MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 chromosome

Total Repeats: 7998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005861	TTAA	2	8	45	52	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005861	TGAT	2	8	1037	1044	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005861	AAGA	2	8	1173	1180	75 %	0 %	25 %	0 %	46445637
4	NC_005861	AATT	2	8	1333	1340	50 %	50 %	0 %	0 %	46445637
5	NC_005861	AAAC	2	8	2126	2133	75 %	0 %	0 %	25 %	46445637
6	NC_005861	TTTG	2	8	2170	2177	0 %	75 %	25 %	0 %	46445637
7	NC_005861	CTTA	2	8	3150	3157	25 %	50 %	0 %	25 %	46445637
8	NC_005861	GAAG	2	8	3158	3165	50 %	0 %	50 %	0 %	46445637
9	NC_005861	CATT	2	8	3341	3348	25 %	50 %	0 %	25 %	46445637
10	NC_005861	GAAA	2	8	3574	3581	75 %	0 %	25 %	0 %	46445637
11	NC_005861	AATT	2	8	4079	4086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005861	TTTG	2	8	4091	4098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005861	ATTG	2	8	5250	5257	25 %	50 %	25 %	0 %	46445638
14	NC_005861	TTCA	2	8	6087	6094	25 %	50 %	0 %	25 %	46445639
15	NC_005861	GTAG	2	8	6828	6835	25 %	25 %	50 %	0 %	46445639
16	NC_005861	AAGA	2	8	7078	7085	75 %	0 %	25 %	0 %	46445639
17	NC_005861	GTTT	2	8	7482	7489	0 %	75 %	25 %	0 %	46445639
18	NC_005861	ACAA	2	8	7597	7604	75 %	0 %	0 %	25 %	46445639
19	NC_005861	AAAT	2	8	8035	8042	75 %	25 %	0 %	0 %	46445639
20	NC_005861	ATAA	2	8	8085	8092	75 %	25 %	0 %	0 %	46445639
21	NC_005861	AAAT	2	8	8185	8192	75 %	25 %	0 %	0 %	46445639
22	NC_005861	GACA	2	8	8199	8206	50 %	0 %	25 %	25 %	46445639
23	NC_005861	ATTT	2	8	8232	8239	25 %	75 %	0 %	0 %	46445639
24	NC_005861	ATGA	2	8	8364	8371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005861	AATT	2	8	8578	8585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005861	CTTT	2	8	9346	9353	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_005861	CAAT	2	8	9392	9399	50 %	25 %	0 %	25 %	46445641
28	NC_005861	AATA	2	8	9634	9641	75 %	25 %	0 %	0 %	46445641
29	NC_005861	ATAC	2	8	9660	9667	50 %	25 %	0 %	25 %	46445641
30	NC_005861	TGAA	2	8	11076	11083	50 %	25 %	25 %	0 %	46445641
31	NC_005861	CAAT	2	8	11092	11099	50 %	25 %	0 %	25 %	46445641
32	NC_005861	TTAA	2	8	11198	11205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005861	ATGG	2	8	11425	11432	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005861	ATTT	2	8	11483	11490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005861	AAGG	2	8	11804	11811	50 %	0 %	50 %	0 %	46445642
36	NC_005861	AGTG	2	8	13255	13262	25 %	25 %	50 %	0 %	46445642
37	NC_005861	TTTC	2	8	13797	13804	0 %	75 %	0 %	25 %	46445642
38	NC_005861	TTAT	2	8	14047	14054	25 %	75 %	0 %	0 %	46445642
39	NC_005861	GTTA	2	8	14093	14100	25 %	50 %	25 %	0 %	46445642
40	NC_005861	TACC	2	8	14110	14117	25 %	25 %	0 %	50 %	46445642
41	NC_005861	GTAA	2	8	14219	14226	50 %	25 %	25 %	0 %	46445642
42	NC_005861	ATTT	2	8	14362	14369	25 %	75 %	0 %	0 %	46445642
43	NC_005861	TCCT	2	8	14394	14401	0 %	50 %	0 %	50 %	46445642
44	NC_005861	TGAT	2	8	14412	14419	25 %	50 %	25 %	0 %	46445642
45	NC_005861	ATTT	2	8	14483	14490	25 %	75 %	0 %	0 %	46445642
46	NC_005861	TAAA	2	8	14547	14554	75 %	25 %	0 %	0 %	46445642
47	NC_005861	GAAA	2	8	14978	14985	75 %	0 %	25 %	0 %	46445642
48	NC_005861	ATTA	2	8	15059	15066	50 %	50 %	0 %	0 %	46445642
49	NC_005861	CTAT	2	8	15074	15081	25 %	50 %	0 %	25 %	46445642
50	NC_005861	TTCC	2	8	15114	15121	0 %	50 %	0 %	50 %	46445642
51	NC_005861	AATG	2	8	15589	15596	50 %	25 %	25 %	0 %	46445643
52	NC_005861	ATTA	2	8	16134	16141	50 %	50 %	0 %	0 %	46445643
53	NC_005861	TTTG	2	8	16161	16168	0 %	75 %	25 %	0 %	46445643
54	NC_005861	AATT	2	8	16202	16209	50 %	50 %	0 %	0 %	46445643
55	NC_005861	TTAT	2	8	16599	16606	25 %	75 %	0 %	0 %	46445643
56	NC_005861	TCAA	2	8	16850	16857	50 %	25 %	0 %	25 %	46445643
57	NC_005861	TTGG	2	8	17222	17229	0 %	50 %	50 %	0 %	46445643
58	NC_005861	AGCA	2	8	18213	18220	50 %	0 %	25 %	25 %	46445643
59	NC_005861	ATTA	2	8	18522	18529	50 %	50 %	0 %	0 %	46445643
60	NC_005861	ATTT	2	8	18799	18806	25 %	75 %	0 %	0 %	46445643
61	NC_005861	TTGG	2	8	18917	18924	0 %	50 %	50 %	0 %	46445644
62	NC_005861	ATCA	2	8	19041	19048	50 %	25 %	0 %	25 %	46445644
63	NC_005861	AAAC	2	8	19367	19374	75 %	0 %	0 %	25 %	46445644
64	NC_005861	AATG	2	8	19431	19438	50 %	25 %	25 %	0 %	46445644
65	NC_005861	TTAT	2	8	19829	19836	25 %	75 %	0 %	0 %	46445644
66	NC_005861	GTTT	2	8	19968	19975	0 %	75 %	25 %	0 %	46445644
67	NC_005861	ACAA	2	8	20341	20348	75 %	0 %	0 %	25 %	46445644
68	NC_005861	ATTT	2	8	20714	20721	25 %	75 %	0 %	0 %	46445644
69	NC_005861	TAAA	2	8	20787	20794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005861	ATTT	2	8	20797	20804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005861	TAAA	2	8	20951	20958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005861	TATG	2	8	21446	21453	25 %	50 %	25 %	0 %	46445645
73	NC_005861	GAAG	2	8	21830	21837	50 %	0 %	50 %	0 %	46445646
74	NC_005861	AAAT	2	8	22024	22031	75 %	25 %	0 %	0 %	46445646
75	NC_005861	GTGA	2	8	23032	23039	25 %	25 %	50 %	0 %	46445646
76	NC_005861	TGAA	2	8	23718	23725	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005861	TAAT	3	12	23750	23761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005861	TAGT	2	8	24642	24649	25 %	50 %	25 %	0 %	46445647
79	NC_005861	GAAA	2	8	24799	24806	75 %	0 %	25 %	0 %	46445647
80	NC_005861	AGAA	2	8	25343	25350	75 %	0 %	25 %	0 %	46445648
81	NC_005861	TTGG	2	8	25377	25384	0 %	50 %	50 %	0 %	46445648
82	NC_005861	AGAA	2	8	25772	25779	75 %	0 %	25 %	0 %	46445648
83	NC_005861	GCAC	2	8	26237	26244	25 %	0 %	25 %	50 %	46445649
84	NC_005861	CATG	2	8	26521	26528	25 %	25 %	25 %	25 %	46445649
85	NC_005861	TCTA	2	8	26618	26625	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_005861	TACA	2	8	26741	26748	50 %	25 %	0 %	25 %	46445650
87	NC_005861	ATTT	2	8	26773	26780	25 %	75 %	0 %	0 %	46445650
88	NC_005861	GATA	2	8	26878	26885	50 %	25 %	25 %	0 %	46445650
89	NC_005861	AGGG	2	8	27548	27555	25 %	0 %	75 %	0 %	46445650
90	NC_005861	TTAA	2	8	27930	27937	50 %	50 %	0 %	0 %	46445650
91	NC_005861	AATA	2	8	28227	28234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005861	ACTG	2	8	28275	28282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_005861	CAAC	2	8	29188	29195	50 %	0 %	0 %	50 %	46445651
94	NC_005861	CTTA	2	8	29612	29619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_005861	AAAT	2	8	29633	29640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005861	TTTA	2	8	29748	29755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005861	ATTT	2	8	29773	29780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005861	CAAA	2	8	29889	29896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_005861	ATTT	2	8	30149	30156	25 %	75 %	0 %	0 %	46445652
100	NC_005861	AAAC	2	8	30492	30499	75 %	0 %	0 %	25 %	46445652
101	NC_005861	CAAG	2	8	30503	30510	50 %	0 %	25 %	25 %	46445652
102	NC_005861	TGAA	2	8	30835	30842	50 %	25 %	25 %	0 %	46445652
103	NC_005861	GAAA	2	8	30911	30918	75 %	0 %	25 %	0 %	46445652
104	NC_005861	TGAA	2	8	31015	31022	50 %	25 %	25 %	0 %	46445652
105	NC_005861	TTTG	2	8	31529	31536	0 %	75 %	25 %	0 %	46445652
106	NC_005861	AGCA	2	8	31939	31946	50 %	0 %	25 %	25 %	46445653
107	NC_005861	AATG	2	8	32329	32336	50 %	25 %	25 %	0 %	46445654
108	NC_005861	GAGC	2	8	32389	32396	25 %	0 %	50 %	25 %	46445654
109	NC_005861	AATT	2	8	32679	32686	50 %	50 %	0 %	0 %	46445654
110	NC_005861	AAAT	2	8	32815	32822	75 %	25 %	0 %	0 %	46445655
111	NC_005861	TGTT	2	8	32883	32890	0 %	75 %	25 %	0 %	46445655
112	NC_005861	TGCT	2	8	33182	33189	0 %	50 %	25 %	25 %	46445655
113	NC_005861	TAAG	2	8	33260	33267	50 %	25 %	25 %	0 %	46445655
114	NC_005861	TTGA	2	8	34225	34232	25 %	50 %	25 %	0 %	46445656
115	NC_005861	TTTA	2	8	35546	35553	25 %	75 %	0 %	0 %	46445657
116	NC_005861	GTAG	2	8	35572	35579	25 %	25 %	50 %	0 %	46445657
117	NC_005861	AGGA	2	8	35679	35686	50 %	0 %	50 %	0 %	46445657
118	NC_005861	CAAA	2	8	36366	36373	75 %	0 %	0 %	25 %	46445658
119	NC_005861	ACAA	2	8	37258	37265	75 %	0 %	0 %	25 %	46445659
120	NC_005861	TCTT	2	8	37421	37428	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_005861	CATT	2	8	37523	37530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_005861	GCAT	2	8	37961	37968	25 %	25 %	25 %	25 %	46445660
123	NC_005861	CGAA	2	8	38438	38445	50 %	0 %	25 %	25 %	46445660
124	NC_005861	ATAA	2	8	38953	38960	75 %	25 %	0 %	0 %	46445660
125	NC_005861	TCAA	2	8	39098	39105	50 %	25 %	0 %	25 %	46445660
126	NC_005861	TAAA	2	8	39156	39163	75 %	25 %	0 %	0 %	46445660
127	NC_005861	TTTG	2	8	39786	39793	0 %	75 %	25 %	0 %	46445660
128	NC_005861	GAAC	2	8	39862	39869	50 %	0 %	25 %	25 %	46445660
129	NC_005861	AATT	2	8	40035	40042	50 %	50 %	0 %	0 %	46445660
130	NC_005861	TAAC	2	8	40994	41001	50 %	25 %	0 %	25 %	46445660
131	NC_005861	ATTT	2	8	41121	41128	25 %	75 %	0 %	0 %	46445660
132	NC_005861	CTTG	2	8	41747	41754	0 %	50 %	25 %	25 %	46445660
133	NC_005861	TGGT	2	8	41779	41786	0 %	50 %	50 %	0 %	46445660
134	NC_005861	TGTT	2	8	41918	41925	0 %	75 %	25 %	0 %	46445660
135	NC_005861	TAAT	2	8	42085	42092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005861	AATT	2	8	42164	42171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005861	AATA	2	8	42278	42285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005861	ATTG	2	8	42501	42508	25 %	50 %	25 %	0 %	46445661
139	NC_005861	CTTT	2	8	42561	42568	0 %	75 %	0 %	25 %	46445661
140	NC_005861	GGAA	2	8	42579	42586	50 %	0 %	50 %	0 %	46445661
141	NC_005861	CAAA	2	8	43017	43024	75 %	0 %	0 %	25 %	46445661
142	NC_005861	CTTT	2	8	43180	43187	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_005861	AATA	2	8	43201	43208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005861	ATAA	2	8	43380	43387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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