MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae TW-183

Total Repeats: 25567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005043	CT	3	6	23255	23260	0 %	50 %	0 %	50 %	33241353
502	NC_005043	CTT	2	6	23333	23338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241353
503	NC_005043	ACG	2	6	23360	23365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241353
504	NC_005043	AGG	2	6	23399	23404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241353
505	NC_005043	TGC	2	6	23438	23443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241353
506	NC_005043	ACT	2	6	23473	23478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241353
507	NC_005043	GGA	2	6	23508	23513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241353
508	NC_005043	CT	3	6	23515	23520	0 %	50 %	0 %	50 %	33241353
509	NC_005043	TC	3	6	23545	23550	0 %	50 %	0 %	50 %	33241353
510	NC_005043	ACA	2	6	23664	23669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241353
511	NC_005043	GTA	2	6	23965	23970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241353
512	NC_005043	ACA	2	6	23985	23990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241353
513	NC_005043	TCGATT	2	12	24248	24259	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
514	NC_005043	T	7	7	24293	24299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_005043	A	7	7	24318	24324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_005043	TTA	2	6	24436	24441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241354
517	NC_005043	CT	3	6	24464	24469	0 %	50 %	0 %	50 %	33241354
518	NC_005043	TGC	2	6	24489	24494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241354
519	NC_005043	CAC	2	6	24540	24545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241354
520	NC_005043	AAAC	2	8	24631	24638	75 %	0 %	0 %	25 %	33241354
521	NC_005043	GTT	2	6	24653	24658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241354
522	NC_005043	CTT	2	6	24684	24689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241354
523	NC_005043	ATT	2	6	24721	24726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241354
524	NC_005043	GTT	3	9	24745	24753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241354
525	NC_005043	CAG	2	6	24761	24766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241354
526	NC_005043	TCG	2	6	24991	24996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241354
527	NC_005043	CAA	2	6	24997	25002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241354
528	NC_005043	ACA	2	6	25070	25075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241354
529	NC_005043	ACA	2	6	25081	25086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241354
530	NC_005043	AGG	2	6	25089	25094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241354
531	NC_005043	CTG	2	6	25103	25108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241354
532	NC_005043	ATTG	2	8	25183	25190	25 %	50 %	25 %	0 %	33241354
533	NC_005043	CAG	2	6	25265	25270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241354
534	NC_005043	A	6	6	25297	25302	100 %	0 %	0 %	0 %	33241354
535	NC_005043	GAG	3	9	25322	25330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241354
536	NC_005043	AAC	2	6	25342	25347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241354
537	NC_005043	AGG	2	6	25371	25376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241354
538	NC_005043	GA	3	6	25400	25405	50 %	0 %	50 %	0 %	33241354
539	NC_005043	TAC	2	6	25449	25454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241354
540	NC_005043	CT	3	6	25597	25602	0 %	50 %	0 %	50 %	33241354
541	NC_005043	GA	3	6	25661	25666	50 %	0 %	50 %	0 %	33241354
542	NC_005043	AGA	2	6	25674	25679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241354
543	NC_005043	TGC	2	6	25734	25739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241354
544	NC_005043	ATGG	2	8	25816	25823	25 %	25 %	50 %	0 %	33241354
545	NC_005043	ACT	2	6	25828	25833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241354
546	NC_005043	GCA	2	6	25927	25932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241354
547	NC_005043	TAT	2	6	25987	25992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241354
548	NC_005043	CAT	2	6	25996	26001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241354
549	NC_005043	CAG	2	6	26014	26019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241354
550	NC_005043	ACT	2	6	26059	26064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241354
551	NC_005043	TAC	2	6	26094	26099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241354
552	NC_005043	AAT	2	6	26128	26133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241354
553	NC_005043	CGA	2	6	26143	26148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241354
554	NC_005043	CAAAAA	2	12	26157	26168	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	33241354
555	NC_005043	CAA	2	6	26316	26321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241355
556	NC_005043	AGG	3	9	26413	26421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241355
557	NC_005043	TTC	2	6	26423	26428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241355
558	NC_005043	ATG	2	6	26697	26702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241355
559	NC_005043	GGA	2	6	26720	26725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241355
560	NC_005043	GAT	2	6	26794	26799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241355
561	NC_005043	TC	3	6	26929	26934	0 %	50 %	0 %	50 %	33241355
562	NC_005043	CTT	2	6	27044	27049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241355
563	NC_005043	ATC	2	6	27063	27068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241355
564	NC_005043	TCAG	2	8	27096	27103	25 %	25 %	25 %	25 %	33241355
565	NC_005043	TTC	2	6	27124	27129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241355
566	NC_005043	GCTAT	2	10	27135	27144	20 %	40 %	20 %	20 %	33241355
567	NC_005043	GGA	2	6	27152	27157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241355
568	NC_005043	CT	3	6	27240	27245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_005043	TATTT	2	10	27261	27270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_005043	GTT	2	6	27288	27293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_005043	TGT	2	6	27327	27332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241356
572	NC_005043	T	6	6	27368	27373	0 %	100 %	0 %	0 %	33241356
573	NC_005043	GAA	2	6	27383	27388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241356
574	NC_005043	TCTAG	2	10	27428	27437	20 %	40 %	20 %	20 %	33241356
575	NC_005043	T	6	6	27444	27449	0 %	100 %	0 %	0 %	33241356
576	NC_005043	AATAT	2	10	27513	27522	60 %	40 %	0 %	0 %	33241357
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578	NC_005043	CCACT	2	10	27594	27603	20 %	20 %	0 %	60 %	33241357
579	NC_005043	TGC	2	6	27670	27675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241357
580	NC_005043	CTAC	2	8	27681	27688	25 %	25 %	0 %	50 %	33241357
581	NC_005043	TC	3	6	27689	27694	0 %	50 %	0 %	50 %	33241357
582	NC_005043	TA	3	6	27710	27715	50 %	50 %	0 %	0 %	33241357
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585	NC_005043	TAC	2	6	27922	27927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241357
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587	NC_005043	A	6	6	28094	28099	100 %	0 %	0 %	0 %	33241357
588	NC_005043	AGG	2	6	28186	28191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241357
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591	NC_005043	TGG	2	6	28363	28368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241357
592	NC_005043	AGG	2	6	28447	28452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241357
593	NC_005043	TC	3	6	28469	28474	0 %	50 %	0 %	50 %	33241357
594	NC_005043	CT	3	6	28500	28505	0 %	50 %	0 %	50 %	33241357
595	NC_005043	TAA	2	6	28510	28515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241357
596	NC_005043	AGG	2	6	28540	28545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241357
597	NC_005043	AGG	2	6	28564	28569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241357
598	NC_005043	AGG	2	6	28591	28596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241357
599	NC_005043	ACA	2	6	28628	28633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241357
600	NC_005043	TGC	2	6	28699	28704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241357
601	NC_005043	CTAT	2	8	28719	28726	25 %	50 %	0 %	25 %	33241357
602	NC_005043	ACC	2	6	28742	28747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241357
603	NC_005043	GA	4	8	28830	28837	50 %	0 %	50 %	0 %	33241357
604	NC_005043	CAG	2	6	28845	28850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241357
605	NC_005043	TAG	2	6	28899	28904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241357
606	NC_005043	CA	3	6	28942	28947	50 %	0 %	0 %	50 %	33241357
607	NC_005043	CTT	2	6	28976	28981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241357
608	NC_005043	AGA	2	6	29014	29019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_005043	TCA	2	6	29025	29030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241358
610	NC_005043	CAG	2	6	29091	29096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241358
611	NC_005043	GGGA	2	8	29218	29225	25 %	0 %	75 %	0 %	33241358
612	NC_005043	TTG	2	6	29433	29438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241358
613	NC_005043	TAG	2	6	29470	29475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241358
614	NC_005043	GTA	2	6	29666	29671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241358
615	NC_005043	CTC	2	6	29761	29766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241358
616	NC_005043	GTC	2	6	29786	29791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241358
617	NC_005043	AAT	2	6	29825	29830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241358
618	NC_005043	ATG	2	6	29883	29888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241358
619	NC_005043	TAC	3	9	29918	29926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241358
620	NC_005043	T	6	6	29938	29943	0 %	100 %	0 %	0 %	33241358
621	NC_005043	TAC	2	6	29951	29956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241358
622	NC_005043	AGG	2	6	30013	30018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241358
623	NC_005043	GA	3	6	30083	30088	50 %	0 %	50 %	0 %	33241358
624	NC_005043	TC	3	6	30214	30219	0 %	50 %	0 %	50 %	33241358
625	NC_005043	AG	3	6	30384	30389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_005043	TTG	2	6	30423	30428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_005043	TC	3	6	30435	30440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
628	NC_005043	T	7	7	30480	30486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_005043	AGA	2	6	30491	30496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_005043	AGG	2	6	30568	30573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_005043	T	6	6	30611	30616	0 %	100 %	0 %	0 %	33241359
632	NC_005043	AAG	3	9	30633	30641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241359
633	NC_005043	ATC	2	6	30717	30722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241359
634	NC_005043	GCCA	2	8	30757	30764	25 %	0 %	25 %	50 %	33241359
635	NC_005043	AAT	2	6	30810	30815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241359
636	NC_005043	AG	4	8	30842	30849	50 %	0 %	50 %	0 %	33241359
637	NC_005043	TTTC	2	8	31052	31059	0 %	75 %	0 %	25 %	33241359
638	NC_005043	AACG	2	8	31298	31305	50 %	0 %	25 %	25 %	33241359
639	NC_005043	ATA	2	6	31311	31316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241359
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641	NC_005043	GGA	2	6	31445	31450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241359
642	NC_005043	GC	3	6	31493	31498	0 %	0 %	50 %	50 %	33241359
643	NC_005043	TAT	2	6	31597	31602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241359
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650	NC_005043	TCC	2	6	32087	32092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241359
651	NC_005043	AC	3	6	32168	32173	50 %	0 %	0 %	50 %	33241359
652	NC_005043	TGT	2	6	32180	32185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241359
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654	NC_005043	GAA	2	6	32211	32216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241359
655	NC_005043	T	6	6	32249	32254	0 %	100 %	0 %	0 %	33241359
656	NC_005043	AT	3	6	32274	32279	50 %	50 %	0 %	0 %	33241359
657	NC_005043	C	6	6	32324	32329	0 %	0 %	0 %	100 %	33241359
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659	NC_005043	TACA	2	8	32489	32496	50 %	25 %	0 %	25 %	33241359
660	NC_005043	GTT	2	6	32519	32524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241359
661	NC_005043	TTTTTC	2	12	32595	32606	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	33241359
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663	NC_005043	AAG	2	6	32670	32675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241359
664	NC_005043	T	6	6	32746	32751	0 %	100 %	0 %	0 %	33241360
665	NC_005043	TCA	2	6	32765	32770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241360
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667	NC_005043	GA	3	6	32961	32966	50 %	0 %	50 %	0 %	33241360
668	NC_005043	T	8	8	32970	32977	0 %	100 %	0 %	0 %	33241360
669	NC_005043	GAT	2	6	33024	33029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241360
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672	NC_005043	CTT	2	6	33170	33175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241360
673	NC_005043	TAGG	2	8	33176	33183	25 %	25 %	50 %	0 %	33241360
674	NC_005043	ATG	2	6	33268	33273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241360
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679	NC_005043	T	6	6	33541	33546	0 %	100 %	0 %	0 %	33241360
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681	NC_005043	GCT	3	9	33595	33603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241360
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683	NC_005043	GTA	2	6	33648	33653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241360
684	NC_005043	CTT	2	6	33695	33700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241360
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693	NC_005043	GGC	2	6	33966	33971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33241360
694	NC_005043	GTC	2	6	34020	34025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241360
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698	NC_005043	TCT	2	6	34207	34212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241360
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700	NC_005043	CTG	2	6	34284	34289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241360
701	NC_005043	TA	3	6	34305	34310	50 %	50 %	0 %	0 %	33241360
702	NC_005043	CAA	2	6	34346	34351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241360
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704	NC_005043	CTC	2	6	34424	34429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241361
705	NC_005043	CCA	2	6	34506	34511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241361
706	NC_005043	ATT	2	6	34535	34540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241361
707	NC_005043	GAG	2	6	34625	34630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241361
708	NC_005043	CAT	2	6	34666	34671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241361
709	NC_005043	ATA	2	6	34776	34781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241361
710	NC_005043	TCA	2	6	34881	34886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241361
711	NC_005043	TCT	2	6	34940	34945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241361
712	NC_005043	GAA	2	6	34950	34955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241361
713	NC_005043	AAGG	2	8	34969	34976	50 %	0 %	50 %	0 %	33241361
714	NC_005043	CTC	2	6	34992	34997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
715	NC_005043	ACA	2	6	35012	35017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241362
716	NC_005043	GAA	2	6	35058	35063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241362
717	NC_005043	ATCTT	2	10	35068	35077	20 %	60 %	0 %	20 %	33241362
718	NC_005043	GA	3	6	35129	35134	50 %	0 %	50 %	0 %	33241362
719	NC_005043	AAGA	2	8	35171	35178	75 %	0 %	25 %	0 %	33241362
720	NC_005043	CTAAGT	2	12	35192	35203	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33241362
721	NC_005043	GTT	2	6	35205	35210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241362
722	NC_005043	TCA	2	6	35215	35220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241362
723	NC_005043	CAT	2	6	35247	35252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241362
724	NC_005043	TCC	2	6	35280	35285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241362
725	NC_005043	CAT	2	6	35312	35317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241362
726	NC_005043	AC	3	6	35342	35347	50 %	0 %	0 %	50 %	33241362
727	NC_005043	GAA	2	6	35491	35496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241362
728	NC_005043	ATA	2	6	35557	35562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241362
729	NC_005043	GGAT	2	8	35599	35606	25 %	25 %	50 %	0 %	33241362
730	NC_005043	TGA	2	6	35611	35616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241362
731	NC_005043	T	7	7	35715	35721	0 %	100 %	0 %	0 %	33241362
732	NC_005043	CTT	2	6	35739	35744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241362
733	NC_005043	TC	3	6	35747	35752	0 %	50 %	0 %	50 %	33241362
734	NC_005043	CTCG	2	8	35773	35780	0 %	25 %	25 %	50 %	33241362
735	NC_005043	CAA	2	6	35801	35806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241362
736	NC_005043	TTTTC	2	10	35825	35834	0 %	80 %	0 %	20 %	33241362
737	NC_005043	TGAC	2	8	35980	35987	25 %	25 %	25 %	25 %	33241362
738	NC_005043	TCA	2	6	36067	36072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241362
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740	NC_005043	AG	3	6	36098	36103	50 %	0 %	50 %	0 %	33241362
741	NC_005043	AGA	2	6	36112	36117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241362
742	NC_005043	GAG	2	6	36192	36197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241362
743	NC_005043	TTC	2	6	36198	36203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241362
744	NC_005043	GAT	2	6	36240	36245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241362
745	NC_005043	TAGA	2	8	36294	36301	50 %	25 %	25 %	0 %	33241362
746	NC_005043	TGT	2	6	36366	36371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241362
747	NC_005043	T	6	6	36411	36416	0 %	100 %	0 %	0 %	33241362
748	NC_005043	ACG	2	6	36532	36537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241362
749	NC_005043	CAT	2	6	36542	36547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241362
750	NC_005043	TGC	2	6	36622	36627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
751	NC_005043	CTT	2	6	36674	36679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241363
752	NC_005043	T	7	7	36690	36696	0 %	100 %	0 %	0 %	33241363
753	NC_005043	GTT	2	6	36724	36729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241363
754	NC_005043	AAG	2	6	36750	36755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241363
755	NC_005043	CT	3	6	36784	36789	0 %	50 %	0 %	50 %	33241363
756	NC_005043	G	6	6	36824	36829	0 %	0 %	100 %	0 %	33241363
757	NC_005043	AAT	2	6	37011	37016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241363
758	NC_005043	CTTT	2	8	37018	37025	0 %	75 %	0 %	25 %	33241363
759	NC_005043	TTTCCC	2	12	37026	37037	0 %	50 %	0 %	50 %	33241363
760	NC_005043	TCAAA	2	10	37061	37070	60 %	20 %	0 %	20 %	33241363
761	NC_005043	TTA	2	6	37078	37083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241363
762	NC_005043	AG	3	6	37317	37322	50 %	0 %	50 %	0 %	33241363
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