MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium tetani E88 plasmid pE88

Total Repeats: 2299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004565	TAA	2	6	15753	15758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
502	NC_004565	TTA	2	6	15776	15781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373146
503	NC_004565	ATT	2	6	15792	15797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373146
504	NC_004565	GTA	2	6	15841	15846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373146
505	NC_004565	TAT	3	9	15851	15859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373146
506	NC_004565	AAT	2	6	15894	15899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
507	NC_004565	TTAT	2	8	15919	15926	25 %	75 %	0 %	0 %	28373146
508	NC_004565	ATA	3	9	15928	15936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
509	NC_004565	TAT	2	6	15941	15946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373146
510	NC_004565	TAA	2	6	15972	15977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373146
511	NC_004565	A	6	6	16019	16024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_004565	AAT	2	6	16056	16061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_004565	AT	3	6	16072	16077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_004565	AAT	2	6	16100	16105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_004565	T	6	6	16120	16125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_004565	ACA	2	6	16394	16399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28373167
517	NC_004565	ATTA	2	8	16405	16412	50 %	50 %	0 %	0 %	28373167
518	NC_004565	GTTT	2	8	16633	16640	0 %	75 %	25 %	0 %	28373167
519	NC_004565	TTAG	2	8	16658	16665	25 %	50 %	25 %	0 %	28373167
520	NC_004565	TCTAA	2	10	16670	16679	40 %	40 %	0 %	20 %	28373167
521	NC_004565	ATT	2	6	16690	16695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373167
522	NC_004565	TGGTCT	2	12	16733	16744	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	28373167
523	NC_004565	AT	3	6	16748	16753	50 %	50 %	0 %	0 %	28373167
524	NC_004565	ATTTT	2	10	16776	16785	20 %	80 %	0 %	0 %	28373167
525	NC_004565	T	7	7	16791	16797	0 %	100 %	0 %	0 %	28373167
526	NC_004565	T	6	6	16811	16816	0 %	100 %	0 %	0 %	28373167
527	NC_004565	T	6	6	16879	16884	0 %	100 %	0 %	0 %	28373167
528	NC_004565	TCT	2	6	16886	16891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28373167
529	NC_004565	CAG	2	6	16902	16907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28373167
530	NC_004565	TTTTCT	2	12	16952	16963	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	28373167
531	NC_004565	T	6	6	17002	17007	0 %	100 %	0 %	0 %	28373167
532	NC_004565	TAA	2	6	17038	17043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373167
533	NC_004565	CTTTAA	2	12	17070	17081	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	28373167
534	NC_004565	GTT	2	6	17149	17154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28373167
535	NC_004565	T	6	6	17170	17175	0 %	100 %	0 %	0 %	28373167
536	NC_004565	AGTT	2	8	17284	17291	25 %	50 %	25 %	0 %	28373167
537	NC_004565	AT	3	6	17345	17350	50 %	50 %	0 %	0 %	28373167
538	NC_004565	T	6	6	17446	17451	0 %	100 %	0 %	0 %	28373167
539	NC_004565	AT	3	6	17460	17465	50 %	50 %	0 %	0 %	28373167
540	NC_004565	CAC	2	6	17488	17493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28373167
541	NC_004565	GTAG	2	8	17529	17536	25 %	25 %	50 %	0 %	28373148
542	NC_004565	AAC	2	6	17712	17717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28373148
543	NC_004565	TAT	3	9	17806	17814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373148
544	NC_004565	TAC	2	6	17847	17852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_004565	ATA	2	6	17863	17868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_004565	CAA	2	6	17869	17874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_004565	TA	3	6	17876	17881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_004565	A	6	6	17941	17946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_004565	TAA	2	6	17947	17952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_004565	TAT	2	6	17976	17981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_004565	T	6	6	18117	18122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_004565	ATAA	2	8	18127	18134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_004565	AT	3	6	18174	18179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_004565	TAT	2	6	18188	18193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_004565	A	6	6	18200	18205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_004565	TAATTT	2	12	18238	18249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_004565	TAGTTA	2	12	18301	18312	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_004565	CTTCA	2	10	18329	18338	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
559	NC_004565	ATT	2	6	18345	18350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_004565	AAAT	2	8	18365	18372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_004565	ATTAA	2	10	18378	18387	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_004565	ATT	2	6	18402	18407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_004565	ATT	2	6	18419	18424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_004565	TAA	2	6	18446	18451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_004565	CTT	2	6	18489	18494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_004565	AT	3	6	18510	18515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_004565	ATA	2	6	18542	18547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_004565	TA	3	6	18612	18617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_004565	GAAG	2	8	18633	18640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_004565	CTA	2	6	18671	18676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_004565	TTG	2	6	18744	18749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_004565	TGA	2	6	18768	18773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004565	GCT	2	6	18832	18837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_004565	A	7	7	18868	18874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_004565	AGA	3	9	18906	18914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_004565	A	7	7	18982	18988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_004565	AG	3	6	19007	19012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_004565	TAA	2	6	19031	19036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_004565	TTA	2	6	19054	19059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_004565	ATT	2	6	19070	19075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_004565	CTA	2	6	19076	19081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_004565	TAA	2	6	19111	19116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_004565	A	6	6	19158	19163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_004565	AAT	2	6	19195	19200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_004565	AT	3	6	19211	19216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_004565	AAT	2	6	19239	19244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_004565	T	6	6	19259	19264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_004565	AAT	2	6	19423	19428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_004565	ATA	2	6	19447	19452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_004565	ACCTT	2	10	19474	19483	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
591	NC_004565	TAT	2	6	19547	19552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_004565	T	7	7	19563	19569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_004565	TCTA	2	8	19628	19635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
594	NC_004565	TAA	3	9	19648	19656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_004565	A	8	8	19670	19677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_004565	TA	3	6	19716	19721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_004565	TAT	2	6	19761	19766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_004565	ATA	2	6	19800	19805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_004565	AATTAA	2	12	19819	19830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_004565	TAA	2	6	19994	19999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_004565	AT	3	6	20002	20007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_004565	TGT	3	9	20017	20025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_004565	CTT	2	6	20117	20122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_004565	CTTT	2	8	20181	20188	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
605	NC_004565	ATA	2	6	20226	20231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_004565	TTG	2	6	20251	20256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28373149
607	NC_004565	A	8	8	20262	20269	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
608	NC_004565	TAG	2	6	20296	20301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373149
609	NC_004565	ATA	2	6	20310	20315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373149
610	NC_004565	CAC	2	6	20320	20325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28373149
611	NC_004565	A	6	6	20371	20376	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
612	NC_004565	AGG	2	6	20419	20424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28373149
613	NC_004565	A	6	6	20430	20435	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
614	NC_004565	TA	3	6	20473	20478	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
615	NC_004565	TCC	2	6	20526	20531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28373149
616	NC_004565	TA	3	6	20578	20583	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
617	NC_004565	TAA	2	6	20609	20614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373149
618	NC_004565	TAG	2	6	20621	20626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373149
619	NC_004565	AGG	2	6	20696	20701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28373149
620	NC_004565	TAA	2	6	20741	20746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28373149
621	NC_004565	ATT	2	6	20752	20757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28373149
622	NC_004565	A	8	8	20787	20794	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
623	NC_004565	TAG	2	6	20836	20841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373149
624	NC_004565	A	6	6	20860	20865	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
625	NC_004565	AT	3	6	20942	20947	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
626	NC_004565	AAG	2	6	20999	21004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373149
627	NC_004565	TA	6	12	21009	21020	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
628	NC_004565	TA	3	6	21060	21065	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
629	NC_004565	AAG	2	6	21068	21073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373149
630	NC_004565	AAAG	2	8	21129	21136	75 %	0 %	25 %	0 %	28373149
631	NC_004565	A	6	6	21141	21146	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
632	NC_004565	A	6	6	21162	21167	100 %	0 %	0 %	0 %	28373149
633	NC_004565	T	6	6	21189	21194	0 %	100 %	0 %	0 %	28373149
634	NC_004565	TGA	2	6	21197	21202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373149
635	NC_004565	GAAG	2	8	21249	21256	50 %	0 %	50 %	0 %	28373149
636	NC_004565	AGA	2	6	21260	21265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28373149
637	NC_004565	TTAA	2	8	21267	21274	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
638	NC_004565	AGT	2	6	21288	21293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28373149
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640	NC_004565	TA	3	6	21406	21411	50 %	50 %	0 %	0 %	28373149
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