MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae TW-183

Total Repeats: 25567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005043	GCG	2	6	48515	48520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33241373
1002	NC_005043	T	6	6	48523	48528	0 %	100 %	0 %	0 %	33241373
1003	NC_005043	GC	3	6	48589	48594	0 %	0 %	50 %	50 %	33241373
1004	NC_005043	TGT	2	6	48661	48666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241373
1005	NC_005043	CAG	2	6	48681	48686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241373
1006	NC_005043	TGT	2	6	48701	48706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241373
1007	NC_005043	TGT	2	6	48728	48733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241373
1008	NC_005043	AAC	2	6	48764	48769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241373
1009	NC_005043	T	6	6	48779	48784	0 %	100 %	0 %	0 %	33241373
1010	NC_005043	TTG	2	6	48876	48881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241373
1011	NC_005043	AG	3	6	48918	48923	50 %	0 %	50 %	0 %	33241373
1012	NC_005043	GCT	2	6	48928	48933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241373
1013	NC_005043	GGA	2	6	49104	49109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241373
1014	NC_005043	ACA	2	6	49159	49164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241373
1015	NC_005043	TTTC	2	8	49312	49319	0 %	75 %	0 %	25 %	33241373
1016	NC_005043	GAA	2	6	49374	49379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241373
1017	NC_005043	TCT	2	6	49402	49407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241373
1018	NC_005043	GTT	2	6	49473	49478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_005043	A	6	6	49485	49490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_005043	ATT	2	6	49532	49537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_005043	TTG	2	6	49557	49562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_005043	AAG	2	6	49588	49593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241374
1023	NC_005043	GAA	2	6	49643	49648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241374
1024	NC_005043	AGG	2	6	49679	49684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241374
1025	NC_005043	GAT	2	6	49790	49795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241374
1026	NC_005043	ATG	2	6	49815	49820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241374
1027	NC_005043	GAG	2	6	49853	49858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241374
1028	NC_005043	GGATA	2	10	49954	49963	40 %	20 %	40 %	0 %	33241374
1029	NC_005043	GA	4	8	49975	49982	50 %	0 %	50 %	0 %	33241374
1030	NC_005043	AAG	2	6	50052	50057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241374
1031	NC_005043	GA	3	6	50074	50079	50 %	0 %	50 %	0 %	33241374
1032	NC_005043	A	7	7	50086	50092	100 %	0 %	0 %	0 %	33241374
1033	NC_005043	ATAAA	2	10	50101	50110	80 %	20 %	0 %	0 %	33241374
1034	NC_005043	GA	4	8	50202	50209	50 %	0 %	50 %	0 %	33241374
1035	NC_005043	T	7	7	50257	50263	0 %	100 %	0 %	0 %	33241374
1036	NC_005043	GAA	2	6	50275	50280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241374
1037	NC_005043	AG	3	6	50296	50301	50 %	0 %	50 %	0 %	33241374
1038	NC_005043	TAG	2	6	50302	50307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241374
1039	NC_005043	CA	3	6	50308	50313	50 %	0 %	0 %	50 %	33241374
1040	NC_005043	GA	3	6	50314	50319	50 %	0 %	50 %	0 %	33241374
1041	NC_005043	AGA	2	6	50406	50411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241374
1042	NC_005043	AGA	2	6	50435	50440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241374
1043	NC_005043	ACCTAG	2	12	50503	50514	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33241374
1044	NC_005043	AGCA	2	8	50527	50534	50 %	0 %	25 %	25 %	33241374
1045	NC_005043	ATG	2	6	50561	50566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241374
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1047	NC_005043	GTA	2	6	50684	50689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241374
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1050	NC_005043	GGA	2	6	50746	50751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241374
1051	NC_005043	AGGA	2	8	50822	50829	50 %	0 %	50 %	0 %	33241374
1052	NC_005043	TTG	2	6	50930	50935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241374
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1054	NC_005043	A	6	6	50994	50999	100 %	0 %	0 %	0 %	33241374
1055	NC_005043	A	6	6	51004	51009	100 %	0 %	0 %	0 %	33241374
1056	NC_005043	CTTT	2	8	51041	51048	0 %	75 %	0 %	25 %	33241375
1057	NC_005043	GGT	2	6	51134	51139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241375
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1060	NC_005043	CCT	2	6	51358	51363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241375
1061	NC_005043	T	6	6	51372	51377	0 %	100 %	0 %	0 %	33241375
1062	NC_005043	CAT	2	6	51382	51387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241375
1063	NC_005043	CCT	2	6	51394	51399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241375
1064	NC_005043	GGA	2	6	51456	51461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241375
1065	NC_005043	ACA	2	6	51498	51503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241375
1066	NC_005043	CAG	2	6	51514	51519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241375
1067	NC_005043	T	6	6	51619	51624	0 %	100 %	0 %	0 %	33241375
1068	NC_005043	CCTT	2	8	51645	51652	0 %	50 %	0 %	50 %	33241375
1069	NC_005043	TGT	2	6	51662	51667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241375
1070	NC_005043	AG	3	6	51675	51680	50 %	0 %	50 %	0 %	33241375
1071	NC_005043	GTT	2	6	51711	51716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241375
1072	NC_005043	TAT	2	6	51733	51738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241375
1073	NC_005043	CTT	2	6	51740	51745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241375
1074	NC_005043	GAG	2	6	51778	51783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241375
1075	NC_005043	AATG	2	8	51790	51797	50 %	25 %	25 %	0 %	33241375
1076	NC_005043	AGATC	2	10	51838	51847	40 %	20 %	20 %	20 %	33241376
1077	NC_005043	GCA	2	6	51881	51886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241376
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1081	NC_005043	T	8	8	52202	52209	0 %	100 %	0 %	0 %	33241377
1082	NC_005043	AAG	3	9	52251	52259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241377
1083	NC_005043	TTA	2	6	52279	52284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241377
1084	NC_005043	GGA	2	6	52414	52419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241377
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1088	NC_005043	CAG	2	6	52503	52508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241377
1089	NC_005043	TGT	2	6	52525	52530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241377
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1091	NC_005043	CACAT	2	10	52717	52726	40 %	20 %	0 %	40 %	33241377
1092	NC_005043	GAG	2	6	52778	52783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241377
1093	NC_005043	GCT	2	6	52881	52886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241377
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1095	NC_005043	TTC	2	6	52957	52962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241377
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1098	NC_005043	CCTA	2	8	53065	53072	25 %	25 %	0 %	50 %	33241377
1099	NC_005043	AG	3	6	53078	53083	50 %	0 %	50 %	0 %	33241377
1100	NC_005043	A	6	6	53182	53187	100 %	0 %	0 %	0 %	33241377
1101	NC_005043	AAGA	2	8	53189	53196	75 %	0 %	25 %	0 %	33241377
1102	NC_005043	GAT	2	6	53422	53427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241377
1103	NC_005043	TCCT	2	8	53436	53443	0 %	50 %	0 %	50 %	33241377
1104	NC_005043	TC	3	6	53455	53460	0 %	50 %	0 %	50 %	33241377
1105	NC_005043	CAG	2	6	53547	53552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241377
1106	NC_005043	TTTA	2	8	53650	53657	25 %	75 %	0 %	0 %	33241377
1107	NC_005043	GAA	2	6	53795	53800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241377
1108	NC_005043	ACA	2	6	53814	53819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241377
1109	NC_005043	CAT	2	6	53826	53831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241377
1110	NC_005043	T	7	7	53848	53854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_005043	ATG	2	6	53870	53875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_005043	A	6	6	53926	53931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_005043	CGG	2	6	53943	53948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_005043	GCA	2	6	54026	54031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241378
1115	NC_005043	TGA	2	6	54117	54122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241378
1116	NC_005043	CTT	2	6	54216	54221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241378
1117	NC_005043	T	9	9	54220	54228	0 %	100 %	0 %	0 %	33241378
1118	NC_005043	TATC	2	8	54253	54260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_005043	ACA	2	6	54342	54347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241379
1120	NC_005043	TAA	2	6	54356	54361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241379
1121	NC_005043	GCA	2	6	54429	54434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241379
1122	NC_005043	T	8	8	54441	54448	0 %	100 %	0 %	0 %	33241379
1123	NC_005043	A	6	6	54453	54458	100 %	0 %	0 %	0 %	33241379
1124	NC_005043	GAG	2	6	54487	54492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241379
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1127	NC_005043	ATGA	2	8	54608	54615	50 %	25 %	25 %	0 %	33241379
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1129	NC_005043	CTTG	2	8	54728	54735	0 %	50 %	25 %	25 %	33241379
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