MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 plasmid pQpH1

Total Repeats: 847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004704	AAG	2	6	22209	22214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29648134
502	NC_004704	GCA	2	6	22229	22234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29648134
503	NC_004704	GAATTC	2	12	22259	22270	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	29648134
504	NC_004704	GAA	2	6	22360	22365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29648134
505	NC_004704	GAG	2	6	22375	22380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29648134
506	NC_004704	T	7	7	22614	22620	0 %	100 %	0 %	0 %	29648135
507	NC_004704	AAT	2	6	22629	22634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29648135
508	NC_004704	CAAA	2	8	22669	22676	75 %	0 %	0 %	25 %	29648135
509	NC_004704	T	6	6	22677	22682	0 %	100 %	0 %	0 %	29648135
510	NC_004704	AAT	2	6	22757	22762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29648135
511	NC_004704	TC	3	6	22820	22825	0 %	50 %	0 %	50 %	29648135
512	NC_004704	ACGT	2	8	22884	22891	25 %	25 %	25 %	25 %	29648135
513	NC_004704	AGGC	2	8	22947	22954	25 %	0 %	50 %	25 %	29648135
514	NC_004704	TCC	2	6	22982	22987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29648135
515	NC_004704	ATTG	2	8	23041	23048	25 %	50 %	25 %	0 %	29648135
516	NC_004704	ATT	2	6	23049	23054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29648135
517	NC_004704	TTTAA	2	10	23076	23085	40 %	60 %	0 %	0 %	29648135
518	NC_004704	GGA	2	6	23096	23101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29648135
519	NC_004704	CTC	2	6	23179	23184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29648135
520	NC_004704	T	6	6	23226	23231	0 %	100 %	0 %	0 %	29648135
521	NC_004704	ATA	2	6	23289	23294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_004704	TAA	2	6	23333	23338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_004704	CCT	2	6	23366	23371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_004704	TTA	2	6	23385	23390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_004704	TC	4	8	23450	23457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_004704	ATTT	2	8	23463	23470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_004704	ATA	2	6	23477	23482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_004704	A	7	7	23482	23488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_004704	AGA	2	6	23507	23512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_004704	TCGAA	2	10	23578	23587	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
531	NC_004704	ATA	2	6	23642	23647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_004704	T	6	6	23655	23660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_004704	ATTT	2	8	23675	23682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_004704	TTAA	2	8	23692	23699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_004704	AGC	2	6	23718	23723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29648136
536	NC_004704	TCT	2	6	23732	23737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29648136
537	NC_004704	TGT	2	6	23886	23891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29648136
538	NC_004704	GATG	2	8	23904	23911	25 %	25 %	50 %	0 %	29648136
539	NC_004704	TCCA	2	8	24061	24068	25 %	25 %	0 %	50 %	29648136
540	NC_004704	GAAAGT	2	12	24126	24137	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29648136
541	NC_004704	ATTT	2	8	24186	24193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_004704	TCT	2	6	24222	24227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_004704	GAA	2	6	24272	24277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_004704	CTT	2	6	24329	24334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29648137
545	NC_004704	TCT	2	6	24338	24343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29648137
546	NC_004704	T	8	8	24378	24385	0 %	100 %	0 %	0 %	29648137
547	NC_004704	T	6	6	24434	24439	0 %	100 %	0 %	0 %	29648137
548	NC_004704	T	6	6	24442	24447	0 %	100 %	0 %	0 %	29648137
549	NC_004704	ACC	2	6	24448	24453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29648137
550	NC_004704	GTTT	2	8	24465	24472	0 %	75 %	25 %	0 %	29648137
551	NC_004704	T	7	7	24470	24476	0 %	100 %	0 %	0 %	29648137
552	NC_004704	TGC	2	6	24489	24494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29648137
553	NC_004704	TTC	2	6	24495	24500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29648137
554	NC_004704	GTCA	2	8	24501	24508	25 %	25 %	25 %	25 %	29648137
555	NC_004704	CAT	2	6	24524	24529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29648137
556	NC_004704	TGGC	2	8	24587	24594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
557	NC_004704	ATT	2	6	24638	24643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_004704	TAT	2	6	24652	24657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_004704	TAA	2	6	24683	24688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_004704	AAC	2	6	24715	24720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_004704	A	7	7	24724	24730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_004704	TTTAT	2	10	24754	24763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_004704	TAATTT	2	12	24814	24825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_004704	A	8	8	24853	24860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_004704	ATT	2	6	24878	24883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_004704	TCG	2	6	24979	24984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29648138
567	NC_004704	GC	3	6	25023	25028	0 %	0 %	50 %	50 %	29648138
568	NC_004704	GC	3	6	25034	25039	0 %	0 %	50 %	50 %	29648138
569	NC_004704	A	7	7	25075	25081	100 %	0 %	0 %	0 %	29648138
570	NC_004704	CTT	2	6	25120	25125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29648138
571	NC_004704	CAG	2	6	25173	25178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_004704	TGA	2	6	25189	25194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004704	TG	3	6	25216	25221	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_004704	A	6	6	25233	25238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_004704	TGAGTC	2	12	25247	25258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
576	NC_004704	A	6	6	25276	25281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_004704	TGA	2	6	25349	25354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_004704	TTG	2	6	25606	25611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29648139
579	NC_004704	CAT	2	6	25630	25635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29648139
580	NC_004704	CTTTT	2	10	25698	25707	0 %	80 %	0 %	20 %	29648139
581	NC_004704	T	8	8	25704	25711	0 %	100 %	0 %	0 %	29648139
582	NC_004704	TCA	2	6	25717	25722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29648139
583	NC_004704	TAA	2	6	25750	25755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29648140
584	NC_004704	CCT	2	6	25812	25817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29648140
585	NC_004704	A	7	7	25867	25873	100 %	0 %	0 %	0 %	29648140
586	NC_004704	TCT	2	6	25880	25885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29648140
587	NC_004704	ATT	2	6	25898	25903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29648140
588	NC_004704	T	6	6	25948	25953	0 %	100 %	0 %	0 %	29648140
589	NC_004704	TCA	2	6	25992	25997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29648140
590	NC_004704	CCT	2	6	26195	26200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_004704	GTG	2	6	26283	26288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_004704	T	6	6	26345	26350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_004704	GCT	2	6	26396	26401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_004704	GCC	2	6	26438	26443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_004704	CTTG	2	8	26447	26454	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
596	NC_004704	CCG	2	6	26483	26488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_004704	TG	3	6	26523	26528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_004704	GGTT	2	8	26665	26672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_004704	GT	3	6	26719	26724	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_004704	GTGA	2	8	26739	26746	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
601	NC_004704	CTTT	2	8	26776	26783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_004704	AGT	2	6	26826	26831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_004704	TTTG	2	8	26894	26901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
604	NC_004704	TCT	2	6	26908	26913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_004704	GTTT	2	8	26937	26944	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
606	NC_004704	ATT	2	6	26964	26969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_004704	AGT	2	6	27048	27053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_004704	TCG	2	6	27134	27139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_004704	TTC	2	6	27165	27170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_004704	AAT	2	6	27185	27190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_004704	T	6	6	27200	27205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_004704	TTC	2	6	27246	27251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_004704	TCA	3	9	27311	27319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_004704	T	6	6	27334	27339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_004704	GCA	2	6	27359	27364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_004704	TCG	2	6	27374	27379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_004704	GA	4	8	27401	27408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_004704	TCT	2	6	27433	27438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_004704	CCA	2	6	27533	27538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_004704	TTA	2	6	27565	27570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_004704	ATT	2	6	27585	27590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_004704	A	6	6	27616	27621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_004704	TAA	2	6	27710	27715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_004704	TGT	3	9	27807	27815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_004704	CG	3	6	27826	27831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
626	NC_004704	TTG	2	6	27870	27875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_004704	AGA	2	6	27889	27894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_004704	T	6	6	27910	27915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_004704	TGATT	2	10	27918	27927	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
630	NC_004704	TTTC	2	8	27959	27966	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
631	NC_004704	GCAA	2	8	27970	27977	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
632	NC_004704	TCA	2	6	28004	28009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_004704	CT	3	6	28029	28034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_004704	ACG	2	6	28096	28101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_004704	T	7	7	28161	28167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_004704	TTC	2	6	28179	28184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_004704	T	6	6	28221	28226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_004704	AT	3	6	28380	28385	50 %	50 %	0 %	0 %	29648142
639	NC_004704	TAT	2	6	28395	28400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29648142
640	NC_004704	CCA	2	6	28424	28429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29648142
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