007503	A	7	7	26188	26194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_007503	TTA	2	6	26239	26244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_007503	A	7	7	26250	26256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_007503	GCG	2	6	26309	26314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043206
537	NC_007503	ATC	2	6	26336	26341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78043206
538	NC_007503	TTC	2	6	26374	26379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043206
539	NC_007503	GGA	2	6	26442	26447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78043206
540	NC_007503	TA	3	6	26464	26469	50 %	50 %	0 %	0 %	78043206
541	NC_007503	CGG	2	6	26551	26556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043206
542	NC_007503	AAAG	2	8	26628	26635	75 %	0 %	25 %	0 %	78043206
543	NC_007503	TTAA	2	8	26772	26779	50 %	50 %	0 %	0 %	78043206
544	NC_007503	AGT	2	6	26828	26833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78043206
545	NC_007503	TAA	2	6	26875	26880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78043206
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548	NC_007503	T	6	6	27031	27036	0 %	100 %	0 %	0 %	78043206
549	NC_007503	TAC	2	6	27278	27283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78043206
550	NC_007503	CGG	2	6	27331	27336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043206
551	NC_007503	CTT	2	6	27361	27366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043206
552	NC_007503	AAATA	2	10	27485	27494	80 %	20 %	0 %	0 %	78043206
553	NC_007503	GGC	3	9	27605	27613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043206
554	NC_007503	CCGG	2	8	27636	27643	0 %	0 %	50 %	50 %	78043206
555	NC_007503	CTT	2	6	27667	27672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043206
556	NC_007503	TTTATC	2	12	27824	27835	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	78043206
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558	NC_007503	TACC	2	8	28183	28190	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_007503	TCC	2	6	28191	28196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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561	NC_007503	T	6	6	28208	28213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_007503	A	7	7	28231	28237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_007503	TAC	2	6	28293	28298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_007503	GAG	2	6	28337	28342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_007503	GTAA	2	8	28345	28352	50 %	25 %	25 %	0 %	78042831
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573	NC_007503	GAT	2	6	28601	28606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78042831
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592	NC_007503	T	6	6	29461	29466	0 %	100 %	0 %	0 %	78044007
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598	NC_007503	TTC	2	6	29652	29657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78044007
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600	NC_007503	AACC	2	8	29757	29764	50 %	0 %	0 %	50 %	78044007
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603	NC_007503	GGA	2	6	29872	29877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78044007
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616	NC_007503	AGA	2	6	30863	30868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78043341
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619	NC_007503	A	8	8	30924	30931	100 %	0 %	0 %	0 %	78043822
620	NC_007503	AGA	2	6	31036	31041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78043822
621	NC_007503	TCCC	2	8	31078	31085	0 %	25 %	0 %	75 %	78043822
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