MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 chromosome

Total Repeats: 50308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_007503	AAAAT	2	10	238492	238501	80 %	20 %	0 %	0 %	78044116
5003	NC_007503	TGG	3	9	238516	238524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78044116
5004	NC_007503	T	6	6	238542	238547	0 %	100 %	0 %	0 %	78044116
5005	NC_007503	TAT	2	6	238630	238635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044116
5006	NC_007503	GAAA	2	8	238713	238720	75 %	0 %	25 %	0 %	78044116
5007	NC_007503	GCA	2	6	238831	238836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78044116
5008	NC_007503	TTA	2	6	238897	238902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044116
5009	NC_007503	T	6	6	238913	238918	0 %	100 %	0 %	0 %	78044116
5010	NC_007503	A	6	6	239007	239012	100 %	0 %	0 %	0 %	78044116
5011	NC_007503	AAG	2	6	239065	239070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044116
5012	NC_007503	CGGT	2	8	239118	239125	0 %	25 %	50 %	25 %	78044116
5013	NC_007503	AGA	2	6	239156	239161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044116
5014	NC_007503	A	7	7	239161	239167	100 %	0 %	0 %	0 %	78044116
5015	NC_007503	GGA	2	6	239210	239215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78044116
5016	NC_007503	A	6	6	239227	239232	100 %	0 %	0 %	0 %	78043705
5017	NC_007503	TATT	2	8	239233	239240	25 %	75 %	0 %	0 %	78043705
5018	NC_007503	TTA	2	6	239282	239287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043705
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5020	NC_007503	T	7	7	239378	239384	0 %	100 %	0 %	0 %	78043705
5021	NC_007503	GAA	2	6	239461	239466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78043705
5022	NC_007503	A	6	6	239478	239483	100 %	0 %	0 %	0 %	78043705
5023	NC_007503	TGG	3	9	239514	239522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043705
5024	NC_007503	GGA	2	6	239602	239607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78043705
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5029	NC_007503	T	6	6	239810	239815	0 %	100 %	0 %	0 %	78043705
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5034	NC_007503	TCCA	2	8	239963	239970	25 %	25 %	0 %	50 %	78043705
5035	NC_007503	GTG	2	6	240085	240090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043705
5036	NC_007503	TTATG	2	10	240123	240132	20 %	60 %	20 %	0 %	78043705
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5041	NC_007503	GGAA	2	8	240425	240432	50 %	0 %	50 %	0 %	78043705
5042	NC_007503	A	6	6	240440	240445	100 %	0 %	0 %	0 %	78043705
5043	NC_007503	CTTT	2	8	240538	240545	0 %	75 %	0 %	25 %	78044641
5044	NC_007503	CGG	2	6	240627	240632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78044641
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5050	NC_007503	A	7	7	241048	241054	100 %	0 %	0 %	0 %	78044641
5051	NC_007503	A	7	7	241137	241143	100 %	0 %	0 %	0 %	78044641
5052	NC_007503	ACT	2	6	241162	241167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78044641
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5054	NC_007503	TCCT	2	8	241340	241347	0 %	50 %	0 %	50 %	78044641
5055	NC_007503	GGT	2	6	241390	241395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78044641
5056	NC_007503	T	7	7	241408	241414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_007503	GGT	2	6	241417	241422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_007503	AGA	2	6	241449	241454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044140
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5061	NC_007503	T	6	6	241581	241586	0 %	100 %	0 %	0 %	78044140
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5065	NC_007503	A	7	7	241667	241673	100 %	0 %	0 %	0 %	78044140
5066	NC_007503	TAT	2	6	241678	241683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044140
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5099	NC_007503	GAG	2	6	243334	243339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78044467
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5105	NC_007503	GGAGCG	2	12	243734	243745	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	78042659
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5107	NC_007503	TCC	2	6	243763	243768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	78042659
5108	NC_007503	GCCC	2	8	243790	243797	0 %	0 %	25 %	75 %	78042659
5109	NC_007503	GTG	2	6	243800	243805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78042659
5110	NC_007503	A	7	7	243806	243812	100 %	0 %	0 %	0 %	78042659
5111	NC_007503	ACT	2	6	243841	243846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045229
5112	NC_007503	T	7	7	243874	243880	0 %	100 %	0 %	0 %	78045229
5113	NC_007503	GCT	3	9	243881	243889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78045229
5114	NC_007503	ATTT	2	8	243895	243902	25 %	75 %	0 %	0 %	78045229
5115	NC_007503	T	8	8	244014	244021	0 %	100 %	0 %	0 %	78045229
5116	NC_007503	GAT	2	6	244067	244072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045229
5117	NC_007503	T	7	7	244159	244165	0 %	100 %	0 %	0 %	78045229
5118	NC_007503	A	6	6	244224	244229	100 %	0 %	0 %	0 %	78045229
5119	NC_007503	TGT	2	6	244268	244273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045229
5120	NC_007503	GTT	2	6	244332	244337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045229
5121	NC_007503	AAG	2	6	244402	244407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_007503	ATT	2	6	244430	244435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_007503	TCT	2	6	244449	244454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_007503	CAG	2	6	244591	244596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78044494
5125	NC_007503	GAAATT	2	12	244618	244629	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	78044494
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5127	NC_007503	GAA	2	6	244747	244752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044494
5128	NC_007503	AGC	2	6	244783	244788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78044494
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5144	NC_007503	A	6	6	245380	245385	100 %	0 %	0 %	0 %	78044494
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5153	NC_007503	A	6	6	246037	246042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5154	NC_007503	T	7	7	246131	246137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5155	NC_007503	TAATT	2	10	246139	246148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5156	NC_007503	AGG	2	6	246157	246162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5157	NC_007503	GAAATT	2	12	246245	246256	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	78043763
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5163	NC_007503	TGC	2	6	246657	246662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78043763
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