MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 chromosome

Total Repeats: 56234

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_005861	CAC	2	6	196227	196232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46445760
4502	NC_005861	AGA	2	6	196283	196288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445760
4503	NC_005861	ATC	2	6	196357	196362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445760
4504	NC_005861	GTA	2	6	196396	196401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445760
4505	NC_005861	TGTA	2	8	196516	196523	25 %	50 %	25 %	0 %	46445760
4506	NC_005861	GAA	2	6	196564	196569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445760
4507	NC_005861	TGG	2	6	196589	196594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46445760
4508	NC_005861	TTGAT	2	10	196615	196624	20 %	60 %	20 %	0 %	46445760
4509	NC_005861	ATC	2	6	196632	196637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445760
4510	NC_005861	TCA	2	6	196687	196692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445760
4511	NC_005861	ATTG	2	8	196734	196741	25 %	50 %	25 %	0 %	46445760
4512	NC_005861	GAA	2	6	196788	196793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445760
4513	NC_005861	TACA	2	8	196818	196825	50 %	25 %	0 %	25 %	46445760
4514	NC_005861	A	6	6	196841	196846	100 %	0 %	0 %	0 %	46445760
4515	NC_005861	T	7	7	196912	196918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_005861	T	8	8	196970	196977	0 %	100 %	0 %	0 %	46445761
4517	NC_005861	CAT	2	6	197034	197039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445761
4518	NC_005861	TAA	2	6	197047	197052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445761
4519	NC_005861	TCC	3	9	197242	197250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445761
4520	NC_005861	A	6	6	197341	197346	100 %	0 %	0 %	0 %	46445761
4521	NC_005861	A	6	6	197368	197373	100 %	0 %	0 %	0 %	46445761
4522	NC_005861	TAAA	2	8	197391	197398	75 %	25 %	0 %	0 %	46445761
4523	NC_005861	TGT	2	6	197461	197466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445761
4524	NC_005861	AGA	2	6	197509	197514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445761
4525	NC_005861	ATT	2	6	197528	197533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445761
4526	NC_005861	A	6	6	197620	197625	100 %	0 %	0 %	0 %	46445761
4527	NC_005861	ATA	2	6	197713	197718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445761
4528	NC_005861	A	7	7	197816	197822	100 %	0 %	0 %	0 %	46445761
4529	NC_005861	TAAAAG	2	12	197848	197859	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46445761
4530	NC_005861	GAG	2	6	197898	197903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445761
4531	NC_005861	A	6	6	197939	197944	100 %	0 %	0 %	0 %	46445761
4532	NC_005861	A	6	6	197964	197969	100 %	0 %	0 %	0 %	46445761
4533	NC_005861	AT	3	6	197996	198001	50 %	50 %	0 %	0 %	46445761
4534	NC_005861	CCT	2	6	198002	198007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445761
4535	NC_005861	ATC	2	6	198041	198046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445761
4536	NC_005861	T	8	8	198070	198077	0 %	100 %	0 %	0 %	46445761
4537	NC_005861	CAG	2	6	198129	198134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445761
4538	NC_005861	A	6	6	198210	198215	100 %	0 %	0 %	0 %	46445761
4539	NC_005861	GCT	2	6	198257	198262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46445761
4540	NC_005861	AACC	2	8	198263	198270	50 %	0 %	0 %	50 %	46445761
4541	NC_005861	TAAT	2	8	198438	198445	50 %	50 %	0 %	0 %	46445761
4542	NC_005861	AAT	2	6	198503	198508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445762
4543	NC_005861	ATCG	2	8	198595	198602	25 %	25 %	25 %	25 %	46445762
4544	NC_005861	ACA	3	9	198624	198632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445762
4545	NC_005861	GAG	2	6	198742	198747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445762
4546	NC_005861	A	6	6	198757	198762	100 %	0 %	0 %	0 %	46445762
4547	NC_005861	TTCCAG	2	12	198766	198777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46445762
4548	NC_005861	GAA	2	6	198813	198818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445762
4549	NC_005861	AAT	2	6	198917	198922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445762
4550	NC_005861	AG	3	6	198930	198935	50 %	0 %	50 %	0 %	46445762
4551	NC_005861	GTT	2	6	198939	198944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445762
4552	NC_005861	GAT	2	6	199069	199074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445762
4553	NC_005861	ATG	2	6	199081	199086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445762
4554	NC_005861	AGC	2	6	199097	199102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445762
4555	NC_005861	TCT	2	6	199233	199238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445762
4556	NC_005861	T	8	8	199280	199287	0 %	100 %	0 %	0 %	46445762
4557	NC_005861	GTT	2	6	199306	199311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445762
4558	NC_005861	AGCT	2	8	199331	199338	25 %	25 %	25 %	25 %	46445762
4559	NC_005861	TAT	2	6	199420	199425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445762
4560	NC_005861	CAT	2	6	199495	199500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445762
4561	NC_005861	AATA	2	8	199534	199541	75 %	25 %	0 %	0 %	46445762
4562	NC_005861	GTT	2	6	199542	199547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445762
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4564	NC_005861	A	7	7	199563	199569	100 %	0 %	0 %	0 %	46445762
4565	NC_005861	A	8	8	199571	199578	100 %	0 %	0 %	0 %	46445762
4566	NC_005861	TAA	2	6	199583	199588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445762
4567	NC_005861	T	7	7	199600	199606	0 %	100 %	0 %	0 %	46445762
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4569	NC_005861	TAG	2	6	199648	199653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445762
4570	NC_005861	TAT	2	6	199681	199686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_005861	TCT	2	6	199693	199698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445763
4572	NC_005861	TAAA	2	8	199719	199726	75 %	25 %	0 %	0 %	46445763
4573	NC_005861	AC	3	6	199788	199793	50 %	0 %	0 %	50 %	46445763
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4584	NC_005861	TAA	2	6	200111	200116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445763
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4592	NC_005861	T	6	6	200635	200640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_005861	TA	3	6	200663	200668	50 %	50 %	0 %	0 %	46445764
4594	NC_005861	AGTA	2	8	200692	200699	50 %	25 %	25 %	0 %	46445764
4595	NC_005861	A	6	6	200729	200734	100 %	0 %	0 %	0 %	46445764
4596	NC_005861	T	7	7	200735	200741	0 %	100 %	0 %	0 %	46445764
4597	NC_005861	T	7	7	200752	200758	0 %	100 %	0 %	0 %	46445764
4598	NC_005861	GAA	2	6	200782	200787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445764
4599	NC_005861	CAAAC	2	10	200789	200798	60 %	0 %	0 %	40 %	46445764
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4604	NC_005861	TTCT	2	8	200888	200895	0 %	75 %	0 %	25 %	46445764
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4606	NC_005861	T	7	7	200949	200955	0 %	100 %	0 %	0 %	46445764
4607	NC_005861	A	7	7	201038	201044	100 %	0 %	0 %	0 %	46445764
4608	NC_005861	A	6	6	201066	201071	100 %	0 %	0 %	0 %	46445764
4609	NC_005861	AATC	2	8	201110	201117	50 %	25 %	0 %	25 %	46445765
4610	NC_005861	TTC	2	6	201125	201130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445765
4611	NC_005861	TAA	2	6	201185	201190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445765
4612	NC_005861	T	6	6	201239	201244	0 %	100 %	0 %	0 %	46445765
4613	NC_005861	CAA	2	6	201250	201255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445765
4614	NC_005861	CAG	2	6	201265	201270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445765
4615	NC_005861	T	6	6	201294	201299	0 %	100 %	0 %	0 %	46445765
4616	NC_005861	AAGT	2	8	201313	201320	50 %	25 %	25 %	0 %	46445765
4617	NC_005861	T	7	7	201335	201341	0 %	100 %	0 %	0 %	46445765
4618	NC_005861	GAC	2	6	201376	201381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445765
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4620	NC_005861	AAC	2	6	201596	201601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445765
4621	NC_005861	AGT	2	6	201644	201649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445765
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4623	NC_005861	CGA	2	6	201748	201753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445765
4624	NC_005861	T	8	8	201754	201761	0 %	100 %	0 %	0 %	46445765
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