MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium tetani E88 plasmid pE88

Total Repeats: 2299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004565	ATT	2	6	33564	33569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373159
1002	NC_004565	TAT	2	6	33575	33580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373159
1003	NC_004565	ATAG	2	8	33622	33629	50 %	25 %	25 %	0 %	28373159
1004	NC_004565	ATT	3	9	33639	33647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373159
1005	NC_004565	ATT	2	6	33678	33683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373159
1006	NC_004565	TTA	2	6	33691	33696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373159
1007	NC_004565	TA	3	6	33776	33781	50 %	50 %	0 %	0 %	28373159
1008	NC_004565	AGT	2	6	33786	33791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373159
1009	NC_004565	TAT	2	6	33794	33799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373159
1010	NC_004565	TCAT	2	8	33802	33809	25 %	50 %	0 %	25 %	28373159
1011	NC_004565	TAG	2	6	33833	33838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373159
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1013	NC_004565	ATT	2	6	33936	33941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373159
1014	NC_004565	AAT	2	6	33942	33947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373159
1015	NC_004565	TTA	2	6	34000	34005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373159
1016	NC_004565	T	6	6	34012	34017	0 %	100 %	0 %	0 %	28373159
1017	NC_004565	TGT	2	6	34040	34045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28373159
1018	NC_004565	ATTT	2	8	34055	34062	25 %	75 %	0 %	0 %	28373159
1019	NC_004565	ATT	2	6	34074	34079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373159
1020	NC_004565	T	6	6	34078	34083	0 %	100 %	0 %	0 %	28373159
1021	NC_004565	T	7	7	34107	34113	0 %	100 %	0 %	0 %	28373159
1022	NC_004565	AGA	2	6	34128	34133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373159
1023	NC_004565	T	6	6	34135	34140	0 %	100 %	0 %	0 %	28373159
1024	NC_004565	AAT	2	6	34146	34151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373159
1025	NC_004565	TAT	2	6	34157	34162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373159
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1030	NC_004565	ATT	2	6	34305	34310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373159
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1034	NC_004565	ATA	2	6	34354	34359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373159
1035	NC_004565	TAT	2	6	34362	34367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373159
1036	NC_004565	A	7	7	34415	34421	100 %	0 %	0 %	0 %	28373159
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1042	NC_004565	TA	3	6	34573	34578	50 %	50 %	0 %	0 %	28373159
1043	NC_004565	TTA	2	6	34622	34627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373159
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1051	NC_004565	ATTAT	2	10	34849	34858	40 %	60 %	0 %	0 %	28373159
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1054	NC_004565	ATT	2	6	34884	34889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373159
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1059	NC_004565	ATA	2	6	35041	35046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373159
1060	NC_004565	TTG	2	6	35082	35087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28373159
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1062	NC_004565	AT	3	6	35120	35125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_004565	A	6	6	35160	35165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_004565	AT	3	6	35196	35201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_004565	AATA	2	8	35224	35231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_004565	AAT	2	6	35288	35293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1068	NC_004565	CATA	2	8	35306	35313	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_004565	ATGC	2	8	35314	35321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_004565	ATTA	2	8	35360	35367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_004565	A	6	6	35384	35389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_004565	TAAT	2	8	35398	35405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_004565	ATT	2	6	35409	35414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_004565	TAAA	2	8	35437	35444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_004565	TA	3	6	35484	35489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_004565	TCCT	2	8	35491	35498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_004565	ATT	2	6	35520	35525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373160
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1086	NC_004565	T	6	6	35715	35720	0 %	100 %	0 %	0 %	28373160
1087	NC_004565	CCATA	2	10	35722	35731	40 %	20 %	0 %	40 %	28373160
1088	NC_004565	T	6	6	35741	35746	0 %	100 %	0 %	0 %	28373160
1089	NC_004565	T	6	6	35802	35807	0 %	100 %	0 %	0 %	28373160
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1093	NC_004565	T	7	7	36015	36021	0 %	100 %	0 %	0 %	28373160
1094	NC_004565	T	7	7	36070	36076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_004565	T	6	6	36089	36094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_004565	TAATT	2	10	36098	36107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_004565	AT	4	8	36148	36155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_004565	ATTT	2	8	36233	36240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_004565	TAA	2	6	36308	36313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_004565	AGG	2	6	36355	36360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_004565	TAT	2	6	36368	36373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_004565	AT	3	6	36379	36384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_004565	ATT	2	6	36420	36425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_004565	A	6	6	36426	36431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_004565	ATA	2	6	36518	36523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_004565	ATT	2	6	36538	36543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_004565	TTAA	2	8	36545	36552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_004565	A	6	6	36566	36571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_004565	TA	3	6	36578	36583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_004565	TTTA	2	8	36595	36602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_004565	TAT	2	6	36606	36611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_004565	TAT	2	6	36650	36655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_004565	CAC	2	6	36672	36677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_004565	AT	3	6	36704	36709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_004565	AGT	2	6	36725	36730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_004565	GAA	2	6	36738	36743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_004565	TGA	2	6	36764	36769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_004565	ATG	2	6	36787	36792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_004565	TGTAC	2	10	36858	36867	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1120	NC_004565	ATG	2	6	36904	36909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_004565	AT	3	6	36942	36947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_004565	GAA	2	6	36948	36953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_004565	AGA	2	6	36965	36970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_004565	T	6	6	36977	36982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_004565	ATA	2	6	36998	37003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_004565	AT	3	6	37014	37019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_004565	AAT	2	6	37123	37128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_004565	A	6	6	37167	37172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_004565	TAGAAA	2	12	37174	37185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_004565	ATA	2	6	37195	37200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_004565	TGG	2	6	37219	37224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_004565	ATTT	2	8	37286	37293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_004565	ATTAT	2	10	37310	37319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_004565	TCT	2	6	37402	37407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_004565	TAA	2	6	37446	37451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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