MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis A/HAR-13

Total Repeats: 2883

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007429	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	76788712
2	NC_007429	GTTC	2	8	109	116	0 %	50 %	25 %	25 %	76788712
3	NC_007429	GCGT	2	8	294	301	0 %	25 %	50 %	25 %	76788712
4	NC_007429	AGTG	2	8	541	548	25 %	25 %	50 %	0 %	76788712
5	NC_007429	TGGC	2	8	575	582	0 %	25 %	50 %	25 %	76788712
6	NC_007429	AATG	2	8	1060	1067	50 %	25 %	25 %	0 %	76788712
7	NC_007429	CTAT	2	8	1394	1401	25 %	50 %	0 %	25 %	76788712
8	NC_007429	AAGG	2	8	1903	1910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007429	AGTA	2	8	2083	2090	50 %	25 %	25 %	0 %	76788713
10	NC_007429	ATGA	2	8	2487	2494	50 %	25 %	25 %	0 %	76788714
11	NC_007429	GATA	2	8	2525	2532	50 %	25 %	25 %	0 %	76788714
12	NC_007429	TTTC	2	8	2822	2829	0 %	75 %	0 %	25 %	76788715
13	NC_007429	CATG	2	8	3703	3710	25 %	25 %	25 %	25 %	76788715
14	NC_007429	TTCC	2	8	4008	4015	0 %	50 %	0 %	50 %	76788715
15	NC_007429	TTTA	2	8	4406	4413	25 %	75 %	0 %	0 %	76788716
16	NC_007429	ATCC	2	8	4706	4713	25 %	25 %	0 %	50 %	76788716
17	NC_007429	GACG	2	8	5453	5460	25 %	0 %	50 %	25 %	76788716
18	NC_007429	TTGG	2	8	5556	5563	0 %	50 %	50 %	0 %	76788716
19	NC_007429	TGGA	2	8	5917	5924	25 %	25 %	50 %	0 %	76788717
20	NC_007429	CTTT	2	8	6294	6301	0 %	75 %	0 %	25 %	76788717
21	NC_007429	GGGA	2	8	6809	6816	25 %	0 %	75 %	0 %	76788717
22	NC_007429	GGAG	2	8	6900	6907	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007429	GGTG	2	8	7112	7119	0 %	25 %	75 %	0 %	76788718
24	NC_007429	AAAT	2	8	7178	7185	75 %	25 %	0 %	0 %	76788718
25	NC_007429	TATG	2	8	7549	7556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007429	ATTT	2	8	7690	7697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007429	TTTG	2	8	7782	7789	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007429	AAGC	2	8	8416	8423	50 %	0 %	25 %	25 %	76788719
29	NC_007429	ATTG	2	8	8814	8821	25 %	50 %	25 %	0 %	76788720
30	NC_007429	AGCG	2	8	9281	9288	25 %	0 %	50 %	25 %	76788720
31	NC_007429	AAAG	2	8	9302	9309	75 %	0 %	25 %	0 %	76788720
32	NC_007429	CTTT	2	8	9642	9649	0 %	75 %	0 %	25 %	76788720
33	NC_007429	TATT	2	8	9905	9912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007429	TTCG	2	8	10014	10021	0 %	50 %	25 %	25 %	76788721
35	NC_007429	AATT	2	8	10119	10126	50 %	50 %	0 %	0 %	76788721
36	NC_007429	ATGG	2	8	10178	10185	25 %	25 %	50 %	0 %	76788721
37	NC_007429	CTTT	2	8	10803	10810	0 %	75 %	0 %	25 %	76788722
38	NC_007429	GCAA	2	8	11020	11027	50 %	0 %	25 %	25 %	76788722
39	NC_007429	AGCC	2	8	11250	11257	25 %	0 %	25 %	50 %	76788722
40	NC_007429	GAAA	2	8	11393	11400	75 %	0 %	25 %	0 %	76788722
41	NC_007429	AGAA	2	8	11797	11804	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007429	AATG	2	8	12135	12142	50 %	25 %	25 %	0 %	76788723
43	NC_007429	GTTT	2	8	13167	13174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007429	ATGC	2	8	13598	13605	25 %	25 %	25 %	25 %	76788724
45	NC_007429	AAGG	2	8	14033	14040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007429	TTGT	2	8	14634	14641	0 %	75 %	25 %	0 %	76788725
47	NC_007429	TTCT	2	8	14805	14812	0 %	75 %	0 %	25 %	76788725
48	NC_007429	ATTT	2	8	15011	15018	25 %	75 %	0 %	0 %	76788725
49	NC_007429	TTTC	2	8	15673	15680	0 %	75 %	0 %	25 %	76788726
50	NC_007429	AAAT	2	8	16155	16162	75 %	25 %	0 %	0 %	76788726
51	NC_007429	CAAA	2	8	16667	16674	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007429	GTAA	2	8	16997	17004	50 %	25 %	25 %	0 %	76788727
53	NC_007429	CTAA	2	8	17190	17197	50 %	25 %	0 %	25 %	76788727
54	NC_007429	AGAA	2	8	17453	17460	75 %	0 %	25 %	0 %	76788727
55	NC_007429	ATTT	2	8	17599	17606	25 %	75 %	0 %	0 %	76788727
56	NC_007429	TGCG	2	8	19121	19128	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007429	GAAG	2	8	20105	20112	50 %	0 %	50 %	0 %	76788729
58	NC_007429	TTTG	2	8	20131	20138	0 %	75 %	25 %	0 %	76788729
59	NC_007429	TGTA	2	8	20823	20830	25 %	50 %	25 %	0 %	76788730
60	NC_007429	CGCT	2	8	21863	21870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007429	TTAA	2	8	21884	21891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007429	GTTA	2	8	21921	21928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007429	GATC	2	8	21976	21983	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007429	GATG	2	8	22239	22246	25 %	25 %	50 %	0 %	76788731
65	NC_007429	CATT	2	8	23298	23305	25 %	50 %	0 %	25 %	76788731
66	NC_007429	GCTT	2	8	23641	23648	0 %	50 %	25 %	25 %	76788731
67	NC_007429	GGTT	2	8	23689	23696	0 %	50 %	50 %	0 %	76788731
68	NC_007429	TTCT	2	8	24059	24066	0 %	75 %	0 %	25 %	76788731
69	NC_007429	TAAC	2	8	24161	24168	50 %	25 %	0 %	25 %	76788731
70	NC_007429	CATT	2	8	24284	24291	25 %	50 %	0 %	25 %	76788731
71	NC_007429	GGTA	2	8	24654	24661	25 %	25 %	50 %	0 %	76788731
72	NC_007429	TTGA	2	8	25651	25658	25 %	50 %	25 %	0 %	76788732
73	NC_007429	TTCG	2	8	25796	25803	0 %	50 %	25 %	25 %	76788732
74	NC_007429	TAGG	2	8	25875	25882	25 %	25 %	50 %	0 %	76788732
75	NC_007429	TTCC	2	8	25999	26006	0 %	50 %	0 %	50 %	76788732
76	NC_007429	TAGG	2	8	26113	26120	25 %	25 %	50 %	0 %	76788732
77	NC_007429	GCTT	2	8	26885	26892	0 %	50 %	25 %	25 %	76788732
78	NC_007429	GGAA	2	8	27468	27475	50 %	0 %	50 %	0 %	76788733
79	NC_007429	TTAA	2	8	27541	27548	50 %	50 %	0 %	0 %	76788733
80	NC_007429	AAAG	2	8	27591	27598	75 %	0 %	25 %	0 %	76788733
81	NC_007429	GGGC	2	8	27871	27878	0 %	0 %	75 %	25 %	76788733
82	NC_007429	CAGA	2	8	28176	28183	50 %	0 %	25 %	25 %	76788734
83	NC_007429	ATTG	2	8	28535	28542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007429	CTTT	2	8	30148	30155	0 %	75 %	0 %	25 %	76788736
85	NC_007429	TTTG	2	8	30163	30170	0 %	75 %	25 %	0 %	76788736
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88	NC_007429	AAAG	2	8	30921	30928	75 %	0 %	25 %	0 %	76788737
89	NC_007429	AAAC	2	8	30991	30998	75 %	0 %	0 %	25 %	76788737
90	NC_007429	GATG	2	8	31134	31141	25 %	25 %	50 %	0 %	76788737
91	NC_007429	GATA	2	8	32243	32250	50 %	25 %	25 %	0 %	76788739
92	NC_007429	TGAT	2	8	34737	34744	25 %	50 %	25 %	0 %	76788742
93	NC_007429	AAGA	3	12	34865	34876	75 %	0 %	25 %	0 %	76788742
94	NC_007429	AAGC	2	8	35085	35092	50 %	0 %	25 %	25 %	76788743
95	NC_007429	GTTC	2	8	35118	35125	0 %	50 %	25 %	25 %	76788743
96	NC_007429	GGCA	2	8	35497	35504	25 %	0 %	50 %	25 %	76788744
97	NC_007429	TCGA	2	8	35754	35761	25 %	25 %	25 %	25 %	76788744
98	NC_007429	TGCT	2	8	35907	35914	0 %	50 %	25 %	25 %	76788744
99	NC_007429	TATG	2	8	36050	36057	25 %	50 %	25 %	0 %	76788744
100	NC_007429	TTGG	2	8	36139	36146	0 %	50 %	50 %	0 %	76788744
101	NC_007429	AGAT	2	8	36859	36866	50 %	25 %	25 %	0 %	76788744
102	NC_007429	CTTT	2	8	37232	37239	0 %	75 %	0 %	25 %	76788745
103	NC_007429	ATGA	2	8	37722	37729	50 %	25 %	25 %	0 %	76788745
104	NC_007429	TAGG	2	8	37881	37888	25 %	25 %	50 %	0 %	76788745
105	NC_007429	CAAT	2	8	38065	38072	50 %	25 %	0 %	25 %	76788745
106	NC_007429	AATG	2	8	38852	38859	50 %	25 %	25 %	0 %	76788745
107	NC_007429	AGAA	2	8	39689	39696	75 %	0 %	25 %	0 %	76788746
108	NC_007429	AAGA	2	8	39741	39748	75 %	0 %	25 %	0 %	76788746
109	NC_007429	ATCC	2	8	39749	39756	25 %	25 %	0 %	50 %	76788746
110	NC_007429	TAAT	2	8	39960	39967	50 %	50 %	0 %	0 %	76788746
111	NC_007429	GTGC	2	8	42049	42056	0 %	25 %	50 %	25 %	76788748
112	NC_007429	AGAA	2	8	42468	42475	75 %	0 %	25 %	0 %	76788748
113	NC_007429	GGAT	2	8	42620	42627	25 %	25 %	50 %	0 %	76788748
114	NC_007429	AAAC	2	8	43829	43836	75 %	0 %	0 %	25 %	76788751
115	NC_007429	CAAT	2	8	44033	44040	50 %	25 %	0 %	25 %	76788751
116	NC_007429	TGTT	2	8	44413	44420	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007429	AATA	2	8	44652	44659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007429	ATTT	2	8	44790	44797	25 %	75 %	0 %	0 %	76788753
119	NC_007429	GCTC	2	8	45098	45105	0 %	25 %	25 %	50 %	76788753
120	NC_007429	TTCT	2	8	45240	45247	0 %	75 %	0 %	25 %	76788753
121	NC_007429	TTGA	2	8	45840	45847	25 %	50 %	25 %	0 %	76788754
122	NC_007429	TGTT	2	8	46012	46019	0 %	75 %	25 %	0 %	76788754
123	NC_007429	CTAT	2	8	46042	46049	25 %	50 %	0 %	25 %	76788754
124	NC_007429	TGTT	2	8	46071	46078	0 %	75 %	25 %	0 %	76788754
125	NC_007429	CTAT	2	8	46367	46374	25 %	50 %	0 %	25 %	76788754
126	NC_007429	AAGA	2	8	46862	46869	75 %	0 %	25 %	0 %	76788755
127	NC_007429	AAGA	2	8	46919	46926	75 %	0 %	25 %	0 %	76788755
128	NC_007429	AAAG	2	8	46959	46966	75 %	0 %	25 %	0 %	76788755
129	NC_007429	AAGA	2	8	47074	47081	75 %	0 %	25 %	0 %	76788755
130	NC_007429	ACTT	2	8	47335	47342	25 %	50 %	0 %	25 %	76788755
131	NC_007429	ATGG	2	8	47961	47968	25 %	25 %	50 %	0 %	76788755
132	NC_007429	AGGA	2	8	47992	47999	50 %	0 %	50 %	0 %	76788755
133	NC_007429	GAAC	2	8	48539	48546	50 %	0 %	25 %	25 %	76788755
134	NC_007429	AAGT	2	8	48574	48581	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007429	AACA	2	8	48783	48790	75 %	0 %	0 %	25 %	76788756
136	NC_007429	CTTT	2	8	48979	48986	0 %	75 %	0 %	25 %	76788756
137	NC_007429	CTTT	2	8	49863	49870	0 %	75 %	0 %	25 %	76788757
138	NC_007429	GTAG	2	8	49881	49888	25 %	25 %	50 %	0 %	76788757
139	NC_007429	GAAG	2	8	51309	51316	50 %	0 %	50 %	0 %	76788758
140	NC_007429	TTCA	2	8	51731	51738	25 %	50 %	0 %	25 %	76788758
141	NC_007429	TATT	2	8	52773	52780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007429	GGAA	2	8	53004	53011	50 %	0 %	50 %	0 %	76788760
143	NC_007429	TTAA	2	8	53745	53752	50 %	50 %	0 %	0 %	76788760
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