MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium tetani E88 chromosome

Total Repeats: 8927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004557	TTCC	2	8	54	61	0 %	50 %	0 %	50 %	28209835
2	NC_004557	CTTT	2	8	404	411	0 %	75 %	0 %	25 %	28209835
3	NC_004557	CTAC	2	8	1826	1833	25 %	25 %	0 %	50 %	28209835
4	NC_004557	TTTC	2	8	1961	1968	0 %	75 %	0 %	25 %	28209835
5	NC_004557	ATTC	2	8	2029	2036	25 %	50 %	0 %	25 %	28209835
6	NC_004557	AAAT	2	8	2062	2069	75 %	25 %	0 %	0 %	28209835
7	NC_004557	TAAT	2	8	2328	2335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004557	TTTA	2	8	2462	2469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004557	AGAA	2	8	2564	2571	75 %	0 %	25 %	0 %	28209836
10	NC_004557	ATTT	2	8	2978	2985	25 %	75 %	0 %	0 %	28209836
11	NC_004557	AAAT	2	8	3094	3101	75 %	25 %	0 %	0 %	28209836
12	NC_004557	AATC	2	8	3360	3367	50 %	25 %	0 %	25 %	28209836
13	NC_004557	AGCT	2	8	3385	3392	25 %	25 %	25 %	25 %	28209836
14	NC_004557	TTCC	2	8	3493	3500	0 %	50 %	0 %	50 %	28209836
15	NC_004557	AAAT	2	8	3757	3764	75 %	25 %	0 %	0 %	28209836
16	NC_004557	TATT	2	8	3941	3948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004557	GGTG	2	8	4015	4022	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004557	TTTA	2	8	4056	4063	25 %	75 %	0 %	0 %	28209837
19	NC_004557	AAAT	2	8	4271	4278	75 %	25 %	0 %	0 %	28209837
20	NC_004557	TAAA	2	8	4542	4549	75 %	25 %	0 %	0 %	28209837
21	NC_004557	ATTA	2	8	4556	4563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004557	TTTA	2	8	4572	4579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004557	TTAT	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004557	AATT	2	8	5227	5234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004557	TCAG	2	8	5584	5591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_004557	AGCA	2	8	6417	6424	50 %	0 %	25 %	25 %	28209839
27	NC_004557	ACCT	2	8	6804	6811	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_004557	ACTC	2	8	7174	7181	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_004557	GTCT	2	8	8133	8140	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_004557	AAAT	2	8	8167	8174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004557	TCGC	2	8	8198	8205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_004557	GAAG	2	8	10148	10155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004557	TGTC	2	8	10346	10353	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_004557	ATTT	2	8	10414	10421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004557	CTTT	2	8	10503	10510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_004557	ACTA	2	8	10776	10783	50 %	25 %	0 %	25 %	28209840
37	NC_004557	TGAA	2	8	11261	11268	50 %	25 %	25 %	0 %	28209840
38	NC_004557	TCCT	2	8	11348	11355	0 %	50 %	0 %	50 %	28209840
39	NC_004557	TTAA	2	8	11394	11401	50 %	50 %	0 %	0 %	28209840
40	NC_004557	TATT	2	8	11699	11706	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004557	AAAT	2	8	11993	12000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004557	TCTT	2	8	12011	12018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_004557	TTAT	2	8	12356	12363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004557	TTGG	2	8	12505	12512	0 %	50 %	50 %	0 %	28209841
45	NC_004557	TTTC	2	8	12778	12785	0 %	75 %	0 %	25 %	28209841
46	NC_004557	TTCC	2	8	12980	12987	0 %	50 %	0 %	50 %	28209841
47	NC_004557	TATT	2	8	13260	13267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004557	TTAT	2	8	13570	13577	25 %	75 %	0 %	0 %	28209842
49	NC_004557	ATTA	2	8	14018	14025	50 %	50 %	0 %	0 %	28209842
50	NC_004557	GAAG	2	8	14364	14371	50 %	0 %	50 %	0 %	28209842
51	NC_004557	TTTC	2	8	14915	14922	0 %	75 %	0 %	25 %	28209843
52	NC_004557	CTTC	2	8	15134	15141	0 %	50 %	0 %	50 %	28209843
53	NC_004557	CTTT	2	8	15250	15257	0 %	75 %	0 %	25 %	28209843
54	NC_004557	AATT	2	8	15357	15364	50 %	50 %	0 %	0 %	28209843
55	NC_004557	TCTT	2	8	15955	15962	0 %	75 %	0 %	25 %	28209844
56	NC_004557	TTTA	2	8	16418	16425	25 %	75 %	0 %	0 %	28209845
57	NC_004557	TCTT	2	8	16769	16776	0 %	75 %	0 %	25 %	28209845
58	NC_004557	ATCC	2	8	16974	16981	25 %	25 %	0 %	50 %	28209845
59	NC_004557	TTTA	2	8	17447	17454	25 %	75 %	0 %	0 %	28209845
60	NC_004557	TTTA	2	8	17585	17592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004557	ATAC	2	8	17601	17608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004557	ATTT	2	8	17619	17626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004557	TTTA	2	8	17642	17649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004557	TATT	2	8	17668	17675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004557	TAAA	2	8	17685	17692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004557	TTTA	3	12	17700	17711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004557	ATAA	2	8	17721	17728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004557	GTAT	2	8	17781	17788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004557	TAAA	2	8	18183	18190	75 %	25 %	0 %	0 %	28209846
70	NC_004557	CTTT	2	8	18403	18410	0 %	75 %	0 %	25 %	28209846
71	NC_004557	TTTA	2	8	18805	18812	25 %	75 %	0 %	0 %	28209846
72	NC_004557	GAAA	2	8	18840	18847	75 %	0 %	25 %	0 %	28209846
73	NC_004557	ATTT	2	8	19438	19445	25 %	75 %	0 %	0 %	28209846
74	NC_004557	TAAG	2	8	19567	19574	50 %	25 %	25 %	0 %	28209846
75	NC_004557	ATTA	2	8	19580	19587	50 %	50 %	0 %	0 %	28209846
76	NC_004557	TTTA	2	8	19972	19979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004557	AAAT	2	8	20257	20264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004557	AATT	2	8	20270	20277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004557	TGAA	2	8	20306	20313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004557	CTTT	2	8	21482	21489	0 %	75 %	0 %	25 %	28209848
81	NC_004557	TGCA	2	8	21500	21507	25 %	25 %	25 %	25 %	28209848
82	NC_004557	CTTG	2	8	21628	21635	0 %	50 %	25 %	25 %	28209848
83	NC_004557	GCTT	2	8	21694	21701	0 %	50 %	25 %	25 %	28209848
84	NC_004557	TTAT	2	8	21709	21716	25 %	75 %	0 %	0 %	28209848
85	NC_004557	TTTC	2	8	21994	22001	0 %	75 %	0 %	25 %	28209849
86	NC_004557	ACTT	2	8	22586	22593	25 %	50 %	0 %	25 %	28209849
87	NC_004557	TAAT	2	8	22597	22604	50 %	50 %	0 %	0 %	28209849
88	NC_004557	CATT	2	8	23253	23260	25 %	50 %	0 %	25 %	28209849
89	NC_004557	ATTA	2	8	23640	23647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004557	TTAA	2	8	23752	23759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004557	TAAA	2	8	23844	23851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004557	ATTA	2	8	24729	24736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004557	CTTT	2	8	24973	24980	0 %	75 %	0 %	25 %	28209850
94	NC_004557	ATTT	2	8	25031	25038	25 %	75 %	0 %	0 %	28209850
95	NC_004557	TTTC	2	8	25082	25089	0 %	75 %	0 %	25 %	28209850
96	NC_004557	TATT	2	8	25436	25443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004557	ATTT	2	8	25697	25704	25 %	75 %	0 %	0 %	28209851
98	NC_004557	ACAT	2	8	25825	25832	50 %	25 %	0 %	25 %	28209851
99	NC_004557	TTTA	2	8	26143	26150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004557	ATTT	2	8	26295	26302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004557	TAAA	2	8	26392	26399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004557	ATGA	2	8	27382	27389	50 %	25 %	25 %	0 %	28209853
103	NC_004557	ATAA	2	8	27535	27542	75 %	25 %	0 %	0 %	28209853
104	NC_004557	GTTT	2	8	27761	27768	0 %	75 %	25 %	0 %	28209853
105	NC_004557	TTAA	2	8	28666	28673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004557	AAAT	2	8	30138	30145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004557	ACCA	2	8	30159	30166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_004557	TTTA	2	8	30763	30770	25 %	75 %	0 %	0 %	28209856
109	NC_004557	TATC	2	8	30939	30946	25 %	50 %	0 %	25 %	28209856
110	NC_004557	CTTT	2	8	31145	31152	0 %	75 %	0 %	25 %	28209856
111	NC_004557	AATG	2	8	31286	31293	50 %	25 %	25 %	0 %	28209856
112	NC_004557	TAAA	2	8	31299	31306	75 %	25 %	0 %	0 %	28209856
113	NC_004557	CATA	2	8	32083	32090	50 %	25 %	0 %	25 %	28209856
114	NC_004557	AACC	2	8	32209	32216	50 %	0 %	0 %	50 %	28209857
115	NC_004557	TTTA	2	8	32241	32248	25 %	75 %	0 %	0 %	28209857
116	NC_004557	ATTC	2	8	32679	32686	25 %	50 %	0 %	25 %	28209857
117	NC_004557	ATTT	2	8	32903	32910	25 %	75 %	0 %	0 %	28209857
118	NC_004557	ATTT	2	8	33197	33204	25 %	75 %	0 %	0 %	28209857
119	NC_004557	TTTA	2	8	33450	33457	25 %	75 %	0 %	0 %	28209857
120	NC_004557	ATTT	2	8	33560	33567	25 %	75 %	0 %	0 %	28209857
121	NC_004557	ATTT	2	8	34022	34029	25 %	75 %	0 %	0 %	28209857
122	NC_004557	TTTA	2	8	34080	34087	25 %	75 %	0 %	0 %	28209857
123	NC_004557	TAAA	2	8	34157	34164	75 %	25 %	0 %	0 %	28209857
124	NC_004557	TCCT	2	8	34561	34568	0 %	50 %	0 %	50 %	28209858
125	NC_004557	TAAT	2	8	34878	34885	50 %	50 %	0 %	0 %	28209858
126	NC_004557	TAAA	2	8	35208	35215	75 %	25 %	0 %	0 %	28209858
127	NC_004557	ATTT	2	8	35361	35368	25 %	75 %	0 %	0 %	28209858
128	NC_004557	TTTA	2	8	35545	35552	25 %	75 %	0 %	0 %	28209858
129	NC_004557	AAAT	2	8	35696	35703	75 %	25 %	0 %	0 %	28209858
130	NC_004557	CTTT	2	8	35906	35913	0 %	75 %	0 %	25 %	28209858
131	NC_004557	ATTT	2	8	35917	35924	25 %	75 %	0 %	0 %	28209858
132	NC_004557	CTAT	2	8	35930	35937	25 %	50 %	0 %	25 %	28209858
133	NC_004557	TATT	2	8	37793	37800	25 %	75 %	0 %	0 %	28209860
134	NC_004557	AATT	2	8	37889	37896	50 %	50 %	0 %	0 %	28209860
135	NC_004557	TCTA	2	8	38097	38104	25 %	50 %	0 %	25 %	28209860
136	NC_004557	TCAG	2	8	38670	38677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_004557	AGCA	2	8	39503	39510	50 %	0 %	25 %	25 %	28209861
138	NC_004557	ACCT	2	8	39890	39897	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_004557	ACTC	2	8	40260	40267	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_004557	GTCT	2	8	41219	41226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_004557	AAAT	2	8	41253	41260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004557	TCGC	2	8	41284	41291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_004557	GAAG	2	8	43234	43241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004557	TGTC	2	8	43432	43439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_004557	ATTT	2	8	43500	43507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_004557	TACT	2	8	44083	44090	25 %	50 %	0 %	25 %	28209862
147	NC_004557	AAGT	2	8	44417	44424	50 %	25 %	25 %	0 %	28209862
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149	NC_004557	TTTA	2	8	45758	45765	25 %	75 %	0 %	0 %	28209862
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