MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A/HAR-13 plasmid pCTA

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007430	T	7	7	375	381	0 %	100 %	0 %	0 %	76789624
2	NC_007430	A	6	6	409	414	100 %	0 %	0 %	0 %	76789624
3	NC_007430	A	8	8	520	527	100 %	0 %	0 %	0 %	76789624
4	NC_007430	A	6	6	580	585	100 %	0 %	0 %	0 %	76789624
5	NC_007430	T	6	6	845	850	0 %	100 %	0 %	0 %	76789624
6	NC_007430	T	6	6	991	996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007430	T	6	6	1657	1662	0 %	100 %	0 %	0 %	76789625
8	NC_007430	T	8	8	1884	1891	0 %	100 %	0 %	0 %	76789625
9	NC_007430	A	6	6	1892	1897	100 %	0 %	0 %	0 %	76789625
10	NC_007430	T	7	7	1910	1916	0 %	100 %	0 %	0 %	76789625
11	NC_007430	A	6	6	2097	2102	100 %	0 %	0 %	0 %	76789626
12	NC_007430	T	7	7	2482	2488	0 %	100 %	0 %	0 %	76789626
13	NC_007430	T	6	6	2620	2625	0 %	100 %	0 %	0 %	76789626
14	NC_007430	A	6	6	2700	2705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007430	T	6	6	2801	2806	0 %	100 %	0 %	0 %	76789627
16	NC_007430	T	6	6	2995	3000	0 %	100 %	0 %	0 %	76789627
17	NC_007430	A	6	6	3152	3157	100 %	0 %	0 %	0 %	76789628
18	NC_007430	T	6	6	3929	3934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007430	T	6	6	4073	4078	0 %	100 %	0 %	0 %	76789629
20	NC_007430	T	7	7	4177	4183	0 %	100 %	0 %	0 %	76789629
21	NC_007430	T	6	6	5047	5052	0 %	100 %	0 %	0 %	76789630
22	NC_007430	T	8	8	5838	5845	0 %	100 %	0 %	0 %	76789630
23	NC_007430	A	7	7	6402	6408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007430	T	6	6	6680	6685	0 %	100 %	0 %	0 %	76789631
25	NC_007430	A	6	6	6774	6779	100 %	0 %	0 %	0 %	76789631
26	NC_007430	T	6	6	6924	6929	0 %	100 %	0 %	0 %	76789631
27	NC_007430	A	8	8	6998	7005	100 %	0 %	0 %	0 %	76789631
28	NC_007430	T	6	6	7495	7500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.