MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium tetani E88 plasmid pE88

Total Repeats: 1154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004565	ATA	2	6	25	30	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004565	TTA	2	6	48	53	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004565	TAA	2	6	62	67	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004565	AAT	2	6	229	234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004565	TTC	2	6	402	407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_004565	AGG	2	6	428	433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004565	TGA	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373132
8	NC_004565	ATA	2	6	610	615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
9	NC_004565	CAT	2	6	630	635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28373132
10	NC_004565	AAG	2	6	731	736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373132
11	NC_004565	ACT	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28373132
12	NC_004565	GCA	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28373132
13	NC_004565	TTA	2	6	1083	1088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373132
14	NC_004565	ATA	2	6	1099	1104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
15	NC_004565	TAA	2	6	1409	1414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
16	NC_004565	TAG	2	6	1517	1522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373132
17	NC_004565	TAA	2	6	1552	1557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
18	NC_004565	TTA	2	6	1560	1565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373132
19	NC_004565	AGA	2	6	1574	1579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373132
20	NC_004565	ATA	2	6	1609	1614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373132
21	NC_004565	AAG	2	6	1615	1620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373132
22	NC_004565	TAA	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004565	TTA	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004565	TAT	2	6	2009	2014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004565	ATT	2	6	2079	2084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004565	ATA	2	6	2085	2090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004565	TTA	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004565	ATG	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004565	ATA	2	6	2163	2168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004565	TTA	2	6	2194	2199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004565	ATC	2	6	2251	2256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_004565	TAT	2	6	2313	2318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004565	AAG	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004565	GAA	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004565	AAT	2	6	2403	2408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004565	ATT	2	6	2492	2497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004565	TAG	2	6	2532	2537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004565	ATT	2	6	2606	2611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004565	TTA	2	6	2616	2621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004565	TAA	2	6	2656	2661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004565	TAA	2	6	2730	2735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004565	ATT	2	6	2759	2764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004565	AAT	2	6	2766	2771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004565	ATG	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004565	AAG	2	6	2819	2824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004565	CTT	2	6	2857	2862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_004565	AAT	2	6	2867	2872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004565	ACA	2	6	2925	2930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28373133
49	NC_004565	AGG	2	6	2942	2947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28373133
50	NC_004565	ATA	2	6	3044	3049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373133
51	NC_004565	TCC	2	6	3065	3070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28373133
52	NC_004565	ATT	2	6	3314	3319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004565	AAG	2	6	3383	3388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004565	CAT	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28373134
55	NC_004565	CTC	2	6	3651	3656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_004565	AAG	2	6	3673	3678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373135
57	NC_004565	TCT	2	6	3729	3734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373135
58	NC_004565	TCT	2	6	3792	3797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373135
59	NC_004565	GAT	2	6	3855	3860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373135
60	NC_004565	TCC	2	6	3894	3899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_004565	ATT	2	6	3920	3925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004565	CTA	2	6	3949	3954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_004565	TAG	2	6	3983	3988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004565	TAA	2	6	4022	4027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004565	AAT	2	6	4043	4048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004565	ATT	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004565	ATT	2	6	4095	4100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004565	TAA	2	6	4242	4247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004565	TCT	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_004565	TGC	2	6	4319	4324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_004565	CAT	2	6	4462	4467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004565	ATC	2	6	4535	4540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_004565	ATT	2	6	4574	4579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004565	TAA	2	6	4713	4718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004565	TAT	2	6	4730	4735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004565	TAA	2	6	4750	4755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004565	AAT	2	6	4848	4853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004565	GGA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004565	TAG	2	6	4970	4975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373136
80	NC_004565	AGT	2	6	5017	5022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373136
81	NC_004565	GAA	2	6	5041	5046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373136
82	NC_004565	AGA	2	6	5067	5072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373136
83	NC_004565	TAA	2	6	5133	5138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373136
84	NC_004565	TAT	2	6	5177	5182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373136
85	NC_004565	AAT	2	6	5219	5224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373136
86	NC_004565	ATT	2	6	5251	5256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004565	TAA	2	6	5269	5274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004565	AGG	2	6	5302	5307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004565	GTT	2	6	5376	5381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28373137
90	NC_004565	ATT	2	6	5438	5443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373137
91	NC_004565	TGG	2	6	5447	5452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28373137
92	NC_004565	TTA	2	6	5461	5466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373137
93	NC_004565	AAT	2	6	5504	5509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373137
94	NC_004565	ATA	2	6	5518	5523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373137
95	NC_004565	GAA	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373137
96	NC_004565	AAT	2	6	5592	5597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373137
97	NC_004565	ATA	2	6	5649	5654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373137
98	NC_004565	ATA	2	6	5668	5673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373137
99	NC_004565	ATT	3	9	5821	5829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004565	AAT	2	6	5836	5841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004565	ATT	2	6	5863	5868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004565	ATA	3	9	5934	5942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004565	ATT	2	6	6037	6042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004565	ATT	2	6	6131	6136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004565	ATT	2	6	6151	6156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004565	CAA	2	6	6277	6282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_004565	TAA	3	9	6292	6300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004565	AAT	2	6	6305	6310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004565	TAA	2	6	6367	6372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004565	TTA	2	6	6379	6384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004565	TTA	2	6	6411	6416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004565	ATG	2	6	6426	6431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004565	ATA	2	6	6443	6448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004565	TTA	2	6	6474	6479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004565	ATT	2	6	6539	6544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373138
116	NC_004565	AAG	2	6	6635	6640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373138
117	NC_004565	TAA	2	6	6725	6730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373138
118	NC_004565	TTC	2	6	6761	6766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373138
119	NC_004565	AGA	2	6	6806	6811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373138
120	NC_004565	TAA	2	6	6814	6819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373138
121	NC_004565	AGA	2	6	6827	6832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373138
122	NC_004565	AAT	2	6	6846	6851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373138
123	NC_004565	GGA	2	6	6871	6876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004565	AAT	2	6	7013	7018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004565	ATT	2	6	7025	7030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004565	CAT	2	6	7052	7057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_004565	TAT	2	6	7129	7134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004565	AAG	2	6	7154	7159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004565	AAT	2	6	7219	7224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004565	ATA	2	6	7292	7297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004565	TAA	2	6	7309	7314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004565	TCC	2	6	7333	7338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_004565	GGT	2	6	7413	7418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004565	TTA	2	6	7560	7565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004565	TAG	2	6	7622	7627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004565	ATT	2	6	7701	7706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004565	ATA	2	6	7785	7790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004565	ATA	2	6	7886	7891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004565	TGT	2	6	7944	7949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28373139
140	NC_004565	TAA	2	6	8064	8069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373139
141	NC_004565	TGG	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28373139
142	NC_004565	TAA	2	6	8295	8300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_004565	ATT	2	6	18402	18407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_004565	ATT	2	6	18419	18424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_004565	ATA	2	6	19447	19452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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