MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium tetani E88 chromosome

Total Repeats: 44790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004557	CTA	2	6	39	44	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209835
2	NC_004557	TCT	2	6	224	229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
3	NC_004557	TCA	2	6	236	241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209835
4	NC_004557	ATA	2	6	245	250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209835
5	NC_004557	CTT	2	6	270	275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
6	NC_004557	ATT	3	9	437	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209835
7	NC_004557	TCT	2	6	497	502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
8	NC_004557	TCT	2	6	580	585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
9	NC_004557	TCA	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209835
10	NC_004557	AGG	2	6	631	636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28209835
11	NC_004557	TTA	2	6	693	698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209835
12	NC_004557	AAT	2	6	716	721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209835
13	NC_004557	TCT	2	6	823	828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
14	NC_004557	TAA	2	6	901	906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209835
15	NC_004557	CTT	2	6	915	920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
16	NC_004557	ATC	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209835
17	NC_004557	TCT	2	6	1005	1010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
18	NC_004557	TTC	2	6	1015	1020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
19	NC_004557	GCT	2	6	1061	1066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28209835
20	NC_004557	CTT	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
21	NC_004557	CTA	2	6	1146	1151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209835
22	NC_004557	CCT	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209835
23	NC_004557	TAT	2	6	1317	1322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209835
24	NC_004557	CTC	2	6	1354	1359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209835
25	NC_004557	TCT	2	6	1378	1383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
26	NC_004557	TTC	2	6	1420	1425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
27	NC_004557	CTC	2	6	1455	1460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209835
28	NC_004557	GCA	2	6	1487	1492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28209835
29	NC_004557	CTC	2	6	1500	1505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209835
30	NC_004557	CTA	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209835
31	NC_004557	TAA	2	6	1654	1659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209835
32	NC_004557	TAT	2	6	1702	1707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209835
33	NC_004557	ATT	2	6	1771	1776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209835
34	NC_004557	TCT	2	6	1783	1788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209835
35	NC_004557	ACA	2	6	1835	1840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28209835
36	NC_004557	ATC	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209835
37	NC_004557	ATT	2	6	2044	2049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209835
38	NC_004557	TAA	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209835
39	NC_004557	ATT	2	6	2168	2173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209835
40	NC_004557	TAG	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209835
41	NC_004557	TTA	2	6	2352	2357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004557	TTA	2	6	2385	2390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004557	AGG	2	6	2474	2479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004557	TTC	2	6	2520	2525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209836
45	NC_004557	TAA	2	6	2539	2544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209836
46	NC_004557	TAA	3	9	2602	2610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209836
47	NC_004557	ACC	2	6	2618	2623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28209836
48	NC_004557	GAT	2	6	2736	2741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209836
49	NC_004557	AAT	2	6	2802	2807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209836
50	NC_004557	CAT	2	6	2877	2882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209836
51	NC_004557	ATA	2	6	2916	2921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209836
52	NC_004557	TGG	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28209836
53	NC_004557	AAT	2	6	3306	3311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209836
54	NC_004557	TAA	2	6	3322	3327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209836
55	NC_004557	TCA	2	6	3417	3422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209836
56	NC_004557	TAT	2	6	3506	3511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209836
57	NC_004557	ATT	2	6	3681	3686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209836
58	NC_004557	CTA	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209836
59	NC_004557	GAA	2	6	3780	3785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209836
60	NC_004557	AGA	2	6	3800	3805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209836
61	NC_004557	GTT	2	6	3902	3907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28209836
62	NC_004557	TTC	2	6	3908	3913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209836
63	NC_004557	AGG	2	6	3933	3938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004557	AGA	3	9	3966	3974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004557	GAT	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004557	AGA	2	6	4092	4097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209837
67	NC_004557	AGC	2	6	4116	4121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28209837
68	NC_004557	GAA	2	6	4232	4237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209837
69	NC_004557	CCT	2	6	4255	4260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209837
70	NC_004557	ATT	2	6	4327	4332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209837
71	NC_004557	CTA	2	6	4379	4384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209837
72	NC_004557	ATC	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209837
73	NC_004557	AGA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28209837
74	NC_004557	ATT	2	6	4583	4588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209838
75	NC_004557	TTA	2	6	4589	4594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209838
76	NC_004557	TCA	2	6	4597	4602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209838
77	NC_004557	TCC	2	6	4635	4640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28209838
78	NC_004557	CTA	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28209838
79	NC_004557	TCT	2	6	4666	4671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209838
80	NC_004557	TTC	2	6	4695	4700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209838
81	NC_004557	TCT	2	6	4711	4716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209838
82	NC_004557	CTT	2	6	4775	4780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209838
83	NC_004557	TTA	2	6	4786	4791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209838
84	NC_004557	TCT	2	6	4825	4830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209838
85	NC_004557	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209838
86	NC_004557	TAT	2	6	4844	4849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209838
87	NC_004557	TTG	2	6	4863	4868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28209838
88	NC_004557	TCT	2	6	4876	4881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209838
89	NC_004557	TAT	2	6	4893	4898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28209838
90	NC_004557	TTC	2	6	4950	4955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28209838
91	NC_004557	TGA	2	6	4971	4976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28209838
92	NC_004557	CAA	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28209838
93	NC_004557	ATA	2	6	5136	5141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28209838
94	NC_004557	TAA	2	6	5181	5186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004557	ATT	2	6	5196	5201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004557	GAA	2	6	5504	5509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004557	AAT	2	6	5524	5529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004557	AAT	2	6	5552	5557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004557	TGC	2	6	5602	5607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_004557	TTC	2	6	5637	5642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_004557	ACG	2	6	5861	5866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_004557	CGA	2	6	5941	5946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28209839
103	NC_004557	ACC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28209839
104	NC_004557	AGG	2	6	6192	6197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28209839
105	NC_004557	GGT	2	6	6280	6285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28209839
106	NC_004557	GCC	2	6	6550	6555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28209839
107	NC_004557	TTC	2	6	6774	6779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_004557	CTT	2	6	7197	7202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_004557	CTC	2	6	7231	7236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_004557	GGT	2	6	7263	7268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004557	GCT	2	6	7342	7347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_004557	GTT	2	6	7432	7437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004557	TGT	2	6	7525	7530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004557	GAG	2	6	7600	7605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004557	TCC	2	6	7688	7693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_004557	GGT	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004557	ATG	2	6	8143	8148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004557	CTA	2	6	8208	8213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_004557	TCC	2	6	8237	8242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_004557	TGC	2	6	8501	8506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_004557	GCT	2	6	8530	8535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_004557	TAC	2	6	8555	8560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_004557	TTA	2	6	8596	8601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004557	AGG	2	6	8719	8724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004557	ATG	2	6	9053	9058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004557	TCC	2	6	9079	9084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_004557	TAA	3	9	9134	9142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004557	GAC	2	6	9191	9196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_004557	CAC	2	6	9204	9209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_004557	TTC	2	6	9279	9284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_004557	GCT	2	6	9314	9319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_004557	CCT	2	6	9417	9422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_004557	TTC	2	6	9540	9545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_004557	GCT	2	6	9731	9736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_004557	TCA	2	6	9817	9822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_004557	TGC	2	6	9835	9840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_004557	CTG	2	6	9874	9879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_004557	TCG	2	6	9949	9954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_004557	TCC	2	6	10067	10072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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302	NC_004557	TAC	2	6	20556	20561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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